MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49004	NC_012984	ATGA	2	8	2501516	2501523	50 %	25 %	25 %	0 %	254557503
49005	NC_012984	GCT	2	6	2501537	2501542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557503
49006	NC_012984	AGCC	2	8	2501565	2501572	25 %	0 %	25 %	50 %	254557503
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49117	NC_012984	CA	4	8	2507880	2507887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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49119	NC_012984	TTA	2	6	2507964	2507969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49232	NC_012984	TCA	2	6	2513090	2513095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557510
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49234	NC_012984	TTG	2	6	2513183	2513188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557510
49235	NC_012984	CTT	2	6	2513204	2513209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49236	NC_012984	TAA	2	6	2513213	2513218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49237	NC_012984	TAT	3	9	2513228	2513236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49238	NC_012984	AATT	2	8	2513246	2513253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49239	NC_012984	A	6	6	2513272	2513277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49240	NC_012984	ATTT	2	8	2513311	2513318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49262	NC_012984	ATG	2	6	2514305	2514310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49272	NC_012984	TAT	2	6	2515096	2515101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49274	NC_012984	AT	3	6	2515174	2515179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49275	NC_012984	ATT	2	6	2515207	2515212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49277	NC_012984	GGTC	2	8	2515294	2515301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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49344	NC_012984	TCAA	2	8	2518780	2518787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49345	NC_012984	CAT	2	6	2518802	2518807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49346	NC_012984	TCAG	2	8	2518854	2518861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49347	NC_012984	A	6	6	2518875	2518880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49348	NC_012984	CAA	2	6	2518908	2518913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49349	NC_012984	TTAT	2	8	2518921	2518928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49350	NC_012984	AATC	2	8	2519015	2519022	50 %	25 %	0 %	25 %	254557515
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49354	NC_012984	ACC	2	6	2519190	2519195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557515
49355	NC_012984	GGC	2	6	2519226	2519231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557515
49356	NC_012984	CGT	2	6	2519238	2519243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557515
49357	NC_012984	GGC	2	6	2519250	2519255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557515
49358	NC_012984	CTT	2	6	2519258	2519263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557515
49359	NC_012984	CAT	3	9	2519331	2519339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557515
49360	NC_012984	ATC	2	6	2519367	2519372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557515
49361	NC_012984	AATA	2	8	2519374	2519381	75 %	25 %	0 %	0 %	254557515
49362	NC_012984	TCTCAG	2	12	2519411	2519422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254557515
49363	NC_012984	CGT	2	6	2519429	2519434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557515
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49368	NC_012984	AAT	2	6	2519777	2519782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557515
49369	NC_012984	A	8	8	2519800	2519807	100 %	0 %	0 %	0 %	254557515
49370	NC_012984	ACG	2	6	2519818	2519823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557515
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49373	NC_012984	CGT	2	6	2519973	2519978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557515
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49382	NC_012984	TGG	2	6	2520418	2520423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557516
49383	NC_012984	T	8	8	2520503	2520510	0 %	100 %	0 %	0 %	254557516
49384	NC_012984	GTC	2	6	2520537	2520542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557516
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49388	NC_012984	A	7	7	2520756	2520762	100 %	0 %	0 %	0 %	254557516
49389	NC_012984	A	7	7	2520881	2520887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49390	NC_012984	TTA	2	6	2520888	2520893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49391	NC_012984	A	6	6	2520927	2520932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49392	NC_012984	CGT	2	6	2520936	2520941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49397	NC_012984	ATCTT	2	10	2521087	2521096	20 %	60 %	0 %	20 %	254557517
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49444	NC_012984	TA	4	8	2523786	2523793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49445	NC_012984	T	6	6	2523907	2523912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49446	NC_012984	T	6	6	2523919	2523924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49447	NC_012984	AATC	2	8	2523944	2523951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49448	NC_012984	AACC	2	8	2523965	2523972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49449	NC_012984	GCTT	2	8	2523981	2523988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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49454	NC_012984	A	6	6	2524170	2524175	100 %	0 %	0 %	0 %	254557519
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49463	NC_012984	TG	3	6	2524671	2524676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49464	NC_012984	GTG	2	6	2524680	2524685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49465	NC_012984	T	8	8	2524686	2524693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49466	NC_012984	GCTT	2	8	2524716	2524723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49467	NC_012984	CT	3	6	2524736	2524741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49468	NC_012984	AATTA	2	10	2524744	2524753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49469	NC_012984	GGA	2	6	2524769	2524774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49470	NC_012984	CGC	2	6	2524808	2524813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557520
49471	NC_012984	CTG	2	6	2524825	2524830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557520
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49473	NC_012984	AC	3	6	2524889	2524894	50 %	0 %	0 %	50 %	254557520
49474	NC_012984	CAA	2	6	2524934	2524939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557520
49475	NC_012984	ATT	2	6	2524944	2524949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557520
49476	NC_012984	TGCAAT	2	12	2524970	2524981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254557520
49477	NC_012984	ATC	2	6	2525002	2525007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557520
49478	NC_012984	AAGG	2	8	2525025	2525032	50 %	0 %	50 %	0 %	254557520
49479	NC_012984	CAA	3	9	2525115	2525123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557520
49480	NC_012984	ATT	2	6	2525148	2525153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557520
49481	NC_012984	CAG	2	6	2525322	2525327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557521
49482	NC_012984	TCA	2	6	2525342	2525347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557521
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49485	NC_012984	GGC	2	6	2525489	2525494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557521
49486	NC_012984	GCC	2	6	2525520	2525525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557521
49487	NC_012984	ACA	2	6	2525564	2525569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557521
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49491	NC_012984	ACC	2	6	2526016	2526021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557521
49492	NC_012984	ACG	2	6	2526114	2526119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557521
49493	NC_012984	CTT	2	6	2526125	2526130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557521
49494	NC_012984	AAC	2	6	2526199	2526204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557521
49495	NC_012984	AAT	2	6	2526266	2526271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557521
49496	NC_012984	TCC	2	6	2526294	2526299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49497	NC_012984	CTT	2	6	2526310	2526315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49498	NC_012984	AAT	2	6	2526497	2526502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557522
49499	NC_012984	CAT	2	6	2526511	2526516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557522
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