MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52119	NC_012984	TGA	2	6	2659955	2659960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557639
52120	NC_012984	CTAATA	2	12	2660067	2660078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254557639
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52123	NC_012984	AAC	2	6	2660250	2660255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52124	NC_012984	CA	3	6	2660267	2660272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52125	NC_012984	A	6	6	2660272	2660277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52126	NC_012984	AACCTA	2	12	2660309	2660320	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52127	NC_012984	ATTA	2	8	2660326	2660333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52128	NC_012984	ATC	2	6	2660334	2660339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52129	NC_012984	TCA	2	6	2660438	2660443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557640
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52131	NC_012984	ATC	2	6	2660774	2660779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557640
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52145	NC_012984	T	6	6	2661446	2661451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52146	NC_012984	GTTA	2	8	2661456	2661463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52147	NC_012984	TAAA	2	8	2661534	2661541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52151	NC_012984	ATT	2	6	2661807	2661812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52152	NC_012984	AGT	2	6	2661881	2661886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557641
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52209	NC_012984	TA	3	6	2664363	2664368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52210	NC_012984	CGT	3	9	2664433	2664441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557644
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52221	NC_012984	ACTA	2	8	2665133	2665140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52222	NC_012984	CAA	2	6	2665147	2665152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557645
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52230	NC_012984	CGT	2	6	2665540	2665545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557646
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52233	NC_012984	TAT	2	6	2665680	2665685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557646
52234	NC_012984	ACT	2	6	2665714	2665719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557646
52235	NC_012984	GACC	2	8	2665843	2665850	25 %	0 %	25 %	50 %	254557646
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52357	NC_012984	TTA	2	6	2672540	2672545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557655
52358	NC_012984	TGG	2	6	2672547	2672552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557655
52359	NC_012984	AC	3	6	2672571	2672576	50 %	0 %	0 %	50 %	254557655
52360	NC_012984	CCAA	2	8	2672591	2672598	50 %	0 %	0 %	50 %	254557655
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52367	NC_012984	CTG	2	6	2673035	2673040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557655
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52379	NC_012984	T	6	6	2673804	2673809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52380	NC_012984	TAAA	2	8	2673822	2673829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52462	NC_012984	TTTA	2	8	2678574	2678581	25 %	75 %	0 %	0 %	254557657
52463	NC_012984	TAA	2	6	2678606	2678611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557657
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52468	NC_012984	ACCAC	2	10	2678797	2678806	40 %	0 %	0 %	60 %	254557657
52469	NC_012984	TTG	2	6	2678918	2678923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557657
52470	NC_012984	CAC	2	6	2678982	2678987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557657
52471	NC_012984	CAT	2	6	2679218	2679223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557657
52472	NC_012984	GCC	2	6	2679265	2679270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557657
52473	NC_012984	GCA	2	6	2679397	2679402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557657
52474	NC_012984	TTA	2	6	2679415	2679420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557657
52475	NC_012984	ACT	2	6	2679504	2679509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557657
52476	NC_012984	GTC	2	6	2679520	2679525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557657
52477	NC_012984	GTT	2	6	2679556	2679561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557657
52478	NC_012984	TCG	2	6	2679619	2679624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557657
52479	NC_012984	TAGCCG	2	12	2679626	2679637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254557657
52480	NC_012984	CAC	2	6	2679638	2679643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557657
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52482	NC_012984	ACT	2	6	2679669	2679674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557657
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52484	NC_012984	CCA	2	6	2679863	2679868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557657
52485	NC_012984	CCG	2	6	2679933	2679938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557657
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52489	NC_012984	ATT	2	6	2680056	2680061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52490	NC_012984	CAT	2	6	2680091	2680096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52491	NC_012984	TCC	2	6	2680151	2680156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52492	NC_012984	TAT	2	6	2680162	2680167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52493	NC_012984	CATA	2	8	2680223	2680230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52494	NC_012984	A	6	6	2680249	2680254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52495	NC_012984	T	6	6	2680267	2680272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52496	NC_012984	GAAA	2	8	2680288	2680295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52497	NC_012984	TG	3	6	2680304	2680309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52498	NC_012984	TAA	2	6	2680325	2680330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52499	NC_012984	ATCA	2	8	2680339	2680346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52500	NC_012984	TTA	2	6	2680347	2680352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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