MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_010524	G	6	6	1027564	1027569	0 %	0 %	100 %	0 %	171057650
28503	NC_010524	GTG	2	6	1027613	1027618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057650
28504	NC_010524	GC	3	6	1027648	1027653	0 %	0 %	50 %	50 %	171057650
28505	NC_010524	GCT	2	6	1027693	1027698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057650
28506	NC_010524	GGC	2	6	1027741	1027746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057650
28507	NC_010524	GCA	2	6	1027812	1027817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057650
28508	NC_010524	GGT	2	6	1027828	1027833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057650
28509	NC_010524	GCG	2	6	1027838	1027843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057650
28510	NC_010524	CGC	2	6	1027844	1027849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057650
28511	NC_010524	CGC	2	6	1027965	1027970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057650
28512	NC_010524	GCG	2	6	1028018	1028023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057650
28513	NC_010524	TGC	2	6	1028037	1028042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057650
28514	NC_010524	CGC	2	6	1028074	1028079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057650
28515	NC_010524	CCGG	2	8	1028138	1028145	0 %	0 %	50 %	50 %	171057650
28516	NC_010524	TCGC	2	8	1028159	1028166	0 %	25 %	25 %	50 %	171057650
28517	NC_010524	CTG	2	6	1028231	1028236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057650
28518	NC_010524	TCA	2	6	1028253	1028258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057650
28519	NC_010524	AGG	2	6	1028322	1028327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057650
28520	NC_010524	CGC	2	6	1028397	1028402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057650
28521	NC_010524	CCT	2	6	1028410	1028415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28522	NC_010524	GCC	2	6	1028454	1028459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28523	NC_010524	CTG	3	9	1028518	1028526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28524	NC_010524	GAC	2	6	1028550	1028555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28525	NC_010524	CGA	2	6	1028577	1028582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28526	NC_010524	AGC	2	6	1028630	1028635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28527	NC_010524	GCC	2	6	1028639	1028644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28528	NC_010524	CGG	2	6	1028675	1028680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28529	NC_010524	TTC	2	6	1028695	1028700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057651
28530	NC_010524	TCA	2	6	1028750	1028755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057651
28531	NC_010524	GCG	2	6	1028786	1028791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28532	NC_010524	GC	4	8	1028838	1028845	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28533	NC_010524	CCG	2	6	1028884	1028889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28534	NC_010524	CGG	2	6	1028901	1028906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28535	NC_010524	CTG	2	6	1028911	1028916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28536	NC_010524	GCG	2	6	1028939	1028944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28537	NC_010524	CCAG	2	8	1028951	1028958	25 %	0 %	25 %	50 %	171057651
28538	NC_010524	CTG	3	9	1028971	1028979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28539	NC_010524	C	6	6	1029040	1029045	0 %	0 %	0 %	100 %	171057651
28540	NC_010524	CGC	2	6	1029056	1029061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28541	NC_010524	CGG	3	9	1029074	1029082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28542	NC_010524	GTG	2	6	1029091	1029096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057651
28543	NC_010524	CTG	2	6	1029151	1029156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28544	NC_010524	GC	3	6	1029157	1029162	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28545	NC_010524	GCG	2	6	1029177	1029182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28546	NC_010524	CCG	2	6	1029209	1029214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28547	NC_010524	TCG	2	6	1029262	1029267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28548	NC_010524	GC	3	6	1029290	1029295	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28549	NC_010524	TCG	2	6	1029365	1029370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28550	NC_010524	GCC	2	6	1029373	1029378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28551	NC_010524	GC	3	6	1029389	1029394	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28552	NC_010524	CGC	2	6	1029483	1029488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28553	NC_010524	GACC	2	8	1029567	1029574	25 %	0 %	25 %	50 %	171057651
28554	NC_010524	CGC	2	6	1029579	1029584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28555	NC_010524	GC	3	6	1029611	1029616	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28556	NC_010524	GGA	2	6	1029621	1029626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057651
28557	NC_010524	CGC	2	6	1029672	1029677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28558	NC_010524	ACG	2	6	1029689	1029694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28559	NC_010524	ACC	2	6	1029695	1029700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057651
28560	NC_010524	GGC	2	6	1029723	1029728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28561	NC_010524	GCG	2	6	1029748	1029753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28562	NC_010524	CCGGTG	2	12	1029754	1029765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057651
28563	NC_010524	CGC	2	6	1029843	1029848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28564	NC_010524	TCA	2	6	1029860	1029865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057651
28565	NC_010524	GCTC	2	8	1029950	1029957	0 %	25 %	25 %	50 %	171057651
28566	NC_010524	CGC	2	6	1029975	1029980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057651
28567	NC_010524	GCG	2	6	1029981	1029986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28568	NC_010524	GGC	2	6	1029996	1030001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28569	NC_010524	CGA	3	9	1030002	1030010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28570	NC_010524	CG	3	6	1030029	1030034	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28571	NC_010524	CCTGCA	2	12	1030038	1030049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171057651
28572	NC_010524	GC	3	6	1030155	1030160	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28573	NC_010524	TGG	2	6	1030205	1030210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057651
28574	NC_010524	GCG	2	6	1030282	1030287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28575	NC_010524	CG	3	6	1030286	1030291	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28576	NC_010524	GCG	2	6	1030296	1030301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057651
28577	NC_010524	GC	3	6	1030375	1030380	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28578	NC_010524	GCA	2	6	1030391	1030396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28579	NC_010524	GCA	2	6	1030467	1030472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28580	NC_010524	TGG	2	6	1030483	1030488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057651
28581	NC_010524	CG	3	6	1030491	1030496	0 %	0 %	50 %	50 %	171057651
28582	NC_010524	CGGCT	2	10	1030509	1030518	0 %	20 %	40 %	40 %	171057651
28583	NC_010524	GCT	2	6	1030520	1030525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057651
28584	NC_010524	GCG	2	6	1030535	1030540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28585	NC_010524	GTC	2	6	1030626	1030631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28586	NC_010524	GCCC	2	8	1030633	1030640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28587	NC_010524	CAAT	2	8	1030653	1030660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28588	NC_010524	AGC	2	6	1030667	1030672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28589	NC_010524	GC	3	6	1030739	1030744	0 %	0 %	50 %	50 %	171057652
28590	NC_010524	TCG	3	9	1030789	1030797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28591	NC_010524	GAA	2	6	1030836	1030841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057652
28592	NC_010524	CG	3	6	1030939	1030944	0 %	0 %	50 %	50 %	171057652
28593	NC_010524	GGC	2	6	1031037	1031042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057652
28594	NC_010524	GCT	2	6	1031087	1031092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
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28598	NC_010524	GCCGT	2	10	1031194	1031203	0 %	20 %	40 %	40 %	171057652
28599	NC_010524	GC	3	6	1031228	1031233	0 %	0 %	50 %	50 %	171057652
28600	NC_010524	GCT	2	6	1031237	1031242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28601	NC_010524	GGC	2	6	1031319	1031324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057652
28602	NC_010524	CTG	2	6	1031334	1031339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28603	NC_010524	CATGG	2	10	1031351	1031360	20 %	20 %	40 %	20 %	171057652
28604	NC_010524	CGC	2	6	1031361	1031366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057652
28605	NC_010524	GTG	2	6	1031385	1031390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057652
28606	NC_010524	CGGT	2	8	1031392	1031399	0 %	25 %	50 %	25 %	171057652
28607	NC_010524	GAA	2	6	1031438	1031443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057652
28608	NC_010524	CGA	2	6	1031474	1031479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28609	NC_010524	CGC	2	6	1031499	1031504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057652
28610	NC_010524	TCG	2	6	1031563	1031568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28611	NC_010524	TGGAC	2	10	1031611	1031620	20 %	20 %	40 %	20 %	171057652
28612	NC_010524	CAA	2	6	1031621	1031626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057652
28613	NC_010524	TCG	2	6	1031647	1031652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28614	NC_010524	CGAAGT	2	12	1031663	1031674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171057652
28615	NC_010524	CGA	2	6	1031690	1031695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28616	NC_010524	GCG	2	6	1031773	1031778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057652
28617	NC_010524	TCG	2	6	1031824	1031829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057652
28618	NC_010524	AAG	2	6	1031913	1031918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057652
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28623	NC_010524	AAGG	2	8	1032171	1032178	50 %	0 %	50 %	0 %	171057652
28624	NC_010524	CGA	2	6	1032179	1032184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057652
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28734	NC_010524	GGT	2	6	1035876	1035881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057657
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28849	NC_010524	GCA	2	6	1041237	1041242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057663
28850	NC_010524	GCG	2	6	1041279	1041284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057663
28851	NC_010524	GCG	2	6	1041321	1041326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057663
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28855	NC_010524	GC	3	6	1041515	1041520	0 %	0 %	50 %	50 %	171057663
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28964	NC_010524	TCGAC	2	10	1045139	1045148	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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