MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_010524	GCT	2	6	773159	773164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22003	NC_010524	CGC	2	6	773168	773173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22004	NC_010524	CCA	2	6	773174	773179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22005	NC_010524	GCAG	2	8	773180	773187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22006	NC_010524	GCAG	2	8	773203	773210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22007	NC_010524	GCC	2	6	773218	773223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22008	NC_010524	CCCGC	2	10	773225	773234	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22009	NC_010524	GCA	2	6	773249	773254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22010	NC_010524	CCA	2	6	773348	773353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22011	NC_010524	GCT	2	6	773382	773387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22012	NC_010524	GAC	2	6	773421	773426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22013	NC_010524	CG	3	6	773443	773448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22014	NC_010524	GCGT	2	8	773459	773466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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22016	NC_010524	TGG	2	6	773476	773481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22019	NC_010524	GTC	2	6	773568	773573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057415
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22022	NC_010524	CGGTG	2	10	773637	773646	0 %	20 %	60 %	20 %	171057415
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22057	NC_010524	GCC	2	6	775050	775055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057416
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22123	NC_010524	GAGC	2	8	777837	777844	25 %	0 %	50 %	25 %	171057418
22124	NC_010524	CTG	2	6	777856	777861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057418
22125	NC_010524	CGGCG	2	10	777862	777871	0 %	0 %	60 %	40 %	171057418
22126	NC_010524	AGC	2	6	777893	777898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057418
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22138	NC_010524	GTC	2	6	778525	778530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057420
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22221	NC_010524	TGCC	2	8	781572	781579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22222	NC_010524	GCG	2	6	781658	781663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057422
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22227	NC_010524	TCA	2	6	781836	781841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057422
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22236	NC_010524	ACT	2	6	782064	782069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057422
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22238	NC_010524	CGC	2	6	782103	782108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057422
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22240	NC_010524	TGC	2	6	782151	782156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057422
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22242	NC_010524	CTG	2	6	782237	782242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057422
22243	NC_010524	CGG	2	6	782260	782265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22245	NC_010524	TCG	2	6	782386	782391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057423
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22251	NC_010524	CTT	2	6	782761	782766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22482	NC_010524	GAT	2	6	789825	789830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057431
22483	NC_010524	CGG	2	6	789845	789850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057431
22484	NC_010524	CAT	2	6	789855	789860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057431
22485	NC_010524	ATC	2	6	789940	789945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057431
22486	NC_010524	GGC	2	6	789946	789951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057431
22487	NC_010524	CAA	2	6	789963	789968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057431
22488	NC_010524	CCA	2	6	789969	789974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057431
22489	NC_010524	CG	3	6	790042	790047	0 %	0 %	50 %	50 %	171057431
22490	NC_010524	CGC	3	9	790082	790090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057431
22491	NC_010524	CGG	2	6	790182	790187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057431
22492	NC_010524	CGA	2	6	790206	790211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057431
22493	NC_010524	GC	4	8	790224	790231	0 %	0 %	50 %	50 %	171057431
22494	NC_010524	GCTG	2	8	790280	790287	0 %	25 %	50 %	25 %	171057431
22495	NC_010524	AGA	2	6	790301	790306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057431
22496	NC_010524	GCC	2	6	790483	790488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057431
22497	NC_010524	CG	4	8	790518	790525	0 %	0 %	50 %	50 %	171057431
22498	NC_010524	GCT	2	6	790534	790539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22499	NC_010524	ACA	2	6	790589	790594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22500	NC_010524	TCGAG	2	10	790669	790678	20 %	20 %	40 %	20 %	171057432

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