MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
136001	NC_010524	GCCAGC	2	12	4838336	4838347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060991
136002	NC_010524	CGA	2	6	4838397	4838402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060991
136003	NC_010524	CGA	2	6	4838480	4838485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060991
136004	NC_010524	CACG	2	8	4838496	4838503	25 %	0 %	25 %	50 %	171060991
136005	NC_010524	TGA	2	6	4838543	4838548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060991
136006	NC_010524	CAG	2	6	4838563	4838568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060991
136007	NC_010524	CG	3	6	4838592	4838597	0 %	0 %	50 %	50 %	171060991
136008	NC_010524	GCC	2	6	4838695	4838700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060991
136009	NC_010524	GTG	2	6	4838761	4838766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060991
136010	NC_010524	TGG	2	6	4838795	4838800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060991
136011	NC_010524	ACG	2	6	4838807	4838812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060991
136012	NC_010524	GC	3	6	4838814	4838819	0 %	0 %	50 %	50 %	171060991
136013	NC_010524	GGCGCG	2	12	4838823	4838834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060991
136014	NC_010524	GGT	2	6	4838868	4838873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060991
136015	NC_010524	CGGC	2	8	4838885	4838892	0 %	0 %	50 %	50 %	171060991
136016	NC_010524	CAGC	2	8	4838994	4839001	25 %	0 %	25 %	50 %	171060991
136017	NC_010524	TCA	2	6	4839034	4839039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136018	NC_010524	AGC	2	6	4839049	4839054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136019	NC_010524	CG	4	8	4839113	4839120	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136020	NC_010524	GCGCG	2	10	4839129	4839138	0 %	0 %	60 %	40 %	171060992
136021	NC_010524	GC	3	6	4839157	4839162	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136022	NC_010524	GCA	2	6	4839165	4839170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136023	NC_010524	CG	3	6	4839211	4839216	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136024	NC_010524	GCGG	2	8	4839312	4839319	0 %	0 %	75 %	25 %	171060992
136025	NC_010524	CAG	2	6	4839370	4839375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136026	NC_010524	CGA	3	9	4839447	4839455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136027	NC_010524	TGC	2	6	4839491	4839496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136028	NC_010524	CCG	2	6	4839501	4839506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136029	NC_010524	CGC	2	6	4839519	4839524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136030	NC_010524	CAC	2	6	4839534	4839539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060992
136031	NC_010524	GGCC	2	8	4839552	4839559	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136032	NC_010524	GGC	2	6	4839564	4839569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060992
136033	NC_010524	GCT	2	6	4839576	4839581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136034	NC_010524	CCA	2	6	4839605	4839610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060992
136035	NC_010524	CGA	2	6	4839663	4839668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136036	NC_010524	TCAAGC	2	12	4839686	4839697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060992
136037	NC_010524	GC	3	6	4839696	4839701	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136038	NC_010524	GC	3	6	4839737	4839742	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136039	NC_010524	CGC	2	6	4839744	4839749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136040	NC_010524	GCT	2	6	4839756	4839761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136041	NC_010524	GC	3	6	4839774	4839779	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136042	NC_010524	CCG	2	6	4839785	4839790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136043	NC_010524	TTC	2	6	4839835	4839840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060992
136044	NC_010524	GGCC	2	8	4839843	4839850	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136045	NC_010524	CGA	2	6	4839861	4839866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136046	NC_010524	CGA	2	6	4839885	4839890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060992
136047	NC_010524	CGC	2	6	4839900	4839905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136048	NC_010524	CGC	3	9	4839914	4839922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136049	NC_010524	ACC	2	6	4839925	4839930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060992
136050	NC_010524	GTG	2	6	4840033	4840038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060992
136051	NC_010524	GGC	2	6	4840040	4840045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060992
136052	NC_010524	CG	3	6	4840082	4840087	0 %	0 %	50 %	50 %	171060992
136053	NC_010524	CGC	2	6	4840104	4840109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060992
136054	NC_010524	GC	3	6	4840114	4840119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136055	NC_010524	GCCG	2	8	4840125	4840132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136056	NC_010524	TCG	2	6	4840147	4840152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136057	NC_010524	CCCTCG	2	12	4840196	4840207	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	171060993
136058	NC_010524	CAT	2	6	4840209	4840214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060993
136059	NC_010524	TCG	2	6	4840277	4840282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060993
136060	NC_010524	CGC	3	9	4840302	4840310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060993
136061	NC_010524	GCC	2	6	4840321	4840326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060993
136062	NC_010524	GCT	2	6	4840359	4840364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060993
136063	NC_010524	CGC	3	9	4840397	4840405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060993
136064	NC_010524	CAC	2	6	4840411	4840416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060993
136065	NC_010524	CGG	2	6	4840439	4840444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060993
136066	NC_010524	CGC	2	6	4840473	4840478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060993
136067	NC_010524	TGG	2	6	4840502	4840507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060993
136068	NC_010524	AAG	2	6	4840522	4840527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060993
136069	NC_010524	GC	3	6	4840541	4840546	0 %	0 %	50 %	50 %	171060993
136070	NC_010524	GC	3	6	4840568	4840573	0 %	0 %	50 %	50 %	171060993
136071	NC_010524	CG	4	8	4840580	4840587	0 %	0 %	50 %	50 %	171060993
136072	NC_010524	CACGG	2	10	4840621	4840630	20 %	0 %	40 %	40 %	171060993
136073	NC_010524	CTT	2	6	4840677	4840682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060993
136074	NC_010524	CAC	2	6	4840744	4840749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060993
136075	NC_010524	CAC	2	6	4840785	4840790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060993
136076	NC_010524	GC	3	6	4840889	4840894	0 %	0 %	50 %	50 %	171060993
136077	NC_010524	GCA	2	6	4840926	4840931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060993
136078	NC_010524	CGA	2	6	4840959	4840964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060993
136079	NC_010524	GCA	2	6	4840967	4840972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060993
136080	NC_010524	CGG	2	6	4840998	4841003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060993
136081	NC_010524	CG	3	6	4841016	4841021	0 %	0 %	50 %	50 %	171060993
136082	NC_010524	ACC	2	6	4841065	4841070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060993
136083	NC_010524	CGC	2	6	4841187	4841192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060993
136084	NC_010524	ACC	2	6	4841221	4841226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060993
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136086	NC_010524	CG	3	6	4841346	4841351	0 %	0 %	50 %	50 %	171060994
136087	NC_010524	GTGG	2	8	4841367	4841374	0 %	25 %	75 %	0 %	171060994
136088	NC_010524	CACG	2	8	4841385	4841392	25 %	0 %	25 %	50 %	171060994
136089	NC_010524	CA	3	6	4841414	4841419	50 %	0 %	0 %	50 %	171060994
136090	NC_010524	GTC	2	6	4841445	4841450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060994
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136093	NC_010524	GTC	2	6	4841530	4841535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060994
136094	NC_010524	CCG	2	6	4841570	4841575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060994
136095	NC_010524	GC	3	6	4841583	4841588	0 %	0 %	50 %	50 %	171060994
136096	NC_010524	GCC	3	9	4841594	4841602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060994
136097	NC_010524	CGTG	2	8	4841622	4841629	0 %	25 %	50 %	25 %	171060994
136098	NC_010524	CCG	2	6	4841630	4841635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060994
136099	NC_010524	TCT	2	6	4841708	4841713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060994
136100	NC_010524	AGC	2	6	4841729	4841734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060994
136101	NC_010524	TG	3	6	4841821	4841826	0 %	50 %	50 %	0 %	171060994
136102	NC_010524	CCG	2	6	4841855	4841860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060994
136103	NC_010524	GCT	2	6	4841913	4841918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060994
136104	NC_010524	TGG	2	6	4841945	4841950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060994
136105	NC_010524	CGC	2	6	4841979	4841984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060994
136106	NC_010524	GCA	3	9	4842012	4842020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060994
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136109	NC_010524	CG	3	6	4842208	4842213	0 %	0 %	50 %	50 %	171060995
136110	NC_010524	CGA	2	6	4842234	4842239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
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136112	NC_010524	GCG	2	6	4842467	4842472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060995
136113	NC_010524	TGG	2	6	4842521	4842526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060995
136114	NC_010524	CGA	2	6	4842537	4842542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136115	NC_010524	CGA	2	6	4842579	4842584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136116	NC_010524	CG	3	6	4842680	4842685	0 %	0 %	50 %	50 %	171060995
136117	NC_010524	CTG	2	6	4842691	4842696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136118	NC_010524	TGC	2	6	4842716	4842721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136119	NC_010524	AGC	2	6	4842722	4842727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136120	NC_010524	CGCT	2	8	4842865	4842872	0 %	25 %	25 %	50 %	171060995
136121	NC_010524	CG	3	6	4842895	4842900	0 %	0 %	50 %	50 %	171060995
136122	NC_010524	GGAGTG	2	12	4842948	4842959	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	171060995
136123	NC_010524	GC	3	6	4842995	4843000	0 %	0 %	50 %	50 %	171060995
136124	NC_010524	CGA	2	6	4843044	4843049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136125	NC_010524	CGC	2	6	4843053	4843058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060995
136126	NC_010524	CGA	2	6	4843068	4843073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060995
136127	NC_010524	CGC	2	6	4843074	4843079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060995
136128	NC_010524	CCG	2	6	4843083	4843088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060995
136129	NC_010524	AC	3	6	4843123	4843128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136130	NC_010524	ACA	2	6	4843137	4843142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060996
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136132	NC_010524	GCG	2	6	4843176	4843181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060996
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136134	NC_010524	TGG	2	6	4843245	4843250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060996
136135	NC_010524	GC	3	6	4843254	4843259	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
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136137	NC_010524	CG	3	6	4843283	4843288	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
136138	NC_010524	GCT	2	6	4843320	4843325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060996
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136142	NC_010524	GCGT	2	8	4843527	4843534	0 %	25 %	50 %	25 %	171060996
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136144	NC_010524	CG	3	6	4843583	4843588	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
136145	NC_010524	TGG	2	6	4843590	4843595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060996
136146	NC_010524	CGGC	2	8	4843596	4843603	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
136147	NC_010524	CGC	2	6	4843659	4843664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060996
136148	NC_010524	CGGCC	2	10	4843729	4843738	0 %	0 %	40 %	60 %	171060996
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136152	NC_010524	CAC	2	6	4843825	4843830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060996
136153	NC_010524	TCG	2	6	4843833	4843838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060996
136154	NC_010524	CCGG	2	8	4843839	4843846	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
136155	NC_010524	CGA	2	6	4843852	4843857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060996
136156	NC_010524	CTG	2	6	4843901	4843906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060996
136157	NC_010524	GCCA	2	8	4843910	4843917	25 %	0 %	25 %	50 %	171060996
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136161	NC_010524	CCCG	2	8	4844030	4844037	0 %	0 %	25 %	75 %	171060996
136162	NC_010524	CG	3	6	4844046	4844051	0 %	0 %	50 %	50 %	171060996
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136172	NC_010524	CTG	2	6	4844377	4844382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136173	NC_010524	ACC	2	6	4844401	4844406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060997
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136176	NC_010524	GC	3	6	4844599	4844604	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136177	NC_010524	TGC	2	6	4844606	4844611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136178	NC_010524	GGA	2	6	4844673	4844678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060997
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136180	NC_010524	CGA	2	6	4844744	4844749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060997
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136183	NC_010524	GC	4	8	4844814	4844821	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136184	NC_010524	GC	3	6	4844850	4844855	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136185	NC_010524	AGG	2	6	4844861	4844866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060997
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136190	NC_010524	TGA	2	6	4844981	4844986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060997
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136206	NC_010524	TGC	2	6	4845260	4845265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
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136216	NC_010524	GC	3	6	4845649	4845654	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136217	NC_010524	TCG	2	6	4845707	4845712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136218	NC_010524	CGA	2	6	4845804	4845809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136219	NC_010524	CATC	2	8	4845813	4845820	25 %	25 %	0 %	50 %	171060997
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136221	NC_010524	CAG	2	6	4845867	4845872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136222	NC_010524	CGGCG	2	10	4845930	4845939	0 %	0 %	60 %	40 %	171060997
136223	NC_010524	CGG	3	9	4845965	4845973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060997
136224	NC_010524	GC	3	6	4845982	4845987	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136225	NC_010524	CG	3	6	4846092	4846097	0 %	0 %	50 %	50 %	171060997
136226	NC_010524	CGT	3	9	4846122	4846130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136227	NC_010524	TGGC	2	8	4846162	4846169	0 %	25 %	50 %	25 %	171060997
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136229	NC_010524	TGC	2	6	4846235	4846240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060997
136230	NC_010524	GCC	2	6	4846246	4846251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060997
136231	NC_010524	GCC	2	6	4846262	4846267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060997
136232	NC_010524	ACA	2	6	4846295	4846300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060997
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136248	NC_010524	CTG	2	6	4846847	4846852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136344	NC_010524	CGG	2	6	4849748	4849753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060999
136345	NC_010524	GGC	2	6	4849761	4849766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060999
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136347	NC_010524	TCT	2	6	4849795	4849800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136348	NC_010524	TGA	2	6	4849901	4849906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061000
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136395	NC_010524	TCGAT	2	10	4852129	4852138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136396	NC_010524	GTC	2	6	4852154	4852159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136445	NC_010524	GC	4	8	4854149	4854156	0 %	0 %	50 %	50 %	171061005
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136450	NC_010524	GCC	2	6	4854318	4854323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061005
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136453	NC_010524	CCA	2	6	4854383	4854388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061005
136454	NC_010524	TGCCGG	2	12	4854395	4854406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171061005
136455	NC_010524	CAC	2	6	4854420	4854425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061005
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136458	NC_010524	TCG	2	6	4854529	4854534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061005
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136460	NC_010524	GGC	2	6	4854560	4854565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061005
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