MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_010524	GCC	2	6	622667	622672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057263
18002	NC_010524	TGC	2	6	622674	622679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
18003	NC_010524	CTG	2	6	622712	622717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
18004	NC_010524	GGTCG	2	10	622789	622798	0 %	20 %	60 %	20 %	171057264
18005	NC_010524	GGT	2	6	622800	622805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057264
18006	NC_010524	TCG	2	6	622823	622828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057264
18007	NC_010524	TGG	2	6	622868	622873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057264
18008	NC_010524	GC	3	6	622891	622896	0 %	0 %	50 %	50 %	171057264
18009	NC_010524	CAC	2	6	622942	622947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057264
18010	NC_010524	AGT	2	6	622962	622967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057264
18011	NC_010524	GC	3	6	623006	623011	0 %	0 %	50 %	50 %	171057264
18012	NC_010524	GCA	2	6	623043	623048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057264
18013	NC_010524	GC	3	6	623140	623145	0 %	0 %	50 %	50 %	171057264
18014	NC_010524	ATG	2	6	623147	623152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057264
18015	NC_010524	CTT	2	6	623178	623183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057264
18016	NC_010524	GCC	2	6	623233	623238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057264
18017	NC_010524	GAT	2	6	623308	623313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057264
18018	NC_010524	ATT	2	6	623379	623384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_010524	GCG	2	6	623398	623403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_010524	TTC	2	6	623467	623472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057265
18021	NC_010524	GAAG	2	8	623484	623491	50 %	0 %	50 %	0 %	171057265
18022	NC_010524	CGCC	2	8	623492	623499	0 %	0 %	25 %	75 %	171057265
18023	NC_010524	TGA	2	6	623525	623530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057265
18024	NC_010524	GC	3	6	623532	623537	0 %	0 %	50 %	50 %	171057265
18025	NC_010524	CAT	2	6	623616	623621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057265
18026	NC_010524	GAG	2	6	623626	623631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057265
18027	NC_010524	GCT	2	6	623655	623660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18028	NC_010524	GGT	2	6	623667	623672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057265
18029	NC_010524	GCCG	2	8	623676	623683	0 %	0 %	50 %	50 %	171057265
18030	NC_010524	GCT	2	6	623727	623732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18031	NC_010524	TCA	2	6	623762	623767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057265
18032	NC_010524	GTC	2	6	623788	623793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18033	NC_010524	CGCC	2	8	623802	623809	0 %	0 %	25 %	75 %	171057265
18034	NC_010524	AGC	2	6	623828	623833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18035	NC_010524	GAA	2	6	623838	623843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057265
18036	NC_010524	CGA	2	6	623871	623876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18037	NC_010524	GCCG	2	8	623879	623886	0 %	0 %	50 %	50 %	171057265
18038	NC_010524	CAT	2	6	623895	623900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057265
18039	NC_010524	CGC	2	6	623949	623954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057265
18040	NC_010524	ACG	2	6	623972	623977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18041	NC_010524	GGC	2	6	624036	624041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18042	NC_010524	CGG	2	6	624057	624062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18043	NC_010524	CGC	2	6	624138	624143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057265
18044	NC_010524	GCGCG	2	10	624183	624192	0 %	0 %	60 %	40 %	171057265
18045	NC_010524	GCT	2	6	624255	624260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18046	NC_010524	GC	3	6	624274	624279	0 %	0 %	50 %	50 %	171057265
18047	NC_010524	CGA	2	6	624306	624311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18048	NC_010524	ACC	2	6	624340	624345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057265
18049	NC_010524	GCT	3	9	624351	624359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18050	NC_010524	GAA	2	6	624498	624503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057265
18051	NC_010524	GCG	2	6	624557	624562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18052	NC_010524	GCCCGA	2	12	624612	624623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057265
18053	NC_010524	CGT	2	6	624645	624650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18054	NC_010524	TTC	2	6	624721	624726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057265
18055	NC_010524	ACCT	2	8	624760	624767	25 %	25 %	0 %	50 %	171057265
18056	NC_010524	GCT	2	6	624803	624808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18057	NC_010524	GCG	2	6	624838	624843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18058	NC_010524	ACG	2	6	624857	624862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18059	NC_010524	GGT	3	9	624903	624911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057265
18060	NC_010524	GCC	3	9	624949	624957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057265
18061	NC_010524	ACG	2	6	624968	624973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18062	NC_010524	GGC	2	6	624981	624986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18063	NC_010524	CGA	2	6	625005	625010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18064	NC_010524	GTG	2	6	625072	625077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057265
18065	NC_010524	GGCC	2	8	625098	625105	0 %	0 %	50 %	50 %	171057265
18066	NC_010524	CGA	2	6	625128	625133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057265
18067	NC_010524	GGC	2	6	625134	625139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057265
18068	NC_010524	CGC	2	6	625152	625157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057265
18069	NC_010524	GCCCG	2	10	625215	625224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18070	NC_010524	CGG	2	6	625282	625287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057266
18071	NC_010524	TCG	2	6	625290	625295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057266
18072	NC_010524	GCC	2	6	625317	625322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057266
18073	NC_010524	GAG	2	6	625368	625373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057266
18074	NC_010524	CGG	3	9	625405	625413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057266
18075	NC_010524	CGC	2	6	625429	625434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057266
18076	NC_010524	AGC	2	6	625456	625461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057266
18077	NC_010524	CAC	2	6	625487	625492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057266
18078	NC_010524	GCG	2	6	625508	625513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057266
18079	NC_010524	GCG	2	6	625532	625537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057266
18080	NC_010524	GC	3	6	625571	625576	0 %	0 %	50 %	50 %	171057266
18081	NC_010524	GGTCGA	2	12	625607	625618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057266
18082	NC_010524	GC	4	8	625654	625661	0 %	0 %	50 %	50 %	171057266
18083	NC_010524	CGA	2	6	625849	625854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057266
18084	NC_010524	GC	3	6	625866	625871	0 %	0 %	50 %	50 %	171057266
18085	NC_010524	GAC	2	6	625890	625895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057266
18086	NC_010524	CGGC	2	8	625906	625913	0 %	0 %	50 %	50 %	171057266
18087	NC_010524	CTG	2	6	625915	625920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057266
18088	NC_010524	GCA	2	6	626025	626030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18089	NC_010524	TCG	2	6	626045	626050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18090	NC_010524	TCG	2	6	626057	626062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18091	NC_010524	GCG	2	6	626094	626099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057267
18092	NC_010524	GGC	2	6	626125	626130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057267
18093	NC_010524	GGC	3	9	626187	626195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057267
18094	NC_010524	CG	3	6	626218	626223	0 %	0 %	50 %	50 %	171057267
18095	NC_010524	CAG	2	6	626227	626232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18096	NC_010524	CCG	2	6	626256	626261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057267
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18099	NC_010524	GCCG	2	8	626419	626426	0 %	0 %	50 %	50 %	171057267
18100	NC_010524	CAG	2	6	626473	626478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18101	NC_010524	ACC	2	6	626519	626524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057267
18102	NC_010524	TGC	2	6	626542	626547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057267
18103	NC_010524	CAG	2	6	626567	626572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057268
18104	NC_010524	CAT	2	6	626603	626608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057268
18105	NC_010524	GCC	2	6	626618	626623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057268
18106	NC_010524	CGT	2	6	626698	626703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057268
18107	NC_010524	GGT	2	6	626720	626725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057268
18108	NC_010524	CGC	2	6	626737	626742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057268
18109	NC_010524	CG	3	6	626762	626767	0 %	0 %	50 %	50 %	171057268
18110	NC_010524	CAC	2	6	626816	626821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057268
18111	NC_010524	TCG	2	6	626841	626846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057268
18112	NC_010524	GCG	2	6	626889	626894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18113	NC_010524	CGGTG	2	10	626969	626978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18114	NC_010524	GCA	2	6	627019	627024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057269
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18117	NC_010524	GCC	2	6	627228	627233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057269
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18119	NC_010524	CGGC	2	8	627307	627314	0 %	0 %	50 %	50 %	171057269
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18240	NC_010524	GCCA	2	8	630929	630936	25 %	0 %	25 %	50 %	171057272
18241	NC_010524	CAC	2	6	630949	630954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057272
18242	NC_010524	GC	3	6	630967	630972	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
18243	NC_010524	CGG	2	6	630978	630983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
18244	NC_010524	CGC	2	6	631021	631026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057272
18245	NC_010524	GCGCG	2	10	631032	631041	0 %	0 %	60 %	40 %	171057272
18246	NC_010524	GC	3	6	631052	631057	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
18247	NC_010524	GTG	2	6	631129	631134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057272
18248	NC_010524	CGC	2	6	631249	631254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18249	NC_010524	ACG	2	6	631270	631275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18250	NC_010524	CCGAT	2	10	631284	631293	20 %	20 %	20 %	40 %	171057273
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18252	NC_010524	CCTG	2	8	631333	631340	0 %	25 %	25 %	50 %	171057273
18253	NC_010524	GGC	2	6	631351	631356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057273
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18255	NC_010524	CTG	2	6	631367	631372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057273
18256	NC_010524	CGC	2	6	631432	631437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057273
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18259	NC_010524	TGG	2	6	631541	631546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057273
18260	NC_010524	TCG	2	6	631575	631580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18261	NC_010524	CG	3	6	631579	631584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18262	NC_010524	GTC	2	6	631618	631623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057274
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18264	NC_010524	GC	3	6	631635	631640	0 %	0 %	50 %	50 %	171057274
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18269	NC_010524	CTG	2	6	631708	631713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057274
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18297	NC_010524	ATC	2	6	632598	632603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057275
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18339	NC_010524	GTC	2	6	633887	633892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057275
18340	NC_010524	GCAGG	2	10	633982	633991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18341	NC_010524	TGT	3	9	634051	634059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18342	NC_010524	TGG	2	6	634061	634066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18343	NC_010524	TA	3	6	634151	634156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18344	NC_010524	TCC	2	6	634165	634170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18345	NC_010524	CGG	2	6	634210	634215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18346	NC_010524	CTGG	2	8	634225	634232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18347	NC_010524	TCC	2	6	634316	634321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18348	NC_010524	ACC	2	6	634334	634339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18349	NC_010524	AC	3	6	634340	634345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18350	NC_010524	CGG	2	6	634409	634414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057276
18351	NC_010524	CGGT	2	8	634417	634424	0 %	25 %	50 %	25 %	171057276
18352	NC_010524	ACC	2	6	634434	634439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057276
18353	NC_010524	TGG	2	6	634483	634488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057276
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18355	NC_010524	CAT	2	6	634562	634567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057276
18356	NC_010524	CGG	2	6	634580	634585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057276
18357	NC_010524	GCG	2	6	634690	634695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057276
18358	NC_010524	GGC	2	6	634703	634708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057276
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18360	NC_010524	GGGC	2	8	634784	634791	0 %	0 %	75 %	25 %	171057276
18361	NC_010524	TCA	2	6	634819	634824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057276
18362	NC_010524	GACC	2	8	634829	634836	25 %	0 %	25 %	50 %	171057276
18363	NC_010524	CGC	2	6	634840	634845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057276
18364	NC_010524	TGA	2	6	634912	634917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057276
18365	NC_010524	CGA	2	6	634943	634948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057276
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18368	NC_010524	GCA	2	6	635091	635096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057277
18369	NC_010524	A	6	6	635288	635293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18370	NC_010524	GCC	2	6	635303	635308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18371	NC_010524	TGC	2	6	635319	635324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18373	NC_010524	GTC	2	6	635440	635445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057278
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18379	NC_010524	AGC	2	6	635857	635862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18423	NC_010524	GTC	2	6	637342	637347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18424	NC_010524	GCGCA	2	10	637371	637380	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18425	NC_010524	TGC	2	6	637388	637393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057281
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18479	NC_010524	CCG	2	6	639159	639164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18480	NC_010524	GCC	2	6	639175	639180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18481	NC_010524	CGGC	2	8	639286	639293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18482	NC_010524	GCG	2	6	639361	639366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18483	NC_010524	GCA	2	6	639414	639419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18484	NC_010524	TCCG	2	8	639420	639427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18485	NC_010524	TGC	2	6	639469	639474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18486	NC_010524	ACA	2	6	639488	639493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18487	NC_010524	GC	3	6	639552	639557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18488	NC_010524	GC	3	6	639569	639574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18489	NC_010524	GTG	2	6	639584	639589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18490	NC_010524	CCTG	2	8	639608	639615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18491	NC_010524	GTCT	2	8	639660	639667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18492	NC_010524	CG	3	6	639676	639681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18493	NC_010524	CGCTG	2	10	639686	639695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18494	NC_010524	GCC	2	6	639733	639738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18495	NC_010524	CGGG	2	8	639765	639772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18496	NC_010524	GTT	2	6	639801	639806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_010524	GCGA	2	8	639822	639829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18498	NC_010524	CTG	2	6	639844	639849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18499	NC_010524	GAG	2	6	639870	639875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18500	NC_010524	GCG	2	6	639919	639924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057283

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