MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_011660	ATC	2	6	569829	569834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963848
13003	NC_011660	AAAG	2	8	569844	569851	75 %	0 %	25 %	0 %	217963848
13004	NC_011660	AGA	2	6	569915	569920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963848
13005	NC_011660	TA	3	6	569923	569928	50 %	50 %	0 %	0 %	217963848
13006	NC_011660	AGT	2	6	569939	569944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963848
13007	NC_011660	CTAC	2	8	569952	569959	25 %	25 %	0 %	50 %	217963848
13008	NC_011660	AAT	2	6	569965	569970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963848
13009	NC_011660	TGGA	2	8	569987	569994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_011660	T	7	7	570011	570017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_011660	ACAA	2	8	570035	570042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_011660	ATAG	2	8	570108	570115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_011660	A	6	6	570124	570129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13018	NC_011660	A	6	6	570325	570330	100 %	0 %	0 %	0 %	217963849
13019	NC_011660	ATCA	2	8	570351	570358	50 %	25 %	0 %	25 %	217963849
13020	NC_011660	CAAT	2	8	570367	570374	50 %	25 %	0 %	25 %	217963849
13021	NC_011660	AGC	2	6	570396	570401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963849
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13027	NC_011660	GAA	2	6	570669	570674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963849
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13040	NC_011660	A	6	6	571156	571161	100 %	0 %	0 %	0 %	217963850
13041	NC_011660	A	6	6	571259	571264	100 %	0 %	0 %	0 %	217963850
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13047	NC_011660	A	6	6	571590	571595	100 %	0 %	0 %	0 %	217963851
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13061	NC_011660	AAG	2	6	572070	572075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13102	NC_011660	TCAG	2	8	574242	574249	25 %	25 %	25 %	25 %	217963854
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13109	NC_011660	TA	3	6	574474	574479	50 %	50 %	0 %	0 %	217963854
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13118	NC_011660	AATT	2	8	574722	574729	50 %	50 %	0 %	0 %	217963854
13119	NC_011660	AAAG	2	8	574785	574792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_011660	GAAT	2	8	574796	574803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13245	NC_011660	CAA	2	6	580806	580811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963861
13246	NC_011660	AT	3	6	580823	580828	50 %	50 %	0 %	0 %	217963861
13247	NC_011660	GTTG	2	8	580841	580848	0 %	50 %	50 %	0 %	217963861
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13253	NC_011660	GTG	2	6	581048	581053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963861
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13264	NC_011660	ATA	2	6	581334	581339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13265	NC_011660	TAC	2	6	581365	581370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13270	NC_011660	AAT	2	6	581730	581735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963862
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13277	NC_011660	AACA	2	8	581931	581938	75 %	0 %	0 %	25 %	217963862
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13353	NC_011660	TTCG	2	8	585287	585294	0 %	50 %	25 %	25 %	217963865
13354	NC_011660	AG	3	6	585316	585321	50 %	0 %	50 %	0 %	217963865
13355	NC_011660	CCA	2	6	585370	585375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963865
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13358	NC_011660	GT	3	6	585438	585443	0 %	50 %	50 %	0 %	217963865
13359	NC_011660	ACC	2	6	585552	585557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963865
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13361	NC_011660	T	7	7	585687	585693	0 %	100 %	0 %	0 %	217963865
13362	NC_011660	CCT	2	6	585789	585794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963866
13363	NC_011660	TAC	2	6	585810	585815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963866
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13365	NC_011660	TAC	2	6	586038	586043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963866
13366	NC_011660	TGC	2	6	586054	586059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963866
13367	NC_011660	ATC	2	6	586156	586161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963866
13368	NC_011660	AGA	2	6	586171	586176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963866
13369	NC_011660	ATC	2	6	586201	586206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963866
13370	NC_011660	CTT	2	6	586215	586220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963866
13371	NC_011660	T	6	6	586219	586224	0 %	100 %	0 %	0 %	217963866
13372	NC_011660	AGCT	2	8	586231	586238	25 %	25 %	25 %	25 %	217963866
13373	NC_011660	GCTC	2	8	586272	586279	0 %	25 %	25 %	50 %	217963866
13374	NC_011660	TTC	2	6	586294	586299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963866
13375	NC_011660	TGA	2	6	586380	586385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963866
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13380	NC_011660	CTT	2	6	586593	586598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963866
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13384	NC_011660	TCA	2	6	586736	586741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963866
13385	NC_011660	AAT	2	6	586772	586777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963866
13386	NC_011660	TGA	2	6	586824	586829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963866
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13389	NC_011660	CTT	2	6	587064	587069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963866
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13394	NC_011660	TTC	2	6	587312	587317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963866
13395	NC_011660	GAAA	2	8	587389	587396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13396	NC_011660	TTC	2	6	587401	587406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13397	NC_011660	TGT	2	6	587482	587487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963867
13398	NC_011660	CAT	2	6	587502	587507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963867
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13400	NC_011660	TTG	2	6	587547	587552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963867
13401	NC_011660	TGT	2	6	587591	587596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963867
13402	NC_011660	CTT	2	6	587645	587650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963867
13403	NC_011660	T	6	6	587658	587663	0 %	100 %	0 %	0 %	217963867
13404	NC_011660	AAC	2	6	587676	587681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963867
13405	NC_011660	CTG	2	6	587711	587716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963867
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13421	NC_011660	TAGGT	2	10	588183	588192	20 %	40 %	40 %	0 %	217963867
13422	NC_011660	TTTCGT	2	12	588197	588208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	217963867
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13426	NC_011660	ATA	2	6	588456	588461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963867
13427	NC_011660	AGCAA	2	10	588537	588546	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13428	NC_011660	GTA	2	6	588558	588563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13432	NC_011660	GAC	2	6	588698	588703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963868
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13434	NC_011660	GAC	2	6	588914	588919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963868
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13461	NC_011660	T	6	6	590745	590750	0 %	100 %	0 %	0 %	217963869
13462	NC_011660	TCG	2	6	590770	590775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963869
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13465	NC_011660	TCT	2	6	590816	590821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963870
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13472	NC_011660	CAA	2	6	591129	591134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963870
13473	NC_011660	ACC	2	6	591172	591177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963870
13474	NC_011660	ACG	2	6	591203	591208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963870
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13476	NC_011660	CCA	2	6	591311	591316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963870
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13480	NC_011660	TGGA	2	8	591478	591485	25 %	25 %	50 %	0 %	217963870
13481	NC_011660	CCA	2	6	591491	591496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963870
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13485	NC_011660	TGCAAG	2	12	591655	591666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217963870
13486	NC_011660	TGTA	2	8	591667	591674	25 %	50 %	25 %	0 %	217963870
13487	NC_011660	ACC	2	6	591691	591696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963870
13488	NC_011660	CAT	2	6	591720	591725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963870
13489	NC_011660	TAA	2	6	591741	591746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963870
13490	NC_011660	T	6	6	591766	591771	0 %	100 %	0 %	0 %	217963870
13491	NC_011660	TAA	2	6	591804	591809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963870
13492	NC_011660	TGC	2	6	591975	591980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963870
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