MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_010524	CAG	2	6	868560	868565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057494
24503	NC_010524	CCG	2	6	868583	868588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057494
24504	NC_010524	GCCG	2	8	868610	868617	0 %	0 %	50 %	50 %	171057494
24505	NC_010524	ATG	2	6	868618	868623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057494
24506	NC_010524	CAGC	2	8	868629	868636	25 %	0 %	25 %	50 %	171057494
24507	NC_010524	ATG	2	6	868693	868698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057494
24508	NC_010524	GCG	2	6	868711	868716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057494
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24513	NC_010524	ATG	2	6	869014	869019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057494
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24518	NC_010524	CGA	2	6	869147	869152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057494
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24533	NC_010524	CGT	2	6	869657	869662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057495
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24603	NC_010524	GGT	2	6	873131	873136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057496
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24614	NC_010524	A	6	6	873637	873642	100 %	0 %	0 %	0 %	171057497
24615	NC_010524	TC	3	6	873829	873834	0 %	50 %	0 %	50 %	171057497
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24740	NC_010524	CCT	2	6	878846	878851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057503
24741	NC_010524	TCT	2	6	878882	878887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057503
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24747	NC_010524	GA	3	6	879199	879204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24753	NC_010524	AGC	2	6	879477	879482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24843	NC_010524	CAT	2	6	883538	883543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24845	NC_010524	CCTT	2	8	883640	883647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24846	NC_010524	CACC	2	8	883648	883655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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24852	NC_010524	CGCT	2	8	884218	884225	0 %	25 %	25 %	50 %	171057509
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24976	NC_010524	CCG	2	6	889652	889657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057515
24977	NC_010524	CAC	2	6	889813	889818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057515
24978	NC_010524	GAT	2	6	889831	889836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057515
24979	NC_010524	CGG	2	6	889844	889849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057515
24980	NC_010524	GAG	2	6	889873	889878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057515
24981	NC_010524	CCTG	2	8	889953	889960	0 %	25 %	25 %	50 %	171057515
24982	NC_010524	GAT	2	6	889968	889973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057515
24983	NC_010524	GGCC	2	8	890013	890020	0 %	0 %	50 %	50 %	171057515
24984	NC_010524	GAG	2	6	890053	890058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057515
24985	NC_010524	GGC	2	6	890112	890117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057515
24986	NC_010524	GCG	2	6	890160	890165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057515
24987	NC_010524	CAATC	2	10	890214	890223	40 %	20 %	0 %	40 %	171057516
24988	NC_010524	CGC	2	6	890231	890236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057516
24989	NC_010524	CGA	2	6	890242	890247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057516
24990	NC_010524	GCA	2	6	890421	890426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057516
24991	NC_010524	CAT	2	6	890429	890434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057516
24992	NC_010524	GGCG	2	8	890462	890469	0 %	0 %	75 %	25 %	171057516
24993	NC_010524	CGC	2	6	890488	890493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057516
24994	NC_010524	G	6	6	890517	890522	0 %	0 %	100 %	0 %	171057516
24995	NC_010524	GAC	2	6	890638	890643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057516
24996	NC_010524	CTG	2	6	890658	890663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057516
24997	NC_010524	GC	3	6	890671	890676	0 %	0 %	50 %	50 %	171057516
24998	NC_010524	TCT	2	6	890700	890705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057516
24999	NC_010524	AAGGTC	2	12	890733	890744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171057516
25000	NC_010524	GCA	3	9	890788	890796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057516

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