MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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22117	NC_012984	TGGTCG	2	12	1121125	1121136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254556225
22118	NC_012984	CAG	2	6	1121147	1121152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556225
22119	NC_012984	AG	3	6	1121176	1121181	50 %	0 %	50 %	0 %	254556225
22120	NC_012984	GC	3	6	1121182	1121187	0 %	0 %	50 %	50 %	254556225
22121	NC_012984	CAC	2	6	1121191	1121196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254556225
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22123	NC_012984	AGT	2	6	1121306	1121311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556225
22124	NC_012984	ACC	2	6	1121345	1121350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254556225
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22138	NC_012984	GCG	2	6	1121919	1121924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556225
22139	NC_012984	TGA	2	6	1121953	1121958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556225
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22151	NC_012984	CAT	2	6	1122608	1122613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556226
22152	NC_012984	CGA	2	6	1122718	1122723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556226
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22163	NC_012984	AT	3	6	1123239	1123244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22164	NC_012984	ATT	2	6	1123251	1123256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22165	NC_012984	AAT	2	6	1123271	1123276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22166	NC_012984	A	6	6	1123314	1123319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22167	NC_012984	GTT	2	6	1123374	1123379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556227
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22189	NC_012984	T	7	7	1124877	1124883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22216	NC_012984	AAT	2	6	1126722	1126727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22217	NC_012984	TGA	2	6	1126780	1126785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22218	NC_012984	GCTG	2	8	1126844	1126851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22219	NC_012984	CAAA	2	8	1126901	1126908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22220	NC_012984	ATG	2	6	1126928	1126933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22221	NC_012984	TCA	2	6	1126959	1126964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22222	NC_012984	T	6	6	1126965	1126970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22223	NC_012984	TTC	2	6	1127005	1127010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22224	NC_012984	GA	3	6	1127073	1127078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22225	NC_012984	CAAT	2	8	1127088	1127095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22226	NC_012984	CGA	2	6	1127202	1127207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556229
22227	NC_012984	AAAC	2	8	1127267	1127274	75 %	0 %	0 %	25 %	254556229
22228	NC_012984	GAC	2	6	1127332	1127337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556229
22229	NC_012984	CTG	2	6	1127418	1127423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556229
22230	NC_012984	GTG	2	6	1127513	1127518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556229
22231	NC_012984	CG	4	8	1127547	1127554	0 %	0 %	50 %	50 %	254556229
22232	NC_012984	CCG	2	6	1127628	1127633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556229
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22234	NC_012984	TTG	2	6	1127753	1127758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556229
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22351	NC_012984	GCT	2	6	1133896	1133901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556234
22352	NC_012984	TGA	2	6	1133912	1133917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556234
22353	NC_012984	CAA	2	6	1133944	1133949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556234
22354	NC_012984	CAT	2	6	1133985	1133990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556234
22355	NC_012984	ACA	2	6	1133993	1133998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556234
22356	NC_012984	ATG	2	6	1134042	1134047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556234
22357	NC_012984	A	6	6	1134059	1134064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22358	NC_012984	GT	4	8	1134065	1134072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22359	NC_012984	TGAA	2	8	1134081	1134088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22360	NC_012984	ATT	2	6	1134158	1134163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22361	NC_012984	T	6	6	1134162	1134167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22362	NC_012984	ATT	2	6	1134244	1134249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556235
22363	NC_012984	TTC	2	6	1134269	1134274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556235
22364	NC_012984	GTC	2	6	1134515	1134520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556235
22365	NC_012984	AAG	2	6	1134563	1134568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556235
22366	NC_012984	TAC	2	6	1134653	1134658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556235
22367	NC_012984	TGGT	2	8	1134673	1134680	0 %	50 %	50 %	0 %	254556235
22368	NC_012984	GCTG	2	8	1134689	1134696	0 %	25 %	50 %	25 %	254556235
22369	NC_012984	GCC	2	6	1134737	1134742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556235
22370	NC_012984	TGG	2	6	1134783	1134788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556235
22371	NC_012984	AGCT	2	8	1134813	1134820	25 %	25 %	25 %	25 %	254556235
22372	NC_012984	GCC	3	9	1134911	1134919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556235
22373	NC_012984	TGA	2	6	1134921	1134926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556235
22374	NC_012984	GTT	2	6	1134938	1134943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556235
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22376	NC_012984	CAT	2	6	1135015	1135020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556235
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22378	NC_012984	ATT	2	6	1135088	1135093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556235
22379	NC_012984	AAATGG	2	12	1135111	1135122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254556235
22380	NC_012984	AGT	2	6	1135148	1135153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556236
22381	NC_012984	GCA	2	6	1135220	1135225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556236
22382	NC_012984	CCTT	2	8	1135226	1135233	0 %	50 %	0 %	50 %	254556236
22383	NC_012984	GGC	2	6	1135254	1135259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556236
22384	NC_012984	TATTCT	2	12	1135305	1135316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254556236
22385	NC_012984	TGG	2	6	1135327	1135332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556236
22386	NC_012984	CCTC	2	8	1135384	1135391	0 %	25 %	0 %	75 %	254556236
22387	NC_012984	GCG	2	6	1135466	1135471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556236
22388	NC_012984	TCT	2	6	1135498	1135503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556236
22389	NC_012984	TATG	2	8	1135543	1135550	25 %	50 %	25 %	0 %	254556236
22390	NC_012984	TTGA	2	8	1135589	1135596	25 %	50 %	25 %	0 %	254556236
22391	NC_012984	GAA	2	6	1135825	1135830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556236
22392	NC_012984	ATT	3	9	1135919	1135927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556236
22393	NC_012984	TCT	2	6	1135956	1135961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556236
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22399	NC_012984	TTG	2	6	1136307	1136312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556237
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22403	NC_012984	CAA	2	6	1136505	1136510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556237
22404	NC_012984	TGA	2	6	1136541	1136546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556237
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22407	NC_012984	TTGG	2	8	1136603	1136610	0 %	50 %	50 %	0 %	254556237
22408	NC_012984	GATTGC	2	12	1136683	1136694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254556237
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22410	NC_012984	TGA	2	6	1136778	1136783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556237
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22414	NC_012984	CTG	2	6	1137177	1137182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556237
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22419	NC_012984	TGA	2	6	1137355	1137360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556238
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22421	NC_012984	AC	3	6	1137508	1137513	50 %	0 %	0 %	50 %	254556238
22422	NC_012984	AAG	2	6	1137515	1137520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556238
22423	NC_012984	GAT	2	6	1137644	1137649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556238
22424	NC_012984	CAAG	2	8	1137661	1137668	50 %	0 %	25 %	25 %	254556238
22425	NC_012984	GGT	2	6	1137737	1137742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556238
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22427	NC_012984	TGA	2	6	1137802	1137807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556238
22428	NC_012984	TGA	2	6	1137855	1137860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556238
22429	NC_012984	TTAT	3	12	1137889	1137900	25 %	75 %	0 %	0 %	254556238
22430	NC_012984	ATC	2	6	1137999	1138004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556238
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22432	NC_012984	ACGAA	2	10	1138092	1138101	60 %	0 %	20 %	20 %	254556238
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22434	NC_012984	TAA	2	6	1138239	1138244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22435	NC_012984	TAT	2	6	1138280	1138285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22436	NC_012984	TTAA	2	8	1138298	1138305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22437	NC_012984	ATTA	2	8	1138322	1138329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22438	NC_012984	A	6	6	1138380	1138385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22439	NC_012984	AAT	3	9	1138500	1138508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22440	NC_012984	TAA	2	6	1138514	1138519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22441	NC_012984	TAA	2	6	1138549	1138554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22442	NC_012984	A	7	7	1138573	1138579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22443	NC_012984	GAC	2	6	1138653	1138658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22444	NC_012984	T	7	7	1138689	1138695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22445	NC_012984	A	6	6	1138740	1138745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22446	NC_012984	AGGA	2	8	1138757	1138764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22447	NC_012984	CAA	2	6	1138778	1138783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556239
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22452	NC_012984	ACG	2	6	1139114	1139119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556239
22453	NC_012984	GTTTA	2	10	1139294	1139303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22454	NC_012984	TAA	2	6	1139327	1139332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22455	NC_012984	GATT	2	8	1139333	1139340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22456	NC_012984	GAT	2	6	1139400	1139405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556240
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22458	NC_012984	TTGG	2	8	1139460	1139467	0 %	50 %	50 %	0 %	254556240
22459	NC_012984	A	6	6	1139554	1139559	100 %	0 %	0 %	0 %	254556240
22460	NC_012984	AAG	2	6	1139565	1139570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556240
22461	NC_012984	GTT	2	6	1139576	1139581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556240
22462	NC_012984	G	6	6	1139626	1139631	0 %	0 %	100 %	0 %	254556240
22463	NC_012984	GAT	2	6	1139727	1139732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556240
22464	NC_012984	ATT	2	6	1139770	1139775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556240
22465	NC_012984	TGA	3	9	1139803	1139811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556240
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22467	NC_012984	A	6	6	1139966	1139971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22468	NC_012984	GCC	2	6	1140043	1140048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556241
22469	NC_012984	GCGAT	2	10	1140118	1140127	20 %	20 %	40 %	20 %	254556241
22470	NC_012984	GACGTG	2	12	1140222	1140233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254556241
22471	NC_012984	ATC	2	6	1140271	1140276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556241
22472	NC_012984	CAA	2	6	1140281	1140286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556241
22473	NC_012984	TCA	2	6	1140290	1140295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556241
22474	NC_012984	TTGAA	2	10	1140316	1140325	40 %	40 %	20 %	0 %	254556241
22475	NC_012984	AGT	2	6	1140362	1140367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556241
22476	NC_012984	CAG	2	6	1140404	1140409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556241
22477	NC_012984	ATG	3	9	1140463	1140471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556241
22478	NC_012984	CAT	2	6	1140521	1140526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556241
22479	NC_012984	GAC	2	6	1140605	1140610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556241
22480	NC_012984	CTT	2	6	1140635	1140640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556241
22481	NC_012984	GTT	2	6	1140758	1140763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556241
22482	NC_012984	CAA	2	6	1140797	1140802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556241
22483	NC_012984	GGCC	2	8	1140820	1140827	0 %	0 %	50 %	50 %	254556241
22484	NC_012984	CGATT	2	10	1140842	1140851	20 %	40 %	20 %	20 %	254556241
22485	NC_012984	TTC	2	6	1140984	1140989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556241
22486	NC_012984	TTA	2	6	1141033	1141038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556241
22487	NC_012984	TAG	2	6	1141096	1141101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556241
22488	NC_012984	CTTC	2	8	1141118	1141125	0 %	50 %	0 %	50 %	254556241
22489	NC_012984	TCG	2	6	1141156	1141161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556241
22490	NC_012984	TGA	2	6	1141327	1141332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556241
22491	NC_012984	CTT	2	6	1141344	1141349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556241
22492	NC_012984	TTC	2	6	1141377	1141382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556241
22493	NC_012984	TGACCG	2	12	1141397	1141408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254556241
22494	NC_012984	CGG	2	6	1141417	1141422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556241
22495	NC_012984	GGC	2	6	1141428	1141433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556241
22496	NC_012984	CAC	2	6	1141490	1141495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254556241
22497	NC_012984	ACC	2	6	1141533	1141538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254556241
22498	NC_012984	GAT	2	6	1141587	1141592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556241
22499	NC_012984	CTTC	2	8	1141610	1141617	0 %	50 %	0 %	50 %	254556241
22500	NC_012984	TTG	2	6	1141623	1141628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556241

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