MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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42227	NC_012984	TCT	2	6	2152285	2152290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557186
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42230	NC_012984	TAA	2	6	2152378	2152383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557186
42231	NC_012984	TCG	2	6	2152434	2152439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557186
42232	NC_012984	ACCG	2	8	2152520	2152527	25 %	0 %	25 %	50 %	254557186
42233	NC_012984	CGG	2	6	2152600	2152605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557186
42234	NC_012984	ACC	2	6	2152667	2152672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557186
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42236	NC_012984	TGA	2	6	2152792	2152797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557186
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42348	NC_012984	AATT	2	8	2158685	2158692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42349	NC_012984	CTTT	2	8	2158791	2158798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42350	NC_012984	AATTTA	2	12	2158804	2158815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42351	NC_012984	TAA	2	6	2158820	2158825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42352	NC_012984	GTT	2	6	2158937	2158942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42353	NC_012984	ACC	2	6	2158968	2158973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42354	NC_012984	TATTC	2	10	2158990	2158999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42355	NC_012984	ATC	2	6	2159040	2159045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42356	NC_012984	CTGAC	2	10	2159058	2159067	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42357	NC_012984	TTTGAT	2	12	2159086	2159097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42358	NC_012984	TGAC	2	8	2159113	2159120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42359	NC_012984	ACT	2	6	2159137	2159142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42360	NC_012984	ATC	2	6	2159164	2159169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557195
42361	NC_012984	TGC	2	6	2159229	2159234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557195
42362	NC_012984	AATA	2	8	2159286	2159293	75 %	25 %	0 %	0 %	254557195
42363	NC_012984	AAT	2	6	2159412	2159417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557195
42364	NC_012984	TGCA	2	8	2159426	2159433	25 %	25 %	25 %	25 %	254557195
42365	NC_012984	CAT	2	6	2159479	2159484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557195
42366	NC_012984	ACC	2	6	2159493	2159498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557195
42367	NC_012984	GTC	2	6	2159547	2159552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557195
42368	NC_012984	TCA	2	6	2159563	2159568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557195
42369	NC_012984	CGA	2	6	2159605	2159610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557195
42370	NC_012984	TAT	2	6	2159611	2159616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557195
42371	NC_012984	TGT	2	6	2159634	2159639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557195
42372	NC_012984	AGCC	2	8	2159660	2159667	25 %	0 %	25 %	50 %	254557195
42373	NC_012984	CCA	2	6	2159788	2159793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557195
42374	NC_012984	TGAGCA	2	12	2159802	2159813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254557195
42375	NC_012984	T	7	7	2159914	2159920	0 %	100 %	0 %	0 %	254557195
42376	NC_012984	GCC	2	6	2159928	2159933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557195
42377	NC_012984	GTTGC	2	10	2159935	2159944	0 %	40 %	40 %	20 %	254557195
42378	NC_012984	TAA	2	6	2159990	2159995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557195
42379	NC_012984	CCA	2	6	2160008	2160013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557195
42380	NC_012984	TTAA	2	8	2160065	2160072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42381	NC_012984	TGCT	2	8	2160139	2160146	0 %	50 %	25 %	25 %	254557196
42382	NC_012984	AGCC	2	8	2160192	2160199	25 %	0 %	25 %	50 %	254557196
42383	NC_012984	GTG	2	6	2160221	2160226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557196
42384	NC_012984	CTTG	2	8	2160304	2160311	0 %	50 %	25 %	25 %	254557196
42385	NC_012984	CG	3	6	2160328	2160333	0 %	0 %	50 %	50 %	254557196
42386	NC_012984	TTC	2	6	2160434	2160439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557196
42387	NC_012984	GC	3	6	2160473	2160478	0 %	0 %	50 %	50 %	254557196
42388	NC_012984	TAA	2	6	2160546	2160551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557196
42389	NC_012984	GAT	2	6	2160553	2160558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557196
42390	NC_012984	CTA	2	6	2160564	2160569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557196
42391	NC_012984	GTTCC	2	10	2160580	2160589	0 %	40 %	20 %	40 %	254557196
42392	NC_012984	ATC	2	6	2160657	2160662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557196
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42396	NC_012984	GCC	2	6	2160943	2160948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557196
42397	NC_012984	T	6	6	2161002	2161007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42398	NC_012984	ATCG	2	8	2161074	2161081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42399	NC_012984	CCG	2	6	2161089	2161094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42400	NC_012984	AAG	2	6	2161112	2161117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42401	NC_012984	TAA	2	6	2161182	2161187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42402	NC_012984	AGG	2	6	2161194	2161199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42403	NC_012984	CG	3	6	2161254	2161259	0 %	0 %	50 %	50 %	254557197
42404	NC_012984	TTC	2	6	2161296	2161301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557197
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42409	NC_012984	TCAAA	2	10	2161788	2161797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42410	NC_012984	GTC	2	6	2161858	2161863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557198
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42412	NC_012984	AATG	2	8	2161961	2161968	50 %	25 %	25 %	0 %	254557198
42413	NC_012984	AACTA	2	10	2161971	2161980	60 %	20 %	0 %	20 %	254557198
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42421	NC_012984	TGA	2	6	2162419	2162424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42422	NC_012984	ATT	2	6	2162432	2162437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42423	NC_012984	CTG	2	6	2162443	2162448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42424	NC_012984	ATTA	2	8	2162489	2162496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42425	NC_012984	CAA	2	6	2162501	2162506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42426	NC_012984	ACCT	2	8	2162630	2162637	25 %	25 %	0 %	50 %	254557200
42427	NC_012984	TCG	2	6	2162656	2162661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557200
42428	NC_012984	TTC	2	6	2162805	2162810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557200
42429	NC_012984	ATT	2	6	2162849	2162854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557200
42430	NC_012984	GTC	2	6	2162960	2162965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557200
42431	NC_012984	TA	3	6	2163030	2163035	50 %	50 %	0 %	0 %	254557200
42432	NC_012984	TGG	2	6	2163044	2163049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557200
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42444	NC_012984	GC	3	6	2163807	2163812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42445	NC_012984	AAT	2	6	2163822	2163827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42447	NC_012984	AAT	2	6	2163874	2163879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42448	NC_012984	AGATT	2	10	2164062	2164071	40 %	40 %	20 %	0 %	254557201
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42452	NC_012984	CGC	2	6	2164240	2164245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557201
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42456	NC_012984	ACAG	2	8	2164541	2164548	50 %	0 %	25 %	25 %	254557201
42457	NC_012984	TTG	2	6	2164738	2164743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557201
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42460	NC_012984	GA	3	6	2164887	2164892	50 %	0 %	50 %	0 %	254557201
42461	NC_012984	AAT	2	6	2164923	2164928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557201
42462	NC_012984	CCAA	2	8	2164932	2164939	50 %	0 %	0 %	50 %	254557201
42463	NC_012984	TCG	2	6	2164965	2164970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557201
42464	NC_012984	TCA	2	6	2164973	2164978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557201
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42466	NC_012984	GAT	2	6	2165020	2165025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557201
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42468	NC_012984	TGA	2	6	2165055	2165060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557201
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42470	NC_012984	ATT	2	6	2165134	2165139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557201
42471	NC_012984	CATC	2	8	2165187	2165194	25 %	25 %	0 %	50 %	254557201
42472	NC_012984	GTT	2	6	2165217	2165222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557201
42473	NC_012984	TGT	2	6	2165526	2165531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557201
42474	NC_012984	CTT	2	6	2165716	2165721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557202
42475	NC_012984	CG	3	6	2165777	2165782	0 %	0 %	50 %	50 %	254557202
42476	NC_012984	GCG	2	6	2165795	2165800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557202
42477	NC_012984	TCAGCT	2	12	2165882	2165893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254557202
42478	NC_012984	CAT	2	6	2165913	2165918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557202
42479	NC_012984	CGT	2	6	2165943	2165948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557202
42480	NC_012984	TCGGCC	2	12	2166005	2166016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254557202
42481	NC_012984	CGT	2	6	2166022	2166027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557202
42482	NC_012984	AAT	2	6	2166042	2166047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557202
42483	NC_012984	TCA	2	6	2166125	2166130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557202
42484	NC_012984	ATTA	2	8	2166139	2166146	50 %	50 %	0 %	0 %	254557202
42485	NC_012984	CGT	2	6	2166165	2166170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557202
42486	NC_012984	CTT	2	6	2166210	2166215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42487	NC_012984	AGCA	2	8	2166242	2166249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42488	NC_012984	GTT	3	9	2166284	2166292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42489	NC_012984	T	6	6	2166291	2166296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42490	NC_012984	ATT	3	9	2166371	2166379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42491	NC_012984	AGC	2	6	2166423	2166428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42492	NC_012984	TTAG	2	8	2166473	2166480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42493	NC_012984	CCAAG	2	10	2166583	2166592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42494	NC_012984	TAA	2	6	2166789	2166794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42495	NC_012984	CGTTT	2	10	2166831	2166840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42496	NC_012984	TGCT	2	8	2166948	2166955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42497	NC_012984	ATT	2	6	2167076	2167081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42498	NC_012984	TGA	2	6	2167276	2167281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557203
42499	NC_012984	TAA	2	6	2167294	2167299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557203
42500	NC_012984	ATT	2	6	2167303	2167308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557203

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