MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012984	TGA	2	6	179130	179135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012984	GTA	2	6	179143	179148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012984	TAA	2	6	179149	179154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012984	CTAG	2	8	179155	179162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_012984	ATT	2	6	179170	179175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_012984	CGC	2	6	179346	179351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555341
3507	NC_012984	TTA	2	6	179430	179435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555341
3508	NC_012984	TA	3	6	179484	179489	50 %	50 %	0 %	0 %	254555341
3509	NC_012984	CGG	2	6	179553	179558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_012984	T	6	6	179561	179566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_012984	AGC	2	6	179590	179595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555342
3512	NC_012984	GTG	2	6	179667	179672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555342
3513	NC_012984	CTT	2	6	179676	179681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555342
3514	NC_012984	GGC	2	6	179698	179703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555342
3515	NC_012984	ACC	2	6	179749	179754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555342
3516	NC_012984	AAT	2	6	179761	179766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555342
3517	NC_012984	GAT	2	6	179824	179829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555342
3518	NC_012984	TCG	2	6	179843	179848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555342
3519	NC_012984	CGTT	2	8	179875	179882	0 %	50 %	25 %	25 %	254555342
3520	NC_012984	CTG	2	6	179889	179894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555342
3521	NC_012984	CAG	2	6	179898	179903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555342
3522	NC_012984	A	6	6	180179	180184	100 %	0 %	0 %	0 %	254555342
3523	NC_012984	ATC	2	6	180238	180243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555342
3524	NC_012984	GTC	2	6	180310	180315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555342
3525	NC_012984	CAAA	2	8	180398	180405	75 %	0 %	0 %	25 %	254555342
3526	NC_012984	ACC	2	6	180412	180417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555342
3527	NC_012984	CCT	2	6	180448	180453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_012984	TTAT	2	8	180472	180479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_012984	TAA	2	6	180480	180485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012984	TAAA	2	8	180533	180540	75 %	25 %	0 %	0 %	254555343
3531	NC_012984	TGG	2	6	180565	180570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3532	NC_012984	GTAATG	2	12	180661	180672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3533	NC_012984	CAG	2	6	180688	180693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555343
3534	NC_012984	CAA	2	6	180757	180762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555343
3535	NC_012984	TTG	2	6	180769	180774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3536	NC_012984	GTT	2	6	180817	180822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3537	NC_012984	CTC	2	6	180838	180843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555343
3538	NC_012984	GAA	2	6	180844	180849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555343
3539	NC_012984	GTT	2	6	180871	180876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3540	NC_012984	GTG	2	6	180994	180999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3541	NC_012984	CCA	3	9	181107	181115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555343
3542	NC_012984	GGCA	2	8	181144	181151	25 %	0 %	50 %	25 %	254555343
3543	NC_012984	ATA	2	6	181196	181201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3544	NC_012984	TGT	2	6	181212	181217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3545	NC_012984	GT	3	6	181229	181234	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
3546	NC_012984	AAT	2	6	181276	181281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3547	NC_012984	AGT	2	6	181313	181318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3548	NC_012984	CAG	2	6	181336	181341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555343
3549	NC_012984	TGG	2	6	181365	181370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3550	NC_012984	TGT	2	6	181419	181424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3551	NC_012984	GCTG	2	8	181432	181439	0 %	25 %	50 %	25 %	254555343
3552	NC_012984	GTG	2	6	181443	181448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3553	NC_012984	GAT	3	9	181486	181494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3554	NC_012984	TTG	2	6	181499	181504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3555	NC_012984	CGT	2	6	181597	181602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555343
3556	NC_012984	TGG	2	6	181629	181634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555343
3557	NC_012984	GGC	2	6	181876	181881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555343
3558	NC_012984	TAG	2	6	182173	182178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555343
3559	NC_012984	ATGA	2	8	182279	182286	50 %	25 %	25 %	0 %	254555343
3560	NC_012984	GTT	2	6	182292	182297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3561	NC_012984	GT	3	6	182304	182309	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
3562	NC_012984	GGTG	2	8	182318	182325	0 %	25 %	75 %	0 %	254555343
3563	NC_012984	ATTG	2	8	182392	182399	25 %	50 %	25 %	0 %	254555343
3564	NC_012984	TAA	2	6	182410	182415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555343
3565	NC_012984	GCTG	2	8	182421	182428	0 %	25 %	50 %	25 %	254555343
3566	NC_012984	CAC	2	6	182437	182442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555343
3567	NC_012984	GTT	2	6	182551	182556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555343
3568	NC_012984	GATT	2	8	182641	182648	25 %	50 %	25 %	0 %	254555343
3569	NC_012984	TCC	2	6	182685	182690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_012984	TAA	2	6	182691	182696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_012984	AGC	2	6	182712	182717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3572	NC_012984	AGCT	2	8	182723	182730	25 %	25 %	25 %	25 %	254555344
3573	NC_012984	TCAG	2	8	182737	182744	25 %	25 %	25 %	25 %	254555344
3574	NC_012984	GAC	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3575	NC_012984	TGA	2	6	182896	182901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3576	NC_012984	TAG	2	6	182924	182929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3577	NC_012984	CAG	2	6	182990	182995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3578	NC_012984	ATG	2	6	183015	183020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3579	NC_012984	TGA	2	6	183038	183043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3580	NC_012984	CGA	2	6	183059	183064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3581	NC_012984	GCG	2	6	183088	183093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555344
3582	NC_012984	TCA	2	6	183181	183186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555344
3583	NC_012984	TGA	2	6	183194	183199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3584	NC_012984	CGA	3	9	183284	183292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
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3588	NC_012984	TA	3	6	183755	183760	50 %	50 %	0 %	0 %	254555344
3589	NC_012984	CTA	2	6	183764	183769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555344
3590	NC_012984	GTTA	2	8	183774	183781	25 %	50 %	25 %	0 %	254555344
3591	NC_012984	CGA	2	6	183812	183817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555344
3592	NC_012984	TGA	2	6	183839	183844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3593	NC_012984	GAA	2	6	183900	183905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555344
3594	NC_012984	CAA	2	6	184217	184222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555344
3595	NC_012984	GTT	2	6	184260	184265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555344
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3597	NC_012984	AAT	2	6	184464	184469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555344
3598	NC_012984	CGT	2	6	184514	184519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555344
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3600	NC_012984	TGA	2	6	184556	184561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3601	NC_012984	GCG	2	6	184588	184593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555344
3602	NC_012984	TGT	2	6	184601	184606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555344
3603	NC_012984	CTT	2	6	184640	184645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555344
3604	NC_012984	GAT	2	6	184646	184651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555344
3605	NC_012984	ATA	2	6	184654	184659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555344
3606	NC_012984	ATT	2	6	184680	184685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_012984	TTTAA	2	10	184686	184695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_012984	AAT	2	6	184719	184724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_012984	AATTG	2	10	184761	184770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012984	ATATA	2	10	184817	184826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_012984	CAT	2	6	185016	185021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555345
3612	NC_012984	TGG	2	6	185161	185166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555345
3613	NC_012984	ATG	2	6	185173	185178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
3614	NC_012984	TGA	2	6	185249	185254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
3615	NC_012984	TTAT	2	8	185259	185266	25 %	75 %	0 %	0 %	254555345
3616	NC_012984	TGGA	2	8	185328	185335	25 %	25 %	50 %	0 %	254555345
3617	NC_012984	TTCGT	2	10	185402	185411	0 %	60 %	20 %	20 %	254555345
3618	NC_012984	CTA	2	6	185441	185446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555345
3619	NC_012984	GAC	2	6	185465	185470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555345
3620	NC_012984	ACC	2	6	185514	185519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555345
3621	NC_012984	TCTGG	2	10	185585	185594	0 %	40 %	40 %	20 %	254555345
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3623	NC_012984	GAT	2	6	185748	185753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555345
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3994	NC_012984	TGC	2	6	205018	205023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555357
3995	NC_012984	GAT	2	6	205204	205209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555357
3996	NC_012984	TGT	2	6	205290	205295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555357
3997	NC_012984	GC	3	6	205310	205315	0 %	0 %	50 %	50 %	254555357
3998	NC_012984	TAAG	2	8	205372	205379	50 %	25 %	25 %	0 %	254555357
3999	NC_012984	GATT	2	8	205394	205401	25 %	50 %	25 %	0 %	254555357
4000	NC_012984	CAG	2	6	205413	205418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555357

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