MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010609	TATT	2	8	229141	229148	25 %	75 %	0 %	0 %	184152841
5002	NC_010609	ATT	2	6	229195	229200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152841
5003	NC_010609	TAA	2	6	229208	229213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152841
5004	NC_010609	GAAA	2	8	229231	229238	75 %	0 %	25 %	0 %	184152841
5005	NC_010609	AGC	2	6	229239	229244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152841
5006	NC_010609	TTA	2	6	229268	229273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010609	AAAAT	2	10	229296	229305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010609	TTG	2	6	229324	229329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010609	TGT	2	6	229346	229351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010609	CTT	2	6	229377	229382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_010609	TTG	2	6	229395	229400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010609	AAT	2	6	229444	229449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010609	ATG	2	6	229495	229500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010609	ATC	2	6	229528	229533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_010609	TAA	2	6	229543	229548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_010609	AT	3	6	229589	229594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010609	TC	3	6	229610	229615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_010609	TAT	3	9	229620	229628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_010609	TCT	2	6	229635	229640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_010609	ATT	2	6	229653	229658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152842
5021	NC_010609	A	6	6	229736	229741	100 %	0 %	0 %	0 %	184152842
5022	NC_010609	ATG	2	6	229749	229754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152842
5023	NC_010609	AGG	2	6	229773	229778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152842
5024	NC_010609	CTT	2	6	229794	229799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152842
5025	NC_010609	GGC	2	6	229841	229846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152842
5026	NC_010609	ACA	2	6	229909	229914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152842
5027	NC_010609	TCC	2	6	229925	229930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152842
5028	NC_010609	TTA	2	6	229946	229951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152842
5029	NC_010609	TTG	2	6	229998	230003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152842
5030	NC_010609	CTG	2	6	230096	230101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152842
5031	NC_010609	AAAG	2	8	230183	230190	75 %	0 %	25 %	0 %	184152842
5032	NC_010609	GTT	2	6	230215	230220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152842
5033	NC_010609	TTGA	2	8	230251	230258	25 %	50 %	25 %	0 %	184152842
5034	NC_010609	TAA	2	6	230351	230356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010609	ATT	3	9	230377	230385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010609	A	6	6	230430	230435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_010609	TCTT	2	8	230465	230472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_010609	TAAT	2	8	230473	230480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010609	TAAA	2	8	230482	230489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010609	AGA	2	6	230501	230506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010609	AGG	2	6	230571	230576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010609	AGA	2	6	230612	230617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152843
5043	NC_010609	ATA	2	6	230632	230637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152843
5044	NC_010609	AGT	2	6	230762	230767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152843
5045	NC_010609	T	6	6	230774	230779	0 %	100 %	0 %	0 %	184152843
5046	NC_010609	TGC	2	6	230783	230788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5047	NC_010609	GCT	2	6	230829	230834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5048	NC_010609	CGT	2	6	230873	230878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5049	NC_010609	T	6	6	230889	230894	0 %	100 %	0 %	0 %	184152843
5050	NC_010609	TTG	2	6	230947	230952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5051	NC_010609	TC	3	6	230960	230965	0 %	50 %	0 %	50 %	184152843
5052	NC_010609	ATT	2	6	230981	230986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152843
5053	NC_010609	CTGC	2	8	231006	231013	0 %	25 %	25 %	50 %	184152843
5054	NC_010609	GTT	2	6	231048	231053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5055	NC_010609	GTT	2	6	231066	231071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5056	NC_010609	ATT	2	6	231075	231080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152843
5057	NC_010609	TAG	2	6	231082	231087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152843
5058	NC_010609	GCT	2	6	231117	231122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5059	NC_010609	TCT	2	6	231134	231139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152843
5060	NC_010609	TTG	3	9	231175	231183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5061	NC_010609	AGCA	2	8	231200	231207	50 %	0 %	25 %	25 %	184152843
5062	NC_010609	TGG	2	6	231257	231262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152843
5063	NC_010609	TA	3	6	231272	231277	50 %	50 %	0 %	0 %	184152843
5064	NC_010609	GAT	2	6	231290	231295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152843
5065	NC_010609	TTTCC	2	10	231296	231305	0 %	60 %	0 %	40 %	184152843
5066	NC_010609	TGC	2	6	231326	231331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5067	NC_010609	CAAT	2	8	231346	231353	50 %	25 %	0 %	25 %	184152843
5068	NC_010609	A	6	6	231358	231363	100 %	0 %	0 %	0 %	184152843
5069	NC_010609	GTT	2	6	231402	231407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5070	NC_010609	ATTG	2	8	231431	231438	25 %	50 %	25 %	0 %	184152843
5071	NC_010609	CAA	2	6	231453	231458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152843
5072	NC_010609	TCA	2	6	231503	231508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152843
5073	NC_010609	GTG	2	6	231511	231516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152843
5074	NC_010609	TGT	2	6	231524	231529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152843
5075	NC_010609	TGA	2	6	231647	231652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152843
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5077	NC_010609	CTTT	2	8	231728	231735	0 %	75 %	0 %	25 %	184152843
5078	NC_010609	ATTG	2	8	231758	231765	25 %	50 %	25 %	0 %	184152843
5079	NC_010609	TGTT	2	8	231772	231779	0 %	75 %	25 %	0 %	184152843
5080	NC_010609	CGT	3	9	231801	231809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152843
5081	NC_010609	GATTA	2	10	231904	231913	40 %	40 %	20 %	0 %	184152843
5082	NC_010609	ATT	2	6	231957	231962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152843
5083	NC_010609	AAAG	2	8	231998	232005	75 %	0 %	25 %	0 %	184152843
5084	NC_010609	AGA	2	6	232040	232045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152843
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5086	NC_010609	A	7	7	232073	232079	100 %	0 %	0 %	0 %	184152844
5087	NC_010609	TGC	2	6	232092	232097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152844
5088	NC_010609	TAC	2	6	232108	232113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152844
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5090	NC_010609	TTGC	2	8	232180	232187	0 %	50 %	25 %	25 %	184152844
5091	NC_010609	AGT	2	6	232227	232232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152844
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5094	NC_010609	ATT	2	6	232396	232401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152844
5095	NC_010609	AT	3	6	232431	232436	50 %	50 %	0 %	0 %	184152844
5096	NC_010609	GTA	2	6	232540	232545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152844
5097	NC_010609	TTG	2	6	232601	232606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152844
5098	NC_010609	TGC	2	6	232628	232633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152844
5099	NC_010609	TGA	2	6	232779	232784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152844
5100	NC_010609	GGAC	2	8	232801	232808	25 %	0 %	50 %	25 %	184152844
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5102	NC_010609	GCCA	2	8	232938	232945	25 %	0 %	25 %	50 %	184152844
5103	NC_010609	GCA	2	6	232981	232986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152844
5104	NC_010609	A	6	6	233050	233055	100 %	0 %	0 %	0 %	184152844
5105	NC_010609	TGG	2	6	233127	233132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152844
5106	NC_010609	CAA	2	6	233177	233182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152844
5107	NC_010609	TTC	2	6	233243	233248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152844
5108	NC_010609	ACC	2	6	233256	233261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152844
5109	NC_010609	TTA	2	6	233267	233272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152844
5110	NC_010609	GAT	2	6	233301	233306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152844
5111	NC_010609	GCT	2	6	233344	233349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152844
5112	NC_010609	AGA	2	6	233361	233366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152844
5113	NC_010609	CGG	2	6	233467	233472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_010609	TCT	2	6	233549	233554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_010609	GGA	2	6	233650	233655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010609	TTGC	2	8	233692	233699	0 %	50 %	25 %	25 %	184152845
5117	NC_010609	GTC	2	6	233723	233728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152845
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5119	NC_010609	TTA	2	6	233843	233848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152845
5120	NC_010609	TGT	3	9	233913	233921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152845
5121	NC_010609	ACA	2	6	234025	234030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152845
5122	NC_010609	AGC	2	6	234105	234110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152845
5123	NC_010609	GAT	2	6	234118	234123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152845
5124	NC_010609	ATT	2	6	234124	234129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152845
5125	NC_010609	TTA	2	6	234139	234144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152845
5126	NC_010609	TGA	2	6	234149	234154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152845
5127	NC_010609	AGC	2	6	234172	234177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152845
5128	NC_010609	TGG	2	6	234240	234245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152845
5129	NC_010609	GAT	2	6	234333	234338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152845
5130	NC_010609	CTT	2	6	234399	234404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152845
5131	NC_010609	GTT	2	6	234442	234447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152845
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5133	NC_010609	TGT	2	6	234645	234650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152845
5134	NC_010609	GTG	2	6	234671	234676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152845
5135	NC_010609	GATT	2	8	234683	234690	25 %	50 %	25 %	0 %	184152845
5136	NC_010609	TCT	2	6	234717	234722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152845
5137	NC_010609	TAT	2	6	234733	234738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152845
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5139	NC_010609	ATTT	2	8	234783	234790	25 %	75 %	0 %	0 %	184152845
5140	NC_010609	GCT	2	6	234916	234921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152846
5141	NC_010609	TGA	2	6	235011	235016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152846
5142	NC_010609	CAG	2	6	235045	235050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152846
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5144	NC_010609	TA	3	6	235187	235192	50 %	50 %	0 %	0 %	184152846
5145	NC_010609	CTT	2	6	235199	235204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152846
5146	NC_010609	AATG	2	8	235209	235216	50 %	25 %	25 %	0 %	184152846
5147	NC_010609	A	6	6	235335	235340	100 %	0 %	0 %	0 %	184152846
5148	NC_010609	TGA	2	6	235407	235412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152846
5149	NC_010609	AGC	2	6	235422	235427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152846
5150	NC_010609	ATA	2	6	235457	235462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152846
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5152	NC_010609	AAT	2	6	235642	235647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152846
5153	NC_010609	GAAA	2	8	235690	235697	75 %	0 %	25 %	0 %	184152846
5154	NC_010609	CGG	2	6	235729	235734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152846
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5157	NC_010609	TGT	2	6	235809	235814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152846
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5182	NC_010609	TTTC	2	8	236699	236706	0 %	75 %	0 %	25 %	184152846
5183	NC_010609	GAAA	2	8	236717	236724	75 %	0 %	25 %	0 %	184152846
5184	NC_010609	AG	3	6	236754	236759	50 %	0 %	50 %	0 %	184152846
5185	NC_010609	TGC	2	6	236982	236987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152846
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5189	NC_010609	AAG	2	6	237190	237195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5190	NC_010609	AC	3	6	237266	237271	50 %	0 %	0 %	50 %	184152847
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5201	NC_010609	GAAA	2	8	237707	237714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5202	NC_010609	A	6	6	237712	237717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5203	NC_010609	CTT	2	6	237735	237740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5224	NC_010609	TAT	3	9	238731	238739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_010609	TAG	2	6	238771	238776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_010609	ATG	2	6	238888	238893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5229	NC_010609	AGG	2	6	238968	238973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_010609	CAA	2	6	239123	239128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152849
5233	NC_010609	A	6	6	239157	239162	100 %	0 %	0 %	0 %	184152849
5234	NC_010609	CCG	2	6	239164	239169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152849
5235	NC_010609	ATT	2	6	239193	239198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152849
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5239	NC_010609	CAA	2	6	239507	239512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152849
5240	NC_010609	CCA	2	6	239543	239548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152849
5241	NC_010609	GCAAT	2	10	239607	239616	40 %	20 %	20 %	20 %	184152849
5242	NC_010609	TGA	2	6	239626	239631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152849
5243	NC_010609	AAAG	2	8	239647	239654	75 %	0 %	25 %	0 %	184152849
5244	NC_010609	TGG	2	6	239794	239799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152849
5245	NC_010609	GCG	2	6	239869	239874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152849
5246	NC_010609	TGC	2	6	239884	239889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152849
5247	NC_010609	AAG	2	6	239919	239924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152849
5248	NC_010609	AAG	2	6	239964	239969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152849
5249	NC_010609	ACT	2	6	239991	239996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152849
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5251	NC_010609	T	8	8	240061	240068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_010609	TAAT	2	8	240124	240131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_010609	A	6	6	240481	240486	100 %	0 %	0 %	0 %	184152850
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5282	NC_010609	TGT	2	6	241291	241296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152851
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5284	NC_010609	GCT	2	6	241331	241336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152851
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5492	NC_010609	TAA	2	6	250759	250764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152861
5493	NC_010609	AAAG	2	8	250786	250793	75 %	0 %	25 %	0 %	184152861
5494	NC_010609	AAG	2	6	250803	250808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152861
5495	NC_010609	CAA	2	6	250809	250814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152861
5496	NC_010609	AT	3	6	250816	250821	50 %	50 %	0 %	0 %	184152861
5497	NC_010609	GTC	2	6	250869	250874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152861
5498	NC_010609	GGGAC	2	10	250922	250931	20 %	0 %	60 %	20 %	184152861
5499	NC_010609	TGT	2	6	251014	251019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152861
5500	NC_010609	CTTTG	2	10	251022	251031	0 %	60 %	20 %	20 %	184152861

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