MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_010524	CCA	2	6	1139205	1139210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057753
31502	NC_010524	GC	3	6	1139228	1139233	0 %	0 %	50 %	50 %	171057753
31503	NC_010524	GAC	2	6	1139248	1139253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057753
31504	NC_010524	GC	3	6	1139325	1139330	0 %	0 %	50 %	50 %	171057753
31505	NC_010524	GTC	2	6	1139341	1139346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057753
31506	NC_010524	GC	3	6	1139385	1139390	0 %	0 %	50 %	50 %	171057753
31507	NC_010524	CGG	2	6	1139413	1139418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057753
31508	NC_010524	GCC	2	6	1139447	1139452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057753
31509	NC_010524	TCG	2	6	1139516	1139521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057753
31510	NC_010524	TTC	2	6	1139588	1139593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057753
31511	NC_010524	GAA	2	6	1139623	1139628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057753
31512	NC_010524	CAG	2	6	1139668	1139673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057753
31513	NC_010524	GGT	2	6	1139680	1139685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057753
31514	NC_010524	GTCGAG	2	12	1139698	1139709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057753
31515	NC_010524	CTGG	2	8	1139728	1139735	0 %	25 %	50 %	25 %	171057753
31516	NC_010524	GGC	2	6	1139743	1139748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057753
31517	NC_010524	CTG	2	6	1139876	1139881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31518	NC_010524	GCA	2	6	1139886	1139891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31519	NC_010524	GCA	2	6	1139934	1139939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31520	NC_010524	GC	3	6	1139940	1139945	0 %	0 %	50 %	50 %	171057754
31521	NC_010524	CGC	2	6	1139948	1139953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057754
31522	NC_010524	CCA	2	6	1139988	1139993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31523	NC_010524	GCA	2	6	1139994	1139999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31524	NC_010524	CGC	2	6	1140006	1140011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057754
31525	NC_010524	CAC	2	6	1140016	1140021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31526	NC_010524	AGC	2	6	1140038	1140043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31527	NC_010524	CAC	2	6	1140169	1140174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31528	NC_010524	GAGCGC	2	12	1140199	1140210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057754
31529	NC_010524	CAGC	2	8	1140286	1140293	25 %	0 %	25 %	50 %	171057754
31530	NC_010524	TGC	2	6	1140302	1140307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31531	NC_010524	GGC	2	6	1140315	1140320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057754
31532	NC_010524	CAG	2	6	1140340	1140345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31533	NC_010524	CGG	2	6	1140354	1140359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057754
31534	NC_010524	GCG	2	6	1140362	1140367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057754
31535	NC_010524	GCA	2	6	1140369	1140374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31536	NC_010524	GCA	2	6	1140423	1140428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31537	NC_010524	CAG	2	6	1140445	1140450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31538	NC_010524	CGAG	2	8	1140465	1140472	25 %	0 %	50 %	25 %	171057754
31539	NC_010524	CAG	2	6	1140481	1140486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31540	NC_010524	TGA	2	6	1140600	1140605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057754
31541	NC_010524	GC	3	6	1140609	1140614	0 %	0 %	50 %	50 %	171057754
31542	NC_010524	ACC	2	6	1140629	1140634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31543	NC_010524	CGG	2	6	1140642	1140647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057754
31544	NC_010524	GCC	2	6	1140658	1140663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057754
31545	NC_010524	GGCCG	2	10	1140667	1140676	0 %	0 %	60 %	40 %	171057754
31546	NC_010524	CACCGC	2	12	1140709	1140720	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171057754
31547	NC_010524	CAG	2	6	1140727	1140732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31548	NC_010524	AGC	2	6	1140746	1140751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31549	NC_010524	CTGG	2	8	1140763	1140770	0 %	25 %	50 %	25 %	171057754
31550	NC_010524	CAG	3	9	1140811	1140819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31551	NC_010524	TGGC	2	8	1140848	1140855	0 %	25 %	50 %	25 %	171057754
31552	NC_010524	CCA	2	6	1140873	1140878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31553	NC_010524	GTG	2	6	1140893	1140898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057754
31554	NC_010524	GC	3	6	1140910	1140915	0 %	0 %	50 %	50 %	171057754
31555	NC_010524	GGCC	2	8	1140939	1140946	0 %	0 %	50 %	50 %	171057754
31556	NC_010524	CAG	3	9	1140955	1140963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31557	NC_010524	CCAGC	2	10	1141033	1141042	20 %	0 %	20 %	60 %	171057754
31558	NC_010524	CCA	2	6	1141044	1141049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057754
31559	NC_010524	TCA	2	6	1141050	1141055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057754
31560	NC_010524	GGT	2	6	1141072	1141077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057754
31561	NC_010524	GCA	2	6	1141116	1141121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31562	NC_010524	GCG	2	6	1141124	1141129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057754
31563	NC_010524	GTC	2	6	1141172	1141177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057754
31564	NC_010524	TGC	2	6	1141240	1141245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057755
31565	NC_010524	GCT	2	6	1141283	1141288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057755
31566	NC_010524	GCC	2	6	1141318	1141323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057755
31567	NC_010524	CAG	2	6	1141434	1141439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057755
31568	NC_010524	GCG	2	6	1141451	1141456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057755
31569	NC_010524	GC	3	6	1141464	1141469	0 %	0 %	50 %	50 %	171057755
31570	NC_010524	CAGCGC	2	12	1141470	1141481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057755
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31572	NC_010524	GGC	2	6	1141560	1141565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057755
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31574	NC_010524	CTG	2	6	1141626	1141631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057755
31575	NC_010524	GCT	2	6	1141641	1141646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057755
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31577	NC_010524	CCA	2	6	1141745	1141750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057755
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31583	NC_010524	GCCA	2	8	1141897	1141904	25 %	0 %	25 %	50 %	171057755
31584	NC_010524	GCA	2	6	1141913	1141918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057755
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31586	NC_010524	GTG	2	6	1141982	1141987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057756
31587	NC_010524	GGCG	2	8	1142018	1142025	0 %	0 %	75 %	25 %	171057756
31588	NC_010524	GCG	2	6	1142061	1142066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057756
31589	NC_010524	CGTG	2	8	1142083	1142090	0 %	25 %	50 %	25 %	171057756
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31591	NC_010524	GTGC	2	8	1142137	1142144	0 %	25 %	50 %	25 %	171057756
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31595	NC_010524	GC	3	6	1142409	1142414	0 %	0 %	50 %	50 %	171057756
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31598	NC_010524	CGA	2	6	1142440	1142445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057756
31599	NC_010524	CCA	2	6	1142470	1142475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057756
31600	NC_010524	CGG	2	6	1142494	1142499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057756
31601	NC_010524	CG	3	6	1142503	1142508	0 %	0 %	50 %	50 %	171057756
31602	NC_010524	GGC	2	6	1142594	1142599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057756
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31604	NC_010524	TTG	2	6	1142646	1142651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057756
31605	NC_010524	GGGT	2	8	1142708	1142715	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31606	NC_010524	GC	3	6	1142731	1142736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31607	NC_010524	GCG	2	6	1142759	1142764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31608	NC_010524	GCA	2	6	1142788	1142793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057757
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31610	NC_010524	CAG	2	6	1142855	1142860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057757
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31612	NC_010524	CCG	2	6	1142878	1142883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057757
31613	NC_010524	CCGG	2	8	1142903	1142910	0 %	0 %	50 %	50 %	171057757
31614	NC_010524	CGT	2	6	1142920	1142925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057757
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31848	NC_010524	TGG	2	6	1151162	1151167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31849	NC_010524	CGT	2	6	1151181	1151186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31850	NC_010524	GGT	2	6	1151214	1151219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31851	NC_010524	TGA	2	6	1151224	1151229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31852	NC_010524	GCG	4	12	1151242	1151253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31853	NC_010524	CGGG	2	8	1151265	1151272	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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31856	NC_010524	CGG	2	6	1151394	1151399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057767
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31862	NC_010524	CGG	2	6	1151536	1151541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057767
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31953	NC_010524	GCT	2	6	1154428	1154433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057767
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31956	NC_010524	CGGCG	2	10	1154548	1154557	0 %	0 %	60 %	40 %	171057767
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31960	NC_010524	GC	6	12	1154697	1154708	0 %	0 %	50 %	50 %	171057767
31961	NC_010524	GCC	2	6	1154713	1154718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057767
31962	NC_010524	CCG	2	6	1154735	1154740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057767
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