MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_012984	GCC	2	6	2400404	2400409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557414
47003	NC_012984	CAT	2	6	2400432	2400437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557414
47004	NC_012984	TGC	2	6	2400475	2400480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557414
47005	NC_012984	GTT	2	6	2400512	2400517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557414
47006	NC_012984	GCCA	2	8	2400625	2400632	25 %	0 %	25 %	50 %	254557414
47007	NC_012984	ATT	2	6	2400640	2400645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557414
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47009	NC_012984	TTG	2	6	2400739	2400744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557414
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47012	NC_012984	ACA	2	6	2400887	2400892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557414
47013	NC_012984	CTT	2	6	2400939	2400944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557414
47014	NC_012984	TTTCAT	2	12	2400961	2400972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47015	NC_012984	T	6	6	2401056	2401061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47016	NC_012984	TTG	2	6	2401094	2401099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47017	NC_012984	AAC	2	6	2401178	2401183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557415
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47024	NC_012984	TATTCT	2	12	2401568	2401579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254557415
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47042	NC_012984	GGT	2	6	2402718	2402723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47043	NC_012984	TAG	2	6	2402745	2402750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47046	NC_012984	TC	3	6	2402941	2402946	0 %	50 %	0 %	50 %	254557416
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47102	NC_012984	CGGC	2	8	2405892	2405899	0 %	0 %	50 %	50 %	254557419
47103	NC_012984	AACC	2	8	2405966	2405973	50 %	0 %	0 %	50 %	254557419
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47109	NC_012984	TA	3	6	2406414	2406419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47110	NC_012984	CTAAT	2	10	2406478	2406487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47111	NC_012984	GTTC	2	8	2406522	2406529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47112	NC_012984	TCTTAA	2	12	2406533	2406544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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47116	NC_012984	A	9	9	2406765	2406773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47117	NC_012984	ACT	2	6	2406840	2406845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47118	NC_012984	AAG	2	6	2406855	2406860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47119	NC_012984	CAC	2	6	2406911	2406916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47120	NC_012984	ATTAGT	2	12	2407008	2407019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47121	NC_012984	ATC	2	6	2407065	2407070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47122	NC_012984	ATCTC	2	10	2407105	2407114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47123	NC_012984	GT	3	6	2407118	2407123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47124	NC_012984	GGC	2	6	2407185	2407190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47126	NC_012984	ACC	2	6	2407488	2407493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47127	NC_012984	CTGT	2	8	2407528	2407535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47128	NC_012984	AGG	2	6	2407624	2407629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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47130	NC_012984	GTG	2	6	2407680	2407685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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47132	NC_012984	CCA	2	6	2407720	2407725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47133	NC_012984	CCTA	2	8	2407764	2407771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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47137	NC_012984	CTA	2	6	2408318	2408323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47143	NC_012984	TCC	2	6	2409133	2409138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47144	NC_012984	CTCCC	2	10	2409368	2409377	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
47145	NC_012984	GTA	2	6	2409429	2409434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47149	NC_012984	TTTGG	2	10	2409630	2409639	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47150	NC_012984	TCGC	2	8	2409652	2409659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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47230	NC_012984	TTA	2	6	2412824	2412829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47232	NC_012984	TAA	4	12	2412867	2412878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47233	NC_012984	GTCCA	2	10	2412898	2412907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47234	NC_012984	ACTT	2	8	2412920	2412927	25 %	50 %	0 %	25 %	254557421
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47241	NC_012984	CTT	2	6	2413281	2413286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557421
47242	NC_012984	ATCG	2	8	2413344	2413351	25 %	25 %	25 %	25 %	254557421
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47357	NC_012984	ATCGAT	2	12	2418862	2418873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254557425
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47360	NC_012984	ATT	2	6	2419070	2419075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47484	NC_012984	GAC	2	6	2426255	2426260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557433
47485	NC_012984	ACC	2	6	2426334	2426339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557433
47486	NC_012984	CAG	2	6	2426401	2426406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557433
47487	NC_012984	GTC	2	6	2426441	2426446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557433
47488	NC_012984	CCCA	2	8	2426485	2426492	25 %	0 %	0 %	75 %	254557433
47489	NC_012984	CAG	3	9	2426505	2426513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557433
47490	NC_012984	TAAA	2	8	2426536	2426543	75 %	25 %	0 %	0 %	254557433
47491	NC_012984	CAA	2	6	2426577	2426582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557433
47492	NC_012984	AAC	2	6	2426707	2426712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557434
47493	NC_012984	ACG	2	6	2426725	2426730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557434
47494	NC_012984	GT	3	6	2426759	2426764	0 %	50 %	50 %	0 %	254557434
47495	NC_012984	ATC	2	6	2426781	2426786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557434
47496	NC_012984	CG	3	6	2426803	2426808	0 %	0 %	50 %	50 %	254557434
47497	NC_012984	CGT	2	6	2426826	2426831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557434
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47500	NC_012984	CAA	2	6	2426960	2426965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557434

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