MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_010524	GC	3	6	951579	951584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26502	NC_010524	CCT	2	6	951672	951677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26503	NC_010524	CCA	3	9	951750	951758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26504	NC_010524	GAA	2	6	951784	951789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057577
26505	NC_010524	ATC	2	6	951800	951805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057577
26506	NC_010524	CGG	2	6	951829	951834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057577
26507	NC_010524	CGA	2	6	951846	951851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26508	NC_010524	AAC	2	6	951872	951877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057577
26509	NC_010524	TGG	2	6	951885	951890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057577
26510	NC_010524	CGAC	2	8	951984	951991	25 %	0 %	25 %	50 %	171057577
26511	NC_010524	CCA	2	6	951996	952001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057577
26512	NC_010524	CAT	2	6	952018	952023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057577
26513	NC_010524	GCTG	2	8	952065	952072	0 %	25 %	50 %	25 %	171057577
26514	NC_010524	ACG	2	6	952101	952106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26515	NC_010524	CGGC	2	8	952221	952228	0 %	0 %	50 %	50 %	171057577
26516	NC_010524	AAG	2	6	952277	952282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057577
26517	NC_010524	ACA	2	6	952287	952292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057577
26518	NC_010524	GGCG	2	8	952297	952304	0 %	0 %	75 %	25 %	171057577
26519	NC_010524	GCT	2	6	952354	952359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26520	NC_010524	AAC	2	6	952436	952441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057577
26521	NC_010524	GCCC	2	8	952479	952486	0 %	0 %	25 %	75 %	171057577
26522	NC_010524	CGT	2	6	952489	952494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26523	NC_010524	GAACCT	2	12	952513	952524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171057577
26524	NC_010524	ACG	2	6	952554	952559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26525	NC_010524	CGC	2	6	952567	952572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057577
26526	NC_010524	CTG	2	6	952577	952582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26527	NC_010524	GCG	2	6	952656	952661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057577
26528	NC_010524	GAA	2	6	952702	952707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057577
26529	NC_010524	CGA	2	6	952711	952716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26530	NC_010524	GC	3	6	952718	952723	0 %	0 %	50 %	50 %	171057577
26531	NC_010524	AGG	2	6	952776	952781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057577
26532	NC_010524	CCG	2	6	952796	952801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057577
26533	NC_010524	ACA	2	6	952899	952904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057577
26534	NC_010524	AAC	2	6	952967	952972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057577
26535	NC_010524	CAG	2	6	952982	952987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057577
26536	NC_010524	GGC	2	6	953023	953028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057577
26537	NC_010524	CGC	3	9	953035	953043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057577
26538	NC_010524	GAA	2	6	953065	953070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057577
26539	NC_010524	GGTC	2	8	953106	953113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26540	NC_010524	CTCAA	2	10	953134	953143	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26541	NC_010524	GTC	2	6	953168	953173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26542	NC_010524	CTG	3	9	953222	953230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26543	NC_010524	GAT	2	6	953257	953262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057578
26544	NC_010524	TGA	2	6	953274	953279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057578
26545	NC_010524	CCCG	2	8	953317	953324	0 %	0 %	25 %	75 %	171057578
26546	NC_010524	TCG	2	6	953382	953387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26547	NC_010524	TGC	2	6	953400	953405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26548	NC_010524	TCA	2	6	953424	953429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057578
26549	NC_010524	ACG	2	6	953463	953468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26550	NC_010524	GCA	2	6	953484	953489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26551	NC_010524	CG	3	6	953491	953496	0 %	0 %	50 %	50 %	171057578
26552	NC_010524	TTC	2	6	953516	953521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057578
26553	NC_010524	GAA	2	6	953551	953556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057578
26554	NC_010524	CTT	2	6	953560	953565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057578
26555	NC_010524	TGG	2	6	953646	953651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057578
26556	NC_010524	TCA	3	9	953655	953663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057578
26557	NC_010524	TCGTG	2	10	953664	953673	0 %	40 %	40 %	20 %	171057578
26558	NC_010524	CTG	2	6	953702	953707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26559	NC_010524	GC	3	6	953747	953752	0 %	0 %	50 %	50 %	171057578
26560	NC_010524	GTG	2	6	953789	953794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057578
26561	NC_010524	TCT	2	6	953844	953849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057578
26562	NC_010524	ACG	2	6	953879	953884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057578
26563	NC_010524	GGGC	2	8	953887	953894	0 %	0 %	75 %	25 %	171057578
26564	NC_010524	TCT	2	6	953928	953933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057578
26565	NC_010524	CG	3	6	953934	953939	0 %	0 %	50 %	50 %	171057578
26566	NC_010524	CGG	3	9	953970	953978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057578
26567	NC_010524	CTT	2	6	954016	954021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057578
26568	NC_010524	CG	3	6	954062	954067	0 %	0 %	50 %	50 %	171057579
26569	NC_010524	GGCT	2	8	954097	954104	0 %	25 %	50 %	25 %	171057579
26570	NC_010524	GCC	2	6	954175	954180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057579
26571	NC_010524	CCG	2	6	954184	954189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057579
26572	NC_010524	GAGC	2	8	954231	954238	25 %	0 %	50 %	25 %	171057579
26573	NC_010524	ACT	2	6	954245	954250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057579
26574	NC_010524	GTG	2	6	954274	954279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057579
26575	NC_010524	GATCGC	2	12	954297	954308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057579
26576	NC_010524	CGG	2	6	954320	954325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057579
26577	NC_010524	CAA	2	6	954348	954353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057579
26578	NC_010524	GGTG	2	8	954405	954412	0 %	25 %	75 %	0 %	171057579
26579	NC_010524	ATCT	2	8	954424	954431	25 %	50 %	0 %	25 %	171057579
26580	NC_010524	AGG	2	6	954536	954541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057579
26581	NC_010524	TGCC	2	8	954542	954549	0 %	25 %	25 %	50 %	171057579
26582	NC_010524	GGC	2	6	954561	954566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057579
26583	NC_010524	GC	3	6	954565	954570	0 %	0 %	50 %	50 %	171057579
26584	NC_010524	ATGG	2	8	954571	954578	25 %	25 %	50 %	0 %	171057579
26585	NC_010524	CTG	2	6	954607	954612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057579
26586	NC_010524	CATCG	2	10	954732	954741	20 %	20 %	20 %	40 %	171057579
26587	NC_010524	AAC	2	6	954836	954841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057579
26588	NC_010524	GAA	2	6	954912	954917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057580
26589	NC_010524	TGG	2	6	954941	954946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057580
26590	NC_010524	TCG	2	6	954995	955000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26591	NC_010524	CTG	2	6	955027	955032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26592	NC_010524	GAT	2	6	955035	955040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057580
26593	NC_010524	TGA	2	6	955091	955096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057580
26594	NC_010524	ACG	2	6	955097	955102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26595	NC_010524	CG	3	6	955115	955120	0 %	0 %	50 %	50 %	171057580
26596	NC_010524	ACA	2	6	955175	955180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057580
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26600	NC_010524	CGA	2	6	955365	955370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26601	NC_010524	TCG	2	6	955505	955510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26602	NC_010524	TGC	2	6	955511	955516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26603	NC_010524	CGC	2	6	955544	955549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057580
26604	NC_010524	CCA	2	6	955568	955573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057580
26605	NC_010524	TCG	2	6	955580	955585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26606	NC_010524	GGT	2	6	955629	955634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057580
26607	NC_010524	GCG	2	6	955640	955645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057580
26608	NC_010524	GCGT	2	8	955736	955743	0 %	25 %	50 %	25 %	171057580
26609	NC_010524	GGT	2	6	955794	955799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057580
26610	NC_010524	CGG	2	6	955809	955814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057580
26611	NC_010524	GCC	2	6	955843	955848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057580
26612	NC_010524	CTG	2	6	955933	955938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057580
26613	NC_010524	CACC	2	8	955975	955982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26614	NC_010524	GTCCCA	2	12	956000	956011	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171057581
26615	NC_010524	TCA	2	6	956014	956019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057581
26616	NC_010524	TCG	3	9	956035	956043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057581
26617	NC_010524	GTCGC	2	10	956143	956152	0 %	20 %	40 %	40 %	171057581
26618	NC_010524	GGT	2	6	956163	956168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057581
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26620	NC_010524	TCGCC	2	10	956245	956254	0 %	20 %	20 %	60 %	171057581
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26981	NC_010524	CAT	2	6	970953	970958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057594
26982	NC_010524	CTG	2	6	970972	970977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057594
26983	NC_010524	CGC	2	6	970983	970988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057594
26984	NC_010524	CGG	2	6	970995	971000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057594
26985	NC_010524	TGC	2	6	971003	971008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057594
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26989	NC_010524	TGC	2	6	971138	971143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057594
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