MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_010524	GCA	2	6	677128	677133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19502	NC_010524	CCG	2	6	677157	677162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057320
19503	NC_010524	GCCGG	2	10	677183	677192	0 %	0 %	60 %	40 %	171057320
19504	NC_010524	TGGC	2	8	677237	677244	0 %	25 %	50 %	25 %	171057320
19505	NC_010524	GCT	2	6	677245	677250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19506	NC_010524	AGG	2	6	677308	677313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_010524	CGG	2	6	677361	677366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057321
19508	NC_010524	CAG	2	6	677431	677436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19509	NC_010524	CGA	2	6	677445	677450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19510	NC_010524	TCG	2	6	677501	677506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19511	NC_010524	CAGC	2	8	677535	677542	25 %	0 %	25 %	50 %	171057321
19512	NC_010524	GAT	2	6	677548	677553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057321
19513	NC_010524	GCCA	2	8	677559	677566	25 %	0 %	25 %	50 %	171057321
19514	NC_010524	CCA	2	6	677589	677594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057321
19515	NC_010524	AGC	2	6	677630	677635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19516	NC_010524	GCT	2	6	677655	677660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19517	NC_010524	CGA	2	6	677688	677693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057321
19518	NC_010524	TCG	2	6	677716	677721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057322
19519	NC_010524	CTG	3	9	677787	677795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057322
19520	NC_010524	TCA	2	6	677881	677886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057322
19521	NC_010524	GC	3	6	677990	677995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19522	NC_010524	GAACA	2	10	678009	678018	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19523	NC_010524	ACA	2	6	678049	678054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19524	NC_010524	CACC	2	8	678089	678096	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19525	NC_010524	TTG	2	6	678125	678130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_010524	CATC	2	8	678165	678172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19527	NC_010524	CG	3	6	678182	678187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19528	NC_010524	ACC	2	6	678216	678221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19529	NC_010524	CGA	2	6	678245	678250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19530	NC_010524	GCC	2	6	678309	678314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057323
19531	NC_010524	ACC	2	6	678342	678347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057323
19532	NC_010524	CGA	2	6	678424	678429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19533	NC_010524	CCA	3	9	678493	678501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057323
19534	NC_010524	TCG	2	6	678544	678549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19535	NC_010524	TGCC	2	8	678559	678566	0 %	25 %	25 %	50 %	171057323
19536	NC_010524	TGG	2	6	678595	678600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19537	NC_010524	CGACGT	2	12	678653	678664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19538	NC_010524	CAG	2	6	678694	678699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19539	NC_010524	CGACAG	2	12	678737	678748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19540	NC_010524	CGGC	2	8	678760	678767	0 %	0 %	50 %	50 %	171057323
19541	NC_010524	CAA	2	6	678797	678802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
19542	NC_010524	TCA	2	6	678865	678870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057323
19543	NC_010524	CGT	2	6	678887	678892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19544	NC_010524	ACG	2	6	678904	678909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19545	NC_010524	CCG	3	9	678910	678918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057323
19546	NC_010524	GGT	2	6	678929	678934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19547	NC_010524	GGC	2	6	678945	678950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19548	NC_010524	TGG	2	6	678955	678960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19549	NC_010524	ACA	2	6	679030	679035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
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19551	NC_010524	GTG	2	6	679207	679212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19552	NC_010524	CGC	2	6	679255	679260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057323
19553	NC_010524	GGC	2	6	679320	679325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19554	NC_010524	CGG	2	6	679349	679354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19555	NC_010524	GAC	2	6	679362	679367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19556	NC_010524	CGA	2	6	679388	679393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19557	NC_010524	GCG	2	6	679405	679410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19558	NC_010524	GAA	2	6	679434	679439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057323
19559	NC_010524	GCG	2	6	679441	679446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19560	NC_010524	GAA	2	6	679458	679463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057323
19561	NC_010524	CAT	2	6	679484	679489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057323
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19563	NC_010524	CGG	2	6	679541	679546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19564	NC_010524	CAA	2	6	679607	679612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
19565	NC_010524	CTG	2	6	679698	679703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19566	NC_010524	GAC	2	6	679716	679721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19567	NC_010524	GCG	2	6	679738	679743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
19568	NC_010524	CAA	2	6	679904	679909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
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19570	NC_010524	CTGG	2	8	679941	679948	0 %	25 %	50 %	25 %	171057323
19571	NC_010524	GGGC	2	8	680005	680012	0 %	0 %	75 %	25 %	171057323
19572	NC_010524	TGG	2	6	680164	680169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19573	NC_010524	GGGC	2	8	680200	680207	0 %	0 %	75 %	25 %	171057323
19574	NC_010524	TGG	2	6	680218	680223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19575	NC_010524	GAC	2	6	680235	680240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
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19577	NC_010524	CGGCT	2	10	680360	680369	0 %	20 %	40 %	40 %	171057323
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19580	NC_010524	CTGG	2	8	680487	680494	0 %	25 %	50 %	25 %	171057323
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19583	NC_010524	TGG	2	6	680764	680769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
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19587	NC_010524	CTG	2	6	680949	680954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
19588	NC_010524	G	7	7	681012	681018	0 %	0 %	100 %	0 %	171057323
19589	NC_010524	CTGG	2	8	681033	681040	0 %	25 %	50 %	25 %	171057323
19590	NC_010524	GGGC	2	8	681097	681104	0 %	0 %	75 %	25 %	171057323
19591	NC_010524	TGG	2	6	681256	681261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19592	NC_010524	GGGC	2	8	681292	681299	0 %	0 %	75 %	25 %	171057323
19593	NC_010524	TGG	2	6	681310	681315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
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19598	NC_010524	G	7	7	681558	681564	0 %	0 %	100 %	0 %	171057323
19599	NC_010524	CTGG	2	8	681579	681586	0 %	25 %	50 %	25 %	171057323
19600	NC_010524	TGG	2	6	681802	681807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
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19602	NC_010524	TGG	2	6	681856	681861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
19603	NC_010524	GAC	2	6	681873	681878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
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19605	NC_010524	CGGCT	2	10	681998	682007	0 %	20 %	40 %	40 %	171057323
19606	NC_010524	CTG	2	6	682041	682046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
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19612	NC_010524	GTA	2	6	682562	682567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057324
19613	NC_010524	CTGG	2	8	682581	682588	0 %	25 %	50 %	25 %	171057324
19614	NC_010524	CTTC	2	8	682692	682699	0 %	50 %	0 %	50 %	171057324
19615	NC_010524	CGCCTG	2	12	682720	682731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057324
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19620	NC_010524	CCGA	2	8	682995	683002	25 %	0 %	25 %	50 %	171057324
19621	NC_010524	CGC	2	6	683053	683058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057324
19622	NC_010524	CCCA	2	8	683088	683095	25 %	0 %	0 %	75 %	171057324
19623	NC_010524	CGG	2	6	683137	683142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057324
19624	NC_010524	CGA	2	6	683162	683167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057324
19625	NC_010524	TCC	2	6	683186	683191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057324
19626	NC_010524	GAC	2	6	683234	683239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057324
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19629	NC_010524	CAGC	2	8	683375	683382	25 %	0 %	25 %	50 %	171057324
19630	NC_010524	TGG	2	6	683421	683426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057324
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19639	NC_010524	CTG	2	6	683819	683824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057324
19640	NC_010524	TGCC	2	8	683839	683846	0 %	25 %	25 %	50 %	171057324
19641	NC_010524	CCGA	2	8	683860	683867	25 %	0 %	25 %	50 %	171057324
19642	NC_010524	CGC	2	6	684029	684034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057324
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19648	NC_010524	TCC	2	6	684356	684361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19649	NC_010524	GCA	2	6	684372	684377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19650	NC_010524	TGA	2	6	684430	684435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19651	NC_010524	G	6	6	684464	684469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19652	NC_010524	C	6	6	684521	684526	0 %	0 %	0 %	100 %	171057325
19653	NC_010524	GC	4	8	684530	684537	0 %	0 %	50 %	50 %	171057325
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19669	NC_010524	TCGTC	2	10	685510	685519	0 %	40 %	20 %	40 %	171057326
19670	NC_010524	TGA	3	9	685526	685534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057326
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19673	NC_010524	GTTCG	2	10	685688	685697	0 %	40 %	40 %	20 %	171057326
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19678	NC_010524	TGA	2	6	685907	685912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057326
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19685	NC_010524	CGA	2	6	686153	686158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057326
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19695	NC_010524	CGGAGG	2	12	686451	686462	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	171057327
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19697	NC_010524	AGT	2	6	686537	686542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057327
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19699	NC_010524	CTG	2	6	686561	686566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057327
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19703	NC_010524	A	6	6	686740	686745	100 %	0 %	0 %	0 %	171057327
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19732	NC_010524	AGGC	2	8	688135	688142	25 %	0 %	50 %	25 %	171057328
19733	NC_010524	AT	3	6	688165	688170	50 %	50 %	0 %	0 %	171057328
19734	NC_010524	TGG	2	6	688173	688178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057328
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19744	NC_010524	GAA	2	6	688685	688690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057328
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19746	NC_010524	CTC	2	6	688719	688724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057328
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19756	NC_010524	CGCT	2	8	689211	689218	0 %	25 %	25 %	50 %	171057329
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19849	NC_010524	ATG	2	6	693243	693248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057333
19850	NC_010524	GTC	2	6	693314	693319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
19851	NC_010524	GC	3	6	693329	693334	0 %	0 %	50 %	50 %	171057333
19852	NC_010524	ACGA	2	8	693338	693345	50 %	0 %	25 %	25 %	171057333
19853	NC_010524	CCAA	2	8	693363	693370	50 %	0 %	0 %	50 %	171057333
19854	NC_010524	GCCG	2	8	693380	693387	0 %	0 %	50 %	50 %	171057333
19855	NC_010524	CTT	2	6	693451	693456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057333
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19858	NC_010524	TCT	2	6	693633	693638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057333
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19860	NC_010524	GAA	2	6	693726	693731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057333
19861	NC_010524	AGGAA	2	10	693735	693744	60 %	0 %	40 %	0 %	171057333
19862	NC_010524	TC	3	6	693757	693762	0 %	50 %	0 %	50 %	171057333
19863	NC_010524	CGT	2	6	693775	693780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
19864	NC_010524	AGG	2	6	693867	693872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057333
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19866	NC_010524	TCTG	2	8	694006	694013	0 %	50 %	25 %	25 %	171057333
19867	NC_010524	AGC	2	6	694019	694024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057333
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19869	NC_010524	GTC	2	6	694085	694090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
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19873	NC_010524	CTG	2	6	694262	694267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
19874	NC_010524	TCGGG	2	10	694302	694311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19875	NC_010524	GATA	2	8	694349	694356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19876	NC_010524	GGT	2	6	694373	694378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19877	NC_010524	CGT	2	6	694450	694455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
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19879	NC_010524	GTT	2	6	694752	694757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057334
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19906	NC_010524	TCT	2	6	695826	695831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19909	NC_010524	CCAG	2	8	696064	696071	25 %	0 %	25 %	50 %	171057336
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19979	NC_010524	GCA	2	6	698977	698982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057339
19980	NC_010524	CGGT	2	8	699054	699061	0 %	25 %	50 %	25 %	171057339
19981	NC_010524	GGC	2	6	699077	699082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057339
19982	NC_010524	TCG	2	6	699099	699104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
19983	NC_010524	GGC	2	6	699134	699139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057339
19984	NC_010524	GTA	2	6	699188	699193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057339
19985	NC_010524	GCG	2	6	699273	699278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057339
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19988	NC_010524	TGC	2	6	699418	699423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
19989	NC_010524	TGG	2	6	699457	699462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057339
19990	NC_010524	GGT	2	6	699467	699472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057339
19991	NC_010524	GCC	3	9	699473	699481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057339
19992	NC_010524	CGAG	2	8	699544	699551	25 %	0 %	50 %	25 %	171057339
19993	NC_010524	CG	3	6	699565	699570	0 %	0 %	50 %	50 %	171057339
19994	NC_010524	CGG	2	6	699574	699579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057339
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19996	NC_010524	GGCG	2	8	699610	699617	0 %	0 %	75 %	25 %	171057339
19997	NC_010524	TGC	2	6	699628	699633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339
19998	NC_010524	GCTC	2	8	699661	699668	0 %	25 %	25 %	50 %	171057339
19999	NC_010524	ACC	2	6	699669	699674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057339
20000	NC_010524	TGC	2	6	699706	699711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057339

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