MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_013198	TCA	2	6	2871396	2871401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509800
53502	NC_013198	ATC	2	6	2871458	2871463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509800
53503	NC_013198	AAT	2	6	2871514	2871519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509800
53504	NC_013198	CAT	2	6	2871556	2871561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509800
53505	NC_013198	GTC	2	6	2871587	2871592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509800
53506	NC_013198	CAA	2	6	2871604	2871609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509800
53507	NC_013198	GCC	2	6	2871638	2871643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509800
53508	NC_013198	TACT	2	8	2871654	2871661	25 %	50 %	0 %	25 %	258509800
53509	NC_013198	CAT	2	6	2871667	2871672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509800
53510	NC_013198	GCA	2	6	2871847	2871852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53511	NC_013198	AAC	2	6	2871853	2871858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53512	NC_013198	A	6	6	2871948	2871953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53513	NC_013198	A	6	6	2871961	2871966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53514	NC_013198	CAG	2	6	2872037	2872042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53515	NC_013198	A	6	6	2872070	2872075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53516	NC_013198	TGG	2	6	2872101	2872106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53517	NC_013198	GAA	2	6	2872261	2872266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53518	NC_013198	TCA	2	6	2872339	2872344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53519	NC_013198	TTC	2	6	2872350	2872355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509801
53520	NC_013198	TTG	2	6	2872363	2872368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509801
53521	NC_013198	TGC	2	6	2872395	2872400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509801
53522	NC_013198	GT	3	6	2872461	2872466	0 %	50 %	50 %	0 %	258509801
53523	NC_013198	TGA	2	6	2872507	2872512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509801
53524	NC_013198	CAT	2	6	2872513	2872518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509801
53525	NC_013198	GCC	2	6	2872533	2872538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509801
53526	NC_013198	CTG	2	6	2872545	2872550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509801
53527	NC_013198	GCC	2	6	2872562	2872567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509801
53528	NC_013198	CCG	2	6	2872578	2872583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509801
53529	NC_013198	AAC	2	6	2872673	2872678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509801
53530	NC_013198	ATTG	2	8	2872696	2872703	25 %	50 %	25 %	0 %	258509801
53531	NC_013198	TCA	2	6	2872719	2872724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509801
53532	NC_013198	CTG	2	6	2872770	2872775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509801
53533	NC_013198	AATT	2	8	2872801	2872808	50 %	50 %	0 %	0 %	258509801
53534	NC_013198	ACCTG	2	10	2872815	2872824	20 %	20 %	20 %	40 %	258509801
53535	NC_013198	GGT	2	6	2872898	2872903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509801
53536	NC_013198	GCG	2	6	2872990	2872995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509801
53537	NC_013198	CAC	2	6	2873180	2873185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509801
53538	NC_013198	TCTT	2	8	2873217	2873224	0 %	75 %	0 %	25 %	258509801
53539	NC_013198	ATAA	2	8	2873228	2873235	75 %	25 %	0 %	0 %	258509801
53540	NC_013198	TGA	2	6	2873267	2873272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509801
53541	NC_013198	ACT	2	6	2873273	2873278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509801
53542	NC_013198	ACT	2	6	2873285	2873290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509801
53543	NC_013198	AAC	2	6	2873378	2873383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509801
53544	NC_013198	GAC	2	6	2873387	2873392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509801
53545	NC_013198	TTGA	2	8	2873435	2873442	25 %	50 %	25 %	0 %	258509801
53546	NC_013198	CCA	2	6	2873538	2873543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509801
53547	NC_013198	CCA	2	6	2873550	2873555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509801
53548	NC_013198	CAA	2	6	2873575	2873580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509801
53549	NC_013198	TTC	3	9	2873601	2873609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509801
53550	NC_013198	CCG	2	6	2873617	2873622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509801
53551	NC_013198	TCC	2	6	2873688	2873693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53552	NC_013198	ATT	2	6	2873727	2873732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53553	NC_013198	AAC	2	6	2873760	2873765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53554	NC_013198	T	6	6	2873772	2873777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53555	NC_013198	GTGAGC	2	12	2873890	2873901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258509802
53556	NC_013198	ACG	2	6	2874228	2874233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509803
53557	NC_013198	A	7	7	2874253	2874259	100 %	0 %	0 %	0 %	258509803
53558	NC_013198	GTC	2	6	2874287	2874292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53559	NC_013198	T	6	6	2874295	2874300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53560	NC_013198	CA	3	6	2874331	2874336	50 %	0 %	0 %	50 %	258509804
53561	NC_013198	ACAA	2	8	2874337	2874344	75 %	0 %	0 %	25 %	258509804
53562	NC_013198	TTG	2	6	2874405	2874410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509804
53563	NC_013198	CAA	2	6	2874414	2874419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509804
53564	NC_013198	TTG	2	6	2874451	2874456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509804
53565	NC_013198	AAAT	2	8	2874478	2874485	75 %	25 %	0 %	0 %	258509804
53566	NC_013198	CATC	2	8	2874509	2874516	25 %	25 %	0 %	50 %	258509804
53567	NC_013198	GCATCG	2	12	2874640	2874651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509804
53568	NC_013198	ATG	2	6	2874720	2874725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509804
53569	NC_013198	GCA	2	6	2874748	2874753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509804
53570	NC_013198	AAC	2	6	2874817	2874822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509804
53571	NC_013198	TCA	2	6	2875004	2875009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509804
53572	NC_013198	GCT	3	9	2875092	2875100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509804
53573	NC_013198	TG	3	6	2875375	2875380	0 %	50 %	50 %	0 %	258509805
53574	NC_013198	ATT	2	6	2875395	2875400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509805
53575	NC_013198	TCA	2	6	2875448	2875453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509805
53576	NC_013198	TAAC	2	8	2875504	2875511	50 %	25 %	0 %	25 %	258509805
53577	NC_013198	AG	3	6	2875608	2875613	50 %	0 %	50 %	0 %	258509805
53578	NC_013198	CATACT	2	12	2875622	2875633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509805
53579	NC_013198	T	6	6	2875693	2875698	0 %	100 %	0 %	0 %	258509805
53580	NC_013198	CTG	2	6	2875761	2875766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509805
53581	NC_013198	CGTG	2	8	2875779	2875786	0 %	25 %	50 %	25 %	258509805
53582	NC_013198	CG	3	6	2875871	2875876	0 %	0 %	50 %	50 %	258509805
53583	NC_013198	CTG	2	6	2875929	2875934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509805
53584	NC_013198	CCTC	2	8	2876026	2876033	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53585	NC_013198	AGCA	2	8	2876034	2876041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53586	NC_013198	TTA	2	6	2876044	2876049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53587	NC_013198	AGTT	2	8	2876057	2876064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53588	NC_013198	TCGC	2	8	2876093	2876100	0 %	25 %	25 %	50 %	258509806
53589	NC_013198	ACT	2	6	2876101	2876106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
53590	NC_013198	ATC	2	6	2876107	2876112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
53591	NC_013198	CTA	2	6	2876162	2876167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
53592	NC_013198	CAGC	2	8	2876173	2876180	25 %	0 %	25 %	50 %	258509806
53593	NC_013198	ATA	2	6	2876215	2876220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
53594	NC_013198	CTA	2	6	2876255	2876260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
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53596	NC_013198	CAT	2	6	2876523	2876528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
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53598	NC_013198	ATA	2	6	2876773	2876778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
53599	NC_013198	TTG	2	6	2876788	2876793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509806
53600	NC_013198	GGC	2	6	2876813	2876818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509806
53601	NC_013198	TTC	2	6	2876869	2876874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509806
53602	NC_013198	GTC	2	6	2876900	2876905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509806
53603	NC_013198	TTAA	2	8	2876975	2876982	50 %	50 %	0 %	0 %	258509806
53604	NC_013198	T	6	6	2876989	2876994	0 %	100 %	0 %	0 %	258509806
53605	NC_013198	TTTGA	2	10	2877046	2877055	20 %	60 %	20 %	0 %	258509806
53606	NC_013198	CTTG	2	8	2877057	2877064	0 %	50 %	25 %	25 %	258509806
53607	NC_013198	A	6	6	2877067	2877072	100 %	0 %	0 %	0 %	258509806
53608	NC_013198	GATA	2	8	2877108	2877115	50 %	25 %	25 %	0 %	258509806
53609	NC_013198	TTG	2	6	2877214	2877219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509806
53610	NC_013198	ATTGGC	2	12	2877235	2877246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258509806
53611	NC_013198	AGC	2	6	2877254	2877259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509806
53612	NC_013198	TAA	2	6	2877281	2877286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
53613	NC_013198	T	7	7	2877318	2877324	0 %	100 %	0 %	0 %	258509806
53614	NC_013198	GTT	2	6	2877344	2877349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509806
53615	NC_013198	ACT	2	6	2877463	2877468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
53616	NC_013198	TCC	2	6	2877488	2877493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509807
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53618	NC_013198	CTT	2	6	2877544	2877549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509807
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53735	NC_013198	TCA	2	6	2883694	2883699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
53736	NC_013198	CAC	2	6	2883708	2883713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509812
53737	NC_013198	CGT	2	6	2883857	2883862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509812
53738	NC_013198	CG	3	6	2883911	2883916	0 %	0 %	50 %	50 %	258509812
53739	NC_013198	TCA	2	6	2884003	2884008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
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53746	NC_013198	CGC	2	6	2884515	2884520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509813
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53762	NC_013198	AAG	2	6	2885417	2885422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509813
53763	NC_013198	GTAA	2	8	2885475	2885482	50 %	25 %	25 %	0 %	258509813
53764	NC_013198	AAAAT	2	10	2885514	2885523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53765	NC_013198	CAA	2	6	2885583	2885588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53831	NC_013198	GTT	2	6	2889324	2889329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509817
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53833	NC_013198	ATTT	2	8	2889378	2889385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53834	NC_013198	GC	3	6	2889417	2889422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53835	NC_013198	ATT	2	6	2889536	2889541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53836	NC_013198	A	7	7	2889570	2889576	100 %	0 %	0 %	0 %	258509818
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53840	NC_013198	TGA	2	6	2889822	2889827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509818
53841	NC_013198	CTCA	2	8	2889850	2889857	25 %	25 %	0 %	50 %	258509818
53842	NC_013198	TGA	2	6	2889865	2889870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509818
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