MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27005	NC_010524	TCA	2	6	971650	971655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057595
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27239	NC_010524	CGGCAT	2	12	980078	980089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057603
27240	NC_010524	CGA	2	6	980135	980140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057603
27241	NC_010524	CCG	2	6	980150	980155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
27242	NC_010524	CGG	2	6	980159	980164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057603
27243	NC_010524	GC	3	6	980199	980204	0 %	0 %	50 %	50 %	171057603
27244	NC_010524	GCG	2	6	980212	980217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057603
27245	NC_010524	GCCG	2	8	980238	980245	0 %	0 %	50 %	50 %	171057603
27246	NC_010524	TGC	3	9	980263	980271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057603
27247	NC_010524	GCC	2	6	980291	980296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
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27249	NC_010524	CGG	2	6	980347	980352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057603
27250	NC_010524	CCG	2	6	980374	980379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
27251	NC_010524	GC	3	6	980383	980388	0 %	0 %	50 %	50 %	171057603
27252	NC_010524	CGA	2	6	980408	980413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057603
27253	NC_010524	GCT	2	6	980444	980449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057603
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27255	NC_010524	CCTGAT	2	12	980528	980539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171057603
27256	NC_010524	GCC	2	6	980571	980576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
27257	NC_010524	CCG	2	6	980635	980640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
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27260	NC_010524	GC	3	6	980749	980754	0 %	0 %	50 %	50 %	171057603
27261	NC_010524	CGG	2	6	980770	980775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057603
27262	NC_010524	GCC	2	6	980777	980782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057603
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27265	NC_010524	TGG	2	6	980962	980967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057603
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27270	NC_010524	CG	3	6	981128	981133	0 %	0 %	50 %	50 %	171057603
27271	NC_010524	AGGCCG	2	12	981145	981156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057603
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27281	NC_010524	CCA	2	6	981600	981605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057604
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27283	NC_010524	GCCGA	2	10	981619	981628	20 %	0 %	40 %	40 %	171057604
27284	NC_010524	CAG	2	6	981630	981635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057604
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27286	NC_010524	GCCG	2	8	981683	981690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27287	NC_010524	AGCG	2	8	981761	981768	25 %	0 %	50 %	25 %	171057605
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27293	NC_010524	GACC	2	8	981936	981943	25 %	0 %	25 %	50 %	171057605
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27295	NC_010524	GCCC	2	8	981974	981981	0 %	0 %	25 %	75 %	171057605
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27328	NC_010524	GCC	2	6	983162	983167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27329	NC_010524	TCTG	3	12	983209	983220	0 %	50 %	25 %	25 %	171057606
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27344	NC_010524	CTG	2	6	983594	983599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057606
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27351	NC_010524	CACGC	2	10	983740	983749	20 %	0 %	20 %	60 %	171057606
27352	NC_010524	GCT	3	9	983800	983808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057606
27353	NC_010524	GC	3	6	983821	983826	0 %	0 %	50 %	50 %	171057606
27354	NC_010524	CG	4	8	983837	983844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27355	NC_010524	CGG	2	6	983941	983946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057607
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27357	NC_010524	GATC	2	8	983989	983996	25 %	25 %	25 %	25 %	171057607
27358	NC_010524	CAC	3	9	984065	984073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057607
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27479	NC_010524	TCG	2	6	988164	988169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27480	NC_010524	TGC	2	6	988171	988176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27481	NC_010524	GC	3	6	988175	988180	0 %	0 %	50 %	50 %	171057611
27482	NC_010524	GCCGTA	2	12	988190	988201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27483	NC_010524	CAG	2	6	988208	988213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27484	NC_010524	GCA	2	6	988219	988224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27485	NC_010524	CGC	2	6	988227	988232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057611
27486	NC_010524	GAC	2	6	988250	988255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27487	NC_010524	TCG	2	6	988263	988268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27488	NC_010524	GCT	2	6	988310	988315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27489	NC_010524	TGG	2	6	988338	988343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057611
27490	NC_010524	CTG	2	6	988355	988360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057611
27491	NC_010524	GCCC	2	8	988365	988372	0 %	0 %	25 %	75 %	171057611
27492	NC_010524	GC	3	6	988379	988384	0 %	0 %	50 %	50 %	171057611
27493	NC_010524	GCG	2	6	988388	988393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057611
27494	NC_010524	GC	4	8	988411	988418	0 %	0 %	50 %	50 %	171057611
27495	NC_010524	GC	3	6	988442	988447	0 %	0 %	50 %	50 %	171057611
27496	NC_010524	GCC	2	6	988455	988460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057611
27497	NC_010524	GCCGC	2	10	988476	988485	0 %	0 %	40 %	60 %	171057611
27498	NC_010524	CGGC	2	8	988509	988516	0 %	0 %	50 %	50 %	171057611
27499	NC_010524	GTCGGC	2	12	988547	988558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057611
27500	NC_010524	CAC	2	6	988559	988564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057611

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