MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_011660	ATCAAT	2	12	658172	658183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217963937
15003	NC_011660	AAT	3	9	658181	658189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963937
15004	NC_011660	T	7	7	658205	658211	0 %	100 %	0 %	0 %	217963937
15005	NC_011660	TGC	2	6	658229	658234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963937
15006	NC_011660	TGG	2	6	658291	658296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963937
15007	NC_011660	TGC	2	6	658299	658304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963937
15008	NC_011660	ATA	2	6	658337	658342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963937
15009	NC_011660	AAT	2	6	658355	658360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963937
15010	NC_011660	TAA	2	6	658366	658371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963937
15011	NC_011660	A	7	7	658370	658376	100 %	0 %	0 %	0 %	217963937
15012	NC_011660	A	6	6	658383	658388	100 %	0 %	0 %	0 %	217963937
15013	NC_011660	T	6	6	658435	658440	0 %	100 %	0 %	0 %	217963937
15014	NC_011660	TAAA	2	8	658445	658452	75 %	25 %	0 %	0 %	217963937
15015	NC_011660	TAG	2	6	658633	658638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963937
15016	NC_011660	GAA	2	6	658650	658655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963937
15017	NC_011660	ATA	2	6	658731	658736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963937
15018	NC_011660	GTA	2	6	658757	658762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963937
15019	NC_011660	TAAT	2	8	658776	658783	50 %	50 %	0 %	0 %	217963937
15020	NC_011660	AATTT	2	10	658797	658806	40 %	60 %	0 %	0 %	217963937
15021	NC_011660	T	7	7	658821	658827	0 %	100 %	0 %	0 %	217963937
15022	NC_011660	A	8	8	658856	658863	100 %	0 %	0 %	0 %	217963937
15023	NC_011660	A	7	7	658872	658878	100 %	0 %	0 %	0 %	217963937
15024	NC_011660	A	8	8	658919	658926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_011660	AAAT	2	8	658982	658989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_011660	AACC	2	8	659018	659025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15027	NC_011660	GAC	2	6	659064	659069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_011660	ATG	2	6	659129	659134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_011660	TAG	2	6	659146	659151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_011660	ATT	2	6	659177	659182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_011660	A	6	6	659195	659200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_011660	A	6	6	659243	659248	100 %	0 %	0 %	0 %	217963939
15033	NC_011660	CGG	2	6	659259	659264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963939
15034	NC_011660	TTG	2	6	659270	659275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963939
15035	NC_011660	GCC	2	6	659284	659289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963939
15036	NC_011660	TATT	2	8	659290	659297	25 %	75 %	0 %	0 %	217963939
15037	NC_011660	TGC	2	6	659358	659363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963939
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15039	NC_011660	A	6	6	659424	659429	100 %	0 %	0 %	0 %	217963939
15040	NC_011660	GCC	2	6	659434	659439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963939
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15044	NC_011660	GTTA	2	8	659640	659647	25 %	50 %	25 %	0 %	217963939
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15050	NC_011660	GCT	2	6	660031	660036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963939
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15052	NC_011660	AGTC	2	8	660200	660207	25 %	25 %	25 %	25 %	217963939
15053	NC_011660	AT	3	6	660330	660335	50 %	50 %	0 %	0 %	217963939
15054	NC_011660	TAG	2	6	660336	660341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963939
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15058	NC_011660	T	6	6	660497	660502	0 %	100 %	0 %	0 %	217963938
15059	NC_011660	CAC	2	6	660535	660540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963938
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15061	NC_011660	CTT	2	6	660622	660627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963938
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15064	NC_011660	ATA	2	6	660789	660794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963938
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15070	NC_011660	ATA	2	6	661161	661166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963938
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15072	NC_011660	T	6	6	661205	661210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_011660	GTAA	2	8	661234	661241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_011660	A	6	6	661240	661245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_011660	AATGA	2	10	661276	661285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_011660	GAT	2	6	661378	661383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963940
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15081	NC_011660	TAC	2	6	661480	661485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963940
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15101	NC_011660	AAAG	2	8	662510	662517	75 %	0 %	25 %	0 %	217963942
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15105	NC_011660	AAAAT	2	10	662686	662695	80 %	20 %	0 %	0 %	217963942
15106	NC_011660	CAG	2	6	662812	662817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963942
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15109	NC_011660	TTG	2	6	662970	662975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963943
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15113	NC_011660	GATG	2	8	663256	663263	25 %	25 %	50 %	0 %	217963943
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15122	NC_011660	TTA	2	6	663944	663949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963943
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15486	NC_011660	AGC	2	6	680643	680648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963960
15487	NC_011660	CTG	2	6	680657	680662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963960
15488	NC_011660	TAAG	2	8	680757	680764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_011660	CGAG	2	8	681015	681022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15490	NC_011660	AATT	2	8	681084	681091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15491	NC_011660	AGAT	2	8	681099	681106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_011660	GTA	2	6	681134	681139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15493	NC_011660	AGAAC	2	10	681141	681150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15494	NC_011660	ATTTA	2	10	681177	681186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_011660	GGTG	2	8	681228	681235	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_011660	CCT	3	9	681268	681276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15497	NC_011660	T	7	7	681288	681294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_011660	TTAA	2	8	681305	681312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_011660	TGG	2	6	681342	681347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963961
15500	NC_011660	GCT	2	6	681353	681358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963961

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