MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_010524	GCTGC	2	10	1155611	1155620	0 %	20 %	40 %	40 %	171057768
32003	NC_010524	CGGCGA	2	12	1155638	1155649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057768
32004	NC_010524	TGG	2	6	1155655	1155660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057768
32005	NC_010524	TGC	2	6	1155661	1155666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057768
32006	NC_010524	CGA	2	6	1155674	1155679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057768
32007	NC_010524	CGC	2	6	1155680	1155685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057768
32008	NC_010524	CTGG	2	8	1155746	1155753	0 %	25 %	50 %	25 %	171057768
32009	NC_010524	GCC	2	6	1155801	1155806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057768
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32011	NC_010524	CGG	4	12	1155865	1155876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057768
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32013	NC_010524	GCC	2	6	1156077	1156082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057769
32014	NC_010524	GCC	2	6	1156107	1156112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057769
32015	NC_010524	TGC	2	6	1156132	1156137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057769
32016	NC_010524	CGA	2	6	1156202	1156207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057769
32017	NC_010524	AAG	2	6	1156236	1156241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057769
32018	NC_010524	GGT	3	9	1156250	1156258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057769
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32023	NC_010524	TGC	2	6	1156460	1156465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057769
32024	NC_010524	TGA	2	6	1156501	1156506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057769
32025	NC_010524	CGG	2	6	1156514	1156519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057769
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32030	NC_010524	GAAG	2	8	1156613	1156620	50 %	0 %	50 %	0 %	171057769
32031	NC_010524	CAT	2	6	1156625	1156630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057769
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32039	NC_010524	GGTG	2	8	1156817	1156824	0 %	25 %	75 %	0 %	171057769
32040	NC_010524	AAG	2	6	1156825	1156830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057769
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32052	NC_010524	AAGT	2	8	1157292	1157299	50 %	25 %	25 %	0 %	171057769
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32054	NC_010524	GCC	2	6	1157327	1157332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32055	NC_010524	CTT	2	6	1157334	1157339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32056	NC_010524	CG	3	6	1157357	1157362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32057	NC_010524	TG	3	6	1157363	1157368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32058	NC_010524	CGGC	3	12	1157393	1157404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32059	NC_010524	GCC	2	6	1157425	1157430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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32063	NC_010524	GCC	2	6	1157538	1157543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057770
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32084	NC_010524	TCA	2	6	1158229	1158234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057770
32085	NC_010524	TGA	3	9	1158253	1158261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057770
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32089	NC_010524	CTG	2	6	1158435	1158440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057770
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32099	NC_010524	GC	3	6	1158769	1158774	0 %	0 %	50 %	50 %	171057770
32100	NC_010524	TCG	2	6	1158820	1158825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057770
32101	NC_010524	TGG	2	6	1158835	1158840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057770
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32103	NC_010524	GGTGC	2	10	1158930	1158939	0 %	20 %	60 %	20 %	171057770
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32107	NC_010524	GCT	2	6	1159144	1159149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057771
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32111	NC_010524	GGCATG	2	12	1159319	1159330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057771
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32114	NC_010524	TGG	2	6	1159461	1159466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057771
32115	NC_010524	CTG	2	6	1159481	1159486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057771
32116	NC_010524	CTT	2	6	1159501	1159506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057771
32117	NC_010524	ATC	2	6	1159544	1159549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057771
32118	NC_010524	TGC	2	6	1159575	1159580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057771
32119	NC_010524	TTC	2	6	1159583	1159588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057771
32120	NC_010524	CGG	2	6	1159606	1159611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057771
32121	NC_010524	CAA	2	6	1159612	1159617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057771
32122	NC_010524	GTG	2	6	1159700	1159705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057771
32123	NC_010524	CTT	2	6	1159714	1159719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057771
32124	NC_010524	CAT	2	6	1159897	1159902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057771
32125	NC_010524	CGG	2	6	1159923	1159928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057771
32126	NC_010524	ATCG	2	8	1159930	1159937	25 %	25 %	25 %	25 %	171057771
32127	NC_010524	CTT	2	6	1159999	1160004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057771
32128	NC_010524	GC	3	6	1160067	1160072	0 %	0 %	50 %	50 %	171057771
32129	NC_010524	AAG	2	6	1160123	1160128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057771
32130	NC_010524	AGG	2	6	1160133	1160138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057771
32131	NC_010524	CG	3	6	1160170	1160175	0 %	0 %	50 %	50 %	171057772
32132	NC_010524	CG	3	6	1160178	1160183	0 %	0 %	50 %	50 %	171057772
32133	NC_010524	GCC	2	6	1160206	1160211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057772
32134	NC_010524	GCC	2	6	1160255	1160260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057772
32135	NC_010524	TGC	2	6	1160261	1160266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32136	NC_010524	CACG	2	8	1160286	1160293	25 %	0 %	25 %	50 %	171057772
32137	NC_010524	AGCCTG	2	12	1160353	1160364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32138	NC_010524	GCTGC	2	10	1160382	1160391	0 %	20 %	40 %	40 %	171057772
32139	NC_010524	ATC	2	6	1160392	1160397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057772
32140	NC_010524	GAC	2	6	1160418	1160423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32141	NC_010524	ATG	2	6	1160425	1160430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057772
32142	NC_010524	TCA	2	6	1160435	1160440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057772
32143	NC_010524	CGT	2	6	1160471	1160476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32144	NC_010524	CTG	2	6	1160494	1160499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32145	NC_010524	ATCGGC	2	12	1160527	1160538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32146	NC_010524	GAA	2	6	1160566	1160571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057772
32147	NC_010524	CTCGCG	2	12	1160596	1160607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057772
32148	NC_010524	GC	6	12	1160616	1160627	0 %	0 %	50 %	50 %	171057772
32149	NC_010524	GCG	2	6	1160648	1160653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057772
32150	NC_010524	ATC	2	6	1160677	1160682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057772
32151	NC_010524	CCG	2	6	1160717	1160722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057772
32152	NC_010524	CTG	2	6	1160725	1160730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32153	NC_010524	TGC	2	6	1160765	1160770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32154	NC_010524	GCT	4	12	1160787	1160798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32155	NC_010524	CGA	2	6	1160799	1160804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32156	NC_010524	GACG	2	8	1160820	1160827	25 %	0 %	50 %	25 %	171057772
32157	NC_010524	CCG	2	6	1160843	1160848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057772
32158	NC_010524	GCA	2	6	1160871	1160876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32159	NC_010524	TGG	4	12	1160882	1160893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057772
32160	NC_010524	TCG	2	6	1160909	1160914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32161	NC_010524	AAG	2	6	1160935	1160940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057772
32162	NC_010524	TGC	2	6	1160948	1160953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057772
32163	NC_010524	TGT	2	6	1160981	1160986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057772
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32166	NC_010524	CGG	2	6	1161078	1161083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057773
32167	NC_010524	CGT	2	6	1161135	1161140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057773
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32172	NC_010524	GGCCT	2	10	1161343	1161352	0 %	20 %	40 %	40 %	171057773
32173	NC_010524	GCA	2	6	1161362	1161367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057773
32174	NC_010524	GAT	2	6	1161414	1161419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057773
32175	NC_010524	GGC	2	6	1161430	1161435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057773
32176	NC_010524	CAG	4	12	1161451	1161462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057773
32177	NC_010524	CG	3	6	1161471	1161476	0 %	0 %	50 %	50 %	171057773
32178	NC_010524	GCT	2	6	1161498	1161503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057773
32179	NC_010524	CGA	2	6	1161510	1161515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057773
32180	NC_010524	CCGA	2	8	1161517	1161524	25 %	0 %	25 %	50 %	171057773
32181	NC_010524	CCAGC	2	10	1161531	1161540	20 %	0 %	20 %	60 %	171057773
32182	NC_010524	ATC	2	6	1161541	1161546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057773
32183	NC_010524	TGC	2	6	1161627	1161632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057773
32184	NC_010524	ATC	2	6	1161673	1161678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057773
32185	NC_010524	GC	3	6	1161679	1161684	0 %	0 %	50 %	50 %	171057773
32186	NC_010524	TCA	2	6	1161693	1161698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057773
32187	NC_010524	GT	3	6	1161741	1161746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32188	NC_010524	CGC	2	6	1161771	1161776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32189	NC_010524	CCCCG	2	10	1161807	1161816	0 %	0 %	20 %	80 %	171057774
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32191	NC_010524	ATGCC	2	10	1161905	1161914	20 %	20 %	20 %	40 %	171057774
32192	NC_010524	GGGC	2	8	1161948	1161955	0 %	0 %	75 %	25 %	171057774
32193	NC_010524	CGG	2	6	1162016	1162021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057774
32194	NC_010524	GCC	2	6	1162069	1162074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057774
32195	NC_010524	TCG	2	6	1162094	1162099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32196	NC_010524	TGC	2	6	1162145	1162150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32197	NC_010524	GC	3	6	1162149	1162154	0 %	0 %	50 %	50 %	171057774
32198	NC_010524	GCC	2	6	1162163	1162168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057774
32199	NC_010524	GC	3	6	1162170	1162175	0 %	0 %	50 %	50 %	171057774
32200	NC_010524	CGG	2	6	1162212	1162217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057774
32201	NC_010524	CAC	2	6	1162235	1162240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057774
32202	NC_010524	TGC	2	6	1162331	1162336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32203	NC_010524	G	6	6	1162344	1162349	0 %	0 %	100 %	0 %	171057774
32204	NC_010524	CGTGGC	2	12	1162410	1162421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057774
32205	NC_010524	GC	3	6	1162463	1162468	0 %	0 %	50 %	50 %	171057774
32206	NC_010524	GAA	2	6	1162500	1162505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057774
32207	NC_010524	CGT	2	6	1162506	1162511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32208	NC_010524	CAC	2	6	1162556	1162561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057774
32209	NC_010524	CTG	2	6	1162687	1162692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32210	NC_010524	CGCAG	2	10	1162694	1162703	20 %	0 %	40 %	40 %	171057774
32211	NC_010524	GGC	2	6	1162797	1162802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057774
32212	NC_010524	GCT	2	6	1162803	1162808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32213	NC_010524	TGC	2	6	1162824	1162829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32214	NC_010524	TGC	2	6	1162854	1162859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32215	NC_010524	CGA	2	6	1162917	1162922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32216	NC_010524	CGG	2	6	1162934	1162939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057774
32217	NC_010524	GTGGC	2	10	1162940	1162949	0 %	20 %	60 %	20 %	171057774
32218	NC_010524	GCC	2	6	1162953	1162958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057774
32219	NC_010524	CGA	2	6	1162974	1162979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057774
32220	NC_010524	GCG	2	6	1163092	1163097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057774
32221	NC_010524	GC	3	6	1163110	1163115	0 %	0 %	50 %	50 %	171057774
32222	NC_010524	TGAAA	2	10	1163152	1163161	60 %	20 %	20 %	0 %	171057774
32223	NC_010524	AGG	2	6	1163174	1163179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32224	NC_010524	CGA	2	6	1163208	1163213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32225	NC_010524	GGC	2	6	1163243	1163248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057775
32226	NC_010524	AGC	2	6	1163284	1163289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057775
32227	NC_010524	TTCGGG	2	12	1163301	1163312	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057775
32228	NC_010524	GTT	2	6	1163367	1163372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057775
32229	NC_010524	GTG	2	6	1163422	1163427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057775
32230	NC_010524	CCAC	3	12	1163488	1163499	25 %	0 %	0 %	75 %	171057775
32231	NC_010524	CAC	2	6	1163510	1163515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057775
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32350	NC_010524	CGTG	2	8	1168525	1168532	0 %	25 %	50 %	25 %	171057781
32351	NC_010524	GCC	2	6	1168557	1168562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057781
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32358	NC_010524	GCT	2	6	1168681	1168686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057781
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32362	NC_010524	GC	3	6	1168757	1168762	0 %	0 %	50 %	50 %	171057781
32363	NC_010524	CTT	2	6	1168781	1168786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057781
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32462	NC_010524	GCCG	2	8	1172626	1172633	0 %	0 %	50 %	50 %	171057784
32463	NC_010524	GCC	2	6	1172642	1172647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057784
32464	NC_010524	CAG	2	6	1172678	1172683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057784
32465	NC_010524	GTC	2	6	1172691	1172696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057784
32466	NC_010524	GCT	2	6	1172788	1172793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057784
32467	NC_010524	GC	3	6	1172794	1172799	0 %	0 %	50 %	50 %	171057784
32468	NC_010524	AGGT	2	8	1172820	1172827	25 %	25 %	50 %	0 %	171057784
32469	NC_010524	TG	3	6	1172866	1172871	0 %	50 %	50 %	0 %	171057784
32470	NC_010524	GGC	2	6	1173010	1173015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057784
32471	NC_010524	GGT	2	6	1173023	1173028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057784
32472	NC_010524	GAT	2	6	1173029	1173034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057784
32473	NC_010524	AGGC	2	8	1173044	1173051	25 %	0 %	50 %	25 %	171057784
32474	NC_010524	CACG	2	8	1173067	1173074	25 %	0 %	25 %	50 %	171057784
32475	NC_010524	GGC	2	6	1173110	1173115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057784
32476	NC_010524	GCT	2	6	1173121	1173126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057784
32477	NC_010524	GCG	2	6	1173145	1173150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057784
32478	NC_010524	GGCC	2	8	1173163	1173170	0 %	0 %	50 %	50 %	171057784
32479	NC_010524	TGG	2	6	1173184	1173189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057784
32480	NC_010524	CAC	2	6	1173284	1173289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057784
32481	NC_010524	GCG	2	6	1173312	1173317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057784
32482	NC_010524	GTG	2	6	1173321	1173326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057784
32483	NC_010524	CAAAG	2	10	1173457	1173466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32484	NC_010524	CAA	2	6	1173536	1173541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32485	NC_010524	ACTC	2	8	1173561	1173568	25 %	25 %	0 %	50 %	171057785
32486	NC_010524	GCG	2	6	1173632	1173637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057785
32487	NC_010524	GCC	2	6	1173706	1173711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057785
32488	NC_010524	ATGC	2	8	1173725	1173732	25 %	25 %	25 %	25 %	171057785
32489	NC_010524	GCCG	2	8	1173747	1173754	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32490	NC_010524	GAA	2	6	1173803	1173808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057785
32491	NC_010524	GCG	2	6	1173886	1173891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057785
32492	NC_010524	TCG	2	6	1173936	1173941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057785
32493	NC_010524	GCC	2	6	1173968	1173973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057785
32494	NC_010524	CCA	2	6	1173982	1173987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057785
32495	NC_010524	CCAGC	2	10	1174022	1174031	20 %	0 %	20 %	60 %	171057785
32496	NC_010524	GAT	2	6	1174055	1174060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057785
32497	NC_010524	CG	3	6	1174069	1174074	0 %	0 %	50 %	50 %	171057785
32498	NC_010524	CGA	2	6	1174159	1174164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057785
32499	NC_010524	GCG	2	6	1174167	1174172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057785
32500	NC_010524	GCA	2	6	1174249	1174254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057785

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