MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 42811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_010610	G	6	6	1864199	1864204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38002	NC_010610	AAT	2	6	1864304	1864309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156120
38003	NC_010610	GCT	2	6	1864346	1864351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156120
38004	NC_010610	CAA	2	6	1864385	1864390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184156120
38005	NC_010610	CGC	2	6	1864397	1864402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156120
38006	NC_010610	CGGG	2	8	1864433	1864440	0 %	0 %	75 %	25 %	184156120
38007	NC_010610	GAA	2	6	1864461	1864466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156120
38008	NC_010610	GCC	2	6	1864471	1864476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156120
38009	NC_010610	GTC	2	6	1864542	1864547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156120
38010	NC_010610	CGA	2	6	1864559	1864564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156120
38011	NC_010610	GCC	2	6	1864593	1864598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156120
38012	NC_010610	GTC	2	6	1864611	1864616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156120
38013	NC_010610	GAA	2	6	1864617	1864622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156120
38014	NC_010610	ACT	2	6	1864726	1864731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156120
38015	NC_010610	TCG	2	6	1864732	1864737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156120
38016	NC_010610	GAAAT	2	10	1864788	1864797	60 %	20 %	20 %	0 %	184156120
38017	NC_010610	TGCAAA	2	12	1864876	1864887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184156120
38018	NC_010610	AGG	2	6	1864919	1864924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156120
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38020	NC_010610	CG	3	6	1864970	1864975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38021	NC_010610	AAG	2	6	1865033	1865038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38022	NC_010610	ACG	2	6	1865066	1865071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38023	NC_010610	ATC	2	6	1865074	1865079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38024	NC_010610	CAT	2	6	1865085	1865090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38025	NC_010610	AAG	2	6	1865300	1865305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38026	NC_010610	ACG	2	6	1865339	1865344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38027	NC_010610	AAC	2	6	1865345	1865350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38028	NC_010610	TGA	2	6	1865411	1865416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38029	NC_010610	GAC	2	6	1865473	1865478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38030	NC_010610	CGA	2	6	1865484	1865489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38031	NC_010610	TCG	2	6	1865558	1865563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38032	NC_010610	AGCT	2	8	1865594	1865601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38033	NC_010610	CGA	2	6	1865612	1865617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38034	NC_010610	CAT	2	6	1865685	1865690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38035	NC_010610	G	6	6	1865691	1865696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_010610	TTA	2	6	1865712	1865717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38037	NC_010610	CAA	2	6	1865728	1865733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38039	NC_010610	AAAG	2	8	1865973	1865980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38040	NC_010610	CGG	2	6	1866000	1866005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38041	NC_010610	ACC	2	6	1866007	1866012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38042	NC_010610	ATC	2	6	1866055	1866060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38043	NC_010610	GGT	2	6	1866075	1866080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38044	NC_010610	TAAAT	2	10	1866100	1866109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38047	NC_010610	AGT	2	6	1866240	1866245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156121
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38049	NC_010610	TAT	2	6	1866337	1866342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156121
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38055	NC_010610	TCCA	2	8	1866708	1866715	25 %	25 %	0 %	50 %	184156121
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38064	NC_010610	TGA	2	6	1867440	1867445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38072	NC_010610	GCC	2	6	1867769	1867774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38073	NC_010610	GCC	2	6	1867784	1867789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38074	NC_010610	GAT	2	6	1867804	1867809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38075	NC_010610	GAAGG	2	10	1867817	1867826	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38076	NC_010610	CCA	2	6	1867833	1867838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38077	NC_010610	CGA	2	6	1867867	1867872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38080	NC_010610	G	6	6	1867934	1867939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38081	NC_010610	TAC	2	6	1867953	1867958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38082	NC_010610	AAAAC	2	10	1867962	1867971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38083	NC_010610	ATTA	2	8	1868024	1868031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38084	NC_010610	TTC	2	6	1868039	1868044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38086	NC_010610	AGTG	2	8	1868211	1868218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38087	NC_010610	AACC	2	8	1868221	1868228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38088	NC_010610	TTC	2	6	1868281	1868286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38089	NC_010610	TGGT	2	8	1868311	1868318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38090	NC_010610	GCACG	2	10	1868387	1868396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38091	NC_010610	TGGT	2	8	1868432	1868439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38092	NC_010610	GCA	2	6	1868458	1868463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38093	NC_010610	GACC	2	8	1868475	1868482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38094	NC_010610	GTG	2	6	1868557	1868562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156122
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38100	NC_010610	CGA	2	6	1868868	1868873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156122
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38103	NC_010610	CGT	2	6	1868976	1868981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156122
38104	NC_010610	GC	3	6	1869031	1869036	0 %	0 %	50 %	50 %	184156122
38105	NC_010610	A	6	6	1869074	1869079	100 %	0 %	0 %	0 %	184156122
38106	NC_010610	GGT	2	6	1869085	1869090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156122
38107	NC_010610	CCG	2	6	1869103	1869108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156122
38108	NC_010610	AGC	2	6	1869140	1869145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156122
38109	NC_010610	GTG	2	6	1869152	1869157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156122
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38112	NC_010610	AAG	2	6	1869371	1869376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156122
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38114	NC_010610	TAAT	2	8	1869428	1869435	50 %	50 %	0 %	0 %	184156122
38115	NC_010610	AC	3	6	1869487	1869492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38116	NC_010610	CATC	2	8	1869568	1869575	25 %	25 %	0 %	50 %	184156123
38117	NC_010610	CG	3	6	1869637	1869642	0 %	0 %	50 %	50 %	184156123
38118	NC_010610	CTGGTT	2	12	1869656	1869667	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	184156123
38119	NC_010610	TCG	2	6	1869748	1869753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156123
38120	NC_010610	ACT	2	6	1869766	1869771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156123
38121	NC_010610	CTG	2	6	1869999	1870004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156123
38122	NC_010610	CCG	2	6	1870027	1870032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156123
38123	NC_010610	CCA	2	6	1870043	1870048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156123
38124	NC_010610	GGT	2	6	1870075	1870080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156123
38125	NC_010610	TAAA	2	8	1870103	1870110	75 %	25 %	0 %	0 %	184156123
38126	NC_010610	AAG	2	6	1870113	1870118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38127	NC_010610	GCA	2	6	1870135	1870140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38128	NC_010610	TGC	2	6	1870163	1870168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38129	NC_010610	GGTTG	2	10	1870185	1870194	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
38130	NC_010610	GAG	2	6	1870305	1870310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38131	NC_010610	CACT	2	8	1870320	1870327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38132	NC_010610	GCCG	2	8	1870365	1870372	0 %	0 %	50 %	50 %	184156124
38133	NC_010610	TCA	2	6	1870408	1870413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156124
38134	NC_010610	GTTG	2	8	1870521	1870528	0 %	50 %	50 %	0 %	184156124
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38141	NC_010610	CGT	2	6	1870817	1870822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156124
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38148	NC_010610	CCA	2	6	1871098	1871103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38149	NC_010610	ACA	2	6	1871214	1871219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38150	NC_010610	GGA	2	6	1871228	1871233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38151	NC_010610	CCTTG	2	10	1871254	1871263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38152	NC_010610	CTT	2	6	1871363	1871368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156125
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38226	NC_010610	GCCC	2	8	1875514	1875521	0 %	0 %	25 %	75 %	184156127
38227	NC_010610	CGG	2	6	1875665	1875670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156127
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38230	NC_010610	AGT	2	6	1875879	1875884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156127
38231	NC_010610	CTT	2	6	1875919	1875924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156127
38232	NC_010610	TGGC	2	8	1876022	1876029	0 %	25 %	50 %	25 %	184156127
38233	NC_010610	CCT	2	6	1876044	1876049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156127
38234	NC_010610	GAG	2	6	1876076	1876081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156127
38235	NC_010610	GTA	2	6	1876117	1876122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156127
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38237	NC_010610	GCC	2	6	1876274	1876279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156127
38238	NC_010610	GCC	2	6	1876295	1876300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156127
38239	NC_010610	TGG	2	6	1876362	1876367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156127
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38355	NC_010610	CACT	2	8	1882228	1882235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38356	NC_010610	CTC	2	6	1882247	1882252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38357	NC_010610	ACCA	2	8	1882300	1882307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38358	NC_010610	TCA	2	6	1882364	1882369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156133
38359	NC_010610	CAC	2	6	1882372	1882377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156133
38360	NC_010610	GGC	2	6	1882393	1882398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156133
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38385	NC_010610	GCAA	2	8	1884008	1884015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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38387	NC_010610	T	7	7	1884124	1884130	0 %	100 %	0 %	0 %	184156134
38388	NC_010610	T	7	7	1884197	1884203	0 %	100 %	0 %	0 %	184156134
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38400	NC_010610	AT	3	6	1884942	1884947	50 %	50 %	0 %	0 %	184156135
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38420	NC_010610	TAT	2	6	1885769	1885774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38473	NC_010610	AGG	2	6	1888450	1888455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156136
38474	NC_010610	CT	4	8	1888513	1888520	0 %	50 %	0 %	50 %	184156136
38475	NC_010610	ACCG	2	8	1888560	1888567	25 %	0 %	25 %	50 %	184156137
38476	NC_010610	TGA	2	6	1888570	1888575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156137
38477	NC_010610	GAC	2	6	1888580	1888585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156137
38478	NC_010610	GTT	2	6	1888607	1888612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156137
38479	NC_010610	CCA	2	6	1888619	1888624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156137
38480	NC_010610	CTT	2	6	1888685	1888690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156137
38481	NC_010610	ATC	2	6	1888752	1888757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156137
38482	NC_010610	C	6	6	1888790	1888795	0 %	0 %	0 %	100 %	184156137
38483	NC_010610	GTC	2	6	1888859	1888864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156137
38484	NC_010610	CAA	2	6	1888882	1888887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184156137
38485	NC_010610	GCT	2	6	1888955	1888960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156137
38486	NC_010610	AGG	2	6	1888968	1888973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156137
38487	NC_010610	TCG	2	6	1888977	1888982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156137
38488	NC_010610	GGT	2	6	1889015	1889020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156137
38489	NC_010610	CAG	2	6	1889021	1889026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156137
38490	NC_010610	TCA	2	6	1889032	1889037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156137
38491	NC_010610	CGGTT	2	10	1889059	1889068	0 %	40 %	40 %	20 %	184156137
38492	NC_010610	TCC	2	6	1889085	1889090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156137
38493	NC_010610	TAT	2	6	1889163	1889168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38494	NC_010610	AGTT	2	8	1889195	1889202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38495	NC_010610	TCA	2	6	1889281	1889286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38496	NC_010610	TGC	2	6	1889412	1889417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156138
38497	NC_010610	CGG	2	6	1889443	1889448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156138
38498	NC_010610	TCC	2	6	1889468	1889473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156138
38499	NC_010610	CGG	3	9	1889545	1889553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156138
38500	NC_010610	CTT	2	6	1889557	1889562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156138

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