MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010524	CCTCGG	2	12	467220	467231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057116
13502	NC_010524	CAG	2	6	467233	467238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13503	NC_010524	GC	4	8	467345	467352	0 %	0 %	50 %	50 %	171057116
13504	NC_010524	CAC	2	6	467380	467385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057116
13505	NC_010524	GGC	2	6	467410	467415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057116
13506	NC_010524	GTC	2	6	467416	467421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13507	NC_010524	GCT	2	6	467445	467450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13508	NC_010524	GC	3	6	467454	467459	0 %	0 %	50 %	50 %	171057116
13509	NC_010524	GCT	2	6	467462	467467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13510	NC_010524	CCG	2	6	467483	467488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
13511	NC_010524	GCC	2	6	467491	467496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
13512	NC_010524	GAA	2	6	467509	467514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057116
13513	NC_010524	ATG	2	6	467537	467542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057116
13514	NC_010524	GTT	2	6	467599	467604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057116
13515	NC_010524	CGG	2	6	467622	467627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057116
13516	NC_010524	GAC	3	9	467659	467667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13517	NC_010524	GCC	2	6	467680	467685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
13518	NC_010524	GAT	3	9	467692	467700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057116
13519	NC_010524	GCCAGC	2	12	467720	467731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057116
13520	NC_010524	GAA	2	6	467737	467742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057116
13521	NC_010524	GGTGAA	2	12	467758	467769	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	171057116
13522	NC_010524	CCAGGC	2	12	467772	467783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057116
13523	NC_010524	GCC	2	6	467824	467829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
13524	NC_010524	GCGATG	2	12	468017	468028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057116
13525	NC_010524	CCG	2	6	468033	468038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
13526	NC_010524	GAA	2	6	468058	468063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057116
13527	NC_010524	CCA	2	6	468066	468071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057116
13528	NC_010524	GC	3	6	468104	468109	0 %	0 %	50 %	50 %	171057116
13529	NC_010524	CAG	2	6	468133	468138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13530	NC_010524	CGG	2	6	468174	468179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057116
13531	NC_010524	GCG	2	6	468197	468202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057116
13532	NC_010524	GGT	2	6	468259	468264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057116
13533	NC_010524	CGA	2	6	468309	468314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13534	NC_010524	CAG	2	6	468319	468324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
13535	NC_010524	TCTT	2	8	468380	468387	0 %	75 %	0 %	25 %	171057117
13536	NC_010524	GCG	2	6	468406	468411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057117
13537	NC_010524	CCG	2	6	468425	468430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057117
13538	NC_010524	GGT	2	6	468484	468489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057117
13539	NC_010524	GCC	2	6	468503	468508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057117
13540	NC_010524	CGA	2	6	468519	468524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057117
13541	NC_010524	GCG	2	6	468561	468566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057117
13542	NC_010524	GAT	2	6	468628	468633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057117
13543	NC_010524	TGA	2	6	468639	468644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057117
13544	NC_010524	TGG	2	6	468645	468650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057117
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13547	NC_010524	GTC	3	9	468720	468728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057118
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13549	NC_010524	GCC	2	6	468814	468819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057118
13550	NC_010524	CGA	2	6	468845	468850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057118
13551	NC_010524	GCC	3	9	468903	468911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057118
13552	NC_010524	GCCA	2	8	468918	468925	25 %	0 %	25 %	50 %	171057118
13553	NC_010524	CGG	2	6	468941	468946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057118
13554	NC_010524	CGA	2	6	468953	468958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057118
13555	NC_010524	CGGCG	2	10	469008	469017	0 %	0 %	60 %	40 %	171057118
13556	NC_010524	TCT	2	6	469082	469087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057118
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13559	NC_010524	CTC	2	6	469152	469157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057118
13560	NC_010524	GCC	2	6	469188	469193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057118
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13564	NC_010524	CGG	3	9	469334	469342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057118
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13570	NC_010524	GTG	2	6	469450	469455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057118
13571	NC_010524	CGCGG	2	10	469456	469465	0 %	0 %	60 %	40 %	171057118
13572	NC_010524	CGG	3	9	469490	469498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057118
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13574	NC_010524	TCGGAC	2	12	469576	469587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057118
13575	NC_010524	GC	4	8	469589	469596	0 %	0 %	50 %	50 %	171057118
13576	NC_010524	CGG	2	6	469628	469633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057118
13577	NC_010524	TCG	2	6	469669	469674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057118
13578	NC_010524	GGC	2	6	469683	469688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057118
13579	NC_010524	CGC	2	6	469697	469702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057118
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13581	NC_010524	TGT	2	6	469823	469828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13583	NC_010524	GAAC	2	8	469856	469863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13584	NC_010524	C	6	6	469866	469871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13585	NC_010524	CTG	2	6	469992	469997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057119
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13587	NC_010524	CGC	2	6	470065	470070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057119
13588	NC_010524	GGT	2	6	470078	470083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057119
13589	NC_010524	CGGC	2	8	470160	470167	0 %	0 %	50 %	50 %	171057119
13590	NC_010524	CGA	2	6	470171	470176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057119
13591	NC_010524	ACCT	2	8	470184	470191	25 %	25 %	0 %	50 %	171057119
13592	NC_010524	TCGG	2	8	470211	470218	0 %	25 %	50 %	25 %	171057119
13593	NC_010524	GC	4	8	470234	470241	0 %	0 %	50 %	50 %	171057119
13594	NC_010524	TGGA	2	8	470268	470275	25 %	25 %	50 %	0 %	171057119
13595	NC_010524	GC	3	6	470288	470293	0 %	0 %	50 %	50 %	171057119
13596	NC_010524	CG	4	8	470298	470305	0 %	0 %	50 %	50 %	171057119
13597	NC_010524	GC	3	6	470314	470319	0 %	0 %	50 %	50 %	171057119
13598	NC_010524	GTG	2	6	470373	470378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057119
13599	NC_010524	GCA	2	6	470429	470434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057120
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13602	NC_010524	GC	3	6	470486	470491	0 %	0 %	50 %	50 %	171057120
13603	NC_010524	CGG	3	9	470520	470528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057120
13604	NC_010524	GGCG	2	8	470544	470551	0 %	0 %	75 %	25 %	171057120
13605	NC_010524	CG	3	6	470565	470570	0 %	0 %	50 %	50 %	171057120
13606	NC_010524	ACG	2	6	470582	470587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057120
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13608	NC_010524	CAC	2	6	470641	470646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057120
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13610	NC_010524	GCC	2	6	470717	470722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057120
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13619	NC_010524	GGCC	2	8	470991	470998	0 %	0 %	50 %	50 %	171057120
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13621	NC_010524	CGGC	2	8	471042	471049	0 %	0 %	50 %	50 %	171057120
13622	NC_010524	GCG	2	6	471066	471071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057120
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13861	NC_010524	GC	3	6	479777	479782	0 %	0 %	50 %	50 %	171057129
13862	NC_010524	TCGG	2	8	479789	479796	0 %	25 %	50 %	25 %	171057129
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13865	NC_010524	GCA	2	6	479966	479971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13938	NC_010524	GCCG	2	8	481952	481959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13979	NC_010524	GTG	2	6	483440	483445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
13980	NC_010524	GGC	2	6	483499	483504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13981	NC_010524	GC	3	6	483513	483518	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13982	NC_010524	GCTGGC	2	12	483529	483540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057133
13983	NC_010524	GC	3	6	483579	483584	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13984	NC_010524	GCT	2	6	483595	483600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13985	NC_010524	CGCC	2	8	483615	483622	0 %	0 %	25 %	75 %	171057133
13986	NC_010524	GCG	2	6	483642	483647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13987	NC_010524	GCT	2	6	483652	483657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13988	NC_010524	CGG	2	6	483703	483708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13989	NC_010524	GCC	3	9	483716	483724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13990	NC_010524	CGC	2	6	483766	483771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13991	NC_010524	CGC	3	9	483775	483783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13992	NC_010524	GCG	2	6	483814	483819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13993	NC_010524	CGC	2	6	483834	483839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13994	NC_010524	CTG	3	9	483854	483862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13995	NC_010524	GCTGG	2	10	483871	483880	0 %	20 %	60 %	20 %	171057133
13996	NC_010524	CTG	2	6	483881	483886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13997	NC_010524	GC	3	6	483921	483926	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13998	NC_010524	CCG	2	6	483953	483958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13999	NC_010524	GGCGCT	2	12	483997	484008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057133
14000	NC_010524	GGC	2	6	484054	484059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133

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