MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_010524	GAA	2	6	1046578	1046583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057667
29003	NC_010524	GTG	2	6	1046593	1046598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057667
29004	NC_010524	CAG	2	6	1046626	1046631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29005	NC_010524	GGC	3	9	1046638	1046646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057667
29006	NC_010524	TTG	2	6	1046654	1046659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057667
29007	NC_010524	TCG	2	6	1046699	1046704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29008	NC_010524	TGT	2	6	1046721	1046726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057667
29009	NC_010524	CGC	2	6	1046731	1046736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29010	NC_010524	CTT	3	9	1046779	1046787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057667
29011	NC_010524	GCA	2	6	1046802	1046807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29012	NC_010524	GCC	2	6	1046815	1046820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29013	NC_010524	GCC	2	6	1046830	1046835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29014	NC_010524	GC	3	6	1046950	1046955	0 %	0 %	50 %	50 %	171057667
29015	NC_010524	CGGCT	2	10	1047026	1047035	0 %	20 %	40 %	40 %	171057667
29016	NC_010524	GCC	2	6	1047061	1047066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29017	NC_010524	CCG	2	6	1047120	1047125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29018	NC_010524	CGT	2	6	1047126	1047131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29019	NC_010524	GC	3	6	1047175	1047180	0 %	0 %	50 %	50 %	171057667
29020	NC_010524	CGT	2	6	1047264	1047269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29021	NC_010524	CCG	2	6	1047288	1047293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29022	NC_010524	GCT	2	6	1047306	1047311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29023	NC_010524	CGC	2	6	1047357	1047362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29024	NC_010524	CAG	2	6	1047415	1047420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
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29026	NC_010524	TTC	2	6	1047440	1047445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057667
29027	NC_010524	GGCG	2	8	1047474	1047481	0 %	0 %	75 %	25 %	171057667
29028	NC_010524	CGC	2	6	1047489	1047494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
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29032	NC_010524	GGC	2	6	1047675	1047680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057667
29033	NC_010524	CGCGGT	2	12	1047708	1047719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057667
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29038	NC_010524	TGG	2	6	1047954	1047959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057667
29039	NC_010524	GC	3	6	1047988	1047993	0 %	0 %	50 %	50 %	171057667
29040	NC_010524	CAG	2	6	1048027	1048032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
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29043	NC_010524	CGA	2	6	1048093	1048098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
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29045	NC_010524	GCG	2	6	1048168	1048173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057667
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29047	NC_010524	ATC	2	6	1048339	1048344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057667
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29051	NC_010524	CGC	2	6	1048486	1048491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29052	NC_010524	GC	3	6	1048498	1048503	0 %	0 %	50 %	50 %	171057667
29053	NC_010524	GCCC	2	8	1048563	1048570	0 %	0 %	25 %	75 %	171057667
29054	NC_010524	GCC	2	6	1048585	1048590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057667
29055	NC_010524	GC	3	6	1048655	1048660	0 %	0 %	50 %	50 %	171057667
29056	NC_010524	CAG	4	12	1048705	1048716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
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29058	NC_010524	GAT	2	6	1048783	1048788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057667
29059	NC_010524	TCG	2	6	1048904	1048909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057667
29060	NC_010524	CGA	2	6	1048926	1048931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057667
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29069	NC_010524	GC	3	6	1049198	1049203	0 %	0 %	50 %	50 %	171057668
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29085	NC_010524	CCG	2	6	1049815	1049820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29095	NC_010524	GC	3	6	1050144	1050149	0 %	0 %	50 %	50 %	171057669
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29102	NC_010524	GCTCG	2	10	1050392	1050401	0 %	20 %	40 %	40 %	171057669
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29109	NC_010524	CTGGG	2	10	1050621	1050630	0 %	20 %	60 %	20 %	171057669
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29116	NC_010524	TGC	2	6	1050799	1050804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057669
29117	NC_010524	CGG	2	6	1050818	1050823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057670
29118	NC_010524	GGC	2	6	1050865	1050870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057670
29119	NC_010524	CGC	2	6	1050876	1050881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057670
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29121	NC_010524	GC	3	6	1051044	1051049	0 %	0 %	50 %	50 %	171057670
29122	NC_010524	CGCC	2	8	1051055	1051062	0 %	0 %	25 %	75 %	171057670
29123	NC_010524	GTG	3	9	1051088	1051096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057670
29124	NC_010524	CGG	2	6	1051128	1051133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057670
29125	NC_010524	GCC	2	6	1051136	1051141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057670
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29128	NC_010524	CG	3	6	1051368	1051373	0 %	0 %	50 %	50 %	171057670
29129	NC_010524	GCC	2	6	1051382	1051387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057670
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29141	NC_010524	TCA	2	6	1051704	1051709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057670
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29144	NC_010524	CGG	2	6	1051817	1051822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
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29148	NC_010524	GC	3	6	1051897	1051902	0 %	0 %	50 %	50 %	171057671
29149	NC_010524	GC	3	6	1051915	1051920	0 %	0 %	50 %	50 %	171057671
29150	NC_010524	AGGCGT	2	12	1051933	1051944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057671
29151	NC_010524	GGC	2	6	1051960	1051965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
29152	NC_010524	GCC	2	6	1051974	1051979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057671
29153	NC_010524	GCG	2	6	1051984	1051989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
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29158	NC_010524	CAG	2	6	1052117	1052122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057671
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29163	NC_010524	TTG	2	6	1052421	1052426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057671
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29176	NC_010524	GCCC	2	8	1052791	1052798	0 %	0 %	25 %	75 %	171057671
29177	NC_010524	AGC	2	6	1052799	1052804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057671
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29181	NC_010524	CGG	2	6	1052878	1052883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
29182	NC_010524	CAC	2	6	1052906	1052911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057671
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29184	NC_010524	CGG	2	6	1052924	1052929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
29185	NC_010524	CCGCG	2	10	1052932	1052941	0 %	0 %	40 %	60 %	171057671
29186	NC_010524	TGC	2	6	1052943	1052948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057671
29187	NC_010524	GGC	2	6	1052965	1052970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057671
29188	NC_010524	CGGG	2	8	1053075	1053082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29189	NC_010524	CGCCC	2	10	1053115	1053124	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29190	NC_010524	GGA	2	6	1053126	1053131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29191	NC_010524	ACCTGA	2	12	1053167	1053178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171057672
29192	NC_010524	GGT	2	6	1053240	1053245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057672
29193	NC_010524	CGA	2	6	1053306	1053311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057672
29194	NC_010524	GAT	2	6	1053417	1053422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057672
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29196	NC_010524	CCG	2	6	1053489	1053494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057672
29197	NC_010524	TTC	2	6	1053529	1053534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057672
29198	NC_010524	GGCGC	2	10	1053573	1053582	0 %	0 %	60 %	40 %	171057672
29199	NC_010524	AAG	2	6	1053610	1053615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057672
29200	NC_010524	TCGA	2	8	1053652	1053659	25 %	25 %	25 %	25 %	171057672
29201	NC_010524	GCT	2	6	1053663	1053668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057672
29202	NC_010524	TAC	2	6	1053670	1053675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057672
29203	NC_010524	CTG	2	6	1053685	1053690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057672
29204	NC_010524	GGC	2	6	1053731	1053736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057673
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29207	NC_010524	CG	3	6	1053764	1053769	0 %	0 %	50 %	50 %	171057673
29208	NC_010524	CGG	2	6	1053772	1053777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057673
29209	NC_010524	CGT	2	6	1053787	1053792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29210	NC_010524	CG	3	6	1053813	1053818	0 %	0 %	50 %	50 %	171057673
29211	NC_010524	CTGCC	2	10	1053825	1053834	0 %	20 %	20 %	60 %	171057673
29212	NC_010524	CAG	2	6	1053860	1053865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29213	NC_010524	TGC	2	6	1053870	1053875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29214	NC_010524	GCT	2	6	1053982	1053987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29215	NC_010524	GCA	5	15	1054012	1054026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29216	NC_010524	GTGG	2	8	1054085	1054092	0 %	25 %	75 %	0 %	171057673
29217	NC_010524	GC	4	8	1054099	1054106	0 %	0 %	50 %	50 %	171057673
29218	NC_010524	ACC	2	6	1054107	1054112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057673
29219	NC_010524	CGA	2	6	1054120	1054125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057673
29220	NC_010524	GGA	2	6	1054160	1054165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057673
29221	NC_010524	TGCGC	2	10	1054296	1054305	0 %	20 %	40 %	40 %	171057674
29222	NC_010524	CG	3	6	1054306	1054311	0 %	0 %	50 %	50 %	171057674
29223	NC_010524	GC	3	6	1054336	1054341	0 %	0 %	50 %	50 %	171057674
29224	NC_010524	GC	3	6	1054345	1054350	0 %	0 %	50 %	50 %	171057674
29225	NC_010524	CCAGGC	2	12	1054351	1054362	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057674
29226	NC_010524	CAG	2	6	1054363	1054368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057674
29227	NC_010524	CGT	2	6	1054392	1054397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057674
29228	NC_010524	CGT	2	6	1054422	1054427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057674
29229	NC_010524	GCGG	2	8	1054432	1054439	0 %	0 %	75 %	25 %	171057674
29230	NC_010524	GGC	3	9	1054489	1054497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057674
29231	NC_010524	CG	4	8	1054513	1054520	0 %	0 %	50 %	50 %	171057674
29232	NC_010524	GGC	2	6	1054528	1054533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057674
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29238	NC_010524	TCG	2	6	1054724	1054729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057674
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29276	NC_010524	G	7	7	1055963	1055969	0 %	0 %	100 %	0 %	171057674
29277	NC_010524	GTC	2	6	1055975	1055980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057674
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29334	NC_010524	GCA	3	9	1057775	1057783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057676
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29339	NC_010524	GAGG	2	8	1057950	1057957	25 %	0 %	75 %	0 %	171057676
29340	NC_010524	CGC	2	6	1057965	1057970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057676
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29345	NC_010524	CGT	2	6	1058195	1058200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057676
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29347	NC_010524	ACAGCG	2	12	1058237	1058248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057676
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29459	NC_010524	GGCG	2	8	1061867	1061874	0 %	0 %	75 %	25 %	171057680
29460	NC_010524	TGCCGG	2	12	1061888	1061899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057680
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