MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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137002	NC_010524	CGCGC	2	10	4872824	4872833	0 %	0 %	40 %	60 %	171061023
137003	NC_010524	TCGAT	2	10	4872844	4872853	20 %	40 %	20 %	20 %	171061023
137004	NC_010524	AGG	2	6	4872859	4872864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171061023
137005	NC_010524	GCT	2	6	4872869	4872874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061023
137006	NC_010524	GC	3	6	4872915	4872920	0 %	0 %	50 %	50 %	171061023
137007	NC_010524	CCA	2	6	4872929	4872934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061023
137008	NC_010524	CAG	2	6	4872935	4872940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061023
137009	NC_010524	GCC	2	6	4872947	4872952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061023
137010	NC_010524	TGC	3	9	4873093	4873101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061023
137011	NC_010524	GCG	3	9	4873117	4873125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061023
137012	NC_010524	CCG	2	6	4873151	4873156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061023
137013	NC_010524	CGC	2	6	4873172	4873177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061023
137014	NC_010524	GC	3	6	4873181	4873186	0 %	0 %	50 %	50 %	171061023
137015	NC_010524	CGG	2	6	4873217	4873222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137016	NC_010524	GTG	2	6	4873241	4873246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061024
137017	NC_010524	CGG	2	6	4873247	4873252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061024
137018	NC_010524	CGA	2	6	4873260	4873265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137019	NC_010524	CGG	2	6	4873285	4873290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061024
137020	NC_010524	GTG	2	6	4873291	4873296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061024
137021	NC_010524	CGG	2	6	4873297	4873302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061024
137022	NC_010524	GTC	2	6	4873303	4873308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137023	NC_010524	AGC	2	6	4873317	4873322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137024	NC_010524	GAA	2	6	4873360	4873365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061024
137025	NC_010524	CGCC	2	8	4873386	4873393	0 %	0 %	25 %	75 %	171061024
137026	NC_010524	CCGG	2	8	4873406	4873413	0 %	0 %	50 %	50 %	171061024
137027	NC_010524	AGCGGT	2	12	4873437	4873448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171061024
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137032	NC_010524	GC	3	6	4873599	4873604	0 %	0 %	50 %	50 %	171061024
137033	NC_010524	CGT	2	6	4873620	4873625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137034	NC_010524	GCA	2	6	4873653	4873658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137035	NC_010524	CG	3	6	4873704	4873709	0 %	0 %	50 %	50 %	171061024
137036	NC_010524	TGA	2	6	4873745	4873750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061024
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137040	NC_010524	CTG	2	6	4873837	4873842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061024
137041	NC_010524	GC	3	6	4873853	4873858	0 %	0 %	50 %	50 %	171061024
137042	NC_010524	GGCT	2	8	4873915	4873922	0 %	25 %	50 %	25 %	171061024
137043	NC_010524	GAA	2	6	4874020	4874025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061024
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137048	NC_010524	GCG	3	9	4874144	4874152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061024
137049	NC_010524	GGC	2	6	4874209	4874214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137050	NC_010524	CAT	2	6	4874250	4874255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137051	NC_010524	GC	3	6	4874269	4874274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137052	NC_010524	CA	3	6	4874367	4874372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137053	NC_010524	CTG	2	6	4874384	4874389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137054	NC_010524	CGT	2	6	4874397	4874402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137055	NC_010524	GCT	2	6	4874433	4874438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
137056	NC_010524	TCG	2	6	4874449	4874454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
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137066	NC_010524	CTG	2	6	4874787	4874792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
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137211	NC_010524	CG	3	6	4879135	4879140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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137250	NC_010524	GCC	2	6	4880400	4880405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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