MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012984	ATCTTT	2	12	634002	634013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254555771
12502	NC_012984	GAC	2	6	634022	634027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555771
12503	NC_012984	ATT	2	6	634092	634097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555771
12504	NC_012984	TGG	3	9	634122	634130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555771
12505	NC_012984	GGC	2	6	634136	634141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12506	NC_012984	ACTT	2	8	634147	634154	25 %	50 %	0 %	25 %	254555771
12507	NC_012984	GCG	2	6	634320	634325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12508	NC_012984	CG	3	6	634403	634408	0 %	0 %	50 %	50 %	254555771
12509	NC_012984	TGA	2	6	634448	634453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555771
12510	NC_012984	CGG	2	6	634477	634482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12511	NC_012984	TCG	2	6	634530	634535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555771
12512	NC_012984	AGC	2	6	634589	634594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555771
12513	NC_012984	GAA	2	6	634640	634645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555771
12514	NC_012984	ATT	2	6	634716	634721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555771
12515	NC_012984	ATA	2	6	634805	634810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_012984	ACG	2	6	635086	635091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555772
12517	NC_012984	GAC	2	6	635155	635160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555772
12518	NC_012984	TGT	2	6	635163	635168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555772
12519	NC_012984	T	7	7	635196	635202	0 %	100 %	0 %	0 %	254555772
12520	NC_012984	ACT	2	6	635206	635211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555772
12521	NC_012984	GGT	2	6	635213	635218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555772
12522	NC_012984	ATT	2	6	635228	635233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555772
12523	NC_012984	GAT	2	6	635249	635254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555772
12524	NC_012984	A	6	6	635277	635282	100 %	0 %	0 %	0 %	254555772
12525	NC_012984	TGG	2	6	635323	635328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555772
12526	NC_012984	GAC	2	6	635338	635343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555772
12527	NC_012984	GCTA	2	8	635458	635465	25 %	25 %	25 %	25 %	254555772
12528	NC_012984	ATT	2	6	635477	635482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555772
12529	NC_012984	ATC	2	6	635501	635506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555772
12530	NC_012984	GTT	2	6	635509	635514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555772
12531	NC_012984	CTT	2	6	635515	635520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555772
12532	NC_012984	TTCGT	2	10	635534	635543	0 %	60 %	20 %	20 %	254555772
12533	NC_012984	GCG	2	6	635564	635569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555772
12534	NC_012984	TTC	2	6	635580	635585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555772
12535	NC_012984	TTTC	2	8	635593	635600	0 %	75 %	0 %	25 %	254555772
12536	NC_012984	GTT	2	6	635632	635637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555772
12537	NC_012984	ATT	2	6	635665	635670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555772
12538	NC_012984	GAT	2	6	635752	635757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555772
12539	NC_012984	AAG	2	6	635774	635779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555772
12540	NC_012984	CAT	2	6	635801	635806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555772
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12542	NC_012984	ATTT	2	8	635887	635894	25 %	75 %	0 %	0 %	254555772
12543	NC_012984	TAT	2	6	635949	635954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555772
12544	NC_012984	TGGAT	2	10	636015	636024	20 %	40 %	40 %	0 %	254555772
12545	NC_012984	CG	3	6	636037	636042	0 %	0 %	50 %	50 %	254555772
12546	NC_012984	AAAT	2	8	636073	636080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_012984	ATT	2	6	636089	636094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_012984	TCA	2	6	636149	636154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_012984	TCA	2	6	636161	636166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_012984	CAAT	2	8	636256	636263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12551	NC_012984	ATG	2	6	636330	636335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_012984	GTTG	2	8	636344	636351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_012984	GAA	2	6	636372	636377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_012984	A	6	6	636395	636400	100 %	0 %	0 %	0 %	254555773
12555	NC_012984	TAG	2	6	636487	636492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555773
12556	NC_012984	AGT	2	6	636494	636499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555773
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12559	NC_012984	GTG	2	6	636618	636623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555773
12560	NC_012984	ATTT	2	8	636681	636688	25 %	75 %	0 %	0 %	254555773
12561	NC_012984	TGT	2	6	636742	636747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555773
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12568	NC_012984	CGA	2	6	637098	637103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555773
12569	NC_012984	CAAC	2	8	637148	637155	50 %	0 %	0 %	50 %	254555773
12570	NC_012984	GAA	2	6	637165	637170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555773
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12573	NC_012984	AT	3	6	637228	637233	50 %	50 %	0 %	0 %	254555773
12574	NC_012984	ATAA	2	8	637291	637298	75 %	25 %	0 %	0 %	254555773
12575	NC_012984	T	7	7	637327	637333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_012984	A	6	6	637371	637376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12579	NC_012984	CTG	2	6	637575	637580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555774
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12582	NC_012984	TGT	2	6	637666	637671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555774
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12585	NC_012984	ACC	2	6	637821	637826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555774
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12589	NC_012984	GTA	2	6	638115	638120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555774
12590	NC_012984	AGG	2	6	638185	638190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_012984	GTC	2	6	638221	638226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555775
12592	NC_012984	CTG	2	6	638263	638268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555775
12593	NC_012984	GCCA	2	8	638282	638289	25 %	0 %	25 %	50 %	254555775
12594	NC_012984	TGA	2	6	638297	638302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555775
12595	NC_012984	GAGT	2	8	638404	638411	25 %	25 %	50 %	0 %	254555775
12596	NC_012984	GC	3	6	638509	638514	0 %	0 %	50 %	50 %	254555775
12597	NC_012984	AATC	2	8	638515	638522	50 %	25 %	0 %	25 %	254555775
12598	NC_012984	ATT	2	6	638552	638557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555775
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12602	NC_012984	TGA	2	6	638822	638827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555775
12603	NC_012984	TGC	2	6	638846	638851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555775
12604	NC_012984	TGT	2	6	638938	638943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555775
12605	NC_012984	GTG	2	6	638956	638961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555775
12606	NC_012984	TTA	2	6	639003	639008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555775
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12610	NC_012984	GA	3	6	639199	639204	50 %	0 %	50 %	0 %	254555775
12611	NC_012984	GACT	2	8	639229	639236	25 %	25 %	25 %	25 %	254555775
12612	NC_012984	CAA	2	6	639243	639248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555775
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12615	NC_012984	GAC	2	6	639342	639347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555775
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12617	NC_012984	GCA	2	6	639397	639402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555775
12618	NC_012984	GTC	2	6	639598	639603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555776
12619	NC_012984	GGC	2	6	639617	639622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555776
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12985	NC_012984	ATCG	2	8	659049	659056	25 %	25 %	25 %	25 %	254555795
12986	NC_012984	ATT	2	6	659142	659147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555795
12987	NC_012984	ATAC	2	8	659232	659239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12988	NC_012984	A	6	6	659246	659251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12989	NC_012984	T	7	7	659280	659286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12990	NC_012984	ATG	2	6	659314	659319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12991	NC_012984	AGT	2	6	659458	659463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12992	NC_012984	TCA	2	6	659470	659475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12993	NC_012984	TAAA	3	12	659543	659554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12994	NC_012984	ATGAA	2	10	659573	659582	60 %	20 %	20 %	0 %	254555796
12995	NC_012984	TTG	2	6	659591	659596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555796
12996	NC_012984	ATC	2	6	659642	659647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555796
12997	NC_012984	TGA	2	6	659676	659681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555796
12998	NC_012984	GGA	2	6	659742	659747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555796
12999	NC_012984	ACT	2	6	659860	659865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555796
13000	NC_012984	GAC	2	6	659904	659909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555796

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