MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_012984	CACTTC	2	12	2323391	2323402	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	254557341
45502	NC_012984	TGA	2	6	2323446	2323451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557341
45503	NC_012984	ATCA	2	8	2323464	2323471	50 %	25 %	0 %	25 %	254557341
45504	NC_012984	ATC	2	6	2323489	2323494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557341
45505	NC_012984	AC	3	6	2323565	2323570	50 %	0 %	0 %	50 %	254557341
45506	NC_012984	ACCA	2	8	2323577	2323584	50 %	0 %	0 %	50 %	254557341
45507	NC_012984	CGT	2	6	2323585	2323590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557341
45508	NC_012984	CGG	2	6	2323609	2323614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557341
45509	NC_012984	CTGG	2	8	2323767	2323774	0 %	25 %	50 %	25 %	254557341
45510	NC_012984	CT	3	6	2323801	2323806	0 %	50 %	0 %	50 %	254557341
45511	NC_012984	TCTAAT	2	12	2323824	2323835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254557341
45512	NC_012984	CAAT	2	8	2323916	2323923	50 %	25 %	0 %	25 %	254557341
45513	NC_012984	ACCA	2	8	2323963	2323970	50 %	0 %	0 %	50 %	254557342
45514	NC_012984	TGA	2	6	2323972	2323977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557342
45515	NC_012984	CAA	2	6	2323988	2323993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557342
45516	NC_012984	CA	3	6	2324130	2324135	50 %	0 %	0 %	50 %	254557342
45517	NC_012984	TTTGC	2	10	2324202	2324211	0 %	60 %	20 %	20 %	254557342
45518	NC_012984	TGACCA	2	12	2324232	2324243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254557342
45519	NC_012984	A	6	6	2324309	2324314	100 %	0 %	0 %	0 %	254557342
45520	NC_012984	GCA	2	6	2324317	2324322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557342
45521	NC_012984	GCTC	2	8	2324326	2324333	0 %	25 %	25 %	50 %	254557342
45522	NC_012984	CAA	2	6	2324441	2324446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557342
45523	NC_012984	AAT	2	6	2324447	2324452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557342
45524	NC_012984	CGC	2	6	2324515	2324520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557343
45525	NC_012984	T	6	6	2324587	2324592	0 %	100 %	0 %	0 %	254557343
45526	NC_012984	GC	3	6	2324604	2324609	0 %	0 %	50 %	50 %	254557343
45527	NC_012984	TGA	3	9	2324641	2324649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557343
45528	NC_012984	CAT	2	6	2324689	2324694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557343
45529	NC_012984	GAA	2	6	2324711	2324716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557343
45530	NC_012984	GAA	2	6	2324726	2324731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557343
45531	NC_012984	CGAC	2	8	2324799	2324806	25 %	0 %	25 %	50 %	254557343
45532	NC_012984	GCC	2	6	2324813	2324818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557343
45533	NC_012984	ATT	2	6	2324819	2324824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557343
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45535	NC_012984	TGA	2	6	2324976	2324981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557343
45536	NC_012984	TTC	2	6	2324993	2324998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557343
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45539	NC_012984	TGG	2	6	2325202	2325207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557343
45540	NC_012984	CG	3	6	2325221	2325226	0 %	0 %	50 %	50 %	254557343
45541	NC_012984	TGG	2	6	2325261	2325266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557343
45542	NC_012984	CAC	2	6	2325316	2325321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557343
45543	NC_012984	ATC	2	6	2325336	2325341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557343
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45550	NC_012984	TTC	2	6	2325665	2325670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557343
45551	NC_012984	GAT	2	6	2325697	2325702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557343
45552	NC_012984	CGT	2	6	2325715	2325720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557343
45553	NC_012984	AAT	2	6	2325835	2325840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45554	NC_012984	TGA	2	6	2325841	2325846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45555	NC_012984	CCAA	2	8	2325879	2325886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45556	NC_012984	TG	3	6	2326089	2326094	0 %	50 %	50 %	0 %	254557344
45557	NC_012984	TGG	2	6	2326191	2326196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557344
45558	NC_012984	TGAT	2	8	2326232	2326239	25 %	50 %	25 %	0 %	254557344
45559	NC_012984	GC	4	8	2326254	2326261	0 %	0 %	50 %	50 %	254557344
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45561	NC_012984	TGATT	2	10	2326336	2326345	20 %	60 %	20 %	0 %	254557344
45562	NC_012984	CCA	2	6	2326475	2326480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557344
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45568	NC_012984	CAT	3	9	2326646	2326654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557344
45569	NC_012984	AATT	2	8	2326689	2326696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45570	NC_012984	ACCA	2	8	2326777	2326784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45571	NC_012984	TTG	2	6	2326929	2326934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557345
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45585	NC_012984	TTGG	2	8	2327805	2327812	0 %	50 %	50 %	0 %	254557345
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45588	NC_012984	CGA	2	6	2327882	2327887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557345
45589	NC_012984	CAT	2	6	2328030	2328035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557345
45590	NC_012984	ACC	4	12	2328060	2328071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557345
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45593	NC_012984	GTG	2	6	2328137	2328142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557346
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45598	NC_012984	TCGAT	2	10	2328344	2328353	20 %	40 %	20 %	20 %	254557346
45599	NC_012984	TTG	2	6	2328433	2328438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557346
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45601	NC_012984	GTA	2	6	2328537	2328542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557346
45602	NC_012984	TCA	2	6	2328606	2328611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557346
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45604	NC_012984	TCA	2	6	2328653	2328658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557346
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45606	NC_012984	AAG	2	6	2328683	2328688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557346
45607	NC_012984	GTGC	2	8	2328690	2328697	0 %	25 %	50 %	25 %	254557346
45608	NC_012984	TCT	2	6	2328699	2328704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557346
45609	NC_012984	AATCG	2	10	2328760	2328769	40 %	20 %	20 %	20 %	254557346
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45612	NC_012984	CGGC	2	8	2328852	2328859	0 %	0 %	50 %	50 %	254557346
45613	NC_012984	GCA	2	6	2328887	2328892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557346
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45969	NC_012984	TGG	2	6	2346553	2346558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557363
45970	NC_012984	CTATT	2	10	2346606	2346615	20 %	60 %	0 %	20 %	254557363
45971	NC_012984	TGA	2	6	2346619	2346624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557363
45972	NC_012984	AGCT	2	8	2346736	2346743	25 %	25 %	25 %	25 %	254557363
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45980	NC_012984	ACT	2	6	2347219	2347224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557364
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45984	NC_012984	GAATTG	2	12	2347578	2347589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557364
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45991	NC_012984	TAC	2	6	2348188	2348193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557364
45992	NC_012984	CAA	2	6	2348194	2348199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557364
45993	NC_012984	GCTA	2	8	2348365	2348372	25 %	25 %	25 %	25 %	254557364
45994	NC_012984	TCTG	2	8	2348392	2348399	0 %	50 %	25 %	25 %	254557364
45995	NC_012984	TTC	2	6	2348502	2348507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557364
45996	NC_012984	CTAC	2	8	2348620	2348627	25 %	25 %	0 %	50 %	254557364
45997	NC_012984	GGA	2	6	2348684	2348689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45998	NC_012984	TTA	2	6	2348724	2348729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557365
45999	NC_012984	TTA	2	6	2348734	2348739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557365
46000	NC_012984	GTC	3	9	2348767	2348775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557365

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