MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
136501	NC_010524	CTG	2	6	4856208	4856213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136502	NC_010524	GTA	2	6	4856232	4856237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061006
136503	NC_010524	GACGCC	2	12	4856256	4856267	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171061006
136504	NC_010524	TCC	2	6	4856350	4856355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171061006
136505	NC_010524	CGC	2	6	4856364	4856369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061006
136506	NC_010524	GGC	2	6	4856406	4856411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061006
136507	NC_010524	CGG	2	6	4856414	4856419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061006
136508	NC_010524	GCG	2	6	4856464	4856469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061006
136509	NC_010524	TCG	2	6	4856470	4856475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136510	NC_010524	AGC	2	6	4856485	4856490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136511	NC_010524	CAG	2	6	4856514	4856519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136512	NC_010524	GC	3	6	4856538	4856543	0 %	0 %	50 %	50 %	171061006
136513	NC_010524	TGC	2	6	4856584	4856589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136514	NC_010524	GC	3	6	4856604	4856609	0 %	0 %	50 %	50 %	171061006
136515	NC_010524	GC	3	6	4856617	4856622	0 %	0 %	50 %	50 %	171061006
136516	NC_010524	GCC	2	6	4856653	4856658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061006
136517	NC_010524	CAG	3	9	4856661	4856669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136518	NC_010524	CGC	2	6	4856672	4856677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061006
136519	NC_010524	CCCAG	2	10	4856678	4856687	20 %	0 %	20 %	60 %	171061006
136520	NC_010524	CGG	2	6	4856692	4856697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061006
136521	NC_010524	TGC	2	6	4856699	4856704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061006
136522	NC_010524	CGG	2	6	4856713	4856718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061006
136523	NC_010524	GGCGA	2	10	4856731	4856740	20 %	0 %	60 %	20 %	171061006
136524	NC_010524	GCGG	2	8	4856757	4856764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136525	NC_010524	GCC	2	6	4856800	4856805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136526	NC_010524	CGG	2	6	4856808	4856813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136527	NC_010524	GC	3	6	4856827	4856832	0 %	0 %	50 %	50 %	171061007
136528	NC_010524	CCGGCA	2	12	4856835	4856846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171061007
136529	NC_010524	TCG	2	6	4856861	4856866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136530	NC_010524	GGCCTC	2	12	4856887	4856898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171061007
136531	NC_010524	GGT	2	6	4856913	4856918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061007
136532	NC_010524	ACC	3	9	4856960	4856968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061007
136533	NC_010524	GC	5	10	4857000	4857009	0 %	0 %	50 %	50 %	171061007
136534	NC_010524	CGC	2	6	4857063	4857068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061007
136535	NC_010524	GCC	2	6	4857086	4857091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061007
136536	NC_010524	GCCG	2	8	4857118	4857125	0 %	0 %	50 %	50 %	171061007
136537	NC_010524	CAG	3	9	4857139	4857147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136538	NC_010524	CAG	2	6	4857154	4857159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136539	NC_010524	GCT	2	6	4857165	4857170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136540	NC_010524	GCGTCA	2	12	4857171	4857182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136541	NC_010524	CCG	2	6	4857213	4857218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061007
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136543	NC_010524	CAT	2	6	4857322	4857327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061007
136544	NC_010524	GCA	2	6	4857333	4857338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136545	NC_010524	GCT	2	6	4857346	4857351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136546	NC_010524	CAG	2	6	4857370	4857375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136547	NC_010524	TGA	2	6	4857393	4857398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
136548	NC_010524	CAGG	2	8	4857460	4857467	25 %	0 %	50 %	25 %	171061007
136549	NC_010524	ATG	2	6	4857575	4857580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
136550	NC_010524	CGA	2	6	4857585	4857590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
136551	NC_010524	TCT	2	6	4857612	4857617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061007
136552	NC_010524	GCC	2	6	4857646	4857651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061007
136553	NC_010524	CAG	2	6	4857688	4857693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
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136564	NC_010524	ACC	2	6	4857977	4857982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061007
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136570	NC_010524	TGA	2	6	4858110	4858115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
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136572	NC_010524	GT	3	6	4858158	4858163	0 %	50 %	50 %	0 %	171061007
136573	NC_010524	TGT	2	6	4858167	4858172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171061007
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136575	NC_010524	CG	3	6	4858234	4858239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136576	NC_010524	CCGG	2	8	4858348	4858355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136577	NC_010524	CGT	2	6	4858370	4858375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136578	NC_010524	GCCCG	2	10	4858422	4858431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136579	NC_010524	C	6	6	4858436	4858441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136580	NC_010524	GCCA	2	8	4858521	4858528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136581	NC_010524	CGA	3	9	4858543	4858551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136583	NC_010524	CGG	2	6	4858572	4858577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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136586	NC_010524	TCGCC	2	10	4858623	4858632	0 %	20 %	20 %	60 %	171061008
136587	NC_010524	TTC	2	6	4858655	4858660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061008
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136598	NC_010524	GCAT	2	8	4859010	4859017	25 %	25 %	25 %	25 %	171061008
136599	NC_010524	GCC	3	9	4859018	4859026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
136600	NC_010524	CTG	2	6	4859063	4859068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061008
136601	NC_010524	GGCCG	2	10	4859077	4859086	0 %	0 %	60 %	40 %	171061008
136602	NC_010524	GCC	2	6	4859105	4859110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
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136614	NC_010524	CGA	2	6	4859401	4859406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061008
136615	NC_010524	CAT	2	6	4859413	4859418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061008
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136729	NC_010524	GTC	2	6	4862853	4862858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061012
136730	NC_010524	CGCGG	2	10	4862882	4862891	0 %	0 %	60 %	40 %	171061012
136731	NC_010524	CG	3	6	4862948	4862953	0 %	0 %	50 %	50 %	171061012
136732	NC_010524	TGG	2	6	4863001	4863006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061012
136733	NC_010524	CTG	2	6	4863024	4863029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061012
136734	NC_010524	TCA	2	6	4863122	4863127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061012
136735	NC_010524	GC	3	6	4863160	4863165	0 %	0 %	50 %	50 %	171061013
136736	NC_010524	CAG	3	9	4863182	4863190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061013
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136738	NC_010524	GCA	2	6	4863268	4863273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061013
136739	NC_010524	CCG	2	6	4863310	4863315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061013
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136741	NC_010524	GCCGA	2	10	4863336	4863345	20 %	0 %	40 %	40 %	171061013
136742	NC_010524	GAA	2	6	4863347	4863352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061013
136743	NC_010524	GGC	2	6	4863384	4863389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061013
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136745	NC_010524	ATCGCG	2	12	4863399	4863410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171061013
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136748	NC_010524	CGATGC	2	12	4863466	4863477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171061013
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136755	NC_010524	CAG	2	6	4863734	4863739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061013
136756	NC_010524	GCG	2	6	4863748	4863753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061013
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136773	NC_010524	CGGGG	2	10	4864218	4864227	0 %	0 %	80 %	20 %	171061014
136774	NC_010524	TGC	2	6	4864273	4864278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061015
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136778	NC_010524	TCG	2	6	4864383	4864388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061015
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136781	NC_010524	GT	3	6	4864546	4864551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136782	NC_010524	GGC	3	9	4864593	4864601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061016
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136792	NC_010524	CCCG	2	8	4865072	4865079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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136816	NC_010524	TCCG	2	8	4866059	4866066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136817	NC_010524	CAG	2	6	4866081	4866086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136818	NC_010524	CA	3	6	4866117	4866122	50 %	0 %	0 %	50 %	171061018
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136822	NC_010524	TGC	2	6	4866330	4866335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061018
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136828	NC_010524	CAGC	2	8	4866529	4866536	25 %	0 %	25 %	50 %	171061018
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136830	NC_010524	CGT	2	6	4866634	4866639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061018
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136832	NC_010524	TCA	2	6	4866762	4866767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061018
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136835	NC_010524	CG	3	6	4866833	4866838	0 %	0 %	50 %	50 %	171061018
136836	NC_010524	G	6	6	4866871	4866876	0 %	0 %	100 %	0 %	171061018
136837	NC_010524	TCA	2	6	4866933	4866938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061018
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136840	NC_010524	GCT	2	6	4867027	4867032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061018
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136842	NC_010524	GCT	2	6	4867159	4867164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061018
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136989	NC_010524	GCG	2	6	4872404	4872409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061022
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136992	NC_010524	CGG	2	6	4872462	4872467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061022
136993	NC_010524	TGC	2	6	4872479	4872484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061022
136994	NC_010524	CGGC	2	8	4872495	4872502	0 %	0 %	50 %	50 %	171061022
136995	NC_010524	TCG	2	6	4872503	4872508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061022
136996	NC_010524	GC	3	6	4872538	4872543	0 %	0 %	50 %	50 %	171061022
136997	NC_010524	CGC	2	6	4872557	4872562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136998	NC_010524	CG	3	6	4872625	4872630	0 %	0 %	50 %	50 %	171061023
136999	NC_010524	GCC	2	6	4872648	4872653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061023
137000	NC_010524	CGA	2	6	4872761	4872766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061023

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