MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_010524	GGT	2	6	930132	930137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057552
26003	NC_010524	GGC	2	6	930174	930179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057552
26004	NC_010524	CGC	2	6	930195	930200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057552
26005	NC_010524	TGG	2	6	930210	930215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057552
26006	NC_010524	TGGCG	2	10	930235	930244	0 %	20 %	60 %	20 %	171057552
26007	NC_010524	CTC	2	6	930294	930299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057552
26008	NC_010524	ACC	2	6	930343	930348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057552
26009	NC_010524	CGAT	2	8	930350	930357	25 %	25 %	25 %	25 %	171057552
26010	NC_010524	GCG	2	6	930415	930420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057552
26011	NC_010524	TGCT	2	8	930494	930501	0 %	50 %	25 %	25 %	171057552
26012	NC_010524	TCG	2	6	930529	930534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057552
26013	NC_010524	TCC	2	6	930568	930573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057553
26014	NC_010524	GTG	2	6	930638	930643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057553
26015	NC_010524	CG	3	6	930709	930714	0 %	0 %	50 %	50 %	171057553
26016	NC_010524	GGC	2	6	930811	930816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057553
26017	NC_010524	AGGT	2	8	930845	930852	25 %	25 %	50 %	0 %	171057553
26018	NC_010524	CGT	2	6	930861	930866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057553
26019	NC_010524	GGCG	2	8	930954	930961	0 %	0 %	75 %	25 %	171057553
26020	NC_010524	CTC	2	6	930970	930975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057553
26021	NC_010524	GCG	2	6	931044	931049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057553
26022	NC_010524	GCC	2	6	931052	931057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057553
26023	NC_010524	ACG	2	6	931106	931111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057553
26024	NC_010524	ATGC	2	8	931119	931126	25 %	25 %	25 %	25 %	171057553
26025	NC_010524	GTC	2	6	931136	931141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057553
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26031	NC_010524	TCG	2	6	931286	931291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057553
26032	NC_010524	CGC	2	6	931322	931327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057553
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26041	NC_010524	CGA	2	6	931751	931756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057554
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26052	NC_010524	GCG	2	6	932121	932126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057554
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26074	NC_010524	GCG	2	6	933058	933063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057555
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26092	NC_010524	AGG	2	6	933723	933728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057556
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26103	NC_010524	CG	3	6	934488	934493	0 %	0 %	50 %	50 %	171057557
26104	NC_010524	GCCGG	2	10	934507	934516	0 %	0 %	60 %	40 %	171057557
26105	NC_010524	CCG	2	6	934604	934609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057557
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26107	NC_010524	GC	3	6	934685	934690	0 %	0 %	50 %	50 %	171057558
26108	NC_010524	GC	3	6	934698	934703	0 %	0 %	50 %	50 %	171057558
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26116	NC_010524	CCGA	2	8	935006	935013	25 %	0 %	25 %	50 %	171057558
26117	NC_010524	GCA	2	6	935023	935028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057558
26118	NC_010524	TCT	2	6	935083	935088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057558
26119	NC_010524	CAT	2	6	935186	935191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057558
26120	NC_010524	GCA	3	9	935194	935202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057558
26121	NC_010524	CAT	2	6	935204	935209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057558
26122	NC_010524	GGT	2	6	935246	935251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057558
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26125	NC_010524	CCCAG	2	10	935314	935323	20 %	0 %	20 %	60 %	171057558
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26127	NC_010524	CAT	2	6	935426	935431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057558
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26129	NC_010524	TCG	2	6	935466	935471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057558
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26133	NC_010524	GCCG	2	8	935581	935588	0 %	0 %	50 %	50 %	171057558
26134	NC_010524	CGC	2	6	935608	935613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057558
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26156	NC_010524	CG	3	6	936784	936789	0 %	0 %	50 %	50 %	171057558
26157	NC_010524	CG	3	6	936802	936807	0 %	0 %	50 %	50 %	171057558
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26210	NC_010524	GTC	2	6	938871	938876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057562
26211	NC_010524	TGG	2	6	938923	938928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26212	NC_010524	GAC	2	6	939035	939040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057563
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26225	NC_010524	CAG	2	6	939481	939486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057563
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26230	NC_010524	CGC	2	6	939625	939630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057563
26231	NC_010524	GGTCAT	2	12	939687	939698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171057563
26232	NC_010524	GC	3	6	939772	939777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26233	NC_010524	TCGC	2	8	939848	939855	0 %	25 %	25 %	50 %	171057564
26234	NC_010524	GCA	2	6	939910	939915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057564
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26236	NC_010524	ACA	2	6	939979	939984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057564
26237	NC_010524	CTCGT	2	10	940019	940028	0 %	40 %	20 %	40 %	171057564
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26239	NC_010524	GCA	2	6	940096	940101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057564
26240	NC_010524	TCGC	2	8	940255	940262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26241	NC_010524	TCG	2	6	940274	940279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26242	NC_010524	CGT	2	6	940475	940480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26243	NC_010524	AGG	2	6	940514	940519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26244	NC_010524	GCA	2	6	940580	940585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057565
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26345	NC_010524	GGT	2	6	944415	944420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26346	NC_010524	GTCAGT	2	12	944476	944487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26347	NC_010524	GCA	2	6	944512	944517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26348	NC_010524	GCG	2	6	944526	944531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26349	NC_010524	TCA	2	6	944635	944640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26350	NC_010524	ATTC	2	8	944641	944648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26351	NC_010524	TGC	3	9	944663	944671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26352	NC_010524	CGA	2	6	944697	944702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26353	NC_010524	CG	3	6	944706	944711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26354	NC_010524	TGGA	2	8	944815	944822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26355	NC_010524	TCG	2	6	944849	944854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057569
26356	NC_010524	TGGT	2	8	944931	944938	0 %	50 %	50 %	0 %	171057569
26357	NC_010524	TG	3	6	945004	945009	0 %	50 %	50 %	0 %	171057569
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26359	NC_010524	GCTGA	2	10	945144	945153	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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26480	NC_010524	CTG	2	6	950678	950683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057575
26481	NC_010524	GGC	2	6	950751	950756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057575
26482	NC_010524	TTC	2	6	950774	950779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057575
26483	NC_010524	CAC	2	6	950798	950803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057575
26484	NC_010524	GCC	3	9	950855	950863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057575
26485	NC_010524	CGG	2	6	950886	950891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057575
26486	NC_010524	GCTC	2	8	950899	950906	0 %	25 %	25 %	50 %	171057575
26487	NC_010524	CGG	2	6	951033	951038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057575
26488	NC_010524	GGC	2	6	951079	951084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057575
26489	NC_010524	CTC	2	6	951104	951109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057575
26490	NC_010524	CTG	3	9	951131	951139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057575
26491	NC_010524	ACA	2	6	951165	951170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057575
26492	NC_010524	CGT	2	6	951189	951194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057575
26493	NC_010524	GCT	2	6	951260	951265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26494	NC_010524	TGT	2	6	951315	951320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26495	NC_010524	TGC	2	6	951359	951364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26496	NC_010524	C	7	7	951386	951392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26497	NC_010524	GCT	2	6	951437	951442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057576
26498	NC_010524	CGG	2	6	951500	951505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057576
26499	NC_010524	CGAC	2	8	951537	951544	25 %	0 %	25 %	50 %	171057576
26500	NC_010524	GACT	2	8	951564	951571	25 %	25 %	25 %	25 %	171057576

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