MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_010524	CCG	2	6	825851	825856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057455
23503	NC_010524	TCG	2	6	825862	825867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23504	NC_010524	CGA	2	6	825900	825905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23505	NC_010524	CCT	2	6	825927	825932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057455
23506	NC_010524	CTG	2	6	825991	825996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23507	NC_010524	GCC	2	6	826060	826065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057455
23508	NC_010524	CAG	2	6	826087	826092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23509	NC_010524	CTG	2	6	826147	826152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23510	NC_010524	CAG	2	6	826165	826170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23511	NC_010524	CGA	2	6	826197	826202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057455
23512	NC_010524	TGG	2	6	826208	826213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057455
23513	NC_010524	GCC	2	6	826219	826224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057455
23514	NC_010524	GAG	2	6	826241	826246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057455
23515	NC_010524	GTC	2	6	826264	826269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23516	NC_010524	TGC	2	6	826277	826282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23517	NC_010524	CGT	2	6	826287	826292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23518	NC_010524	GGC	2	6	826302	826307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23519	NC_010524	ACG	2	6	826325	826330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23520	NC_010524	CTT	2	6	826380	826385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057456
23521	NC_010524	TGC	4	12	826388	826399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23522	NC_010524	GCG	2	6	826406	826411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23523	NC_010524	CGG	2	6	826412	826417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23524	NC_010524	TCG	2	6	826448	826453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23525	NC_010524	GCG	2	6	826488	826493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23526	NC_010524	GCC	2	6	826501	826506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057456
23527	NC_010524	CTG	2	6	826534	826539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23528	NC_010524	GCC	2	6	826570	826575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057456
23529	NC_010524	GC	3	6	826578	826583	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23530	NC_010524	ACC	2	6	826603	826608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057456
23531	NC_010524	CCG	2	6	826616	826621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057456
23532	NC_010524	GC	3	6	826634	826639	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23533	NC_010524	GCC	2	6	826654	826659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057456
23534	NC_010524	AGC	2	6	826660	826665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23535	NC_010524	CGA	2	6	826695	826700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23536	NC_010524	CG	3	6	826711	826716	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23537	NC_010524	GC	3	6	826765	826770	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23538	NC_010524	CTG	2	6	826771	826776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23539	NC_010524	CGA	2	6	826794	826799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23540	NC_010524	AGC	2	6	826823	826828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23541	NC_010524	GCCG	2	8	826839	826846	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23542	NC_010524	GC	3	6	826852	826857	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23543	NC_010524	CTGCGC	2	12	826870	826881	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057456
23544	NC_010524	CG	3	6	826890	826895	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23545	NC_010524	CG	3	6	826929	826934	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23546	NC_010524	CTG	2	6	826936	826941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23547	NC_010524	GGC	2	6	826968	826973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
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23549	NC_010524	CG	5	10	827091	827100	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23550	NC_010524	GGC	2	6	827109	827114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23551	NC_010524	TGGC	2	8	827142	827149	0 %	25 %	50 %	25 %	171057456
23552	NC_010524	CCA	2	6	827172	827177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057456
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23554	NC_010524	GCCG	2	8	827238	827245	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23555	NC_010524	GCT	2	6	827256	827261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23556	NC_010524	GGC	2	6	827274	827279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057456
23557	NC_010524	GCT	2	6	827308	827313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23558	NC_010524	CG	3	6	827317	827322	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23559	NC_010524	CG	4	8	827347	827354	0 %	0 %	50 %	50 %	171057456
23560	NC_010524	CTG	2	6	827359	827364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23561	NC_010524	AGG	2	6	827444	827449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057456
23562	NC_010524	CGA	2	6	827451	827456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057456
23563	NC_010524	GTT	2	6	827471	827476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057456
23564	NC_010524	TAG	2	6	827525	827530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_010524	CT	3	6	827704	827709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23566	NC_010524	CG	3	6	827782	827787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23567	NC_010524	CCGA	2	8	827820	827827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23568	NC_010524	CGGT	2	8	827855	827862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23569	NC_010524	CGG	2	6	827880	827885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23570	NC_010524	GCC	2	6	827963	827968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23571	NC_010524	CTC	2	6	827990	827995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23572	NC_010524	GAC	2	6	828004	828009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23573	NC_010524	GACCC	2	10	828016	828025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23574	NC_010524	CGA	2	6	828086	828091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23575	NC_010524	GCA	2	6	828142	828147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057457
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23577	NC_010524	GT	3	6	828330	828335	0 %	50 %	50 %	0 %	171057457
23578	NC_010524	GCG	2	6	828346	828351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057457
23579	NC_010524	TGG	2	6	828361	828366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057457
23580	NC_010524	GGCTG	2	10	828370	828379	0 %	20 %	60 %	20 %	171057457
23581	NC_010524	CCG	2	6	828382	828387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057457
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23584	NC_010524	GATC	2	8	828542	828549	25 %	25 %	25 %	25 %	171057457
23585	NC_010524	ACG	2	6	828609	828614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057457
23586	NC_010524	ATC	2	6	828624	828629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057457
23587	NC_010524	CG	3	6	828639	828644	0 %	0 %	50 %	50 %	171057457
23588	NC_010524	CAG	3	9	828665	828673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057457
23589	NC_010524	CGA	2	6	828686	828691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057457
23590	NC_010524	GCTC	2	8	828789	828796	0 %	25 %	25 %	50 %	171057457
23591	NC_010524	TGGC	2	8	828984	828991	0 %	25 %	50 %	25 %	171057457
23592	NC_010524	CCGC	2	8	829048	829055	0 %	0 %	25 %	75 %	171057457
23593	NC_010524	GAA	2	6	829076	829081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057457
23594	NC_010524	CTG	2	6	829082	829087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057457
23595	NC_010524	CGG	4	12	829106	829117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057457
23596	NC_010524	GTGG	2	8	829119	829126	0 %	25 %	75 %	0 %	171057457
23597	NC_010524	CCG	2	6	829202	829207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057458
23598	NC_010524	ATGT	2	8	829246	829253	25 %	50 %	25 %	0 %	171057458
23599	NC_010524	ACG	2	6	829318	829323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057458
23600	NC_010524	TGCG	2	8	829346	829353	0 %	25 %	50 %	25 %	171057458
23601	NC_010524	GTG	2	6	829356	829361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057458
23602	NC_010524	GGCC	2	8	829435	829442	0 %	0 %	50 %	50 %	171057458
23603	NC_010524	CGA	2	6	829463	829468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057458
23604	NC_010524	GTC	2	6	829479	829484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057458
23605	NC_010524	CGCC	2	8	829496	829503	0 %	0 %	25 %	75 %	171057458
23606	NC_010524	CGC	2	6	829510	829515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057458
23607	NC_010524	TTC	2	6	829630	829635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057458
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23609	NC_010524	GCC	2	6	829730	829735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057458
23610	NC_010524	CAG	2	6	829746	829751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057458
23611	NC_010524	CTG	2	6	829848	829853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057458
23612	NC_010524	CAGC	2	8	829854	829861	25 %	0 %	25 %	50 %	171057458
23613	NC_010524	TGC	2	6	829913	829918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057458
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23615	NC_010524	CG	3	6	830027	830032	0 %	0 %	50 %	50 %	171057458
23616	NC_010524	AAG	2	6	830062	830067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057458
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23618	NC_010524	GCA	2	6	830139	830144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057459
23619	NC_010524	ATC	2	6	830172	830177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057459
23620	NC_010524	GTG	2	6	830178	830183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057459
23621	NC_010524	GCA	2	6	830200	830205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057459
23622	NC_010524	CTTC	2	8	830215	830222	0 %	50 %	0 %	50 %	171057459
23623	NC_010524	GCA	2	6	830266	830271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057459
23624	NC_010524	GC	4	8	830298	830305	0 %	0 %	50 %	50 %	171057459
23625	NC_010524	CG	3	6	830356	830361	0 %	0 %	50 %	50 %	171057459
23626	NC_010524	GGTT	2	8	830389	830396	0 %	50 %	50 %	0 %	171057459
23627	NC_010524	CGG	2	6	830472	830477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057459
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23629	NC_010524	TGC	2	6	830551	830556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057459
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23631	NC_010524	CGCC	2	8	830594	830601	0 %	0 %	25 %	75 %	171057459
23632	NC_010524	GTT	2	6	830618	830623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057459
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23652	NC_010524	CGC	3	9	831429	831437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23653	NC_010524	GTC	2	6	831581	831586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23656	NC_010524	CGG	2	6	831686	831691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23657	NC_010524	CG	3	6	831814	831819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23658	NC_010524	CTA	2	6	831860	831865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057460
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23661	NC_010524	GCT	2	6	832034	832039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057460
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23733	NC_010524	CCAAC	2	10	835273	835282	40 %	0 %	0 %	60 %	171057461
23734	NC_010524	TCGA	2	8	835288	835295	25 %	25 %	25 %	25 %	171057461
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23736	NC_010524	GAAC	2	8	835603	835610	50 %	0 %	25 %	25 %	171057461
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23983	NC_010524	TCG	2	6	846088	846093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057472
23984	NC_010524	AGC	2	6	846133	846138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057472
23985	NC_010524	GTT	2	6	846167	846172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057472
23986	NC_010524	CG	3	6	846215	846220	0 %	0 %	50 %	50 %	171057472
23987	NC_010524	GAT	2	6	846263	846268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057472
23988	NC_010524	CCG	2	6	846273	846278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057472
23989	NC_010524	GCA	2	6	846365	846370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057472
23990	NC_010524	GCA	2	6	846409	846414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057472
23991	NC_010524	GCA	2	6	846450	846455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057472
23992	NC_010524	CGC	2	6	846460	846465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057472
23993	NC_010524	GTC	3	9	846474	846482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057472
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23997	NC_010524	GCT	2	6	846641	846646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057472
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23999	NC_010524	GCT	2	6	846737	846742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057472
24000	NC_010524	CTGA	2	8	846754	846761	25 %	25 %	25 %	25 %	171057472

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