MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010524	CTC	2	6	657286	657291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057298
19002	NC_010524	ACG	2	6	657563	657568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057298
19003	NC_010524	CGA	2	6	657575	657580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057298
19004	NC_010524	G	6	6	657603	657608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_010524	GTT	2	6	657645	657650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057299
19006	NC_010524	GTG	2	6	657679	657684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057299
19007	NC_010524	TCT	2	6	657686	657691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057299
19008	NC_010524	CTT	2	6	657695	657700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057299
19009	NC_010524	CGAG	2	8	657758	657765	25 %	0 %	50 %	25 %	171057299
19010	NC_010524	GTT	2	6	657827	657832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057299
19011	NC_010524	GAT	2	6	657837	657842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057299
19012	NC_010524	CTT	2	6	657843	657848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057299
19013	NC_010524	TCC	2	6	657882	657887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19014	NC_010524	A	6	6	657901	657906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_010524	TTC	2	6	657939	657944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19016	NC_010524	GGTC	2	8	657988	657995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19017	NC_010524	GCC	2	6	658031	658036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
19018	NC_010524	CGGC	2	8	658072	658079	0 %	0 %	50 %	50 %	171057300
19019	NC_010524	CCG	2	6	658111	658116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
19020	NC_010524	GGC	2	6	658154	658159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057300
19021	NC_010524	AGCG	2	8	658257	658264	25 %	0 %	50 %	25 %	171057300
19022	NC_010524	TGGCC	2	10	658303	658312	0 %	20 %	40 %	40 %	171057300
19023	NC_010524	CAC	2	6	658331	658336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057300
19024	NC_010524	TGA	2	6	658348	658353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057300
19025	NC_010524	TCA	2	6	658372	658377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057300
19026	NC_010524	CGC	2	6	658388	658393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
19027	NC_010524	GTC	3	9	658445	658453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057300
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19029	NC_010524	CCG	2	6	658515	658520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
19030	NC_010524	CGC	2	6	658544	658549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
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19032	NC_010524	GCC	2	6	658592	658597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
19033	NC_010524	GGC	2	6	658601	658606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057300
19034	NC_010524	CGC	2	6	658622	658627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057300
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19037	NC_010524	GCG	2	6	658755	658760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057300
19038	NC_010524	TCG	2	6	658768	658773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057300
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19041	NC_010524	GTT	2	6	659020	659025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057301
19042	NC_010524	GCG	2	6	659040	659045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057301
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19044	NC_010524	GCC	2	6	659087	659092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057301
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19051	NC_010524	GC	3	6	659285	659290	0 %	0 %	50 %	50 %	171057301
19052	NC_010524	GCC	2	6	659326	659331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057301
19053	NC_010524	CGG	2	6	659412	659417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057301
19054	NC_010524	CCA	2	6	659418	659423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057301
19055	NC_010524	GCG	2	6	659459	659464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057301
19056	NC_010524	GTC	2	6	659540	659545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057301
19057	NC_010524	GCG	2	6	659603	659608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057301
19058	NC_010524	TGC	2	6	659625	659630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057301
19059	NC_010524	CGG	2	6	659634	659639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057301
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19062	NC_010524	CGTG	2	8	659753	659760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19063	NC_010524	GC	4	8	659771	659778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_010524	CG	3	6	659781	659786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19065	NC_010524	CGA	2	6	659800	659805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057302
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19067	NC_010524	GATG	2	8	659906	659913	25 %	25 %	50 %	0 %	171057302
19068	NC_010524	TCG	2	6	659934	659939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057302
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19071	NC_010524	CGTGC	2	10	659984	659993	0 %	20 %	40 %	40 %	171057302
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19077	NC_010524	GCAC	2	8	660175	660182	25 %	0 %	25 %	50 %	171057302
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19081	NC_010524	CGGT	2	8	660297	660304	0 %	25 %	50 %	25 %	171057302
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19085	NC_010524	CGA	2	6	660616	660621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057302
19086	NC_010524	GC	4	8	660626	660633	0 %	0 %	50 %	50 %	171057302
19087	NC_010524	CGA	2	6	660649	660654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057302
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19091	NC_010524	AGC	2	6	660890	660895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057303
19092	NC_010524	GCGG	2	8	660901	660908	0 %	0 %	75 %	25 %	171057303
19093	NC_010524	CAT	2	6	660909	660914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057303
19094	NC_010524	CG	3	6	660916	660921	0 %	0 %	50 %	50 %	171057303
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19098	NC_010524	TGA	2	6	661107	661112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057303
19099	NC_010524	ACA	2	6	661119	661124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057303
19100	NC_010524	CGA	2	6	661164	661169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057303
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19103	NC_010524	CGC	2	6	661258	661263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057303
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19105	NC_010524	GC	3	6	661280	661285	0 %	0 %	50 %	50 %	171057303
19106	NC_010524	TGA	2	6	661287	661292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057303
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19115	NC_010524	GCCG	2	8	661558	661565	0 %	0 %	50 %	50 %	171057303
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19120	NC_010524	GATCG	2	10	661663	661672	20 %	20 %	40 %	20 %	171057303
19121	NC_010524	ACC	2	6	661682	661687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057303
19122	NC_010524	CAGT	2	8	661731	661738	25 %	25 %	25 %	25 %	171057303
19123	NC_010524	CGA	2	6	661942	661947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_010524	GGT	2	6	662110	662115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057304
19125	NC_010524	TG	3	6	662151	662156	0 %	50 %	50 %	0 %	171057304
19126	NC_010524	CTT	2	6	662185	662190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057304
19127	NC_010524	GT	3	6	662286	662291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19128	NC_010524	GCC	2	6	662315	662320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057305
19129	NC_010524	CTT	2	6	662324	662329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057305
19130	NC_010524	CTG	2	6	662365	662370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057305
19131	NC_010524	GCA	2	6	662385	662390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057305
19132	NC_010524	GGC	2	6	662451	662456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057305
19133	NC_010524	CAG	3	9	662462	662470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057305
19134	NC_010524	CAGCAC	2	12	662510	662521	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171057305
19135	NC_010524	GTC	2	6	662522	662527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057305
19136	NC_010524	TTC	2	6	662528	662533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057305
19137	NC_010524	AACTGG	2	12	662574	662585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171057305
19138	NC_010524	GCA	2	6	662665	662670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057305
19139	NC_010524	G	7	7	662679	662685	0 %	0 %	100 %	0 %	171057305
19140	NC_010524	CGG	2	6	662691	662696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057305
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19142	NC_010524	GAGC	2	8	662810	662817	25 %	0 %	50 %	25 %	171057305
19143	NC_010524	CGG	2	6	662818	662823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057305
19144	NC_010524	ATG	2	6	662838	662843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057305
19145	NC_010524	GGCT	2	8	662906	662913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19146	NC_010524	CAA	2	6	662915	662920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19147	NC_010524	CATG	2	8	662929	662936	25 %	25 %	25 %	25 %	171057306
19148	NC_010524	CTG	2	6	662987	662992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057306
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19151	NC_010524	GAGC	2	8	663073	663080	25 %	0 %	50 %	25 %	171057306
19152	NC_010524	ATCG	2	8	663127	663134	25 %	25 %	25 %	25 %	171057306
19153	NC_010524	CG	3	6	663200	663205	0 %	0 %	50 %	50 %	171057306
19154	NC_010524	CGT	2	6	663262	663267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057306
19155	NC_010524	CG	3	6	663286	663291	0 %	0 %	50 %	50 %	171057306
19156	NC_010524	GAC	2	6	663440	663445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057306
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19159	NC_010524	CGC	2	6	663623	663628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057307
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19162	NC_010524	TGC	2	6	663674	663679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057307
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19168	NC_010524	CTG	2	6	663849	663854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057307
19169	NC_010524	CGCC	2	8	663856	663863	0 %	0 %	25 %	75 %	171057307
19170	NC_010524	GACAT	2	10	663871	663880	40 %	20 %	20 %	20 %	171057307
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19176	NC_010524	GCT	2	6	664175	664180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057307
19177	NC_010524	GCTG	2	8	664229	664236	0 %	25 %	50 %	25 %	171057307
19178	NC_010524	CCGG	2	8	664301	664308	0 %	0 %	50 %	50 %	171057307
19179	NC_010524	TCT	2	6	664312	664317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057307
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19181	NC_010524	CGT	2	6	664349	664354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19182	NC_010524	GCC	2	6	664385	664390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057308
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19185	NC_010524	CTG	2	6	664440	664445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057308
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19226	NC_010524	GCGG	2	8	665762	665769	0 %	0 %	75 %	25 %	171057308
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19230	NC_010524	CG	3	6	665895	665900	0 %	0 %	50 %	50 %	171057309
19231	NC_010524	CCA	2	6	665964	665969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057309
19232	NC_010524	GGCA	2	8	665976	665983	25 %	0 %	50 %	25 %	171057309
19233	NC_010524	CAGC	2	8	665987	665994	25 %	0 %	25 %	50 %	171057309
19234	NC_010524	GCG	2	6	666033	666038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057309
19235	NC_010524	CAG	2	6	666039	666044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057309
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19238	NC_010524	AGC	3	9	666199	666207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057309
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19243	NC_010524	GCC	2	6	666418	666423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057309
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19361	NC_010524	CGGCTA	2	12	671205	671216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057314
19362	NC_010524	GCA	2	6	671222	671227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057314
19363	NC_010524	GCC	2	6	671242	671247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057314
19364	NC_010524	TCG	2	6	671261	671266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057314
19365	NC_010524	CGC	3	9	671391	671399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057314
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19367	NC_010524	CAC	2	6	671424	671429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057314
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19370	NC_010524	GCC	2	6	671596	671601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057314
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19387	NC_010524	TCG	2	6	672234	672239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19388	NC_010524	GTT	2	6	672284	672289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19389	NC_010524	CGGTTC	2	12	672404	672415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19390	NC_010524	GGT	2	6	672462	672467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19391	NC_010524	GTT	2	6	672509	672514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19392	NC_010524	GTT	2	6	672551	672556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19393	NC_010524	ACCTCG	2	12	672606	672617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19394	NC_010524	AAGC	2	8	672635	672642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19395	NC_010524	TCGGC	2	10	672698	672707	0 %	20 %	40 %	40 %	171057315
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19431	NC_010524	ACCG	2	8	674345	674352	25 %	0 %	25 %	50 %	171057318
19432	NC_010524	ATC	2	6	674358	674363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057318
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19471	NC_010524	GC	3	6	676028	676033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19472	NC_010524	CA	3	6	676052	676057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19479	NC_010524	CCGGC	2	10	676221	676230	0 %	0 %	40 %	60 %	171057320
19480	NC_010524	CTG	2	6	676295	676300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19481	NC_010524	CGT	2	6	676330	676335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19482	NC_010524	CGC	2	6	676387	676392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057320
19483	NC_010524	CTA	2	6	676417	676422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057320
19484	NC_010524	GC	3	6	676480	676485	0 %	0 %	50 %	50 %	171057320
19485	NC_010524	CCCA	2	8	676550	676557	25 %	0 %	0 %	75 %	171057320
19486	NC_010524	CG	3	6	676628	676633	0 %	0 %	50 %	50 %	171057320
19487	NC_010524	TGC	2	6	676680	676685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19488	NC_010524	GC	3	6	676684	676689	0 %	0 %	50 %	50 %	171057320
19489	NC_010524	GGT	2	6	676699	676704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057320
19490	NC_010524	GC	3	6	676715	676720	0 %	0 %	50 %	50 %	171057320
19491	NC_010524	ATC	2	6	676805	676810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057320
19492	NC_010524	CCCG	2	8	676837	676844	0 %	0 %	25 %	75 %	171057320
19493	NC_010524	GCT	2	6	676870	676875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19494	NC_010524	CGCA	2	8	676901	676908	25 %	0 %	25 %	50 %	171057320
19495	NC_010524	CG	3	6	676930	676935	0 %	0 %	50 %	50 %	171057320
19496	NC_010524	GCT	2	6	677005	677010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19497	NC_010524	GCC	2	6	677082	677087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057320
19498	NC_010524	CTG	2	6	677093	677098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057320
19499	NC_010524	TTC	2	6	677105	677110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057320
19500	NC_010524	CGCTG	2	10	677116	677125	0 %	20 %	40 %	40 %	171057320

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