MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_010524	CTCTT	2	10	1120597	1120606	0 %	60 %	0 %	40 %	171057736
31002	NC_010524	GAAC	2	8	1120644	1120651	50 %	0 %	25 %	25 %	171057736
31003	NC_010524	CGA	2	6	1120707	1120712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31004	NC_010524	GCT	2	6	1120728	1120733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31005	NC_010524	CGT	2	6	1120740	1120745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31006	NC_010524	GC	3	6	1120780	1120785	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31007	NC_010524	CGC	2	6	1120809	1120814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057736
31008	NC_010524	GCG	2	6	1120858	1120863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057736
31009	NC_010524	GCG	2	6	1120868	1120873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057736
31010	NC_010524	CG	4	8	1120872	1120879	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31011	NC_010524	CGG	2	6	1120899	1120904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057736
31012	NC_010524	CGG	2	6	1120908	1120913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057736
31013	NC_010524	ACC	2	6	1120991	1120996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057736
31014	NC_010524	GC	3	6	1120997	1121002	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31015	NC_010524	TAC	2	6	1121041	1121046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057736
31016	NC_010524	GACGCC	2	12	1121047	1121058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057736
31017	NC_010524	GCCG	2	8	1121103	1121110	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31018	NC_010524	TGC	3	9	1121120	1121128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31019	NC_010524	CTG	2	6	1121133	1121138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31020	NC_010524	GCA	2	6	1121178	1121183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31021	NC_010524	GGT	2	6	1121184	1121189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057736
31022	NC_010524	GCA	2	6	1121280	1121285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057736
31023	NC_010524	GCC	2	6	1121293	1121298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057736
31024	NC_010524	CTT	2	6	1121307	1121312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057736
31025	NC_010524	GC	3	6	1121363	1121368	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31026	NC_010524	GGT	2	6	1121373	1121378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057736
31027	NC_010524	CG	4	8	1121400	1121407	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31028	NC_010524	ACT	2	6	1121441	1121446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057736
31029	NC_010524	CCG	2	6	1121452	1121457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057736
31030	NC_010524	GGT	2	6	1121472	1121477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057736
31031	NC_010524	GC	3	6	1121505	1121510	0 %	0 %	50 %	50 %	171057736
31032	NC_010524	GCC	2	6	1121587	1121592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057736
31033	NC_010524	AAC	2	6	1121737	1121742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057736
31034	NC_010524	GTG	2	6	1121758	1121763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057736
31035	NC_010524	GCCGTT	2	12	1121852	1121863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31036	NC_010524	CCA	2	6	1121897	1121902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057737
31037	NC_010524	CAG	2	6	1121928	1121933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31038	NC_010524	GCGCG	2	10	1121934	1121943	0 %	0 %	60 %	40 %	171057737
31039	NC_010524	GTC	2	6	1121974	1121979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31040	NC_010524	CGGG	2	8	1121992	1121999	0 %	0 %	75 %	25 %	171057737
31041	NC_010524	CAG	2	6	1122015	1122020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31042	NC_010524	CCAGG	2	10	1122024	1122033	20 %	0 %	40 %	40 %	171057737
31043	NC_010524	CGC	2	6	1122083	1122088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057737
31044	NC_010524	CGC	2	6	1122122	1122127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057737
31045	NC_010524	GCC	2	6	1122145	1122150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057737
31046	NC_010524	GC	3	6	1122173	1122178	0 %	0 %	50 %	50 %	171057737
31047	NC_010524	CGG	2	6	1122284	1122289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057737
31048	NC_010524	GCGG	2	8	1122320	1122327	0 %	0 %	75 %	25 %	171057737
31049	NC_010524	CGA	2	6	1122338	1122343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31050	NC_010524	CAG	2	6	1122363	1122368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31051	NC_010524	CGCGAT	2	12	1122369	1122380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31052	NC_010524	CGC	2	6	1122389	1122394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057737
31053	NC_010524	TCG	2	6	1122418	1122423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31054	NC_010524	CGG	2	6	1122479	1122484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057737
31055	NC_010524	AGC	2	6	1122532	1122537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31056	NC_010524	GC	3	6	1122556	1122561	0 %	0 %	50 %	50 %	171057737
31057	NC_010524	GAC	3	9	1122606	1122614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31058	NC_010524	GCT	2	6	1122642	1122647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31059	NC_010524	CAC	2	6	1122699	1122704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057737
31060	NC_010524	GTC	2	6	1122795	1122800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057737
31061	NC_010524	GGC	2	6	1122892	1122897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31062	NC_010524	ACC	2	6	1122943	1122948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31063	NC_010524	GT	3	6	1122961	1122966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31064	NC_010524	TGC	2	6	1122975	1122980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31065	NC_010524	CG	3	6	1122995	1123000	0 %	0 %	50 %	50 %	171057738
31066	NC_010524	CGC	2	6	1123025	1123030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057738
31067	NC_010524	GCG	2	6	1123054	1123059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057738
31068	NC_010524	GGC	2	6	1123073	1123078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057738
31069	NC_010524	TGC	2	6	1123087	1123092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057738
31070	NC_010524	GCA	2	6	1123136	1123141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057738
31071	NC_010524	CAC	2	6	1123144	1123149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057738
31072	NC_010524	CCA	2	6	1123166	1123171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057738
31073	NC_010524	GCC	2	6	1123333	1123338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057739
31074	NC_010524	AGC	2	6	1123387	1123392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31075	NC_010524	GCT	2	6	1123460	1123465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31076	NC_010524	GCA	3	9	1123481	1123489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31077	NC_010524	CTG	2	6	1123509	1123514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31078	NC_010524	CAG	2	6	1123593	1123598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
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31081	NC_010524	GCAG	2	8	1123709	1123716	25 %	0 %	50 %	25 %	171057739
31082	NC_010524	ACC	3	9	1123717	1123725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057739
31083	NC_010524	CTG	2	6	1123743	1123748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31084	NC_010524	GCA	2	6	1123769	1123774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31085	NC_010524	GCG	2	6	1123784	1123789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057739
31086	NC_010524	GCTG	2	8	1123805	1123812	0 %	25 %	50 %	25 %	171057739
31087	NC_010524	CCG	3	9	1123847	1123855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057739
31088	NC_010524	GCG	2	6	1123901	1123906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057739
31089	NC_010524	GGGCC	2	10	1123910	1123919	0 %	0 %	60 %	40 %	171057739
31090	NC_010524	CGG	2	6	1123925	1123930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057739
31091	NC_010524	GCCGG	3	15	1123950	1123964	0 %	0 %	60 %	40 %	171057739
31092	NC_010524	CCG	2	6	1123987	1123992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057739
31093	NC_010524	TTG	2	6	1123996	1124001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057739
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31097	NC_010524	TCG	2	6	1124236	1124241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
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31099	NC_010524	GGCC	2	8	1124318	1124325	0 %	0 %	50 %	50 %	171057739
31100	NC_010524	CG	3	6	1124366	1124371	0 %	0 %	50 %	50 %	171057739
31101	NC_010524	TCT	2	6	1124375	1124380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057739
31102	NC_010524	TCG	2	6	1124452	1124457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31103	NC_010524	GCG	2	6	1124503	1124508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057739
31104	NC_010524	CAG	2	6	1124568	1124573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31105	NC_010524	CG	3	6	1124574	1124579	0 %	0 %	50 %	50 %	171057739
31106	NC_010524	CCGC	2	8	1124687	1124694	0 %	0 %	25 %	75 %	171057739
31107	NC_010524	CCA	2	6	1124710	1124715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057739
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31110	NC_010524	TCG	2	6	1124791	1124796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31111	NC_010524	GC	4	8	1124801	1124808	0 %	0 %	50 %	50 %	171057739
31112	NC_010524	TGC	2	6	1124843	1124848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31113	NC_010524	GCA	2	6	1124897	1124902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057739
31114	NC_010524	GCC	2	6	1124929	1124934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057739
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31116	NC_010524	CGT	2	6	1124948	1124953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057739
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31230	NC_010524	CAG	2	6	1128935	1128940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31231	NC_010524	CAG	3	9	1128959	1128967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
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31233	NC_010524	CAG	2	6	1129100	1129105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31234	NC_010524	CAG	2	6	1129118	1129123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31235	NC_010524	GCC	2	6	1129142	1129147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057744
31236	NC_010524	GTC	2	6	1129181	1129186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31237	NC_010524	GCG	2	6	1129309	1129314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057744
31238	NC_010524	CAG	2	6	1129331	1129336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
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31240	NC_010524	GCA	3	9	1129405	1129413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31241	NC_010524	CAG	2	6	1129421	1129426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31242	NC_010524	GCA	2	6	1129441	1129446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31243	NC_010524	CAG	3	9	1129448	1129456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
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31245	NC_010524	CAG	2	6	1129481	1129486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057744
31246	NC_010524	CGAGC	2	10	1129560	1129569	20 %	0 %	40 %	40 %	171057744
31247	NC_010524	GC	3	6	1129594	1129599	0 %	0 %	50 %	50 %	171057745
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31256	NC_010524	CGT	2	6	1129790	1129795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057745
31257	NC_010524	TCG	2	6	1129825	1129830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057745
31258	NC_010524	GAA	2	6	1129920	1129925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057745
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31260	NC_010524	GC	4	8	1130069	1130076	0 %	0 %	50 %	50 %	171057745
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31263	NC_010524	GC	3	6	1130184	1130189	0 %	0 %	50 %	50 %	171057745
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31332	NC_010524	GGC	2	6	1132987	1132992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057747
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31343	NC_010524	CGGCG	2	10	1133408	1133417	0 %	0 %	60 %	40 %	171057747
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31346	NC_010524	GGC	2	6	1133475	1133480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057747
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31348	NC_010524	GAT	2	6	1133564	1133569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057747
31349	NC_010524	CGA	3	9	1133588	1133596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057747
31350	NC_010524	GAT	2	6	1133612	1133617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057747
31351	NC_010524	ACG	2	6	1133629	1133634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057747
31352	NC_010524	TGG	2	6	1133728	1133733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057747
31353	NC_010524	GGA	2	6	1133759	1133764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057747
31354	NC_010524	GGC	2	6	1133784	1133789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057748
31355	NC_010524	GCTG	2	8	1133790	1133797	0 %	25 %	50 %	25 %	171057748
31356	NC_010524	GCC	2	6	1133840	1133845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057748
31357	NC_010524	CGT	2	6	1133857	1133862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057748
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31362	NC_010524	GCT	2	6	1133953	1133958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057748
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31364	NC_010524	GCT	2	6	1133983	1133988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057748
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31367	NC_010524	GCT	2	6	1134148	1134153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057748
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31382	NC_010524	GTT	2	6	1134499	1134504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057748
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31411	NC_010524	CGT	2	6	1135479	1135484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31413	NC_010524	AACG	2	8	1135507	1135514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31414	NC_010524	GA	3	6	1135516	1135521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31415	NC_010524	TGC	2	6	1135582	1135587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057750
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31417	NC_010524	GC	3	6	1135619	1135624	0 %	0 %	50 %	50 %	171057750
31418	NC_010524	CGCT	2	8	1135635	1135642	0 %	25 %	25 %	50 %	171057750
31419	NC_010524	GGC	2	6	1135658	1135663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057750
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31422	NC_010524	ACC	2	6	1135753	1135758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057750
31423	NC_010524	GCTG	2	8	1135775	1135782	0 %	25 %	50 %	25 %	171057750
31424	NC_010524	CGA	2	6	1135835	1135840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057750
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31430	NC_010524	TCG	2	6	1136068	1136073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057750
31431	NC_010524	TTC	2	6	1136085	1136090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057750
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31433	NC_010524	GCCG	2	8	1136181	1136188	0 %	0 %	50 %	50 %	171057750
31434	NC_010524	GTGC	2	8	1136216	1136223	0 %	25 %	50 %	25 %	171057750
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31453	NC_010524	TGC	2	6	1136908	1136913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057751
31454	NC_010524	GTC	2	6	1136915	1136920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057751
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31462	NC_010524	CAG	2	6	1137140	1137145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057751
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31464	NC_010524	GC	3	6	1137197	1137202	0 %	0 %	50 %	50 %	171057751
31465	NC_010524	AGT	2	6	1137214	1137219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057751
31466	NC_010524	CTG	2	6	1137230	1137235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057751
31467	NC_010524	AGC	2	6	1137339	1137344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057751
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31469	NC_010524	GCCA	2	8	1137474	1137481	25 %	0 %	25 %	50 %	171057751
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31472	NC_010524	GT	3	6	1137597	1137602	0 %	50 %	50 %	0 %	171057751
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31483	NC_010524	ATCC	2	8	1138196	1138203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31484	NC_010524	GCG	3	9	1138273	1138281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057752
31485	NC_010524	GGCC	2	8	1138305	1138312	0 %	0 %	50 %	50 %	171057752
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31492	NC_010524	CGC	2	6	1138704	1138709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057752
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31496	NC_010524	GGGA	2	8	1138983	1138990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31497	NC_010524	TGGA	2	8	1139013	1139020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31498	NC_010524	ATC	2	6	1139111	1139116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057753
31499	NC_010524	CGA	3	9	1139152	1139160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057753
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