MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 42811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_010610	GTA	2	6	2008218	2008223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156242
41002	NC_010610	GCCGT	2	10	2008264	2008273	0 %	20 %	40 %	40 %	184156242
41003	NC_010610	CTT	2	6	2008302	2008307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156242
41004	NC_010610	CAG	2	6	2008308	2008313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41005	NC_010610	GCT	2	6	2008317	2008322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41006	NC_010610	ATCG	2	8	2008434	2008441	25 %	25 %	25 %	25 %	184156242
41007	NC_010610	CAG	2	6	2008491	2008496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41008	NC_010610	AAG	2	6	2008543	2008548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156242
41009	NC_010610	TGG	2	6	2008576	2008581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156242
41010	NC_010610	GGT	2	6	2008748	2008753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156242
41011	NC_010610	CTC	2	6	2008758	2008763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156242
41012	NC_010610	TCA	2	6	2008783	2008788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156242
41013	NC_010610	GCT	2	6	2008817	2008822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41014	NC_010610	GTC	2	6	2008837	2008842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41015	NC_010610	GGT	2	6	2008949	2008954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156242
41016	NC_010610	GGC	2	6	2009013	2009018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156242
41017	NC_010610	TCG	2	6	2009221	2009226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41018	NC_010610	CGT	2	6	2009252	2009257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41019	NC_010610	TCG	2	6	2009327	2009332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41020	NC_010610	TTC	2	6	2009382	2009387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156242
41021	NC_010610	TGG	2	6	2009468	2009473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156242
41022	NC_010610	TCG	2	6	2009477	2009482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41023	NC_010610	GCC	2	6	2009485	2009490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156242
41024	NC_010610	GGT	2	6	2009529	2009534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156242
41025	NC_010610	AAG	2	6	2009551	2009556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156242
41026	NC_010610	AGC	2	6	2009617	2009622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41027	NC_010610	CAG	2	6	2009670	2009675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156242
41028	NC_010610	TCA	2	6	2009683	2009688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156242
41029	NC_010610	CCGC	2	8	2009693	2009700	0 %	0 %	25 %	75 %	184156242
41030	NC_010610	CG	3	6	2009762	2009767	0 %	0 %	50 %	50 %	184156242
41031	NC_010610	TCT	2	6	2009808	2009813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156243
41032	NC_010610	T	6	6	2009813	2009818	0 %	100 %	0 %	0 %	184156243
41033	NC_010610	AGT	2	6	2009830	2009835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156243
41034	NC_010610	GGT	2	6	2009836	2009841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156243
41035	NC_010610	CGG	2	6	2009914	2009919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156243
41036	NC_010610	AGG	2	6	2010016	2010021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156243
41037	NC_010610	ATC	2	6	2010054	2010059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156243
41038	NC_010610	ACC	2	6	2010063	2010068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156243
41039	NC_010610	CAGGT	2	10	2010090	2010099	20 %	20 %	40 %	20 %	184156243
41040	NC_010610	AAG	2	6	2010120	2010125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156243
41041	NC_010610	GGC	2	6	2010128	2010133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156243
41042	NC_010610	AGG	2	6	2010193	2010198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156243
41043	NC_010610	TTC	2	6	2010290	2010295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156243
41044	NC_010610	CCGC	2	8	2010301	2010308	0 %	0 %	25 %	75 %	184156243
41045	NC_010610	AGG	2	6	2010417	2010422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156243
41046	NC_010610	TCA	2	6	2010487	2010492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156243
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41048	NC_010610	CAT	2	6	2010614	2010619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156243
41049	NC_010610	AAT	2	6	2010656	2010661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156243
41050	NC_010610	GTC	2	6	2010708	2010713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156243
41051	NC_010610	TAA	2	6	2010754	2010759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156243
41052	NC_010610	ATG	2	6	2010834	2010839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156243
41053	NC_010610	ACC	2	6	2010845	2010850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156243
41054	NC_010610	CAGG	2	8	2010899	2010906	25 %	0 %	50 %	25 %	184156243
41055	NC_010610	GGTA	2	8	2010994	2011001	25 %	25 %	50 %	0 %	184156243
41056	NC_010610	CA	4	8	2011009	2011016	50 %	0 %	0 %	50 %	184156243
41057	NC_010610	CTT	2	6	2011076	2011081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156243
41058	NC_010610	TCC	2	6	2011091	2011096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41059	NC_010610	ATT	2	6	2011124	2011129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41060	NC_010610	TTTC	2	8	2011147	2011154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41061	NC_010610	GCG	2	6	2011227	2011232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41062	NC_010610	AATC	2	8	2011260	2011267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41063	NC_010610	TCT	2	6	2011375	2011380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156244
41064	NC_010610	TCT	2	6	2011393	2011398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156244
41065	NC_010610	CCA	2	6	2011429	2011434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156244
41066	NC_010610	T	7	7	2011510	2011516	0 %	100 %	0 %	0 %	184156244
41067	NC_010610	ACT	2	6	2011567	2011572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156244
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41069	NC_010610	CTT	2	6	2011637	2011642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156244
41070	NC_010610	TGG	2	6	2011674	2011679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156244
41071	NC_010610	CGT	2	6	2011694	2011699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156244
41072	NC_010610	ACG	2	6	2011765	2011770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156244
41073	NC_010610	CCG	2	6	2011842	2011847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156244
41074	NC_010610	ATT	2	6	2011886	2011891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156244
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41076	NC_010610	GGCTG	2	10	2011944	2011953	0 %	20 %	60 %	20 %	184156244
41077	NC_010610	CAC	2	6	2011977	2011982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156244
41078	NC_010610	T	7	7	2012045	2012051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_010610	TCA	2	6	2012185	2012190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41080	NC_010610	TCA	2	6	2012200	2012205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41081	NC_010610	GCG	2	6	2012229	2012234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41082	NC_010610	TTC	2	6	2012316	2012321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41083	NC_010610	TCCTA	2	10	2012333	2012342	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41084	NC_010610	TAAT	2	8	2012378	2012385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_010610	GAT	2	6	2012423	2012428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_010610	TCGC	2	8	2012476	2012483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41087	NC_010610	AGA	2	6	2012554	2012559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41088	NC_010610	AAC	2	6	2012589	2012594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41089	NC_010610	GCG	2	6	2012645	2012650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41090	NC_010610	AATT	2	8	2012676	2012683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41091	NC_010610	AGA	2	6	2012697	2012702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41092	NC_010610	ATT	2	6	2012728	2012733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156245
41093	NC_010610	GCA	2	6	2012756	2012761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156245
41094	NC_010610	A	6	6	2012825	2012830	100 %	0 %	0 %	0 %	184156245
41095	NC_010610	AAT	2	6	2012848	2012853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156245
41096	NC_010610	A	6	6	2012980	2012985	100 %	0 %	0 %	0 %	184156245
41097	NC_010610	TCA	2	6	2013129	2013134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156245
41098	NC_010610	GTC	2	6	2013155	2013160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156245
41099	NC_010610	TCA	2	6	2013210	2013215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156245
41100	NC_010610	TTG	2	6	2013361	2013366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156245
41101	NC_010610	AG	4	8	2013368	2013375	50 %	0 %	50 %	0 %	184156245
41102	NC_010610	AAC	2	6	2013387	2013392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184156245
41103	NC_010610	A	7	7	2013532	2013538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41104	NC_010610	TCA	2	6	2013545	2013550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41105	NC_010610	A	7	7	2013586	2013592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41106	NC_010610	T	6	6	2013624	2013629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41107	NC_010610	GAA	2	6	2013670	2013675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156246
41108	NC_010610	TGT	2	6	2013684	2013689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156246
41109	NC_010610	A	8	8	2013694	2013701	100 %	0 %	0 %	0 %	184156246
41110	NC_010610	TTA	2	6	2013704	2013709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156246
41111	NC_010610	TGCAGT	2	12	2013765	2013776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184156246
41112	NC_010610	ATT	2	6	2013844	2013849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156246
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41115	NC_010610	AAT	2	6	2013958	2013963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156246
41116	NC_010610	TGG	2	6	2014083	2014088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156246
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41118	NC_010610	TGG	2	6	2014104	2014109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156246
41119	NC_010610	AGA	2	6	2014120	2014125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156246
41120	NC_010610	TGA	2	6	2014164	2014169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156246
41121	NC_010610	ATT	2	6	2014231	2014236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156246
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41123	NC_010610	ACC	2	6	2014275	2014280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156246
41124	NC_010610	CAT	2	6	2014288	2014293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156246
41125	NC_010610	CAT	2	6	2014306	2014311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156246
41126	NC_010610	A	7	7	2014447	2014453	100 %	0 %	0 %	0 %	184156246
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41129	NC_010610	GAC	2	6	2014518	2014523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156246
41130	NC_010610	AT	3	6	2014551	2014556	50 %	50 %	0 %	0 %	184156246
41131	NC_010610	A	6	6	2014616	2014621	100 %	0 %	0 %	0 %	184156246
41132	NC_010610	ATTT	2	8	2014739	2014746	25 %	75 %	0 %	0 %	184156246
41133	NC_010610	GAT	2	6	2014771	2014776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156246
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41137	NC_010610	CGT	2	6	2015231	2015236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156247
41138	NC_010610	ACTG	2	8	2015275	2015282	25 %	25 %	25 %	25 %	184156247
41139	NC_010610	GAC	2	6	2015327	2015332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156247
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41142	NC_010610	TCA	2	6	2015481	2015486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156247
41143	NC_010610	GA	3	6	2015534	2015539	50 %	0 %	50 %	0 %	184156247
41144	NC_010610	ACT	3	9	2015550	2015558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156247
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41147	NC_010610	TG	3	6	2015648	2015653	0 %	50 %	50 %	0 %	184156247
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41233	NC_010610	CTT	2	6	2019969	2019974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41234	NC_010610	CACTA	2	10	2019990	2019999	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41235	NC_010610	TA	3	6	2019998	2020003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41236	NC_010610	CCA	2	6	2020102	2020107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41238	NC_010610	AAT	2	6	2020179	2020184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41239	NC_010610	CAA	2	6	2020217	2020222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41240	NC_010610	GGCA	2	8	2020285	2020292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41241	NC_010610	GCAC	2	8	2020298	2020305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41242	NC_010610	GT	3	6	2020333	2020338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41244	NC_010610	ATAA	2	8	2020450	2020457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41245	NC_010610	GTA	2	6	2020471	2020476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41248	NC_010610	GAAG	2	8	2020569	2020576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41249	NC_010610	GTG	2	6	2020607	2020612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41252	NC_010610	TGG	2	6	2020717	2020722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41253	NC_010610	ATT	2	6	2020770	2020775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41256	NC_010610	GTT	2	6	2020942	2020947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41359	NC_010610	TAA	2	6	2026608	2026613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156255
41360	NC_010610	T	6	6	2026616	2026621	0 %	100 %	0 %	0 %	184156255
41361	NC_010610	TCT	2	6	2026651	2026656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156255
41362	NC_010610	CTG	2	6	2026722	2026727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156255
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41481	NC_010610	GTT	2	6	2033720	2033725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41482	NC_010610	T	6	6	2033724	2033729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41483	NC_010610	ATC	2	6	2033757	2033762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41484	NC_010610	T	6	6	2033776	2033781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41485	NC_010610	ATT	2	6	2033817	2033822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41486	NC_010610	ATT	2	6	2033864	2033869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41487	NC_010610	TTTAA	2	10	2033888	2033897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41488	NC_010610	AT	3	6	2033903	2033908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41489	NC_010610	GA	3	6	2033915	2033920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41490	NC_010610	T	7	7	2033933	2033939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41491	NC_010610	TCA	2	6	2033983	2033988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41492	NC_010610	TAAATA	2	12	2033996	2034007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41493	NC_010610	ATT	2	6	2034096	2034101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41495	NC_010610	TGT	2	6	2034147	2034152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41498	NC_010610	AAAT	2	8	2034218	2034225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41499	NC_010610	AAT	3	9	2034241	2034249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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