MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 66494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012488	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012488	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012488	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012488	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012488	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	226222640
7	NC_012488	A	9	9	363	371	100 %	0 %	0 %	0 %	226222640
8	NC_012488	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222640
9	NC_012488	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
10	NC_012488	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
11	NC_012488	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
12	NC_012488	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
13	NC_012488	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222640
14	NC_012488	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222640
15	NC_012488	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222640
16	NC_012488	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
17	NC_012488	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
18	NC_012488	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
19	NC_012488	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	226222640
20	NC_012488	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
21	NC_012488	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
22	NC_012488	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	226222640
23	NC_012488	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
24	NC_012488	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
25	NC_012488	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	226222640
26	NC_012488	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	226222640
27	NC_012488	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222640
28	NC_012488	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	226222640
29	NC_012488	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
30	NC_012488	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222640
31	NC_012488	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
32	NC_012488	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222640
33	NC_012488	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
34	NC_012488	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
35	NC_012488	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
36	NC_012488	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	226222640
37	NC_012488	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	226222640
38	NC_012488	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
39	NC_012488	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222640
40	NC_012488	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	226222640
41	NC_012488	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222640
42	NC_012488	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	226222640
43	NC_012488	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012488	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012488	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012488	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012488	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
48	NC_012488	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
49	NC_012488	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
50	NC_012488	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222641
51	NC_012488	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	226222641
52	NC_012488	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222641
53	NC_012488	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222641
54	NC_012488	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	226222641
55	NC_012488	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	226222641
56	NC_012488	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
57	NC_012488	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
58	NC_012488	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	226222641
59	NC_012488	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
60	NC_012488	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
61	NC_012488	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	226222641
62	NC_012488	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222641
63	NC_012488	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222641
64	NC_012488	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222641
65	NC_012488	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222641
66	NC_012488	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
67	NC_012488	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
68	NC_012488	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012488	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
70	NC_012488	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222642
71	NC_012488	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	226222642
72	NC_012488	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
73	NC_012488	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
74	NC_012488	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	226222642
75	NC_012488	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	226222642
76	NC_012488	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
77	NC_012488	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
78	NC_012488	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222642
79	NC_012488	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	226222642
80	NC_012488	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
81	NC_012488	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
82	NC_012488	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222642
83	NC_012488	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	226222642
84	NC_012488	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	226222642
85	NC_012488	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	226222642
86	NC_012488	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222642
87	NC_012488	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	226222642
88	NC_012488	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222642
89	NC_012488	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	226222642
90	NC_012488	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222642
91	NC_012488	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222642
92	NC_012488	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222642
93	NC_012488	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222642
94	NC_012488	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222642
95	NC_012488	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
96	NC_012488	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
97	NC_012488	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
98	NC_012488	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
99	NC_012488	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	226222642
100	NC_012488	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
101	NC_012488	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
102	NC_012488	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	226222642
103	NC_012488	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222642
104	NC_012488	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	226222642
105	NC_012488	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
106	NC_012488	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012488	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012488	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012488	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_012488	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012488	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012488	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012488	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012488	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	226222643
115	NC_012488	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222643
116	NC_012488	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226222643
117	NC_012488	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	226222644
118	NC_012488	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222644
119	NC_012488	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222644
120	NC_012488	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
121	NC_012488	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
122	NC_012488	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	226222644
123	NC_012488	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
124	NC_012488	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	226222644
125	NC_012488	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222644
126	NC_012488	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222644
127	NC_012488	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	226222644
128	NC_012488	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	226222644
129	NC_012488	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222644
130	NC_012488	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
131	NC_012488	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
132	NC_012488	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222644
133	NC_012488	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
134	NC_012488	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
135	NC_012488	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
136	NC_012488	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
137	NC_012488	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	226222644
138	NC_012488	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012488	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012488	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012488	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
142	NC_012488	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222645
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174	NC_012488	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222645
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185	NC_012488	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_012488	A	6	6	9377	9382	100 %	0 %	0 %	0 %	226222646
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250	NC_012488	CA	3	6	10536	10541	50 %	0 %	0 %	50 %	226222646
251	NC_012488	TGA	2	6	10548	10553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222646
252	NC_012488	AGA	2	6	10584	10589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222646
253	NC_012488	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012488	AGT	2	6	10759	10764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222647
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258	NC_012488	ATTA	2	8	10846	10853	50 %	50 %	0 %	0 %	226222647
259	NC_012488	CTA	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222647
260	NC_012488	ATTA	2	8	11020	11027	50 %	50 %	0 %	0 %	226222647
261	NC_012488	ACA	2	6	11049	11054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222647
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266	NC_012488	GAA	2	6	11492	11497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222647
267	NC_012488	TGC	2	6	11623	11628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222647
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392	NC_012488	CCAA	2	8	17506	17513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
393	NC_012488	CT	3	6	17566	17571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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402	NC_012488	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012488	T	6	6	17930	17935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_012488	A	6	6	17942	17947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_012488	T	6	6	17992	17997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_012488	AT	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_012488	A	6	6	18145	18150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012488	T	7	7	18160	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_012488	T	6	6	18190	18195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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