MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_012984	ATA	2	6	2601082	2601087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51003	NC_012984	CTT	2	6	2601091	2601096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51004	NC_012984	CA	3	6	2601120	2601125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51005	NC_012984	CAAT	2	8	2601162	2601169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51006	NC_012984	CAA	2	6	2601238	2601243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557591
51007	NC_012984	AGT	2	6	2601374	2601379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557591
51008	NC_012984	CAC	2	6	2601385	2601390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557591
51009	NC_012984	CAA	2	6	2601460	2601465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557591
51010	NC_012984	AAC	2	6	2601470	2601475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557591
51011	NC_012984	CCA	2	6	2601485	2601490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557591
51012	NC_012984	GTT	2	6	2601523	2601528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557591
51013	NC_012984	GTCAAC	2	12	2601563	2601574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254557591
51014	NC_012984	ATAG	2	8	2601633	2601640	50 %	25 %	25 %	0 %	254557591
51015	NC_012984	A	6	6	2601669	2601674	100 %	0 %	0 %	0 %	254557591
51016	NC_012984	CCA	2	6	2601742	2601747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557591
51017	NC_012984	GGC	2	6	2601763	2601768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557591
51018	NC_012984	CAC	2	6	2601796	2601801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557591
51019	NC_012984	ATA	2	6	2601930	2601935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557591
51020	NC_012984	ATA	2	6	2601980	2601985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557591
51021	NC_012984	TAA	2	6	2601996	2602001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557591
51022	NC_012984	AATA	2	8	2602017	2602024	75 %	25 %	0 %	0 %	254557591
51023	NC_012984	GATT	2	8	2602126	2602133	25 %	50 %	25 %	0 %	254557591
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51025	NC_012984	CAAC	2	8	2602209	2602216	50 %	0 %	0 %	50 %	254557591
51026	NC_012984	TGC	2	6	2602238	2602243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557591
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51028	NC_012984	TAACTG	2	12	2602300	2602311	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254557591
51029	NC_012984	ATC	2	6	2602312	2602317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557591
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51032	NC_012984	TGG	2	6	2602475	2602480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557592
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51034	NC_012984	A	6	6	2602719	2602724	100 %	0 %	0 %	0 %	254557592
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51037	NC_012984	TCA	2	6	2602770	2602775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557592
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51050	NC_012984	GTA	2	6	2603275	2603280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557592
51051	NC_012984	GCT	2	6	2603321	2603326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557592
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51054	NC_012984	CTG	2	6	2603500	2603505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557592
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51100	NC_012984	CAAT	2	8	2605971	2605978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51101	NC_012984	ATATC	2	10	2605979	2605988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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51104	NC_012984	TG	3	6	2606026	2606031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51105	NC_012984	AAT	2	6	2606037	2606042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51107	NC_012984	TAA	2	6	2606101	2606106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51108	NC_012984	TAA	2	6	2606141	2606146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51109	NC_012984	TCT	2	6	2606214	2606219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51110	NC_012984	TGA	2	6	2606224	2606229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51117	NC_012984	TCG	3	9	2606460	2606468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557595
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51227	NC_012984	A	6	6	2612025	2612030	100 %	0 %	0 %	0 %	254557600
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51235	NC_012984	ACA	2	6	2612555	2612560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51236	NC_012984	CGC	2	6	2612574	2612579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51237	NC_012984	TAAT	2	8	2612609	2612616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51238	NC_012984	ATT	2	6	2612642	2612647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51239	NC_012984	ATTCG	2	10	2612657	2612666	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51240	NC_012984	TTA	2	6	2612705	2612710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51241	NC_012984	GCG	2	6	2612877	2612882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557601
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51252	NC_012984	AAC	2	6	2613487	2613492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557601
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51255	NC_012984	GCT	2	6	2613570	2613575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557601
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51264	NC_012984	ATT	2	6	2613960	2613965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51268	NC_012984	CAGC	2	8	2614159	2614166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51269	NC_012984	TAGT	2	8	2614209	2614216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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51273	NC_012984	TCAA	2	8	2614462	2614469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51347	NC_012984	TGAT	2	8	2618761	2618768	25 %	50 %	25 %	0 %	254557604
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51354	NC_012984	TAA	2	6	2618997	2619002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557604
51355	NC_012984	TGT	2	6	2619109	2619114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51356	NC_012984	T	6	6	2619134	2619139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51357	NC_012984	CCCA	2	8	2619146	2619153	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51358	NC_012984	CTA	2	6	2619158	2619163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51359	NC_012984	TTA	2	6	2619222	2619227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51360	NC_012984	ACG	2	6	2619270	2619275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51361	NC_012984	TAA	2	6	2619303	2619308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51362	NC_012984	ATC	2	6	2619415	2619420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51363	NC_012984	ATC	2	6	2619485	2619490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557605
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51374	NC_012984	TTC	2	6	2619979	2619984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557605
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51389	NC_012984	TAA	2	6	2620978	2620983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557605
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51427	NC_012984	GTC	2	6	2622833	2622838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557605
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51453	NC_012984	AAT	2	6	2624409	2624414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51454	NC_012984	CTAA	2	8	2624478	2624485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51455	NC_012984	T	6	6	2624517	2624522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51456	NC_012984	CAAT	2	8	2624529	2624536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51457	NC_012984	A	6	6	2624618	2624623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51458	NC_012984	A	6	6	2624708	2624713	100 %	0 %	0 %	0 %	254557607
51459	NC_012984	AAT	2	6	2624790	2624795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557607
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51461	NC_012984	TGT	2	6	2624930	2624935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557607
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51463	NC_012984	CAATA	2	10	2625022	2625031	60 %	20 %	0 %	20 %	254557608
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51467	NC_012984	TG	3	6	2625182	2625187	0 %	50 %	50 %	0 %	254557608
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51471	NC_012984	CAC	2	6	2625329	2625334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557608
51472	NC_012984	GGCA	2	8	2625452	2625459	25 %	0 %	50 %	25 %	254557608
51473	NC_012984	TGG	2	6	2625576	2625581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557608
51474	NC_012984	TAA	2	6	2625584	2625589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557608
51475	NC_012984	CAT	2	6	2625625	2625630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557608
51476	NC_012984	TTA	2	6	2625645	2625650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557608
51477	NC_012984	TGAC	2	8	2625718	2625725	25 %	25 %	25 %	25 %	254557608
51478	NC_012984	AAT	2	6	2625749	2625754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557608
51479	NC_012984	A	6	6	2625764	2625769	100 %	0 %	0 %	0 %	254557608
51480	NC_012984	TAA	2	6	2625779	2625784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557608
51481	NC_012984	A	6	6	2625816	2625821	100 %	0 %	0 %	0 %	254557608
51482	NC_012984	CGG	2	6	2625823	2625828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557608
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51484	NC_012984	GCA	2	6	2625883	2625888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557608
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51486	NC_012984	CTA	2	6	2626009	2626014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557608
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51489	NC_012984	CA	3	6	2626100	2626105	50 %	0 %	0 %	50 %	254557608
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51491	NC_012984	ATG	2	6	2626206	2626211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557608
51492	NC_012984	ACA	2	6	2626255	2626260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51493	NC_012984	CCG	2	6	2626269	2626274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51494	NC_012984	CTG	2	6	2626300	2626305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51495	NC_012984	ACC	2	6	2626314	2626319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51496	NC_012984	TCA	2	6	2626320	2626325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51497	NC_012984	TAA	2	6	2626421	2626426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51498	NC_012984	TTA	3	9	2626440	2626448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51499	NC_012984	ATT	2	6	2626449	2626454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51500	NC_012984	A	7	7	2626458	2626464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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