MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 42811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_010610	CCCAA	2	10	1958606	1958615	40 %	0 %	0 %	60 %	184156201
40002	NC_010610	CTT	2	6	1958646	1958651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156201
40003	NC_010610	ATC	2	6	1958692	1958697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40004	NC_010610	A	6	6	1958719	1958724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40005	NC_010610	T	6	6	1958742	1958747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40006	NC_010610	GATTT	2	10	1958947	1958956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40007	NC_010610	TTG	2	6	1958994	1958999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40008	NC_010610	CAA	2	6	1959007	1959012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40009	NC_010610	GCTTT	2	10	1959268	1959277	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40010	NC_010610	ATG	2	6	1959354	1959359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40011	NC_010610	CGT	2	6	1959446	1959451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40012	NC_010610	GTGG	2	8	1959557	1959564	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40013	NC_010610	GTTGCG	2	12	1959723	1959734	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40014	NC_010610	GTA	2	6	1959755	1959760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40015	NC_010610	CGGC	2	8	1959768	1959775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40016	NC_010610	GAG	2	6	1959825	1959830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40017	NC_010610	GTT	2	6	1959877	1959882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40018	NC_010610	CTG	2	6	1959988	1959993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40019	NC_010610	A	6	6	1960065	1960070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40020	NC_010610	TGA	2	6	1960078	1960083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40021	NC_010610	ACT	2	6	1960122	1960127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40022	NC_010610	TTA	2	6	1960137	1960142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40023	NC_010610	CAG	2	6	1960227	1960232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40024	NC_010610	AAG	2	6	1960290	1960295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40025	NC_010610	CCGT	2	8	1960309	1960316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40026	NC_010610	AAT	2	6	1960410	1960415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40027	NC_010610	AAATCG	2	12	1960477	1960488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40028	NC_010610	CAAG	2	8	1960520	1960527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40029	NC_010610	AGCA	2	8	1960585	1960592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40030	NC_010610	AG	3	6	1960707	1960712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40031	NC_010610	A	7	7	1960730	1960736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40032	NC_010610	GGC	3	9	1960773	1960781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156202
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40034	NC_010610	T	6	6	1960805	1960810	0 %	100 %	0 %	0 %	184156202
40035	NC_010610	CCGT	2	8	1960880	1960887	0 %	25 %	25 %	50 %	184156202
40036	NC_010610	TAAG	2	8	1961216	1961223	50 %	25 %	25 %	0 %	184156202
40037	NC_010610	TTC	2	6	1961239	1961244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156202
40038	NC_010610	GCG	2	6	1961373	1961378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156202
40039	NC_010610	TAC	2	6	1961471	1961476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156202
40040	NC_010610	TCA	2	6	1961566	1961571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156202
40041	NC_010610	AC	3	6	1961657	1961662	50 %	0 %	0 %	50 %	184156202
40042	NC_010610	GA	3	6	1961687	1961692	50 %	0 %	50 %	0 %	184156202
40043	NC_010610	ACG	2	6	1961758	1961763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156202
40044	NC_010610	ATT	2	6	1961979	1961984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156202
40045	NC_010610	TGG	2	6	1962117	1962122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40046	NC_010610	T	7	7	1962127	1962133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40047	NC_010610	A	6	6	1962148	1962153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40048	NC_010610	CAC	2	6	1962168	1962173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40049	NC_010610	CAA	2	6	1962187	1962192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40050	NC_010610	A	7	7	1962209	1962215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40051	NC_010610	CAG	2	6	1962280	1962285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156203
40052	NC_010610	CAG	2	6	1962380	1962385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156203
40053	NC_010610	GGA	2	6	1962400	1962405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156203
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40055	NC_010610	AAAC	2	8	1962584	1962591	75 %	0 %	0 %	25 %	184156203
40056	NC_010610	CTA	2	6	1962608	1962613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156203
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40058	NC_010610	TAA	2	6	1962688	1962693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156203
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40060	NC_010610	TGG	2	6	1962953	1962958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156203
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40062	NC_010610	TTGG	2	8	1963112	1963119	0 %	50 %	50 %	0 %	184156203
40063	NC_010610	TTG	2	6	1963183	1963188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40064	NC_010610	CTT	2	6	1963225	1963230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40065	NC_010610	CTC	2	6	1963252	1963257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40066	NC_010610	CTTC	2	8	1963261	1963268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40067	NC_010610	ACT	2	6	1963316	1963321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40069	NC_010610	A	6	6	1963375	1963380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40070	NC_010610	GCA	2	6	1963403	1963408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40081	NC_010610	GAC	2	6	1963995	1964000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156204
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40087	NC_010610	CCCAG	2	10	1964124	1964133	20 %	0 %	20 %	60 %	184156204
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40092	NC_010610	CAG	2	6	1964368	1964373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156204
40093	NC_010610	T	7	7	1964424	1964430	0 %	100 %	0 %	0 %	184156204
40094	NC_010610	CTTCC	2	10	1964441	1964450	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40095	NC_010610	TGA	2	6	1964756	1964761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156205
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40104	NC_010610	TTG	2	6	1965237	1965242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156205
40105	NC_010610	TGC	2	6	1965254	1965259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156205
40106	NC_010610	T	6	6	1965304	1965309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40107	NC_010610	GCC	2	6	1965411	1965416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156206
40108	NC_010610	TTC	2	6	1965420	1965425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156206
40109	NC_010610	TCCCA	2	10	1965503	1965512	20 %	20 %	0 %	60 %	184156206
40110	NC_010610	CAG	2	6	1965524	1965529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156206
40111	NC_010610	ATG	2	6	1965546	1965551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156206
40112	NC_010610	CGA	2	6	1965616	1965621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156206
40113	NC_010610	ATG	2	6	1965726	1965731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156206
40114	NC_010610	CCAG	2	8	1965759	1965766	25 %	0 %	25 %	50 %	184156206
40115	NC_010610	TGT	2	6	1965896	1965901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156206
40116	NC_010610	AAAT	2	8	1965908	1965915	75 %	25 %	0 %	0 %	184156206
40117	NC_010610	AAT	2	6	1966011	1966016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156206
40118	NC_010610	TCT	2	6	1966039	1966044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156207
40119	NC_010610	GTG	2	6	1966092	1966097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
40120	NC_010610	GCT	2	6	1966111	1966116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40121	NC_010610	TGT	2	6	1966144	1966149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156207
40122	NC_010610	TCACC	2	10	1966175	1966184	20 %	20 %	0 %	60 %	184156207
40123	NC_010610	GGT	2	6	1966191	1966196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
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40125	NC_010610	GTG	3	9	1966258	1966266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
40126	NC_010610	TCA	2	6	1966271	1966276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156207
40127	NC_010610	GCCG	2	8	1966333	1966340	0 %	0 %	50 %	50 %	184156207
40128	NC_010610	TTC	3	9	1966342	1966350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156207
40129	NC_010610	CGT	2	6	1966373	1966378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40130	NC_010610	TC	3	6	1966398	1966403	0 %	50 %	0 %	50 %	184156207
40131	NC_010610	GTC	2	6	1966434	1966439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40132	NC_010610	TGG	2	6	1966472	1966477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
40133	NC_010610	CTT	2	6	1966484	1966489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156207
40134	NC_010610	TGGC	2	8	1966492	1966499	0 %	25 %	50 %	25 %	184156207
40135	NC_010610	CAG	3	9	1966509	1966517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40136	NC_010610	TCA	2	6	1966712	1966717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156207
40137	NC_010610	CGGGTA	2	12	1966721	1966732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184156207
40138	NC_010610	CAT	2	6	1966809	1966814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156207
40139	NC_010610	CGA	2	6	1966823	1966828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40140	NC_010610	CGA	2	6	1966835	1966840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156207
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40143	NC_010610	GTG	2	6	1967019	1967024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
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40145	NC_010610	TGA	2	6	1967032	1967037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156207
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40149	NC_010610	GTC	2	6	1967118	1967123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40150	NC_010610	TGG	2	6	1967131	1967136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
40151	NC_010610	CCT	2	6	1967153	1967158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156207
40152	NC_010610	GTG	3	9	1967181	1967189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156207
40153	NC_010610	CCG	2	6	1967221	1967226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156207
40154	NC_010610	GTC	2	6	1967239	1967244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156207
40155	NC_010610	AGTCC	2	10	1967309	1967318	20 %	20 %	20 %	40 %	184156207
40156	NC_010610	CAT	2	6	1967340	1967345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156207
40157	NC_010610	TAAG	2	8	1967379	1967386	50 %	25 %	25 %	0 %	184156207
40158	NC_010610	AAT	2	6	1967407	1967412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156208
40159	NC_010610	GCC	2	6	1967513	1967518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156208
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40220	NC_010610	TG	3	6	1970516	1970521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40221	NC_010610	GGAA	2	8	1970538	1970545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40222	NC_010610	T	6	6	1970599	1970604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40223	NC_010610	ACA	2	6	1970693	1970698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40224	NC_010610	A	7	7	1970705	1970711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40225	NC_010610	CTT	2	6	1970724	1970729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40227	NC_010610	CAAT	2	8	1970761	1970768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40228	NC_010610	A	7	7	1970769	1970775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40229	NC_010610	ACGC	2	8	1970781	1970788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40230	NC_010610	A	7	7	1970856	1970862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40231	NC_010610	CTT	2	6	1970870	1970875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40233	NC_010610	AT	3	6	1970988	1970993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40234	NC_010610	TGT	2	6	1971037	1971042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40235	NC_010610	A	6	6	1971045	1971050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40236	NC_010610	TCT	2	6	1971226	1971231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40358	NC_010610	ACC	2	6	1977000	1977005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156214
40359	NC_010610	TTTG	2	8	1977108	1977115	0 %	75 %	25 %	0 %	184156214
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40365	NC_010610	AAT	2	6	1977278	1977283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40388	NC_010610	AATA	2	8	1978380	1978387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40467	NC_010610	CT	3	6	1982738	1982743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40468	NC_010610	GCA	2	6	1982765	1982770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40476	NC_010610	ATA	2	6	1983251	1983256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156220
40477	NC_010610	GAA	2	6	1983268	1983273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156220
40478	NC_010610	GAT	3	9	1983285	1983293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156220
40479	NC_010610	ACG	2	6	1983302	1983307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156220
40480	NC_010610	AGC	2	6	1983479	1983484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156220
40481	NC_010610	ACT	2	6	1983537	1983542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156220
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40483	NC_010610	CCGA	2	8	1983574	1983581	25 %	0 %	25 %	50 %	184156220
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40491	NC_010610	TCA	2	6	1983911	1983916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40497	NC_010610	TGGT	2	8	1984087	1984094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40498	NC_010610	TGTCC	2	10	1984175	1984184	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40499	NC_010610	A	6	6	1984246	1984251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40500	NC_010610	TTAG	2	8	1984294	1984301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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