MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013198	CAT	2	6	612202	612207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507596
11502	NC_013198	GCC	2	6	612238	612243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507596
11503	NC_013198	GAA	2	6	612350	612355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507596
11504	NC_013198	ACC	2	6	612376	612381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507596
11505	NC_013198	GTCGTG	2	12	612389	612400	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258507596
11506	NC_013198	GCA	2	6	612411	612416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507596
11507	NC_013198	CAAGGA	2	12	612541	612552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11508	NC_013198	ATG	2	6	612557	612562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507597
11509	NC_013198	TTAT	2	8	612579	612586	25 %	75 %	0 %	0 %	258507597
11510	NC_013198	GATGGT	2	12	612617	612628	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258507597
11511	NC_013198	CAT	2	6	612646	612651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507597
11512	NC_013198	CGC	2	6	612717	612722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507597
11513	NC_013198	ATG	2	6	612738	612743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507597
11514	NC_013198	CAT	2	6	612832	612837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507597
11515	NC_013198	ATT	2	6	612918	612923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507597
11516	NC_013198	ACC	2	6	612934	612939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507597
11517	NC_013198	ATT	3	9	613020	613028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507597
11518	NC_013198	CCGT	2	8	613077	613084	0 %	25 %	25 %	50 %	258507597
11519	NC_013198	AAG	2	6	613086	613091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507597
11520	NC_013198	TAT	2	6	613099	613104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507597
11521	NC_013198	GC	3	6	613114	613119	0 %	0 %	50 %	50 %	258507597
11522	NC_013198	GGCAA	2	10	613163	613172	40 %	0 %	40 %	20 %	258507597
11523	NC_013198	TA	3	6	613215	613220	50 %	50 %	0 %	0 %	258507597
11524	NC_013198	GCC	2	6	613259	613264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507597
11525	NC_013198	ACC	2	6	613316	613321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507597
11526	NC_013198	GGC	3	9	613493	613501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507597
11527	NC_013198	AAT	2	6	613520	613525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507597
11528	NC_013198	AAG	2	6	613752	613757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507597
11529	NC_013198	ATT	2	6	613766	613771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507597
11530	NC_013198	CCAA	2	8	613862	613869	50 %	0 %	0 %	50 %	258507597
11531	NC_013198	AGCTG	2	10	613891	613900	20 %	20 %	40 %	20 %	258507597
11532	NC_013198	ACGA	2	8	614019	614026	50 %	0 %	25 %	25 %	258507597
11533	NC_013198	AAT	2	6	614057	614062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507597
11534	NC_013198	TACCGC	2	12	614085	614096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258507597
11535	NC_013198	CCA	2	6	614168	614173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507597
11536	NC_013198	TTG	2	6	614189	614194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507597
11537	NC_013198	A	6	6	614301	614306	100 %	0 %	0 %	0 %	258507598
11538	NC_013198	ATG	2	6	614375	614380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507598
11539	NC_013198	GAT	2	6	614417	614422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507598
11540	NC_013198	TTA	2	6	614432	614437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507598
11541	NC_013198	GC	3	6	614472	614477	0 %	0 %	50 %	50 %	258507598
11542	NC_013198	GATG	2	8	614497	614504	25 %	25 %	50 %	0 %	258507598
11543	NC_013198	GTGAT	2	10	614520	614529	20 %	40 %	40 %	0 %	258507598
11544	NC_013198	A	6	6	614555	614560	100 %	0 %	0 %	0 %	258507598
11545	NC_013198	AAG	2	6	614567	614572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507598
11546	NC_013198	GAAG	2	8	614602	614609	50 %	0 %	50 %	0 %	258507598
11547	NC_013198	GCG	2	6	614649	614654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507598
11548	NC_013198	AAG	2	6	614655	614660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507598
11549	NC_013198	TGA	2	6	614667	614672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507598
11550	NC_013198	GCA	2	6	614705	614710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507598
11551	NC_013198	GAA	2	6	614713	614718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507598
11552	NC_013198	GAT	2	6	614843	614848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507598
11553	NC_013198	AAC	2	6	614955	614960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507598
11554	NC_013198	AAC	2	6	615157	615162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507598
11555	NC_013198	ATT	2	6	615200	615205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507598
11556	NC_013198	CTT	2	6	615232	615237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507598
11557	NC_013198	TCGGA	2	10	615273	615282	20 %	20 %	40 %	20 %	258507598
11558	NC_013198	CTG	2	6	615345	615350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507598
11559	NC_013198	CTT	2	6	615394	615399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507598
11560	NC_013198	GAT	2	6	615445	615450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507598
11561	NC_013198	GGC	2	6	615466	615471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507598
11562	NC_013198	TCT	2	6	615543	615548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507598
11563	NC_013198	TGGT	2	8	615549	615556	0 %	50 %	50 %	0 %	258507598
11564	NC_013198	TCA	2	6	615723	615728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507598
11565	NC_013198	TGCT	2	8	615880	615887	0 %	50 %	25 %	25 %	258507598
11566	NC_013198	TGG	2	6	615970	615975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507598
11567	NC_013198	TTA	2	6	615989	615994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507598
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11569	NC_013198	GCA	2	6	616118	616123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507598
11570	NC_013198	GATGCG	2	12	616154	616165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258507598
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11572	NC_013198	AAG	3	9	616187	616195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507598
11573	NC_013198	AAT	2	6	616215	616220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507598
11574	NC_013198	TGA	2	6	616265	616270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_013198	TGA	2	6	616344	616349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_013198	AAG	2	6	616424	616429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_013198	GGA	2	6	616458	616463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_013198	CCT	2	6	616559	616564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507599
11579	NC_013198	TGTT	2	8	616592	616599	0 %	75 %	25 %	0 %	258507599
11580	NC_013198	TTC	2	6	616728	616733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507599
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11585	NC_013198	GTG	2	6	616966	616971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507599
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11587	NC_013198	CTG	2	6	617101	617106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507599
11588	NC_013198	TGG	2	6	617114	617119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507599
11589	NC_013198	TGGTT	2	10	617159	617168	0 %	60 %	40 %	0 %	258507599
11590	NC_013198	GGC	2	6	617332	617337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507599
11591	NC_013198	GGCGG	2	10	617350	617359	0 %	0 %	80 %	20 %	258507599
11592	NC_013198	TTG	2	6	617431	617436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507599
11593	NC_013198	GGC	2	6	617511	617516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507599
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11599	NC_013198	GGC	2	6	617703	617708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507599
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11602	NC_013198	A	6	6	617880	617885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_013198	GGC	2	6	617897	617902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_013198	TCA	2	6	617903	617908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_013198	TGGC	2	8	617920	617927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11606	NC_013198	TGT	2	6	617938	617943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_013198	T	6	6	618014	618019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_013198	ATT	2	6	618085	618090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507600
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11610	NC_013198	GT	3	6	618108	618113	0 %	50 %	50 %	0 %	258507600
11611	NC_013198	GCGT	2	8	618150	618157	0 %	25 %	50 %	25 %	258507600
11612	NC_013198	CAG	2	6	618243	618248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507600
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11614	NC_013198	GCG	2	6	618269	618274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507600
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11616	NC_013198	TGCCA	2	10	618319	618328	20 %	20 %	20 %	40 %	258507600
11617	NC_013198	TGT	2	6	618358	618363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507600
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11619	NC_013198	GTT	2	6	618400	618405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507600
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11621	NC_013198	CGA	2	6	618474	618479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507600
11622	NC_013198	TTG	2	6	618534	618539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507600
11623	NC_013198	GTG	3	9	618551	618559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507600
11624	NC_013198	TGC	2	6	618561	618566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507600
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11626	NC_013198	CG	3	6	618585	618590	0 %	0 %	50 %	50 %	258507600
11627	NC_013198	TGC	2	6	618601	618606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507600
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11639	NC_013198	GGCA	2	8	619565	619572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11640	NC_013198	TGAG	2	8	619576	619583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11641	NC_013198	CTG	2	6	619676	619681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11643	NC_013198	CTT	2	6	619723	619728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507601
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11693	NC_013198	AAAT	2	8	622596	622603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11694	NC_013198	CAT	2	6	622661	622666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11721	NC_013198	CG	4	8	624376	624383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11987	NC_013198	CGC	2	6	639313	639318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507620
11988	NC_013198	CAT	2	6	639341	639346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507620
11989	NC_013198	CAC	2	6	639347	639352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507620
11990	NC_013198	CG	3	6	639406	639411	0 %	0 %	50 %	50 %	258507620
11991	NC_013198	GCA	2	6	639418	639423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507620
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11996	NC_013198	CCT	2	6	639596	639601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11997	NC_013198	ACC	2	6	639669	639674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11998	NC_013198	ACA	2	6	639686	639691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507621
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