MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_010524	CG	3	6	1174272	1174277	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32503	NC_010524	GC	3	6	1174310	1174315	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32504	NC_010524	GGCG	2	8	1174322	1174329	0 %	0 %	75 %	25 %	171057785
32505	NC_010524	GCA	2	6	1174375	1174380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057785
32506	NC_010524	CGC	2	6	1174390	1174395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057785
32507	NC_010524	CTT	2	6	1174396	1174401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057785
32508	NC_010524	GC	3	6	1174430	1174435	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32509	NC_010524	TGCG	2	8	1174451	1174458	0 %	25 %	50 %	25 %	171057785
32510	NC_010524	CG	3	6	1174486	1174491	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32511	NC_010524	GC	3	6	1174496	1174501	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32512	NC_010524	GCCG	2	8	1174537	1174544	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32513	NC_010524	GCGCC	2	10	1174614	1174623	0 %	0 %	40 %	60 %	171057786
32514	NC_010524	GGCA	2	8	1174624	1174631	25 %	0 %	50 %	25 %	171057786
32515	NC_010524	TGC	2	6	1174697	1174702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057786
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32517	NC_010524	CGA	2	6	1174749	1174754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
32518	NC_010524	GC	3	6	1174791	1174796	0 %	0 %	50 %	50 %	171057786
32519	NC_010524	CGA	2	6	1174819	1174824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
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32521	NC_010524	CAG	2	6	1174843	1174848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
32522	NC_010524	GC	3	6	1174876	1174881	0 %	0 %	50 %	50 %	171057786
32523	NC_010524	CAG	2	6	1174882	1174887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
32524	NC_010524	CAG	2	6	1174903	1174908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
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32528	NC_010524	TGC	2	6	1175037	1175042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057786
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32531	NC_010524	CG	3	6	1175097	1175102	0 %	0 %	50 %	50 %	171057786
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32533	NC_010524	CTG	2	6	1175191	1175196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057786
32534	NC_010524	CGA	2	6	1175232	1175237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
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32536	NC_010524	CGA	2	6	1175256	1175261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057786
32537	NC_010524	CGGT	2	8	1175264	1175271	0 %	25 %	50 %	25 %	171057786
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32539	NC_010524	GCG	3	9	1175309	1175317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057786
32540	NC_010524	GGGT	2	8	1175321	1175328	0 %	25 %	75 %	0 %	171057786
32541	NC_010524	GCG	2	6	1175332	1175337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057786
32542	NC_010524	T	6	6	1175410	1175415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32543	NC_010524	GCC	2	6	1175476	1175481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057787
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32546	NC_010524	GCT	2	6	1175577	1175582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057787
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32550	NC_010524	CACGG	2	10	1175795	1175804	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32551	NC_010524	TGC	2	6	1175809	1175814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32552	NC_010524	ACCT	2	8	1175851	1175858	25 %	25 %	0 %	50 %	171057788
32553	NC_010524	CTG	3	9	1175875	1175883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057788
32554	NC_010524	GCTG	2	8	1175885	1175892	0 %	25 %	50 %	25 %	171057788
32555	NC_010524	TCA	2	6	1175897	1175902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057788
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32559	NC_010524	GCG	2	6	1175999	1176004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057788
32560	NC_010524	CGG	3	9	1176021	1176029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057788
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32571	NC_010524	GCCG	2	8	1176391	1176398	0 %	0 %	50 %	50 %	171057788
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32573	NC_010524	CTG	2	6	1176409	1176414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057788
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32585	NC_010524	TGG	2	6	1176725	1176730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057788
32586	NC_010524	GCT	2	6	1176738	1176743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057788
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32588	NC_010524	GTC	2	6	1176784	1176789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057788
32589	NC_010524	CGG	2	6	1176797	1176802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057788
32590	NC_010524	CAT	2	6	1176834	1176839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057788
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32592	NC_010524	CAA	2	6	1176879	1176884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057788
32593	NC_010524	AGC	2	6	1176917	1176922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057788
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32597	NC_010524	CAT	2	6	1177052	1177057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32599	NC_010524	CTG	2	6	1177124	1177129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057789
32600	NC_010524	TGC	2	6	1177161	1177166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057789
32601	NC_010524	CGC	2	6	1177198	1177203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057789
32602	NC_010524	CCTG	2	8	1177251	1177258	0 %	25 %	25 %	50 %	171057789
32603	NC_010524	CACCGC	2	12	1177270	1177281	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171057789
32604	NC_010524	GTC	2	6	1177291	1177296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057789
32605	NC_010524	TCG	2	6	1177299	1177304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057789
32606	NC_010524	TGG	2	6	1177314	1177319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057789
32607	NC_010524	TGG	2	6	1177335	1177340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057789
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32610	NC_010524	AGA	2	6	1177455	1177460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057789
32611	NC_010524	CCGG	2	8	1177467	1177474	0 %	0 %	50 %	50 %	171057789
32612	NC_010524	GGCCTG	2	12	1177493	1177504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057789
32613	NC_010524	TCG	2	6	1177527	1177532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057789
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32732	NC_010524	TCG	2	6	1181680	1181685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
32733	NC_010524	GGT	2	6	1181709	1181714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057791
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32735	NC_010524	CGT	2	6	1181786	1181791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
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32738	NC_010524	GTC	2	6	1181916	1181921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
32739	NC_010524	GTC	2	6	1181976	1181981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
32740	NC_010524	TCG	2	6	1182007	1182012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
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32743	NC_010524	CGGC	2	8	1182043	1182050	0 %	0 %	50 %	50 %	171057791
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32759	NC_010524	GCT	2	6	1182530	1182535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057791
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32767	NC_010524	GCACC	2	10	1182794	1182803	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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32770	NC_010524	CG	3	6	1182877	1182882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32771	NC_010524	TGC	2	6	1182923	1182928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32832	NC_010524	GC	3	6	1184699	1184704	0 %	0 %	50 %	50 %	171057793
32833	NC_010524	CGGC	2	8	1184774	1184781	0 %	0 %	50 %	50 %	171057793
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32845	NC_010524	GCT	3	9	1185106	1185114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057794
32846	NC_010524	GC	3	6	1185145	1185150	0 %	0 %	50 %	50 %	171057794
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