MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50009	NC_012984	GAT	2	6	2553913	2553918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557545
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50118	NC_012984	CAT	2	6	2559143	2559148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557549
50119	NC_012984	CGT	2	6	2559261	2559266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557549
50120	NC_012984	CGT	2	6	2559282	2559287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557549
50121	NC_012984	AT	3	6	2559364	2559369	50 %	50 %	0 %	0 %	254557549
50122	NC_012984	TTC	2	6	2559492	2559497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557549
50123	NC_012984	TTGC	2	8	2559500	2559507	0 %	50 %	25 %	25 %	254557549
50124	NC_012984	AAC	2	6	2559556	2559561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557549
50125	NC_012984	AT	3	6	2559651	2559656	50 %	50 %	0 %	0 %	254557549
50126	NC_012984	GTA	2	6	2559711	2559716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557549
50127	NC_012984	TTA	2	6	2559718	2559723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557549
50128	NC_012984	TTGTCG	2	12	2559737	2559748	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	254557549
50129	NC_012984	AGC	2	6	2559806	2559811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557549
50130	NC_012984	C	6	6	2559862	2559867	0 %	0 %	0 %	100 %	254557550
50131	NC_012984	TAA	2	6	2559899	2559904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557550
50132	NC_012984	ATA	2	6	2559938	2559943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557550
50133	NC_012984	TTG	2	6	2560070	2560075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557550
50134	NC_012984	CGT	2	6	2560079	2560084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557550
50135	NC_012984	GTTT	2	8	2560089	2560096	0 %	75 %	25 %	0 %	254557550
50136	NC_012984	CGA	2	6	2560133	2560138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557550
50137	NC_012984	AGC	2	6	2560154	2560159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557550
50138	NC_012984	GATG	2	8	2560166	2560173	25 %	25 %	50 %	0 %	254557550
50139	NC_012984	TAA	2	6	2560187	2560192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557550
50140	NC_012984	T	6	6	2560242	2560247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50141	NC_012984	CTA	2	6	2560254	2560259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50142	NC_012984	GCC	2	6	2560324	2560329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557551
50143	NC_012984	CTT	2	6	2560331	2560336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557551
50144	NC_012984	ACC	2	6	2560405	2560410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557551
50145	NC_012984	ATC	2	6	2560427	2560432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557551
50146	NC_012984	GGC	2	6	2560463	2560468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557551
50147	NC_012984	TGT	2	6	2560510	2560515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557551
50148	NC_012984	TGTT	2	8	2560557	2560564	0 %	75 %	25 %	0 %	254557551
50149	NC_012984	CGT	2	6	2560586	2560591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50150	NC_012984	ACG	2	6	2560629	2560634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50151	NC_012984	CGT	2	6	2560661	2560666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50152	NC_012984	ATC	2	6	2560686	2560691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557551
50153	NC_012984	CTG	2	6	2560693	2560698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50154	NC_012984	CAC	2	6	2560715	2560720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557551
50155	NC_012984	CAG	2	6	2560747	2560752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50156	NC_012984	CAC	2	6	2560811	2560816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557551
50157	NC_012984	CTTCA	2	10	2560850	2560859	20 %	40 %	0 %	40 %	254557551
50158	NC_012984	ACCA	2	8	2560891	2560898	50 %	0 %	0 %	50 %	254557551
50159	NC_012984	CGT	2	6	2560982	2560987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557551
50160	NC_012984	CAT	2	6	2561035	2561040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557551
50161	NC_012984	GCC	2	6	2561072	2561077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557551
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50163	NC_012984	CTGCC	2	10	2561165	2561174	0 %	20 %	20 %	60 %	254557551
50164	NC_012984	A	6	6	2561189	2561194	100 %	0 %	0 %	0 %	254557551
50165	NC_012984	ATT	2	6	2561252	2561257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557551
50166	NC_012984	ACC	2	6	2561289	2561294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557551
50167	NC_012984	ATC	2	6	2561310	2561315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557551
50168	NC_012984	ACC	2	6	2561332	2561337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557551
50169	NC_012984	CAT	2	6	2561339	2561344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557551
50170	NC_012984	ATT	2	6	2561352	2561357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557551
50171	NC_012984	C	6	6	2561362	2561367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50172	NC_012984	ATT	2	6	2561372	2561377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50173	NC_012984	TTAAT	2	10	2561422	2561431	40 %	60 %	0 %	0 %	254557552
50174	NC_012984	CTG	2	6	2561435	2561440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557552
50175	NC_012984	ATG	2	6	2561441	2561446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557552
50176	NC_012984	GCC	2	6	2561485	2561490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557552
50177	NC_012984	ACG	2	6	2561500	2561505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557552
50178	NC_012984	CAAG	2	8	2561528	2561535	50 %	0 %	25 %	25 %	254557552
50179	NC_012984	GCT	2	6	2561566	2561571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557552
50180	NC_012984	ACC	2	6	2561673	2561678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557552
50181	NC_012984	GAA	2	6	2561707	2561712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557552
50182	NC_012984	CGTTGC	2	12	2562087	2562098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557552
50183	NC_012984	TCG	2	6	2562101	2562106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557552
50184	NC_012984	CTA	2	6	2562194	2562199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557552
50185	NC_012984	T	6	6	2562201	2562206	0 %	100 %	0 %	0 %	254557552
50186	NC_012984	TAA	2	6	2562251	2562256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50187	NC_012984	CAA	2	6	2562271	2562276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50188	NC_012984	GCT	2	6	2562298	2562303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50189	NC_012984	ATCA	2	8	2562323	2562330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50190	NC_012984	T	6	6	2562369	2562374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50191	NC_012984	TCA	2	6	2562378	2562383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50192	NC_012984	A	6	6	2562394	2562399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50193	NC_012984	ACA	2	6	2562430	2562435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50194	NC_012984	TAA	2	6	2562437	2562442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50195	NC_012984	AAC	2	6	2562443	2562448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50196	NC_012984	TAA	3	9	2562469	2562477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50197	NC_012984	T	8	8	2562478	2562485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50198	NC_012984	TTC	2	6	2562510	2562515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50199	NC_012984	TAT	2	6	2562544	2562549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50200	NC_012984	TG	3	6	2562563	2562568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50201	NC_012984	TAA	2	6	2562589	2562594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50202	NC_012984	ACT	2	6	2562613	2562618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50203	NC_012984	TAGC	2	8	2562655	2562662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50204	NC_012984	A	8	8	2562719	2562726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50205	NC_012984	ATC	2	6	2562740	2562745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50206	NC_012984	T	6	6	2562753	2562758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50207	NC_012984	CA	3	6	2562764	2562769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50208	NC_012984	CAC	2	6	2562774	2562779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50209	NC_012984	AAT	2	6	2562826	2562831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50210	NC_012984	GCC	2	6	2562840	2562845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50211	NC_012984	CTG	3	9	2562879	2562887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557553
50212	NC_012984	CGG	2	6	2562906	2562911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557553
50213	NC_012984	ATG	2	6	2563039	2563044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557553
50214	NC_012984	ACC	3	9	2563046	2563054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557553
50215	NC_012984	ATT	2	6	2563114	2563119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557553
50216	NC_012984	ATG	2	6	2563124	2563129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557553
50217	NC_012984	GTA	2	6	2563158	2563163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557553
50218	NC_012984	TGC	2	6	2563216	2563221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557553
50219	NC_012984	CCG	2	6	2563233	2563238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557553
50220	NC_012984	CGT	2	6	2563258	2563263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557553
50221	NC_012984	AGTA	3	12	2563267	2563278	50 %	25 %	25 %	0 %	254557553
50222	NC_012984	TTC	2	6	2563400	2563405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557553
50223	NC_012984	TCG	2	6	2563428	2563433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557553
50224	NC_012984	AAC	2	6	2563444	2563449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557553
50225	NC_012984	GTG	2	6	2563458	2563463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557553
50226	NC_012984	TAA	2	6	2563527	2563532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557554
50227	NC_012984	CGT	2	6	2563635	2563640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557554
50228	NC_012984	TGAT	2	8	2563648	2563655	25 %	50 %	25 %	0 %	254557554
50229	NC_012984	TGA	2	6	2563661	2563666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557554
50230	NC_012984	TAA	2	6	2563682	2563687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557554
50231	NC_012984	TGT	2	6	2563771	2563776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557554
50232	NC_012984	CAC	2	6	2563778	2563783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557554
50233	NC_012984	TTC	2	6	2563816	2563821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557554
50234	NC_012984	AGT	2	6	2563832	2563837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557554
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50236	NC_012984	ACAG	2	8	2563915	2563922	50 %	0 %	25 %	25 %	254557554
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50474	NC_012984	GCC	2	6	2575324	2575329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557567
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50477	NC_012984	TCA	2	6	2575459	2575464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557568
50478	NC_012984	TCA	2	6	2575570	2575575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557568
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