MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 58979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010999	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010999	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010999	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
5	NC_010999	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	191636825
6	NC_010999	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	191636825
7	NC_010999	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636825
8	NC_010999	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	191636825
9	NC_010999	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
10	NC_010999	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
11	NC_010999	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636825
12	NC_010999	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	191636825
13	NC_010999	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636825
14	NC_010999	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
15	NC_010999	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636825
16	NC_010999	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	191636825
17	NC_010999	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
18	NC_010999	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
19	NC_010999	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	191636825
20	NC_010999	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	191636825
21	NC_010999	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
22	NC_010999	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	191636825
23	NC_010999	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	191636825
24	NC_010999	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	191636825
25	NC_010999	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
26	NC_010999	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	191636825
27	NC_010999	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	191636825
28	NC_010999	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
29	NC_010999	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	191636825
30	NC_010999	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	191636825
31	NC_010999	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636825
32	NC_010999	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	191636825
33	NC_010999	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
34	NC_010999	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010999	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010999	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010999	AT	4	8	1573	1580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010999	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010999	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636826
40	NC_010999	AAC	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
41	NC_010999	CAACG	2	10	1773	1782	40 %	0 %	20 %	40 %	191636826
42	NC_010999	AAT	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636826
43	NC_010999	TCA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
44	NC_010999	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
45	NC_010999	A	6	6	2258	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	191636826
46	NC_010999	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
47	NC_010999	GAA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
48	NC_010999	CAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
49	NC_010999	GCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636826
50	NC_010999	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
51	NC_010999	TCA	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
52	NC_010999	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010999	A	6	6	2773	2778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010999	AG	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010999	TGA	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010999	T	6	6	2810	2815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010999	ATA	3	9	2863	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010999	ACGT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010999	GAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010999	TAG	3	9	3009	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010999	TCC	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010999	AT	3	6	3035	3040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010999	ATA	3	9	3079	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010999	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010999	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010999	AAAAGT	2	12	3350	3361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010999	AGT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010999	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010999	GAC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010999	ACA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636827
71	NC_010999	T	6	6	3621	3626	0 %	100 %	0 %	0 %	191636827
72	NC_010999	GAG	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191636827
73	NC_010999	GAT	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636827
74	NC_010999	GGCC	2	8	3774	3781	0 %	0 %	50 %	50 %	191636827
75	NC_010999	TGC	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
76	NC_010999	ACA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
77	NC_010999	AATC	2	8	3925	3932	50 %	25 %	0 %	25 %	191636828
78	NC_010999	TCA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
79	NC_010999	AAC	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
80	NC_010999	CT	3	6	4113	4118	0 %	50 %	0 %	50 %	191636828
81	NC_010999	GCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636828
82	NC_010999	AGC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
83	NC_010999	AGC	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
84	NC_010999	ATC	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
85	NC_010999	TGAC	2	8	4345	4352	25 %	25 %	25 %	25 %	191636828
86	NC_010999	GC	4	8	4386	4393	0 %	0 %	50 %	50 %	191636828
87	NC_010999	GTT	2	6	4397	4402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
88	NC_010999	TGC	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
89	NC_010999	AGC	2	6	4552	4557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
90	NC_010999	GC	3	6	4560	4565	0 %	0 %	50 %	50 %	191636828
91	NC_010999	GAT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
92	NC_010999	GTT	2	6	4613	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
93	NC_010999	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
94	NC_010999	CAC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
95	NC_010999	TGT	2	6	4756	4761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
96	NC_010999	ACC	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
97	NC_010999	ATC	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
98	NC_010999	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
99	NC_010999	TGA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010999	AGG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010999	AAGA	2	8	5057	5064	75 %	0 %	25 %	0 %	191636829
102	NC_010999	GAAGA	2	10	5072	5081	60 %	0 %	40 %	0 %	191636829
103	NC_010999	GGC	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
104	NC_010999	ATG	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
105	NC_010999	CCAG	2	8	5109	5116	25 %	0 %	25 %	50 %	191636829
106	NC_010999	AGC	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
107	NC_010999	CAT	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
108	NC_010999	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
109	NC_010999	GCTG	2	8	5239	5246	0 %	25 %	50 %	25 %	191636829
110	NC_010999	TTGAAG	2	12	5262	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
111	NC_010999	ATA	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636829
112	NC_010999	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
113	NC_010999	CGG	4	12	5398	5409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
114	NC_010999	GTG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
115	NC_010999	TAC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
116	NC_010999	GGCAC	2	10	5558	5567	20 %	0 %	40 %	40 %	191636829
117	NC_010999	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
118	NC_010999	ACC	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636829
119	NC_010999	GC	3	6	5716	5721	0 %	0 %	50 %	50 %	191636829
120	NC_010999	GGC	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
121	NC_010999	A	6	6	5792	5797	100 %	0 %	0 %	0 %	191636829
122	NC_010999	GACAA	2	10	5832	5841	60 %	0 %	20 %	20 %	191636829
123	NC_010999	TTG	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
124	NC_010999	CAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
125	NC_010999	GGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
126	NC_010999	GAT	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
127	NC_010999	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
128	NC_010999	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
129	NC_010999	GGT	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
130	NC_010999	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
131	NC_010999	CCTG	2	8	6304	6311	0 %	25 %	25 %	50 %	191636829
132	NC_010999	ACA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
133	NC_010999	ATT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191636829
134	NC_010999	TCG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636829
135	NC_010999	TGG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
136	NC_010999	GAA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
137	NC_010999	CCGATG	2	12	6585	6596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	191636829
138	NC_010999	TTG	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
139	NC_010999	GCC	2	6	6688	6693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
140	NC_010999	AT	3	6	6727	6732	50 %	50 %	0 %	0 %	191636829
141	NC_010999	GAA	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
142	NC_010999	GCC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
143	NC_010999	GAC	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
144	NC_010999	TGTT	2	8	6978	6985	0 %	75 %	25 %	0 %	191636829
145	NC_010999	AAC	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
146	NC_010999	GAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010999	GAT	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
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152	NC_010999	TGC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
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156	NC_010999	GTT	2	6	7542	7547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
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158	NC_010999	CGGT	2	8	7597	7604	0 %	25 %	50 %	25 %	191636830
159	NC_010999	GAC	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
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162	NC_010999	AT	3	6	7865	7870	50 %	50 %	0 %	0 %	191636830
163	NC_010999	GAAAA	2	10	7917	7926	80 %	0 %	20 %	0 %	191636830
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196	NC_010999	TTTG	2	8	9776	9783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_010999	ATC	2	6	11273	11278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636833
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234	NC_010999	TCA	2	6	11712	11717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636834
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241	NC_010999	CAT	3	9	12027	12035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636834
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247	NC_010999	CAA	2	6	12259	12264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636835
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249	NC_010999	CGT	4	12	12277	12288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636835
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251	NC_010999	AT	3	6	12321	12326	50 %	50 %	0 %	0 %	191636835
252	NC_010999	TTG	2	6	12346	12351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636835
253	NC_010999	TCT	2	6	12462	12467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636835
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255	NC_010999	AAGA	2	8	12488	12495	75 %	0 %	25 %	0 %	191636835
256	NC_010999	A	7	7	12499	12505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010999	T	7	7	12537	12543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010999	ATT	2	6	12544	12549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010999	A	6	6	12554	12559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_010999	AGA	2	6	12614	12619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010999	ATTA	2	8	12660	12667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010999	GAA	2	6	12683	12688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010999	TAG	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010999	TA	3	6	12821	12826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010999	TAA	2	6	12828	12833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010999	TGT	2	6	12843	12848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010999	GGA	2	6	12876	12881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_010999	AAG	3	9	12909	12917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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