MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_012984	A	6	6	607433	607438	100 %	0 %	0 %	0 %	254555744
12003	NC_012984	ATTT	2	8	607490	607497	25 %	75 %	0 %	0 %	254555744
12004	NC_012984	ATTA	2	8	607509	607516	50 %	50 %	0 %	0 %	254555744
12005	NC_012984	ATT	2	6	607663	607668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555745
12006	NC_012984	GGA	2	6	607695	607700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555745
12007	NC_012984	ATT	2	6	607720	607725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555745
12008	NC_012984	AGT	2	6	607829	607834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555746
12009	NC_012984	TTG	2	6	607929	607934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555746
12010	NC_012984	AAG	2	6	608004	608009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555746
12011	NC_012984	CTGCAA	2	12	608046	608057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254555746
12012	NC_012984	TGT	2	6	608080	608085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555746
12013	NC_012984	GGT	2	6	608165	608170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555746
12014	NC_012984	GTTT	2	8	608175	608182	0 %	75 %	25 %	0 %	254555746
12015	NC_012984	T	6	6	608180	608185	0 %	100 %	0 %	0 %	254555746
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12017	NC_012984	TGGTT	2	10	608374	608383	0 %	60 %	40 %	0 %	254555746
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12019	NC_012984	TA	3	6	608501	608506	50 %	50 %	0 %	0 %	254555746
12020	NC_012984	TGG	2	6	608548	608553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555746
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12042	NC_012984	TTC	2	6	609855	609860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_012984	ATT	2	6	609935	609940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_012984	CTA	2	6	609999	610004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12047	NC_012984	GTA	2	6	610102	610107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12054	NC_012984	TATGA	2	10	610575	610584	40 %	40 %	20 %	0 %	254555748
12055	NC_012984	TGC	2	6	610640	610645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555748
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12093	NC_012984	TAAA	2	8	612246	612253	75 %	25 %	0 %	0 %	254555750
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12103	NC_012984	AGG	2	6	612708	612713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_012984	ACA	2	6	612727	612732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555752
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12109	NC_012984	ATC	2	6	613380	613385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555752
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12124	NC_012984	ATG	2	6	614437	614442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12126	NC_012984	TTTTAG	2	12	614550	614561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254555754
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12239	NC_012984	TTTTG	2	10	620190	620199	0 %	80 %	20 %	0 %	254555760
12240	NC_012984	TCT	2	6	620232	620237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555760
12241	NC_012984	ATC	2	6	620242	620247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555760
12242	NC_012984	TTG	2	6	620284	620289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555760
12243	NC_012984	CAT	2	6	620296	620301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555760
12244	NC_012984	CGAC	2	8	620313	620320	25 %	0 %	25 %	50 %	254555760
12245	NC_012984	CAT	2	6	620430	620435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555760
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12254	NC_012984	TGCT	2	8	620923	620930	0 %	50 %	25 %	25 %	254555760
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12260	NC_012984	TAA	2	6	621094	621099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555760
12261	NC_012984	ATA	2	6	621224	621229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12262	NC_012984	GTT	2	6	621288	621293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12263	NC_012984	TTGG	2	8	621312	621319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_012984	TAC	2	6	621321	621326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12265	NC_012984	AGTA	2	8	621341	621348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12266	NC_012984	GAG	2	6	621382	621387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12267	NC_012984	T	6	6	621388	621393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12268	NC_012984	GTT	2	6	621405	621410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555761
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12284	NC_012984	CAAGC	2	10	622075	622084	40 %	0 %	20 %	40 %	254555761
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12288	NC_012984	GACA	2	8	622290	622297	50 %	0 %	25 %	25 %	254555762
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12315	NC_012984	AGTC	2	8	624213	624220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12322	NC_012984	ATCA	2	8	624591	624598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12323	NC_012984	GTA	2	6	624648	624653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12327	NC_012984	CGGG	2	8	624877	624884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12328	NC_012984	ATA	2	6	625033	625038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12329	NC_012984	TAT	2	6	625074	625079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12330	NC_012984	TGA	2	6	625087	625092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12331	NC_012984	TTC	2	6	625114	625119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555765
12332	NC_012984	CTTGTT	2	12	625155	625166	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254555765
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12334	NC_012984	TTC	2	6	625288	625293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555765
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12346	NC_012984	T	7	7	625860	625866	0 %	100 %	0 %	0 %	254555765
12347	NC_012984	GTA	2	6	625894	625899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555765
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12349	NC_012984	GGCCT	2	10	625927	625936	0 %	20 %	40 %	40 %	254555765
12350	NC_012984	AATG	2	8	625939	625946	50 %	25 %	25 %	0 %	254555765
12351	NC_012984	CAT	2	6	626064	626069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555765
12352	NC_012984	TCT	2	6	626145	626150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555765
12353	NC_012984	GCAC	2	8	626228	626235	25 %	0 %	25 %	50 %	254555765
12354	NC_012984	TTG	2	6	626278	626283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555765
12355	NC_012984	AGC	2	6	626438	626443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555765
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12357	NC_012984	TCG	2	6	626505	626510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555765
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12479	NC_012984	ATC	2	6	633032	633037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555771
12480	NC_012984	GGC	2	6	633116	633121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12481	NC_012984	TGT	2	6	633136	633141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555771
12482	NC_012984	ATT	2	6	633168	633173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555771
12483	NC_012984	GTG	2	6	633204	633209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555771
12484	NC_012984	GGC	2	6	633226	633231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12485	NC_012984	CTG	2	6	633258	633263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555771
12486	NC_012984	GCTA	2	8	633335	633342	25 %	25 %	25 %	25 %	254555771
12487	NC_012984	ATTG	2	8	633353	633360	25 %	50 %	25 %	0 %	254555771
12488	NC_012984	CAT	2	6	633380	633385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555771
12489	NC_012984	CAT	2	6	633418	633423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555771
12490	NC_012984	T	6	6	633443	633448	0 %	100 %	0 %	0 %	254555771
12491	NC_012984	ATT	2	6	633450	633455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555771
12492	NC_012984	TAACT	2	10	633503	633512	40 %	40 %	0 %	20 %	254555771
12493	NC_012984	GCA	2	6	633525	633530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555771
12494	NC_012984	TTC	2	6	633581	633586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555771
12495	NC_012984	GCG	2	6	633663	633668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12496	NC_012984	TCT	2	6	633703	633708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555771
12497	NC_012984	TGG	2	6	633710	633715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555771
12498	NC_012984	TTA	2	6	633731	633736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555771
12499	NC_012984	CGG	2	6	633787	633792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555771
12500	NC_012984	CTA	2	6	633812	633817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555771

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