MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_010609	GCTA	2	8	1412466	1412473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31002	NC_010609	TTAA	2	8	1412689	1412696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_010609	TTGTT	2	10	1412726	1412735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_010609	TTC	2	6	1412810	1412815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31005	NC_010609	AGG	2	6	1412846	1412851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_010609	GGC	2	6	1412920	1412925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31007	NC_010609	GT	3	6	1412988	1412993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_010609	GT	3	6	1413157	1413162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_010609	ATG	2	6	1413182	1413187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_010609	CGT	2	6	1413194	1413199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31011	NC_010609	TCC	2	6	1413208	1413213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31012	NC_010609	CACGA	2	10	1413307	1413316	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31013	NC_010609	GAC	3	9	1413320	1413328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_010609	CAC	2	6	1413333	1413338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31015	NC_010609	TTC	2	6	1413408	1413413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31016	NC_010609	CAGAC	2	10	1413641	1413650	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31017	NC_010609	GCC	2	6	1413652	1413657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31018	NC_010609	TTC	2	6	1413671	1413676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31019	NC_010609	AT	3	6	1413678	1413683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_010609	CTT	2	6	1413756	1413761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_010609	GCT	2	6	1413862	1413867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31022	NC_010609	CACG	2	8	1413927	1413934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31023	NC_010609	TTC	2	6	1413935	1413940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31024	NC_010609	CAA	2	6	1413943	1413948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31025	NC_010609	CTT	2	6	1413971	1413976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31026	NC_010609	CTG	2	6	1414030	1414035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31027	NC_010609	TC	3	6	1414085	1414090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31028	NC_010609	CAT	2	6	1414103	1414108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31029	NC_010609	TTACC	2	10	1414124	1414133	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31030	NC_010609	CAAA	2	8	1414187	1414194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31031	NC_010609	TGT	2	6	1414209	1414214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_010609	CACT	2	8	1414293	1414300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31033	NC_010609	ATCA	2	8	1414332	1414339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31034	NC_010609	CCG	2	6	1414378	1414383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31035	NC_010609	AT	3	6	1414421	1414426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31036	NC_010609	TTA	2	6	1414457	1414462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_010609	TCG	2	6	1414529	1414534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31038	NC_010609	ATTAG	2	10	1414609	1414618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31039	NC_010609	AAG	2	6	1414625	1414630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_010609	TTAA	2	8	1414636	1414643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_010609	TGAT	2	8	1414658	1414665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_010609	AT	3	6	1414688	1414693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_010609	CAA	2	6	1414713	1414718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31044	NC_010609	T	6	6	1414730	1414735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_010609	CAG	2	6	1414748	1414753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31047	NC_010609	T	6	6	1414813	1414818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31048	NC_010609	A	7	7	1414821	1414827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31049	NC_010609	ATC	2	6	1414888	1414893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31050	NC_010609	AAAACG	2	12	1414894	1414905	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31051	NC_010609	TTC	2	6	1414936	1414941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31052	NC_010609	CTA	2	6	1414943	1414948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31053	NC_010609	T	6	6	1414984	1414989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_010609	TAA	2	6	1415046	1415051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_010609	TAA	2	6	1415056	1415061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31056	NC_010609	TCC	2	6	1415085	1415090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31057	NC_010609	CA	3	6	1415117	1415122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31058	NC_010609	T	6	6	1415128	1415133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31059	NC_010609	AGT	2	6	1415204	1415209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153907
31060	NC_010609	C	6	6	1415291	1415296	0 %	0 %	0 %	100 %	184153907
31061	NC_010609	CCT	2	6	1415300	1415305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184153907
31062	NC_010609	AAT	2	6	1415323	1415328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184153907
31063	NC_010609	ATA	2	6	1415396	1415401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184153907
31064	NC_010609	AAT	2	6	1415426	1415431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184153907
31065	NC_010609	TAC	2	6	1415443	1415448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184153907
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31068	NC_010609	GAC	2	6	1415527	1415532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184153907
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31124	NC_010609	CGA	2	6	1418190	1418195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184153909
31125	NC_010609	TCA	2	6	1418250	1418255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184153909
31126	NC_010609	AT	3	6	1418286	1418291	50 %	50 %	0 %	0 %	184153909
31127	NC_010609	ATG	2	6	1418294	1418299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153909
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31132	NC_010609	ATA	2	6	1418430	1418435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31133	NC_010609	TAT	2	6	1418451	1418456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31134	NC_010609	CTTC	2	8	1418504	1418511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31135	NC_010609	TAA	2	6	1418564	1418569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31136	NC_010609	A	6	6	1418577	1418582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31137	NC_010609	CT	3	6	1418586	1418591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31138	NC_010609	TTA	2	6	1418626	1418631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184153910
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31239	NC_010609	GTA	2	6	1423018	1423023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153912
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31241	NC_010609	ACT	2	6	1423051	1423056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184153912
31242	NC_010609	TGA	2	6	1423082	1423087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153912
31243	NC_010609	TTCAA	2	10	1423093	1423102	40 %	40 %	0 %	20 %	184153912
31244	NC_010609	TGA	2	6	1423123	1423128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153912
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31247	NC_010609	TGCT	2	8	1423165	1423172	0 %	50 %	25 %	25 %	184153912
31248	NC_010609	GAA	2	6	1423209	1423214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184153912
31249	NC_010609	TCG	2	6	1423262	1423267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184153912
31250	NC_010609	TGA	2	6	1423349	1423354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184153912
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31253	NC_010609	GAA	2	6	1423383	1423388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184153912
31254	NC_010609	CAA	2	6	1423393	1423398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184153912
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31256	NC_010609	A	7	7	1423419	1423425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31257	NC_010609	T	7	7	1423449	1423455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31258	NC_010609	ACG	2	6	1423478	1423483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184153913
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31261	NC_010609	CTG	2	6	1423621	1423626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184153913
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31270	NC_010609	A	6	6	1423979	1423984	100 %	0 %	0 %	0 %	184153913
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31276	NC_010609	A	7	7	1424112	1424118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31350	NC_010609	CCT	2	6	1426998	1427003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31351	NC_010609	TA	3	6	1427040	1427045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31352	NC_010609	GGA	2	6	1427050	1427055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31356	NC_010609	TAT	2	6	1427237	1427242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184153918
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31359	NC_010609	GTT	2	6	1427447	1427452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184153918
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31399	NC_010609	ATT	2	6	1429773	1429778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31472	NC_010609	T	6	6	1434228	1434233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31473	NC_010609	ACG	3	9	1434239	1434247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31474	NC_010609	ACC	2	6	1434263	1434268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31475	NC_010609	TGA	2	6	1434271	1434276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31476	NC_010609	CGG	2	6	1434355	1434360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31477	NC_010609	CAC	2	6	1434389	1434394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31478	NC_010609	CTA	2	6	1434403	1434408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31481	NC_010609	ATGGT	2	10	1434633	1434642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31482	NC_010609	CAT	2	6	1434695	1434700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31483	NC_010609	TCTT	2	8	1434706	1434713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31484	NC_010609	GGC	2	6	1434770	1434775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31485	NC_010609	GCT	2	6	1434781	1434786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31486	NC_010609	TCT	2	6	1434793	1434798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31487	NC_010609	ATAGTT	2	12	1434870	1434881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31488	NC_010609	GTT	2	6	1434941	1434946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31489	NC_010609	CAT	2	6	1434959	1434964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31490	NC_010609	GAT	2	6	1434998	1435003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31491	NC_010609	A	6	6	1435013	1435018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31492	NC_010609	TCA	2	6	1435020	1435025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31493	NC_010609	TA	3	6	1435079	1435084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31494	NC_010609	ACG	2	6	1435173	1435178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31495	NC_010609	CTT	2	6	1435244	1435249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31496	NC_010609	TCA	2	6	1435285	1435290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31497	NC_010609	TGAT	2	8	1435365	1435372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31498	NC_010609	CTGAT	2	10	1435378	1435387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31499	NC_010609	TTC	2	6	1435402	1435407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184153921
31500	NC_010609	T	7	7	1435439	1435445	0 %	100 %	0 %	0 %	184153921

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