MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_010609	CTCAT	2	10	1545055	1545064	20 %	40 %	0 %	40 %	184154010
34002	NC_010609	GGTA	2	8	1545326	1545333	25 %	25 %	50 %	0 %	184154011
34003	NC_010609	GCA	2	6	1545346	1545351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154011
34004	NC_010609	AAC	2	6	1545412	1545417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154011
34005	NC_010609	TGGT	2	8	1545447	1545454	0 %	50 %	50 %	0 %	184154011
34006	NC_010609	TTC	3	9	1545549	1545557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34007	NC_010609	TCA	2	6	1545562	1545567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34008	NC_010609	CTT	2	6	1545602	1545607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34009	NC_010609	AAC	2	6	1545624	1545629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154011
34010	NC_010609	TCA	2	6	1545688	1545693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34011	NC_010609	TAA	2	6	1545737	1545742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154011
34012	NC_010609	T	6	6	1545743	1545748	0 %	100 %	0 %	0 %	184154011
34013	NC_010609	ATC	3	9	1545759	1545767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34014	NC_010609	TGC	2	6	1545775	1545780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154011
34015	NC_010609	TCA	2	6	1545781	1545786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34016	NC_010609	TCA	2	6	1545811	1545816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34017	NC_010609	ACG	2	6	1545825	1545830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154011
34018	NC_010609	TCA	2	6	1545964	1545969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34019	NC_010609	TTCGTG	2	12	1545977	1545988	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	184154011
34020	NC_010609	AAC	2	6	1546110	1546115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154011
34021	NC_010609	CCA	2	6	1546207	1546212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154011
34022	NC_010609	TAC	2	6	1546229	1546234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34023	NC_010609	TTC	2	6	1546248	1546253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34024	NC_010609	TTC	2	6	1546326	1546331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34025	NC_010609	TCA	2	6	1546360	1546365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34026	NC_010609	GC	3	6	1546376	1546381	0 %	0 %	50 %	50 %	184154011
34027	NC_010609	TTC	2	6	1546426	1546431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34028	NC_010609	T	6	6	1546432	1546437	0 %	100 %	0 %	0 %	184154011
34029	NC_010609	TTA	2	6	1546447	1546452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154011
34030	NC_010609	CTTGG	2	10	1546521	1546530	0 %	40 %	40 %	20 %	184154011
34031	NC_010609	CA	4	8	1546611	1546618	50 %	0 %	0 %	50 %	184154011
34032	NC_010609	TAAC	2	8	1546646	1546653	50 %	25 %	0 %	25 %	184154011
34033	NC_010609	TCA	2	6	1546774	1546779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34034	NC_010609	TTG	2	6	1546809	1546814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154011
34035	NC_010609	CG	3	6	1546831	1546836	0 %	0 %	50 %	50 %	184154011
34036	NC_010609	CTT	2	6	1546862	1546867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34037	NC_010609	ATC	2	6	1546875	1546880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154011
34038	NC_010609	CAA	2	6	1546887	1546892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154011
34039	NC_010609	T	6	6	1546941	1546946	0 %	100 %	0 %	0 %	184154011
34040	NC_010609	T	6	6	1547036	1547041	0 %	100 %	0 %	0 %	184154011
34041	NC_010609	ACG	2	6	1547049	1547054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154011
34042	NC_010609	CG	3	6	1547144	1547149	0 %	0 %	50 %	50 %	184154011
34043	NC_010609	TTG	2	6	1547155	1547160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154011
34044	NC_010609	TTC	2	6	1547202	1547207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154011
34045	NC_010609	TAAG	2	8	1547211	1547218	50 %	25 %	25 %	0 %	184154011
34046	NC_010609	TAA	2	6	1547271	1547276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154011
34047	NC_010609	TCAT	2	8	1547314	1547321	25 %	50 %	0 %	25 %	184154011
34048	NC_010609	TAA	2	6	1547328	1547333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154011
34049	NC_010609	CT	3	6	1547363	1547368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34050	NC_010609	CGC	2	6	1547570	1547575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154012
34051	NC_010609	CAT	2	6	1547621	1547626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154012
34052	NC_010609	TTC	2	6	1547650	1547655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154012
34053	NC_010609	AAC	2	6	1547656	1547661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154012
34054	NC_010609	TGAT	2	8	1547682	1547689	25 %	50 %	25 %	0 %	184154012
34055	NC_010609	TAA	2	6	1547729	1547734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154012
34056	NC_010609	CTT	2	6	1547758	1547763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154012
34057	NC_010609	TTC	2	6	1547769	1547774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154012
34058	NC_010609	CAT	2	6	1547798	1547803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154012
34059	NC_010609	TGC	2	6	1547910	1547915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154012
34060	NC_010609	ATC	2	6	1547952	1547957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154012
34061	NC_010609	GCG	2	6	1548130	1548135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154012
34062	NC_010609	ATTG	2	8	1548229	1548236	25 %	50 %	25 %	0 %	184154012
34063	NC_010609	CAT	2	6	1548242	1548247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154012
34064	NC_010609	ACC	2	6	1548256	1548261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154012
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34066	NC_010609	ATAA	2	8	1548414	1548421	75 %	25 %	0 %	0 %	184154012
34067	NC_010609	AGTT	2	8	1548447	1548454	25 %	50 %	25 %	0 %	184154012
34068	NC_010609	TCAT	2	8	1548463	1548470	25 %	50 %	0 %	25 %	184154012
34069	NC_010609	GCCT	2	8	1548546	1548553	0 %	25 %	25 %	50 %	184154012
34070	NC_010609	AAT	2	6	1548597	1548602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154012
34071	NC_010609	TAC	2	6	1548611	1548616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154012
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34073	NC_010609	TAT	2	6	1548681	1548686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154013
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34075	NC_010609	ATC	2	6	1548859	1548864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154013
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34080	NC_010609	TA	3	6	1549265	1549270	50 %	50 %	0 %	0 %	184154014
34081	NC_010609	AATT	2	8	1549293	1549300	50 %	50 %	0 %	0 %	184154014
34082	NC_010609	CTT	2	6	1549334	1549339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154014
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34085	NC_010609	TTG	2	6	1549395	1549400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154014
34086	NC_010609	TGTTCC	2	12	1549539	1549550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	184154014
34087	NC_010609	AAAT	2	8	1549560	1549567	75 %	25 %	0 %	0 %	184154014
34088	NC_010609	AATA	2	8	1549692	1549699	75 %	25 %	0 %	0 %	184154014
34089	NC_010609	A	7	7	1549792	1549798	100 %	0 %	0 %	0 %	184154014
34090	NC_010609	TAA	2	6	1549820	1549825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154014
34091	NC_010609	AGCCT	2	10	1549879	1549888	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34092	NC_010609	CTA	2	6	1549897	1549902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34093	NC_010609	TTA	2	6	1549904	1549909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_010609	AGA	2	6	1549958	1549963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34095	NC_010609	A	6	6	1549968	1549973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34096	NC_010609	TGC	2	6	1550006	1550011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34099	NC_010609	TGTC	2	8	1550060	1550067	0 %	50 %	25 %	25 %	184154015
34100	NC_010609	TCT	2	6	1550121	1550126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154015
34101	NC_010609	TCA	2	6	1550181	1550186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154015
34102	NC_010609	CAT	2	6	1550228	1550233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154015
34103	NC_010609	CTA	2	6	1550299	1550304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154015
34104	NC_010609	CAA	2	6	1550365	1550370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154015
34105	NC_010609	ACC	2	6	1550402	1550407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154015
34106	NC_010609	AGT	2	6	1550519	1550524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154015
34107	NC_010609	ATT	2	6	1550540	1550545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154015
34108	NC_010609	CTT	2	6	1550602	1550607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154015
34109	NC_010609	CCA	2	6	1550646	1550651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154015
34110	NC_010609	TTA	3	9	1550652	1550660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154015
34111	NC_010609	TCA	2	6	1550664	1550669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154015
34112	NC_010609	TTG	2	6	1550675	1550680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154015
34113	NC_010609	CCT	2	6	1550809	1550814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34114	NC_010609	TTA	2	6	1550831	1550836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34115	NC_010609	A	7	7	1550865	1550871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34116	NC_010609	AGC	2	6	1550934	1550939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154016
34117	NC_010609	ACG	2	6	1550967	1550972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154016
34118	NC_010609	CTT	2	6	1551009	1551014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154016
34119	NC_010609	CCA	3	9	1551097	1551105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154016
34120	NC_010609	CGT	2	6	1551122	1551127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154016
34121	NC_010609	TGGT	2	8	1551156	1551163	0 %	50 %	50 %	0 %	184154016
34122	NC_010609	TTGCC	2	10	1551206	1551215	0 %	40 %	20 %	40 %	184154016
34123	NC_010609	TTG	2	6	1551300	1551305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154016
34124	NC_010609	ATTCC	2	10	1551311	1551320	20 %	40 %	0 %	40 %	184154016
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34130	NC_010609	GTA	2	6	1551541	1551546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154017
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34137	NC_010609	CTT	2	6	1551856	1551861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34138	NC_010609	TCA	2	6	1551884	1551889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154018
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34151	NC_010609	TGTT	2	8	1552555	1552562	0 %	75 %	25 %	0 %	184154018
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34154	NC_010609	TTA	2	6	1552656	1552661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34155	NC_010609	CAAT	2	8	1552702	1552709	50 %	25 %	0 %	25 %	184154019
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34216	NC_010609	TAA	2	6	1555155	1555160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34217	NC_010609	TATC	2	8	1555187	1555194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34218	NC_010609	TAAAA	2	10	1555206	1555215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34219	NC_010609	A	6	6	1555212	1555217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34220	NC_010609	CCA	2	6	1555275	1555280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34221	NC_010609	TTA	2	6	1555316	1555321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34222	NC_010609	AATT	2	8	1555343	1555350	50 %	50 %	0 %	0 %	184154022
34223	NC_010609	CAC	2	6	1555387	1555392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154022
34224	NC_010609	GT	3	6	1555417	1555422	0 %	50 %	50 %	0 %	184154022
34225	NC_010609	ACC	2	6	1555424	1555429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154022
34226	NC_010609	TTC	2	6	1555457	1555462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154022
34227	NC_010609	ATC	2	6	1555496	1555501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154022
34228	NC_010609	CAA	2	6	1555522	1555527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154022
34229	NC_010609	ACG	2	6	1555553	1555558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154022
34230	NC_010609	ATC	2	6	1555590	1555595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154022
34231	NC_010609	CAG	2	6	1555600	1555605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154022
34232	NC_010609	AGT	2	6	1555634	1555639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154022
34233	NC_010609	TAA	2	6	1555682	1555687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154022
34234	NC_010609	CCT	2	6	1555743	1555748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34235	NC_010609	GTC	2	6	1555770	1555775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154023
34236	NC_010609	ATTTA	2	10	1555800	1555809	40 %	60 %	0 %	0 %	184154023
34237	NC_010609	TCT	2	6	1555819	1555824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154023
34238	NC_010609	TCA	2	6	1555853	1555858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154023
34239	NC_010609	AG	3	6	1555935	1555940	50 %	0 %	50 %	0 %	184154023
34240	NC_010609	TCT	2	6	1555970	1555975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154023
34241	NC_010609	TG	3	6	1555979	1555984	0 %	50 %	50 %	0 %	184154023
34242	NC_010609	TCT	2	6	1555987	1555992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154023
34243	NC_010609	CAA	2	6	1556036	1556041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154023
34244	NC_010609	AATC	2	8	1556210	1556217	50 %	25 %	0 %	25 %	184154023
34245	NC_010609	ATC	2	6	1556238	1556243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154023
34246	NC_010609	TTA	2	6	1556254	1556259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154023
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34248	NC_010609	CAG	2	6	1556402	1556407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154023
34249	NC_010609	CTTT	2	8	1556465	1556472	0 %	75 %	0 %	25 %	184154023
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34252	NC_010609	ACG	3	9	1556803	1556811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154024
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34257	NC_010609	AGC	3	9	1556974	1556982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154024
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34263	NC_010609	T	6	6	1557172	1557177	0 %	100 %	0 %	0 %	184154024
34264	NC_010609	CCT	2	6	1557199	1557204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34265	NC_010609	T	6	6	1557204	1557209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34266	NC_010609	CTT	3	9	1557224	1557232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154025
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34271	NC_010609	TCT	2	6	1557462	1557467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154025
34272	NC_010609	TCT	2	6	1557490	1557495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154025
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34276	NC_010609	TCC	2	6	1557745	1557750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34277	NC_010609	ACT	2	6	1557773	1557778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154027
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34279	NC_010609	TGG	2	6	1558034	1558039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34280	NC_010609	ACT	2	6	1558057	1558062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34281	NC_010609	AGAT	2	8	1558064	1558071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34282	NC_010609	TAT	2	6	1558120	1558125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34283	NC_010609	CTTT	2	8	1558209	1558216	0 %	75 %	0 %	25 %	184154028
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34288	NC_010609	GCT	3	9	1558496	1558504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154028
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34302	NC_010609	GTC	2	6	1559194	1559199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154029
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34318	NC_010609	ACAA	2	8	1560031	1560038	75 %	0 %	0 %	25 %	184154029
34319	NC_010609	ACC	2	6	1560121	1560126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154030
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34323	NC_010609	CAT	2	6	1560282	1560287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154030
34324	NC_010609	ATG	2	6	1560300	1560305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154030
34325	NC_010609	TGA	2	6	1560463	1560468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154030
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34328	NC_010609	TAT	2	6	1560553	1560558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34329	NC_010609	TTAATT	2	12	1560559	1560570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154031
34330	NC_010609	CTT	2	6	1560577	1560582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154031
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34339	NC_010609	TAG	2	6	1561027	1561032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154032
34340	NC_010609	CAG	2	6	1561066	1561071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154032
34341	NC_010609	CTT	2	6	1561102	1561107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154032
34342	NC_010609	CAA	2	6	1561150	1561155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154032
34343	NC_010609	AGC	2	6	1561163	1561168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154032
34344	NC_010609	ACG	2	6	1561178	1561183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154032
34345	NC_010609	TGA	2	6	1561265	1561270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154032
34346	NC_010609	TCC	2	6	1561287	1561292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34347	NC_010609	T	7	7	1561293	1561299	0 %	100 %	0 %	0 %	184154033
34348	NC_010609	AGC	2	6	1561322	1561327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154033
34349	NC_010609	AGTCTT	2	12	1561448	1561459	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184154033
34350	NC_010609	ACTT	2	8	1561463	1561470	25 %	50 %	0 %	25 %	184154033
34351	NC_010609	TCA	2	6	1561515	1561520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154033
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34353	NC_010609	GAC	2	6	1561612	1561617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154033
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34469	NC_010609	CAT	2	6	1567181	1567186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154046
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