MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_010524	CGA	2	6	890858	890863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057516
25002	NC_010524	AAC	2	6	890967	890972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057516
25003	NC_010524	TTC	2	6	890987	890992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057516
25004	NC_010524	TGC	2	6	891071	891076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057516
25005	NC_010524	TC	3	6	891165	891170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25006	NC_010524	GCTGAT	2	12	891217	891228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25007	NC_010524	GAGT	2	8	891274	891281	25 %	25 %	50 %	0 %	171057517
25008	NC_010524	TCGT	2	8	891343	891350	0 %	50 %	25 %	25 %	171057517
25009	NC_010524	CGAC	2	8	891358	891365	25 %	0 %	25 %	50 %	171057517
25010	NC_010524	CGG	2	6	891473	891478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25011	NC_010524	GACG	2	8	891482	891489	25 %	0 %	50 %	25 %	171057518
25012	NC_010524	CTG	2	6	891506	891511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057518
25013	NC_010524	CAC	2	6	891549	891554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057518
25014	NC_010524	A	6	6	891640	891645	100 %	0 %	0 %	0 %	171057518
25015	NC_010524	CCCG	2	8	891779	891786	0 %	0 %	25 %	75 %	171057518
25016	NC_010524	ACC	2	6	891822	891827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057518
25017	NC_010524	GAT	2	6	891957	891962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057519
25018	NC_010524	TGCCC	2	10	891971	891980	0 %	20 %	20 %	60 %	171057519
25019	NC_010524	TGAT	2	8	892033	892040	25 %	50 %	25 %	0 %	171057519
25020	NC_010524	CG	3	6	892057	892062	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25021	NC_010524	CGC	2	6	892097	892102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057519
25022	NC_010524	CG	3	6	892115	892120	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25023	NC_010524	GCA	2	6	892148	892153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25024	NC_010524	ATG	2	6	892267	892272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057519
25025	NC_010524	CGG	2	6	892286	892291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057519
25026	NC_010524	CGC	2	6	892335	892340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057519
25027	NC_010524	CAG	3	9	892356	892364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25028	NC_010524	CGT	2	6	892376	892381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25029	NC_010524	GCCG	2	8	892398	892405	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25030	NC_010524	ACG	2	6	892426	892431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25031	NC_010524	GCGA	2	8	892444	892451	25 %	0 %	50 %	25 %	171057519
25032	NC_010524	TCGA	2	8	892453	892460	25 %	25 %	25 %	25 %	171057519
25033	NC_010524	CG	3	6	892466	892471	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25034	NC_010524	ACG	2	6	892489	892494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25035	NC_010524	CTT	2	6	892506	892511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057519
25036	NC_010524	GCC	2	6	892564	892569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057519
25037	NC_010524	TTG	2	6	892693	892698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057519
25038	NC_010524	GTG	2	6	892717	892722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057519
25039	NC_010524	TGC	2	6	892736	892741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25040	NC_010524	CGC	2	6	892799	892804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057519
25041	NC_010524	ATC	2	6	892810	892815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057519
25042	NC_010524	GGCC	2	8	892817	892824	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25043	NC_010524	GCGG	2	8	892842	892849	0 %	0 %	75 %	25 %	171057519
25044	NC_010524	GGCC	2	8	892919	892926	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25045	NC_010524	AGC	2	6	892927	892932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057519
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25047	NC_010524	GC	3	6	893028	893033	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25048	NC_010524	GCG	2	6	893041	893046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057519
25049	NC_010524	GTC	2	6	893064	893069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057519
25050	NC_010524	GC	3	6	893087	893092	0 %	0 %	50 %	50 %	171057519
25051	NC_010524	TGC	2	6	893179	893184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057520
25052	NC_010524	ACG	2	6	893237	893242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057520
25053	NC_010524	GGC	2	6	893326	893331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057520
25054	NC_010524	TGG	2	6	893355	893360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057520
25055	NC_010524	CAT	2	6	893368	893373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057520
25056	NC_010524	TCT	2	6	893382	893387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057520
25057	NC_010524	GCC	2	6	893413	893418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057520
25058	NC_010524	GCC	2	6	893515	893520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057520
25059	NC_010524	CAT	2	6	893524	893529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057520
25060	NC_010524	TGG	2	6	893546	893551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057520
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25062	NC_010524	GCC	2	6	893560	893565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057520
25063	NC_010524	GCA	2	6	893568	893573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057520
25064	NC_010524	GCT	2	6	893583	893588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057520
25065	NC_010524	TCC	2	6	893612	893617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057520
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25067	NC_010524	CAT	2	6	893668	893673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057520
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25069	NC_010524	GGT	2	6	893694	893699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057520
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25079	NC_010524	GC	3	6	894002	894007	0 %	0 %	50 %	50 %	171057521
25080	NC_010524	CGC	2	6	894040	894045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057521
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25091	NC_010524	ATC	2	6	894456	894461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057521
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25101	NC_010524	CGA	2	6	895095	895100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057522
25102	NC_010524	GTT	2	6	895147	895152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057522
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25105	NC_010524	GC	3	6	895342	895347	0 %	0 %	50 %	50 %	171057522
25106	NC_010524	GGC	2	6	895366	895371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057522
25107	NC_010524	GAAA	2	8	895478	895485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25108	NC_010524	AATC	2	8	895523	895530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25109	NC_010524	TTC	2	6	895555	895560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057523
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25112	NC_010524	GGA	2	6	895650	895655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057523
25113	NC_010524	GC	3	6	895664	895669	0 %	0 %	50 %	50 %	171057523
25114	NC_010524	CAC	2	6	895683	895688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057523
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25117	NC_010524	GGCCGA	2	12	895758	895769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057523
25118	NC_010524	GCC	2	6	895771	895776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057523
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25120	NC_010524	CTG	2	6	895807	895812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25121	NC_010524	TGC	2	6	895841	895846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25122	NC_010524	GCC	2	6	895874	895879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057523
25123	NC_010524	TCG	2	6	895904	895909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25124	NC_010524	GC	3	6	896033	896038	0 %	0 %	50 %	50 %	171057523
25125	NC_010524	CGA	2	6	896076	896081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057523
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25127	NC_010524	CTG	2	6	896098	896103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25128	NC_010524	TGC	2	6	896132	896137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25129	NC_010524	CGA	2	6	896151	896156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25130	NC_010524	CAT	2	6	896259	896264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057523
25131	NC_010524	ACG	2	6	896267	896272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057523
25132	NC_010524	GGC	2	6	896285	896290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057523
25133	NC_010524	GCC	2	6	896319	896324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057523
25134	NC_010524	GCCGC	2	10	896437	896446	0 %	0 %	40 %	60 %	171057523
25135	NC_010524	CGAT	2	8	896461	896468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25136	NC_010524	TGG	2	6	896491	896496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25137	NC_010524	TTC	2	6	896509	896514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25138	NC_010524	T	6	6	896548	896553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25139	NC_010524	GCCGC	2	10	896554	896563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25140	NC_010524	CATA	2	8	896621	896628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25141	NC_010524	GAT	2	6	896637	896642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057524
25142	NC_010524	GA	3	6	896672	896677	50 %	0 %	50 %	0 %	171057524
25143	NC_010524	CTG	2	6	896752	896757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057524
25144	NC_010524	GCGTC	2	10	896831	896840	0 %	20 %	40 %	40 %	171057524
25145	NC_010524	GAC	2	6	896954	896959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057525
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25147	NC_010524	GC	3	6	897049	897054	0 %	0 %	50 %	50 %	171057525
25148	NC_010524	GTGCTG	2	12	897060	897071	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057525
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25152	NC_010524	ACG	2	6	897142	897147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057525
25153	NC_010524	GC	3	6	897148	897153	0 %	0 %	50 %	50 %	171057525
25154	NC_010524	CGGT	2	8	897205	897212	0 %	25 %	50 %	25 %	171057525
25155	NC_010524	CGG	3	9	897233	897241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057525
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25157	NC_010524	TCG	2	6	897279	897284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057525
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25167	NC_010524	TGC	2	6	897736	897741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057525
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25170	NC_010524	GCT	2	6	897977	897982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057525
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25215	NC_010524	CTG	2	6	899605	899610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057527
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25239	NC_010524	GTC	2	6	900282	900287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25240	NC_010524	ACGC	2	8	900306	900313	25 %	0 %	25 %	50 %	171057528
25241	NC_010524	TGC	2	6	900322	900327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25242	NC_010524	GCC	2	6	900330	900335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057528
25243	NC_010524	CGC	2	6	900395	900400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057528
25244	NC_010524	ATG	2	6	900435	900440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057528
25245	NC_010524	CCG	2	6	900449	900454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057528
25246	NC_010524	TCA	2	6	900523	900528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057528
25247	NC_010524	CG	3	6	900556	900561	0 %	0 %	50 %	50 %	171057528
25248	NC_010524	GGC	2	6	900579	900584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057528
25249	NC_010524	GC	3	6	900621	900626	0 %	0 %	50 %	50 %	171057528
25250	NC_010524	CGA	2	6	900704	900709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25251	NC_010524	TCA	2	6	900727	900732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057528
25252	NC_010524	CTG	2	6	900767	900772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25253	NC_010524	GCTACG	2	12	900784	900795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25254	NC_010524	TGA	2	6	900832	900837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057528
25255	NC_010524	GCC	2	6	900896	900901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057528
25256	NC_010524	GCT	2	6	900902	900907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057528
25257	NC_010524	CTT	2	6	900911	900916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057528
25258	NC_010524	CCA	2	6	900994	900999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057528
25259	NC_010524	GGCC	2	8	901130	901137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25260	NC_010524	CGC	2	6	901228	901233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057529
25261	NC_010524	TCT	2	6	901281	901286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057529
25262	NC_010524	CTG	2	6	901289	901294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057529
25263	NC_010524	CCA	3	9	901302	901310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057529
25264	NC_010524	CTT	2	6	901336	901341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057529
25265	NC_010524	GAA	3	9	901354	901362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057529
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25268	NC_010524	GCC	2	6	901508	901513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057529
25269	NC_010524	GCC	2	6	901517	901522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057529
25270	NC_010524	ACG	2	6	901548	901553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057529
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25276	NC_010524	CAAGGT	2	12	901759	901770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171057529
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25283	NC_010524	CGC	2	6	902047	902052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057529
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25291	NC_010524	AGC	2	6	902280	902285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25292	NC_010524	CGC	2	6	902303	902308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25293	NC_010524	T	6	6	902314	902319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25294	NC_010524	CAT	2	6	902330	902335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057530
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25299	NC_010524	CAA	2	6	902660	902665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057530
25300	NC_010524	GGTT	2	8	902715	902722	0 %	50 %	50 %	0 %	171057530
25301	NC_010524	CGGC	2	8	902723	902730	0 %	0 %	50 %	50 %	171057530
25302	NC_010524	GC	3	6	902760	902765	0 %	0 %	50 %	50 %	171057530
25303	NC_010524	GCC	2	6	902806	902811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057530
25304	NC_010524	CATCGC	2	12	902846	902857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171057530
25305	NC_010524	GCT	2	6	902882	902887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057530
25306	NC_010524	CGA	2	6	902894	902899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057530
25307	NC_010524	GCC	2	6	902925	902930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057530
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25312	NC_010524	ACCG	2	8	903024	903031	25 %	0 %	25 %	50 %	171057530
25313	NC_010524	CGG	2	6	903116	903121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057530
25314	NC_010524	TCTG	2	8	903187	903194	0 %	50 %	25 %	25 %	171057531
25315	NC_010524	CGAT	2	8	903198	903205	25 %	25 %	25 %	25 %	171057531
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25345	NC_010524	GCTG	2	8	904102	904109	0 %	25 %	50 %	25 %	171057531
25346	NC_010524	TGGGCG	2	12	904122	904133	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057531
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25351	NC_010524	CGG	2	6	904216	904221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057531
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25355	NC_010524	TGC	2	6	904332	904337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057531
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25357	NC_010524	CGA	2	6	904430	904435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057532
25358	NC_010524	CCG	2	6	904489	904494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057532
25359	NC_010524	CG	3	6	904531	904536	0 %	0 %	50 %	50 %	171057532
25360	NC_010524	CGC	2	6	904571	904576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057532
25361	NC_010524	TCG	3	9	904597	904605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057532
25362	NC_010524	GCA	2	6	904622	904627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057532
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25364	NC_010524	ATG	2	6	904741	904746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057532
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25366	NC_010524	CGC	2	6	904809	904814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057532
25367	NC_010524	CAG	3	9	904830	904838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057532
25368	NC_010524	CGT	2	6	904850	904855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057532
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25388	NC_010524	GC	3	6	905502	905507	0 %	0 %	50 %	50 %	171057532
25389	NC_010524	GCG	2	6	905515	905520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057532
25390	NC_010524	GTC	2	6	905538	905543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057532
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25392	NC_010524	CGA	2	6	905553	905558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057532
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25394	NC_010524	CGT	2	6	905637	905642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25441	NC_010524	GC	3	6	907603	907608	0 %	0 %	50 %	50 %	171057533
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25462	NC_010524	GCC	2	6	908414	908419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057534
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25468	NC_010524	GGGC	2	8	908842	908849	0 %	0 %	75 %	25 %	171057534
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25470	NC_010524	TGA	2	6	908892	908897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057534
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25475	NC_010524	GCA	2	6	909093	909098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057535
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25477	NC_010524	CGC	2	6	909168	909173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057535
25478	NC_010524	CGG	2	6	909255	909260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057535
25479	NC_010524	TCGT	2	8	909262	909269	0 %	50 %	25 %	25 %	171057535
25480	NC_010524	GCG	2	6	909274	909279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057535
25481	NC_010524	CG	3	6	909278	909283	0 %	0 %	50 %	50 %	171057535
25482	NC_010524	CAG	2	6	909310	909315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057535
25483	NC_010524	GGC	2	6	909381	909386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057535
25484	NC_010524	GCT	2	6	909387	909392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057535
25485	NC_010524	TGCGC	2	10	909420	909429	0 %	20 %	40 %	40 %	171057535
25486	NC_010524	GCCG	2	8	909459	909466	0 %	0 %	50 %	50 %	171057535
25487	NC_010524	CGC	2	6	909510	909515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057535
25488	NC_010524	GAT	2	6	909517	909522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057535
25489	NC_010524	GGC	2	6	909526	909531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057535
25490	NC_010524	TCT	2	6	909588	909593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057535
25491	NC_010524	CGGC	2	8	909627	909634	0 %	0 %	50 %	50 %	171057535
25492	NC_010524	CGG	2	6	909654	909659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057535
25493	NC_010524	GCCCG	2	10	909661	909670	0 %	0 %	40 %	60 %	171057535
25494	NC_010524	GC	3	6	909676	909681	0 %	0 %	50 %	50 %	171057535
25495	NC_010524	CG	3	6	909700	909705	0 %	0 %	50 %	50 %	171057535
25496	NC_010524	GTC	2	6	909748	909753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057535
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25498	NC_010524	AGGT	2	8	909857	909864	25 %	25 %	50 %	0 %	171057535
25499	NC_010524	CCAT	2	8	909884	909891	25 %	25 %	0 %	50 %	171057535
25500	NC_010524	GCCGAT	2	12	909907	909918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057535

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