MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010524	TCG	2	6	639933	639938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18502	NC_010524	CGT	2	6	640012	640017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18503	NC_010524	TCG	2	6	640050	640055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18504	NC_010524	AAGG	2	8	640115	640122	50 %	0 %	50 %	0 %	171057283
18505	NC_010524	CTG	2	6	640175	640180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18506	NC_010524	AGA	2	6	640195	640200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057283
18507	NC_010524	CAA	2	6	640207	640212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057283
18508	NC_010524	GCG	2	6	640217	640222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18509	NC_010524	ACC	2	6	640226	640231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057283
18510	NC_010524	GGCC	2	8	640243	640250	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18511	NC_010524	CAA	2	6	640270	640275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057283
18512	NC_010524	CG	3	6	640278	640283	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18513	NC_010524	GCG	4	12	640281	640292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18514	NC_010524	AGC	2	6	640314	640319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18515	NC_010524	AGC	2	6	640344	640349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18516	NC_010524	CG	3	6	640378	640383	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18517	NC_010524	CCG	2	6	640386	640391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18518	NC_010524	CGA	2	6	640459	640464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18519	NC_010524	GTC	2	6	640507	640512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18520	NC_010524	ACT	2	6	640536	640541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057283
18521	NC_010524	CGA	2	6	640576	640581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18522	NC_010524	TGC	2	6	640608	640613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18523	NC_010524	CGA	2	6	640654	640659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18524	NC_010524	GCG	2	6	640737	640742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18525	NC_010524	GC	4	8	640793	640800	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18526	NC_010524	CGG	2	6	640807	640812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18527	NC_010524	GCC	2	6	640850	640855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18528	NC_010524	CG	3	6	640864	640869	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18529	NC_010524	GCC	2	6	640875	640880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18530	NC_010524	GGC	2	6	640892	640897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18531	NC_010524	GGA	2	6	640924	640929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057283
18532	NC_010524	CCG	2	6	640939	640944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18533	NC_010524	ACCG	2	8	640979	640986	25 %	0 %	25 %	50 %	171057283
18534	NC_010524	GCC	2	6	641037	641042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18535	NC_010524	CAT	2	6	641149	641154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057283
18536	NC_010524	GAAG	2	8	641170	641177	50 %	0 %	50 %	0 %	171057283
18537	NC_010524	CGG	3	9	641181	641189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18538	NC_010524	AGC	2	6	641268	641273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18539	NC_010524	CAC	2	6	641275	641280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057283
18540	NC_010524	TGC	2	6	641283	641288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18541	NC_010524	CAA	2	6	641296	641301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057283
18542	NC_010524	ACG	2	6	641343	641348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18543	NC_010524	GAT	2	6	641383	641388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057283
18544	NC_010524	GAG	2	6	641390	641395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057283
18545	NC_010524	TGC	2	6	641466	641471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18546	NC_010524	GCGCCC	2	12	641513	641524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18547	NC_010524	GCCG	2	8	641584	641591	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18548	NC_010524	TTC	2	6	641600	641605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057283
18549	NC_010524	AAG	2	6	641615	641620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057283
18550	NC_010524	CGG	2	6	641626	641631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18551	NC_010524	GTC	2	6	641681	641686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18552	NC_010524	ACC	2	6	641696	641701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057283
18553	NC_010524	CG	3	6	641706	641711	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18554	NC_010524	CGC	2	6	641744	641749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18555	NC_010524	CGT	2	6	641756	641761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18556	NC_010524	GC	4	8	641882	641889	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18557	NC_010524	CG	3	6	641937	641942	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18558	NC_010524	CG	3	6	641946	641951	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18559	NC_010524	CG	3	6	641964	641969	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18560	NC_010524	CGG	2	6	641974	641979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18561	NC_010524	GTC	2	6	642065	642070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18562	NC_010524	CGC	2	6	642105	642110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18563	NC_010524	GTG	2	6	642111	642116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057283
18564	NC_010524	CGT	2	6	642119	642124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18565	NC_010524	CGC	2	6	642142	642147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18566	NC_010524	CGAC	2	8	642219	642226	25 %	0 %	25 %	50 %	171057283
18567	NC_010524	GCC	2	6	642258	642263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18568	NC_010524	CGC	2	6	642266	642271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18569	NC_010524	GTG	2	6	642273	642278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057283
18570	NC_010524	GCC	2	6	642288	642293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18571	NC_010524	AGC	2	6	642306	642311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18572	NC_010524	CGGCTG	2	12	642363	642374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057283
18573	NC_010524	GCC	2	6	642428	642433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18574	NC_010524	GCC	3	9	642474	642482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18575	NC_010524	CGC	2	6	642485	642490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18576	NC_010524	GCC	2	6	642539	642544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18577	NC_010524	GCG	2	6	642564	642569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18578	NC_010524	CCG	3	9	642573	642581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18579	NC_010524	GAG	2	6	642590	642595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057283
18580	NC_010524	C	6	6	642692	642697	0 %	0 %	0 %	100 %	171057283
18581	NC_010524	GCT	2	6	642701	642706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18582	NC_010524	CCG	2	6	642734	642739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18583	NC_010524	GTG	2	6	642746	642751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057283
18584	NC_010524	CGG	2	6	642771	642776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283
18585	NC_010524	TTCG	2	8	642778	642785	0 %	50 %	25 %	25 %	171057283
18586	NC_010524	GGT	2	6	642799	642804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057283
18587	NC_010524	AGG	2	6	642906	642911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057283
18588	NC_010524	CG	3	6	642945	642950	0 %	0 %	50 %	50 %	171057283
18589	NC_010524	GGT	2	6	642961	642966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057283
18590	NC_010524	CGA	2	6	642973	642978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
18591	NC_010524	GCTGGT	2	12	642985	642996	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057283
18592	NC_010524	CGC	2	6	643004	643009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057283
18593	NC_010524	TCG	2	6	643058	643063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18594	NC_010524	GCC	2	6	643104	643109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18595	NC_010524	GGC	2	6	643122	643127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18596	NC_010524	GGC	2	6	643143	643148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18597	NC_010524	GC	4	8	643187	643194	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
18598	NC_010524	GTG	2	6	643206	643211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057284
18599	NC_010524	GCG	2	6	643232	643237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057284
18600	NC_010524	GCA	2	6	643247	643252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057284
18601	NC_010524	GCG	2	6	643260	643265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057284
18602	NC_010524	CGGGT	2	10	643278	643287	0 %	20 %	60 %	20 %	171057284
18603	NC_010524	CGGCC	2	10	643340	643349	0 %	0 %	40 %	60 %	171057284
18604	NC_010524	CAG	2	6	643374	643379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057284
18605	NC_010524	AGC	2	6	643408	643413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057284
18606	NC_010524	AGCTC	2	10	643427	643436	20 %	20 %	20 %	40 %	171057284
18607	NC_010524	GCC	2	6	643440	643445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057284
18608	NC_010524	GC	3	6	643464	643469	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
18609	NC_010524	CGC	3	9	643467	643475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057284
18610	NC_010524	GTC	2	6	643485	643490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057284
18611	NC_010524	CAGC	2	8	643539	643546	25 %	0 %	25 %	50 %	171057284
18612	NC_010524	GC	3	6	643545	643550	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
18613	NC_010524	GCCG	2	8	643557	643564	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
18614	NC_010524	GC	3	6	643566	643571	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
18615	NC_010524	CCG	2	6	643607	643612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057284
18616	NC_010524	GCT	2	6	643617	643622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057284
18617	NC_010524	AGGGC	2	10	643637	643646	20 %	0 %	60 %	20 %	171057284
18618	NC_010524	GTC	2	6	643647	643652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057284
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18620	NC_010524	CG	3	6	643682	643687	0 %	0 %	50 %	50 %	171057284
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