MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 66494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65003	NC_012488	CTG	3	9	2846870	2846878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225341
65004	NC_012488	CAAT	2	8	2846917	2846924	50 %	25 %	0 %	25 %	226225341
65005	NC_012488	ATC	2	6	2846940	2846945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225341
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65008	NC_012488	T	6	6	2847065	2847070	0 %	100 %	0 %	0 %	226225341
65009	NC_012488	CAT	2	6	2847107	2847112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225341
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65012	NC_012488	GTC	2	6	2847241	2847246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225341
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65113	NC_012488	TGATT	2	10	2851337	2851346	20 %	60 %	20 %	0 %	226225346
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65120	NC_012488	GCTTG	2	10	2851522	2851531	0 %	40 %	40 %	20 %	226225347
65121	NC_012488	ACA	2	6	2851592	2851597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226225347
65122	NC_012488	TAA	2	6	2851634	2851639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225347
65123	NC_012488	GT	3	6	2851736	2851741	0 %	50 %	50 %	0 %	226225347
65124	NC_012488	TA	3	6	2851770	2851775	50 %	50 %	0 %	0 %	226225347
65125	NC_012488	ATT	2	6	2851782	2851787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226225347
65126	NC_012488	CT	3	6	2851819	2851824	0 %	50 %	0 %	50 %	226225347
65127	NC_012488	TCT	2	6	2851909	2851914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225347
65128	NC_012488	TAA	2	6	2851929	2851934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225347
65129	NC_012488	TTAT	2	8	2851950	2851957	25 %	75 %	0 %	0 %	226225348
65130	NC_012488	ATT	2	6	2851969	2851974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226225348
65131	NC_012488	TCT	2	6	2852110	2852115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225348
65132	NC_012488	TCC	2	6	2852200	2852205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226225348
65133	NC_012488	TAA	2	6	2852210	2852215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225348
65134	NC_012488	CTT	2	6	2852342	2852347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225348
65135	NC_012488	CTC	2	6	2852487	2852492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226225348
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65137	NC_012488	TCC	2	6	2852612	2852617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65138	NC_012488	AAG	2	6	2852649	2852654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65139	NC_012488	TATC	2	8	2852701	2852708	25 %	50 %	0 %	25 %	226225349
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65142	NC_012488	T	7	7	2852887	2852893	0 %	100 %	0 %	0 %	226225349
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65149	NC_012488	TGC	2	6	2853167	2853172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225349
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65156	NC_012488	AGTA	2	8	2853441	2853448	50 %	25 %	25 %	0 %	226225349
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65158	NC_012488	ATT	2	6	2853578	2853583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226225349
65159	NC_012488	GTT	2	6	2853695	2853700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226225349
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65161	NC_012488	T	6	6	2853752	2853757	0 %	100 %	0 %	0 %	226225349
65162	NC_012488	TAA	2	6	2853820	2853825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225349
65163	NC_012488	AAG	2	6	2853902	2853907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226225349
65164	NC_012488	TG	3	6	2854095	2854100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65165	NC_012488	CTT	2	6	2854120	2854125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225350
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65167	NC_012488	CTT	2	6	2854180	2854185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225350
65168	NC_012488	TAA	2	6	2854192	2854197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225350
65169	NC_012488	TTA	2	6	2854221	2854226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226225350
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65171	NC_012488	ATG	2	6	2854398	2854403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226225350
65172	NC_012488	GCAA	2	8	2854442	2854449	50 %	0 %	25 %	25 %	226225350
65173	NC_012488	CGTA	2	8	2854462	2854469	25 %	25 %	25 %	25 %	226225350
65174	NC_012488	CAT	2	6	2854486	2854491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225350
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65177	NC_012488	T	6	6	2854841	2854846	0 %	100 %	0 %	0 %	226225350
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65182	NC_012488	GGT	2	6	2855160	2855165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226225351
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65186	NC_012488	CTT	2	6	2855297	2855302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225351
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65190	NC_012488	TAC	2	6	2855420	2855425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225351
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65192	NC_012488	CAA	2	6	2855531	2855536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226225351
65193	NC_012488	CTT	2	6	2855567	2855572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225351
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65195	NC_012488	T	6	6	2855613	2855618	0 %	100 %	0 %	0 %	226225351
65196	NC_012488	CAC	2	6	2855699	2855704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226225351
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65200	NC_012488	CTC	3	9	2855831	2855839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65201	NC_012488	TATCAA	2	12	2855902	2855913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65202	NC_012488	AAATGA	2	12	2855916	2855927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65203	NC_012488	A	6	6	2855968	2855973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65204	NC_012488	TAAAAA	2	12	2855986	2855997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65205	NC_012488	TTG	2	6	2856043	2856048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226225352
65206	NC_012488	TTG	2	6	2856073	2856078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226225352
65207	NC_012488	TGA	2	6	2856098	2856103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226225352
65208	NC_012488	TCT	2	6	2856124	2856129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225352
65209	NC_012488	CCG	2	6	2856166	2856171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226225352
65210	NC_012488	GCT	2	6	2856220	2856225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225352
65211	NC_012488	GAAC	2	8	2856237	2856244	50 %	0 %	25 %	25 %	226225352
65212	NC_012488	T	6	6	2856249	2856254	0 %	100 %	0 %	0 %	226225352
65213	NC_012488	ATA	2	6	2856278	2856283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225352
65214	NC_012488	T	6	6	2856432	2856437	0 %	100 %	0 %	0 %	226225352
65215	NC_012488	CTT	2	6	2856596	2856601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225352
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65217	NC_012488	T	6	6	2856629	2856634	0 %	100 %	0 %	0 %	226225352
65218	NC_012488	CATTC	2	10	2856635	2856644	20 %	40 %	0 %	40 %	226225352
65219	NC_012488	T	6	6	2856745	2856750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65220	NC_012488	GGTTT	2	10	2856797	2856806	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65221	NC_012488	AT	3	6	2856830	2856835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65222	NC_012488	ATT	2	6	2856844	2856849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65223	NC_012488	AAGTAT	2	12	2856853	2856864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65224	NC_012488	TTG	2	6	2856912	2856917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226225353
65225	NC_012488	T	7	7	2856934	2856940	0 %	100 %	0 %	0 %	226225353
65226	NC_012488	CTG	2	6	2856964	2856969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225353
65227	NC_012488	TGG	2	6	2856970	2856975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226225353
65228	NC_012488	T	7	7	2857107	2857113	0 %	100 %	0 %	0 %	226225353
65229	NC_012488	TAA	2	6	2857133	2857138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225353
65230	NC_012488	TATC	2	8	2857153	2857160	25 %	50 %	0 %	25 %	226225353
65231	NC_012488	T	6	6	2857180	2857185	0 %	100 %	0 %	0 %	226225354
65232	NC_012488	TTC	3	9	2857197	2857205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225354
65233	NC_012488	GT	3	6	2857271	2857276	0 %	50 %	50 %	0 %	226225354
65234	NC_012488	T	6	6	2857276	2857281	0 %	100 %	0 %	0 %	226225354
65235	NC_012488	CTT	3	9	2857295	2857303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226225354
65236	NC_012488	T	6	6	2857361	2857366	0 %	100 %	0 %	0 %	226225354
65237	NC_012488	GTC	2	6	2857460	2857465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226225354
65238	NC_012488	ATC	3	9	2857479	2857487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225354
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65473	NC_012488	TTAA	2	8	2867442	2867449	50 %	50 %	0 %	0 %	226225365
65474	NC_012488	A	6	6	2867448	2867453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65475	NC_012488	GGA	2	6	2867454	2867459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65476	NC_012488	TCC	2	6	2867479	2867484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65477	NC_012488	TTTTA	2	10	2867485	2867494	20 %	80 %	0 %	0 %	226225366
65478	NC_012488	T	6	6	2867501	2867506	0 %	100 %	0 %	0 %	226225366
65479	NC_012488	CAAT	2	8	2867518	2867525	50 %	25 %	0 %	25 %	226225366
65480	NC_012488	TAA	2	6	2867534	2867539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226225366
65481	NC_012488	ATC	2	6	2867604	2867609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226225366
65482	NC_012488	A	6	6	2867615	2867620	100 %	0 %	0 %	0 %	226225366
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65490	NC_012488	A	6	6	2867853	2867858	100 %	0 %	0 %	0 %	226225366
65491	NC_012488	AAG	2	6	2867968	2867973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226225366
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65493	NC_012488	AAC	2	6	2868371	2868376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226225366
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65498	NC_012488	AAGA	2	8	2868512	2868519	75 %	0 %	25 %	0 %	226225366
65499	NC_012488	CACTC	2	10	2868693	2868702	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65500	NC_012488	TAT	2	6	2868771	2868776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226225367

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