MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_010524	ACC	2	6	573145	573150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057217
16502	NC_010524	CCA	2	6	573251	573256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057217
16503	NC_010524	GAG	2	6	573265	573270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057217
16504	NC_010524	AGC	2	6	573296	573301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057217
16505	NC_010524	AGC	2	6	573320	573325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057217
16506	NC_010524	CTG	2	6	573361	573366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057217
16507	NC_010524	GCC	2	6	573368	573373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057217
16508	NC_010524	GAG	2	6	573406	573411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057217
16509	NC_010524	TCT	2	6	573413	573418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057217
16510	NC_010524	GAG	2	6	573454	573459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057217
16511	NC_010524	CTG	2	6	573460	573465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057217
16512	NC_010524	CGG	2	6	573486	573491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057217
16513	NC_010524	CGG	2	6	573570	573575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057217
16514	NC_010524	TGG	2	6	573590	573595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057217
16515	NC_010524	GAG	2	6	573631	573636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057217
16516	NC_010524	GC	3	6	573646	573651	0 %	0 %	50 %	50 %	171057217
16517	NC_010524	GGC	2	6	573666	573671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057217
16518	NC_010524	CAAG	2	8	573762	573769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16519	NC_010524	GCC	2	6	573834	573839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16520	NC_010524	G	6	6	573948	573953	0 %	0 %	100 %	0 %	171057218
16521	NC_010524	GCT	2	6	574062	574067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16522	NC_010524	GCC	2	6	574123	574128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057218
16523	NC_010524	GAG	2	6	574129	574134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057218
16524	NC_010524	GC	3	6	574166	574171	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16525	NC_010524	TCA	2	6	574181	574186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057218
16526	NC_010524	CCG	2	6	574187	574192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057218
16527	NC_010524	GCG	2	6	574199	574204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057218
16528	NC_010524	CG	3	6	574233	574238	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16529	NC_010524	GTG	2	6	574273	574278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057218
16530	NC_010524	CCG	2	6	574305	574310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057218
16531	NC_010524	GTG	2	6	574369	574374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057218
16532	NC_010524	GCT	2	6	574386	574391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16533	NC_010524	CGA	2	6	574404	574409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16534	NC_010524	ACG	2	6	574442	574447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16535	NC_010524	CGG	2	6	574464	574469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057218
16536	NC_010524	CAT	2	6	574479	574484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057218
16537	NC_010524	TGA	2	6	574532	574537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057218
16538	NC_010524	GAT	2	6	574554	574559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057218
16539	NC_010524	CCA	2	6	574592	574597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057218
16540	NC_010524	GCT	2	6	574626	574631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16541	NC_010524	GC	3	6	574652	574657	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16542	NC_010524	GTGCTG	2	12	574663	574674	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057218
16543	NC_010524	CAA	2	6	574683	574688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057218
16544	NC_010524	GAC	2	6	574725	574730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16545	NC_010524	CCG	2	6	574734	574739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057218
16546	NC_010524	CGA	2	6	574749	574754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16547	NC_010524	ACG	2	6	574781	574786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16548	NC_010524	GC	3	6	574840	574845	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16549	NC_010524	CG	3	6	574846	574851	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16550	NC_010524	GCC	2	6	574875	574880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057218
16551	NC_010524	GCA	2	6	574887	574892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057218
16552	NC_010524	GCACCG	2	12	574895	574906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057218
16553	NC_010524	ACA	2	6	574907	574912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057218
16554	NC_010524	GC	3	6	574937	574942	0 %	0 %	50 %	50 %	171057218
16555	NC_010524	CGCA	2	8	575014	575021	25 %	0 %	25 %	50 %	171057218
16556	NC_010524	CAA	2	6	575049	575054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057218
16557	NC_010524	CGC	2	6	575108	575113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16558	NC_010524	GCCC	2	8	575145	575152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16559	NC_010524	CGTCGG	2	12	575279	575290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057219
16560	NC_010524	AAG	2	6	575304	575309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057219
16561	NC_010524	CCG	2	6	575357	575362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057219
16562	NC_010524	GC	3	6	575396	575401	0 %	0 %	50 %	50 %	171057219
16563	NC_010524	GC	3	6	575418	575423	0 %	0 %	50 %	50 %	171057219
16564	NC_010524	CGG	2	6	575444	575449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057219
16565	NC_010524	CTG	2	6	575498	575503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16566	NC_010524	GGCCTG	2	12	575505	575516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057219
16567	NC_010524	CCG	2	6	575539	575544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057219
16568	NC_010524	CGG	2	6	575569	575574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057219
16569	NC_010524	CTG	2	6	575589	575594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16570	NC_010524	AGGGCG	2	12	575668	575679	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	171057219
16571	NC_010524	CTGGT	2	10	575685	575694	0 %	40 %	40 %	20 %	171057219
16572	NC_010524	CG	4	8	575819	575826	0 %	0 %	50 %	50 %	171057219
16573	NC_010524	CGA	2	6	575915	575920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16574	NC_010524	ACG	3	9	575953	575961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16575	NC_010524	GCT	2	6	576020	576025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16576	NC_010524	AAC	2	6	576063	576068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057219
16577	NC_010524	GCT	2	6	576071	576076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16578	NC_010524	GC	3	6	576077	576082	0 %	0 %	50 %	50 %	171057219
16579	NC_010524	CTG	2	6	576084	576089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057219
16580	NC_010524	CCGAC	2	10	576091	576100	20 %	0 %	20 %	60 %	171057219
16581	NC_010524	CGC	2	6	576139	576144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057219
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16583	NC_010524	CG	3	6	576192	576197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16584	NC_010524	CTG	4	12	576223	576234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
16585	NC_010524	GCT	2	6	576243	576248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
16586	NC_010524	GGT	2	6	576279	576284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057220
16587	NC_010524	GGC	3	9	576287	576295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057220
16588	NC_010524	ATC	2	6	576307	576312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057220
16589	NC_010524	GGCCT	2	10	576331	576340	0 %	20 %	40 %	40 %	171057220
16590	NC_010524	TGC	3	9	576350	576358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
16591	NC_010524	CGGC	2	8	576405	576412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16592	NC_010524	CCG	3	9	576451	576459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16593	NC_010524	GCCA	2	8	576477	576484	25 %	0 %	25 %	50 %	171057221
16594	NC_010524	GCC	2	6	576501	576506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16595	NC_010524	GCA	2	6	576532	576537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
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16598	NC_010524	GCA	2	6	576628	576633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
16599	NC_010524	CGC	2	6	576635	576640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16600	NC_010524	CGAG	2	8	576808	576815	25 %	0 %	50 %	25 %	171057221
16601	NC_010524	CGGCG	2	10	576817	576826	0 %	0 %	60 %	40 %	171057221
16602	NC_010524	CGC	2	6	576868	576873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16603	NC_010524	CAG	2	6	576890	576895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
16604	NC_010524	GCG	2	6	576937	576942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
16605	NC_010524	GC	3	6	576981	576986	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
16606	NC_010524	GGC	2	6	577007	577012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
16607	NC_010524	GCA	2	6	577114	577119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
16608	NC_010524	CGGC	2	8	577159	577166	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
16609	NC_010524	G	6	6	577171	577176	0 %	0 %	100 %	0 %	171057221
16610	NC_010524	CGGG	2	8	577183	577190	0 %	0 %	75 %	25 %	171057221
16611	NC_010524	TGCAGC	2	12	577209	577220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057221
16612	NC_010524	CCG	2	6	577221	577226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16613	NC_010524	GGC	2	6	577235	577240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
16614	NC_010524	CGG	2	6	577249	577254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
16615	NC_010524	GCG	2	6	577275	577280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
16616	NC_010524	GCC	2	6	577310	577315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
16617	NC_010524	CTT	2	6	577325	577330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057221
16618	NC_010524	GCA	2	6	577360	577365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
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16620	NC_010524	CAGG	2	8	577409	577416	25 %	0 %	50 %	25 %	171057221
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16622	NC_010524	AGGTCG	2	12	577428	577439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057221
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16624	NC_010524	CTG	2	6	577466	577471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
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16740	NC_010524	GTC	2	6	581462	581467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057225
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16979	NC_010524	CG	3	6	589743	589748	0 %	0 %	50 %	50 %	171057233
16980	NC_010524	TGG	2	6	589752	589757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057233
16981	NC_010524	CTG	2	6	589787	589792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057233
16982	NC_010524	TTC	2	6	589808	589813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057233
16983	NC_010524	TGCG	2	8	589845	589852	0 %	25 %	50 %	25 %	171057233
16984	NC_010524	GGC	2	6	589932	589937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057233
16985	NC_010524	GC	3	6	589949	589954	0 %	0 %	50 %	50 %	171057233
16986	NC_010524	CGC	2	6	589964	589969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057233
16987	NC_010524	CGC	2	6	589990	589995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057233
16988	NC_010524	CTG	2	6	590003	590008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057233
16989	NC_010524	GCGG	2	8	590022	590029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16990	NC_010524	CG	3	6	590103	590108	0 %	0 %	50 %	50 %	171057234
16991	NC_010524	TGC	2	6	590120	590125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057234
16992	NC_010524	GCTG	2	8	590133	590140	0 %	25 %	50 %	25 %	171057234
16993	NC_010524	CCG	3	9	590175	590183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057234
16994	NC_010524	GCG	2	6	590201	590206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057234
16995	NC_010524	CTG	2	6	590284	590289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057234
16996	NC_010524	CAA	2	6	590325	590330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057234
16997	NC_010524	TGC	2	6	590333	590338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057234
16998	NC_010524	GCCT	2	8	590380	590387	0 %	25 %	25 %	50 %	171057234
16999	NC_010524	GCCG	2	8	590473	590480	0 %	0 %	50 %	50 %	171057234
17000	NC_010524	TCA	2	6	590492	590497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057234

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