MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_010524	GCC	2	6	607189	607194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057249
17502	NC_010524	GCA	2	6	607236	607241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057249
17503	NC_010524	GCCG	2	8	607246	607253	0 %	0 %	50 %	50 %	171057249
17504	NC_010524	CGA	2	6	607272	607277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057249
17505	NC_010524	CGG	2	6	607287	607292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057249
17506	NC_010524	GGC	2	6	607324	607329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057249
17507	NC_010524	GGC	2	6	607357	607362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057249
17508	NC_010524	GGATG	2	10	607389	607398	20 %	20 %	60 %	0 %	171057249
17509	NC_010524	CGC	2	6	607416	607421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17510	NC_010524	CCA	3	9	607467	607475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057250
17511	NC_010524	CAT	2	6	607503	607508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057250
17512	NC_010524	GC	4	8	607514	607521	0 %	0 %	50 %	50 %	171057250
17513	NC_010524	CGC	2	6	607533	607538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057250
17514	NC_010524	GGCC	2	8	607607	607614	0 %	0 %	50 %	50 %	171057250
17515	NC_010524	GTC	2	6	607666	607671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057250
17516	NC_010524	GC	3	6	607713	607718	0 %	0 %	50 %	50 %	171057250
17517	NC_010524	GCG	2	6	607743	607748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057250
17518	NC_010524	TCG	3	9	607751	607759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057250
17519	NC_010524	GCC	3	9	607783	607791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057250
17520	NC_010524	GC	3	6	607803	607808	0 %	0 %	50 %	50 %	171057250
17521	NC_010524	CCAGGC	2	12	607812	607823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057250
17522	NC_010524	GGCC	2	8	607855	607862	0 %	0 %	50 %	50 %	171057250
17523	NC_010524	GGC	2	6	607863	607868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057250
17524	NC_010524	GT	4	8	607871	607878	0 %	50 %	50 %	0 %	171057250
17525	NC_010524	GT	3	6	607882	607887	0 %	50 %	50 %	0 %	171057250
17526	NC_010524	GT	3	6	607891	607896	0 %	50 %	50 %	0 %	171057250
17527	NC_010524	GT	3	6	607900	607905	0 %	50 %	50 %	0 %	171057250
17528	NC_010524	GT	3	6	607909	607914	0 %	50 %	50 %	0 %	171057250
17529	NC_010524	GCG	3	9	607928	607936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057250
17530	NC_010524	CCG	2	6	607974	607979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17531	NC_010524	CAG	2	6	607996	608001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17532	NC_010524	GGC	2	6	608041	608046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17533	NC_010524	CGG	2	6	608049	608054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17534	NC_010524	TCG	2	6	608066	608071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17535	NC_010524	GCT	2	6	608095	608100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17536	NC_010524	CGG	2	6	608103	608108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17537	NC_010524	GGC	2	6	608149	608154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17538	NC_010524	GCC	2	6	608230	608235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057251
17539	NC_010524	CAG	2	6	608245	608250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17540	NC_010524	GCCC	2	8	608256	608263	0 %	0 %	25 %	75 %	171057251
17541	NC_010524	TG	4	8	608333	608340	0 %	50 %	50 %	0 %	171057251
17542	NC_010524	GCG	3	9	608351	608359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17543	NC_010524	CAG	2	6	608419	608424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17544	NC_010524	GCA	2	6	608466	608471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17545	NC_010524	GCC	2	6	608557	608562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057251
17546	NC_010524	GCG	2	6	608632	608637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17547	NC_010524	GC	3	6	608643	608648	0 %	0 %	50 %	50 %	171057251
17548	NC_010524	GCG	2	6	608686	608691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17549	NC_010524	GCAG	2	8	608784	608791	25 %	0 %	50 %	25 %	171057251
17550	NC_010524	CGC	2	6	608800	608805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057251
17551	NC_010524	GC	3	6	608804	608809	0 %	0 %	50 %	50 %	171057251
17552	NC_010524	CGCC	2	8	608820	608827	0 %	0 %	25 %	75 %	171057251
17553	NC_010524	GCG	2	6	608847	608852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17554	NC_010524	CAG	2	6	608872	608877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17555	NC_010524	TCG	2	6	608891	608896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17556	NC_010524	GC	3	6	608907	608912	0 %	0 %	50 %	50 %	171057251
17557	NC_010524	CGGCG	2	10	608968	608977	0 %	0 %	60 %	40 %	171057251
17558	NC_010524	GCG	2	6	609008	609013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17559	NC_010524	CCGG	2	8	609035	609042	0 %	0 %	50 %	50 %	171057251
17560	NC_010524	GCC	2	6	609088	609093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057251
17561	NC_010524	GCG	2	6	609132	609137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17562	NC_010524	TGC	2	6	609150	609155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17563	NC_010524	GAC	2	6	609196	609201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057251
17564	NC_010524	GCG	3	9	609218	609226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057251
17565	NC_010524	GCAG	2	8	609249	609256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17566	NC_010524	GGGT	2	8	609432	609439	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_010524	CGT	2	6	609505	609510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057252
17568	NC_010524	GTC	2	6	609511	609516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057252
17569	NC_010524	CCG	2	6	609557	609562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057252
17570	NC_010524	GGT	2	6	609591	609596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057252
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17572	NC_010524	CGG	2	6	609606	609611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
17573	NC_010524	GCC	2	6	609637	609642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057252
17574	NC_010524	AAG	2	6	609664	609669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057252
17575	NC_010524	CGG	2	6	609675	609680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
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17578	NC_010524	TCG	2	6	609839	609844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057252
17579	NC_010524	TGG	2	6	609848	609853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057252
17580	NC_010524	GTCG	2	8	609873	609880	0 %	25 %	50 %	25 %	171057252
17581	NC_010524	AGG	2	6	609893	609898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057252
17582	NC_010524	GTTC	2	8	609899	609906	0 %	50 %	25 %	25 %	171057252
17583	NC_010524	GGC	2	6	609918	609923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
17584	NC_010524	CGG	2	6	609960	609965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
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17586	NC_010524	CGACC	2	10	610083	610092	20 %	0 %	20 %	60 %	171057252
17587	NC_010524	CGG	2	6	610095	610100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
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17589	NC_010524	CG	3	6	610124	610129	0 %	0 %	50 %	50 %	171057252
17590	NC_010524	CGC	2	6	610146	610151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057252
17591	NC_010524	CGG	2	6	610155	610160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
17592	NC_010524	GCC	2	6	610183	610188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057252
17593	NC_010524	ACC	2	6	610232	610237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057252
17594	NC_010524	ACA	2	6	610292	610297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057252
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17596	NC_010524	CGC	2	6	610431	610436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057252
17597	NC_010524	CAT	2	6	610446	610451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057252
17598	NC_010524	CGG	2	6	610452	610457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057252
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17600	NC_010524	GCA	2	6	610608	610613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
17601	NC_010524	CCCG	2	8	610681	610688	0 %	0 %	25 %	75 %	171057253
17602	NC_010524	GCCG	2	8	610691	610698	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17603	NC_010524	GC	3	6	610734	610739	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17604	NC_010524	ACG	2	6	610740	610745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
17605	NC_010524	CGC	2	6	610750	610755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
17606	NC_010524	TGG	2	6	610788	610793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057253
17607	NC_010524	GGC	2	6	610835	610840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057253
17608	NC_010524	CG	4	8	610865	610872	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17609	NC_010524	CG	3	6	610874	610879	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17610	NC_010524	TGC	2	6	610881	610886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17612	NC_010524	TGC	2	6	610953	610958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17614	NC_010524	CGA	2	6	611011	611016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17619	NC_010524	CAC	2	6	611089	611094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057253
17620	NC_010524	TGC	2	6	611097	611102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
17621	NC_010524	ACCG	2	8	611138	611145	25 %	0 %	25 %	50 %	171057253
17622	NC_010524	GC	3	6	611158	611163	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17623	NC_010524	CCG	2	6	611190	611195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
17624	NC_010524	GCC	2	6	611232	611237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
17625	NC_010524	CCGG	2	8	611260	611267	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17626	NC_010524	CTCG	2	8	611299	611306	0 %	25 %	25 %	50 %	171057253
17627	NC_010524	GC	3	6	611363	611368	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
17628	NC_010524	TCG	2	6	611373	611378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17630	NC_010524	CTG	2	6	611435	611440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17633	NC_010524	TGCG	2	8	611535	611542	0 %	25 %	50 %	25 %	171057253
17634	NC_010524	TGC	2	6	611589	611594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
17635	NC_010524	GAC	2	6	611633	611638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17645	NC_010524	TGC	2	6	611826	611831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17651	NC_010524	CGA	2	6	612097	612102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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17656	NC_010524	GCT	2	6	612201	612206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057254
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17671	NC_010524	TCA	2	6	612584	612589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057254
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17674	NC_010524	GTCG	2	8	612669	612676	0 %	25 %	50 %	25 %	171057254
17675	NC_010524	CGCC	2	8	612692	612699	0 %	0 %	25 %	75 %	171057254
17676	NC_010524	GC	3	6	612713	612718	0 %	0 %	50 %	50 %	171057254
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17680	NC_010524	GCT	2	6	612786	612791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057254
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17683	NC_010524	GC	4	8	612846	612853	0 %	0 %	50 %	50 %	171057254
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17693	NC_010524	GCT	2	6	613077	613082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057254
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17695	NC_010524	GGC	2	6	613102	613107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057254
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17701	NC_010524	GCT	2	6	613212	613217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057254
17702	NC_010524	GCTG	2	8	613232	613239	0 %	25 %	50 %	25 %	171057254
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17704	NC_010524	GCT	2	6	613384	613389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057255
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17707	NC_010524	CGCTGG	2	12	613476	613487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057255
17708	NC_010524	GGCT	2	8	613494	613501	0 %	25 %	50 %	25 %	171057255
17709	NC_010524	CAT	2	6	613549	613554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057255
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17712	NC_010524	GCC	2	6	613621	613626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057255
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17715	NC_010524	TTCGG	2	10	613745	613754	0 %	40 %	40 %	20 %	171057255
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17719	NC_010524	GGTG	2	8	613810	613817	0 %	25 %	75 %	0 %	171057255
17720	NC_010524	CGC	2	6	613837	613842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057255
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17723	NC_010524	CTG	2	6	613892	613897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057255
17724	NC_010524	CGG	2	6	613906	613911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057255
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17726	NC_010524	GC	3	6	614017	614022	0 %	0 %	50 %	50 %	171057255
17727	NC_010524	GCCT	2	8	614030	614037	0 %	25 %	25 %	50 %	171057255
17728	NC_010524	GCT	2	6	614047	614052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057255
17729	NC_010524	CGGTG	2	10	614098	614107	0 %	20 %	60 %	20 %	171057255
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17731	NC_010524	GGT	2	6	614146	614151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057255
17732	NC_010524	GCT	2	6	614152	614157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057255
17733	NC_010524	TTC	2	6	614165	614170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057255
17734	NC_010524	CG	3	6	614226	614231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17735	NC_010524	GC	3	6	614235	614240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17736	NC_010524	CG	3	6	614292	614297	0 %	0 %	50 %	50 %	171057256
17737	NC_010524	TGGTGC	2	12	614307	614318	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057256
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17983	NC_010524	GTG	2	6	622142	622147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057263
17984	NC_010524	TCA	2	6	622149	622154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057263
17985	NC_010524	TCG	2	6	622170	622175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17986	NC_010524	GCC	2	6	622187	622192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057263
17987	NC_010524	TGC	2	6	622194	622199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17988	NC_010524	GCG	2	6	622284	622289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057263
17989	NC_010524	CTG	2	6	622316	622321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17990	NC_010524	GAC	2	6	622342	622347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17991	NC_010524	GGT	2	6	622348	622353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057263
17992	NC_010524	GTC	2	6	622363	622368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17993	NC_010524	GC	3	6	622379	622384	0 %	0 %	50 %	50 %	171057263
17994	NC_010524	GCT	2	6	622423	622428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
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17996	NC_010524	TGG	2	6	622446	622451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057263
17997	NC_010524	CTG	2	6	622493	622498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17998	NC_010524	CTG	2	6	622550	622555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
17999	NC_010524	GCT	2	6	622564	622569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057263
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