MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012984	GCT	2	6	508146	508151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555634
10002	NC_012984	TAA	2	6	508269	508274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_012984	TTG	2	6	508312	508317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_012984	T	7	7	508374	508380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_012984	TG	3	6	508395	508400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_012984	TATAA	2	10	508489	508498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_012984	AAT	2	6	508525	508530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555635
10008	NC_012984	CCGTT	2	10	508626	508635	0 %	40 %	20 %	40 %	254555635
10009	NC_012984	AG	3	6	508726	508731	50 %	0 %	50 %	0 %	254555635
10010	NC_012984	TGA	2	6	508746	508751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555635
10011	NC_012984	AAGC	2	8	508790	508797	50 %	0 %	25 %	25 %	254555635
10012	NC_012984	CTGGA	2	10	508890	508899	20 %	20 %	40 %	20 %	254555635
10013	NC_012984	AGC	2	6	508906	508911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10014	NC_012984	TTA	2	6	508916	508921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555635
10015	NC_012984	GCG	2	6	508952	508957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555635
10016	NC_012984	AGC	2	6	509125	509130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10017	NC_012984	TAT	2	6	509156	509161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555635
10018	NC_012984	CAC	2	6	509306	509311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555635
10019	NC_012984	TAG	2	6	509328	509333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555635
10020	NC_012984	GCT	2	6	509336	509341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10021	NC_012984	TTA	2	6	509459	509464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555635
10022	NC_012984	CA	3	6	509583	509588	50 %	0 %	0 %	50 %	254555635
10023	NC_012984	GCT	2	6	509615	509620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10024	NC_012984	GAG	2	6	509702	509707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555635
10025	NC_012984	TAT	2	6	509747	509752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555635
10026	NC_012984	GC	4	8	509801	509808	0 %	0 %	50 %	50 %	254555635
10027	NC_012984	AAC	2	6	509832	509837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555635
10028	NC_012984	CGGC	2	8	509854	509861	0 %	0 %	50 %	50 %	254555635
10029	NC_012984	AGTGGG	2	12	509908	509919	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	254555635
10030	NC_012984	A	6	6	510125	510130	100 %	0 %	0 %	0 %	254555635
10031	NC_012984	GAC	2	6	510274	510279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10032	NC_012984	GAC	2	6	510289	510294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555635
10033	NC_012984	ATT	2	6	510374	510379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555635
10034	NC_012984	AGT	2	6	510380	510385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555635
10035	NC_012984	CAAG	2	8	510538	510545	50 %	0 %	25 %	25 %	254555635
10036	NC_012984	GAA	2	6	510638	510643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555635
10037	NC_012984	TGA	2	6	510646	510651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555635
10038	NC_012984	GAT	2	6	510676	510681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555635
10039	NC_012984	CAG	2	6	510718	510723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555636
10040	NC_012984	CATG	2	8	510741	510748	25 %	25 %	25 %	25 %	254555636
10041	NC_012984	CCGT	2	8	510756	510763	0 %	25 %	25 %	50 %	254555636
10042	NC_012984	ACGA	2	8	510795	510802	50 %	0 %	25 %	25 %	254555636
10043	NC_012984	GGT	2	6	510805	510810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555636
10044	NC_012984	TGATAT	2	12	510831	510842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254555636
10045	NC_012984	CTGA	2	8	510856	510863	25 %	25 %	25 %	25 %	254555636
10046	NC_012984	TGA	2	6	510867	510872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555636
10047	NC_012984	TCA	2	6	510890	510895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555636
10048	NC_012984	GTGG	2	8	510982	510989	0 %	25 %	75 %	0 %	254555636
10049	NC_012984	CGGCC	2	10	511022	511031	0 %	0 %	40 %	60 %	254555636
10050	NC_012984	CGC	2	6	511099	511104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555636
10051	NC_012984	AATTA	2	10	511131	511140	60 %	40 %	0 %	0 %	254555636
10052	NC_012984	GACC	2	8	511391	511398	25 %	0 %	25 %	50 %	254555637
10053	NC_012984	TGA	2	6	511415	511420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555637
10054	NC_012984	AT	3	6	511475	511480	50 %	50 %	0 %	0 %	254555637
10055	NC_012984	GTG	2	6	511509	511514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555637
10056	NC_012984	ATC	2	6	511576	511581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555637
10057	NC_012984	TGG	2	6	511610	511615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555637
10058	NC_012984	ATA	2	6	511639	511644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555637
10059	NC_012984	CGC	2	6	511649	511654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555637
10060	NC_012984	CAT	2	6	511703	511708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555637
10061	NC_012984	ATG	2	6	511795	511800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555637
10062	NC_012984	GCG	2	6	511815	511820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555637
10063	NC_012984	GAT	2	6	511826	511831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555637
10064	NC_012984	AATTA	2	10	511946	511955	60 %	40 %	0 %	0 %	254555637
10065	NC_012984	GAA	2	6	511968	511973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555637
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10069	NC_012984	GAT	3	9	512291	512299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555637
10070	NC_012984	ATGA	2	8	512403	512410	50 %	25 %	25 %	0 %	254555637
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10072	NC_012984	GC	3	6	512750	512755	0 %	0 %	50 %	50 %	254555638
10073	NC_012984	GTA	2	6	512763	512768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555638
10074	NC_012984	CTG	2	6	512832	512837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555638
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10081	NC_012984	GTA	2	6	513063	513068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555638
10082	NC_012984	GCT	2	6	513089	513094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555638
10083	NC_012984	GCT	2	6	513127	513132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555638
10084	NC_012984	GTG	2	6	513237	513242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555638
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10086	NC_012984	T	6	6	513420	513425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_012984	TCT	2	6	513509	513514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_012984	TA	3	6	513526	513531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_012984	CTTTT	2	10	513574	513583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10090	NC_012984	AAT	2	6	513597	513602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012984	ATT	2	6	513672	513677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555639
10092	NC_012984	CATTTG	2	12	513775	513786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254555639
10093	NC_012984	ATT	2	6	513805	513810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555639
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10095	NC_012984	TGGT	2	8	513935	513942	0 %	50 %	50 %	0 %	254555639
10096	NC_012984	AAGAT	2	10	513944	513953	60 %	20 %	20 %	0 %	254555639
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10102	NC_012984	TAAA	2	8	514189	514196	75 %	25 %	0 %	0 %	254555639
10103	NC_012984	CAA	2	6	514248	514253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555639
10104	NC_012984	CAG	2	6	514278	514283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555639
10105	NC_012984	GCT	2	6	514298	514303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555639
10106	NC_012984	AAT	2	6	514314	514319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555639
10107	NC_012984	TGG	2	6	514359	514364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555639
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10109	NC_012984	T	6	6	514377	514382	0 %	100 %	0 %	0 %	254555639
10110	NC_012984	TGC	2	6	514402	514407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555639
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10113	NC_012984	CTTT	2	8	514559	514566	0 %	75 %	0 %	25 %	254555639
10114	NC_012984	ATA	2	6	514628	514633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555639
10115	NC_012984	GAT	2	6	514653	514658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555639
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10118	NC_012984	ATTTT	2	10	514829	514838	20 %	80 %	0 %	0 %	254555639
10119	NC_012984	T	6	6	514835	514840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10121	NC_012984	A	6	6	514877	514882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_012984	GAT	2	6	521012	521017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_012984	GAA	2	6	521018	521023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_012984	ATG	2	6	521087	521092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_012984	TTG	2	6	521231	521236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10277	NC_012984	GTA	2	6	522110	522115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10337	NC_012984	AGG	2	6	525354	525359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10365	NC_012984	GTGG	2	8	526712	526719	0 %	25 %	75 %	0 %	254555658
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