MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_010524	GCT	2	6	699764	699769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
20003	NC_010524	GC	3	6	699791	699796	0 %	0 %	50 %	50 %	171057339
20004	NC_010524	CG	3	6	699940	699945	0 %	0 %	50 %	50 %	171057339
20005	NC_010524	TGC	2	6	699997	700002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
20006	NC_010524	TCG	2	6	700023	700028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
20007	NC_010524	ACCGGC	2	12	700050	700061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057339
20008	NC_010524	TCG	2	6	700095	700100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
20009	NC_010524	GCT	2	6	700126	700131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
20010	NC_010524	TGG	2	6	700168	700173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057339
20011	NC_010524	TGCCGG	2	12	700192	700203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057339
20012	NC_010524	GC	3	6	700209	700214	0 %	0 %	50 %	50 %	171057339
20013	NC_010524	TGT	2	6	700261	700266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057339
20014	NC_010524	TGG	2	6	700270	700275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057339
20015	NC_010524	CGC	2	6	700310	700315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057339
20016	NC_010524	ACC	2	6	700337	700342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057339
20017	NC_010524	GCC	2	6	700355	700360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057339
20018	NC_010524	GCC	2	6	700365	700370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057339
20019	NC_010524	CGC	2	6	700378	700383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057339
20020	NC_010524	GGCG	2	8	700400	700407	0 %	0 %	75 %	25 %	171057339
20021	NC_010524	CGG	2	6	700517	700522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20022	NC_010524	GGC	2	6	700655	700660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20023	NC_010524	C	6	6	700671	700676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20024	NC_010524	TGG	2	6	700702	700707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20025	NC_010524	CCGG	2	8	700796	700803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20026	NC_010524	GCAAC	2	10	700847	700856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20027	NC_010524	CGT	2	6	700922	700927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20028	NC_010524	AGC	2	6	700991	700996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20029	NC_010524	T	6	6	701070	701075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20030	NC_010524	TCAG	2	8	701228	701235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20031	NC_010524	GC	3	6	701286	701291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20032	NC_010524	CTTT	2	8	701312	701319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20033	NC_010524	TTGA	2	8	701369	701376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20034	NC_010524	TAA	2	6	701389	701394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20035	NC_010524	GTG	2	6	701467	701472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057340
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20037	NC_010524	CCG	3	9	701559	701567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20038	NC_010524	GCT	2	6	701627	701632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20039	NC_010524	GCC	2	6	701700	701705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20040	NC_010524	GCA	2	6	701717	701722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057340
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20042	NC_010524	CGC	2	6	701788	701793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20043	NC_010524	GAG	2	6	701805	701810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057340
20044	NC_010524	CGCAG	2	10	701901	701910	20 %	0 %	40 %	40 %	171057340
20045	NC_010524	CCA	2	6	701981	701986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057340
20046	NC_010524	GAC	2	6	702018	702023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20047	NC_010524	GCCG	2	8	702056	702063	0 %	0 %	50 %	50 %	171057340
20048	NC_010524	GTC	2	6	702067	702072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20049	NC_010524	TTC	2	6	702126	702131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057340
20050	NC_010524	CG	3	6	702151	702156	0 %	0 %	50 %	50 %	171057340
20051	NC_010524	AAC	2	6	702159	702164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057340
20052	NC_010524	AGC	2	6	702181	702186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20053	NC_010524	CGG	2	6	702218	702223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057340
20054	NC_010524	CCG	2	6	702268	702273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20055	NC_010524	CCA	2	6	702290	702295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057340
20056	NC_010524	GCA	2	6	702308	702313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20057	NC_010524	GCC	2	6	702347	702352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20058	NC_010524	GCT	2	6	702356	702361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20059	NC_010524	CGAT	2	8	702412	702419	25 %	25 %	25 %	25 %	171057340
20060	NC_010524	CGC	2	6	702422	702427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057340
20061	NC_010524	CAA	2	6	702428	702433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057340
20062	NC_010524	CCAC	2	8	702457	702464	25 %	0 %	0 %	75 %	171057340
20063	NC_010524	TTC	3	9	702513	702521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057340
20064	NC_010524	CG	3	6	702598	702603	0 %	0 %	50 %	50 %	171057340
20065	NC_010524	ACG	2	6	702643	702648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057340
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20067	NC_010524	TGA	3	9	702787	702795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057340
20068	NC_010524	ACT	2	6	702796	702801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057340
20069	NC_010524	CGAT	2	8	702808	702815	25 %	25 %	25 %	25 %	171057340
20070	NC_010524	TGCC	2	8	702897	702904	0 %	25 %	25 %	50 %	171057340
20071	NC_010524	CAGCGG	2	12	702905	702916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057340
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20074	NC_010524	CGCTGG	2	12	703129	703140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057340
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20078	NC_010524	TCG	3	9	703357	703365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057340
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20081	NC_010524	GCCG	2	8	703484	703491	0 %	0 %	50 %	50 %	171057340
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20091	NC_010524	GTGCAC	2	12	703938	703949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20092	NC_010524	CAT	2	6	703961	703966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057340
20093	NC_010524	TCG	2	6	704101	704106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057340
20094	NC_010524	TGCCA	2	10	704112	704121	20 %	20 %	20 %	40 %	171057340
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20098	NC_010524	GC	3	6	704331	704336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20099	NC_010524	GCC	2	6	704342	704347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20100	NC_010524	CGTTTC	2	12	704349	704360	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20101	NC_010524	GTC	2	6	704376	704381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20102	NC_010524	GCC	2	6	704452	704457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057341
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20104	NC_010524	CGG	2	6	704508	704513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057341
20105	NC_010524	ACT	2	6	704531	704536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057341
20106	NC_010524	CGT	2	6	704544	704549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057341
20107	NC_010524	GACC	2	8	704553	704560	25 %	0 %	25 %	50 %	171057341
20108	NC_010524	CAA	2	6	704568	704573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057341
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20118	NC_010524	GCT	2	6	704841	704846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057341
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20120	NC_010524	CGC	2	6	704880	704885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057341
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20122	NC_010524	GTC	2	6	704977	704982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057341
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20223	NC_010524	A	6	6	708533	708538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20224	NC_010524	GATC	2	8	708570	708577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20225	NC_010524	CAA	2	6	708591	708596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20237	NC_010524	GCGCG	2	10	709199	709208	0 %	0 %	60 %	40 %	171057345
20238	NC_010524	CTG	2	6	709211	709216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057345
20239	NC_010524	TCCG	2	8	709221	709228	0 %	25 %	25 %	50 %	171057345
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20241	NC_010524	GCTG	2	8	709329	709336	0 %	25 %	50 %	25 %	171057345
20242	NC_010524	CGA	2	6	709342	709347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057345
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20245	NC_010524	CGC	2	6	709491	709496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057345
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20248	NC_010524	GTCA	2	8	709592	709599	25 %	25 %	25 %	25 %	171057345
20249	NC_010524	CTG	2	6	709604	709609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057345
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20252	NC_010524	GCCA	2	8	709670	709677	25 %	0 %	25 %	50 %	171057345
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20344	NC_010524	CG	3	6	712627	712632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20345	NC_010524	ACT	2	6	712661	712666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057348
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20482	NC_010524	CTT	2	6	717720	717725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057354
20483	NC_010524	GC	3	6	717770	717775	0 %	0 %	50 %	50 %	171057354
20484	NC_010524	CGA	2	6	717818	717823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057354
20485	NC_010524	AGCC	2	8	717838	717845	25 %	0 %	25 %	50 %	171057354
20486	NC_010524	CAG	2	6	717885	717890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057354
20487	NC_010524	CGG	2	6	717965	717970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057354
20488	NC_010524	TGG	2	6	717971	717976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057354
20489	NC_010524	CAT	2	6	717981	717986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057354
20490	NC_010524	CGC	2	6	718043	718048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057354
20491	NC_010524	GCC	2	6	718056	718061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057354
20492	NC_010524	ACGCC	2	10	718076	718085	20 %	0 %	20 %	60 %	171057354
20493	NC_010524	CCAG	2	8	718094	718101	25 %	0 %	25 %	50 %	171057354
20494	NC_010524	GC	4	8	718165	718172	0 %	0 %	50 %	50 %	171057354
20495	NC_010524	GTTC	2	8	718256	718263	0 %	50 %	25 %	25 %	171057354
20496	NC_010524	GCCG	2	8	718291	718298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20497	NC_010524	TGA	2	6	718350	718355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20498	NC_010524	CAA	2	6	718439	718444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20499	NC_010524	GTCGCG	2	12	718473	718484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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