MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_010524	GAA	2	6	4801727	4801732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060956
135002	NC_010524	CGG	2	6	4801747	4801752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060956
135003	NC_010524	TG	3	6	4801816	4801821	0 %	50 %	50 %	0 %	171060956
135004	NC_010524	CGG	2	6	4801832	4801837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060956
135005	NC_010524	TCGC	2	8	4801907	4801914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135006	NC_010524	C	13	13	4801930	4801942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135007	NC_010524	TCA	2	6	4801977	4801982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135008	NC_010524	CAG	2	6	4802244	4802249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135009	NC_010524	GA	3	6	4802284	4802289	50 %	0 %	50 %	0 %	171060957
135010	NC_010524	TGC	2	6	4802309	4802314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135011	NC_010524	CGG	2	6	4802357	4802362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060957
135012	NC_010524	CAG	2	6	4802409	4802414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135013	NC_010524	GCAG	2	8	4802506	4802513	25 %	0 %	50 %	25 %	171060957
135014	NC_010524	AGC	2	6	4802584	4802589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135015	NC_010524	CAT	2	6	4802595	4802600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060957
135016	NC_010524	CGGCAT	2	12	4802646	4802657	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135017	NC_010524	CGCCGG	2	12	4802658	4802669	0 %	0 %	50 %	50 %	171060957
135018	NC_010524	TCG	2	6	4802693	4802698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060957
135019	NC_010524	CTGG	2	8	4802741	4802748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135020	NC_010524	AGG	2	6	4802793	4802798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135021	NC_010524	TGC	2	6	4802909	4802914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060958
135022	NC_010524	TCG	2	6	4802920	4802925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060958
135023	NC_010524	TCCT	2	8	4802928	4802935	0 %	50 %	0 %	50 %	171060958
135024	NC_010524	ATC	2	6	4802952	4802957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060958
135025	NC_010524	ATC	2	6	4802964	4802969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060958
135026	NC_010524	CTGG	2	8	4803002	4803009	0 %	25 %	50 %	25 %	171060958
135027	NC_010524	TGG	2	6	4803067	4803072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060958
135028	NC_010524	ATCGC	2	10	4803160	4803169	20 %	20 %	20 %	40 %	171060958
135029	NC_010524	GGCT	2	8	4803174	4803181	0 %	25 %	50 %	25 %	171060958
135030	NC_010524	GCC	2	6	4803295	4803300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135031	NC_010524	GC	3	6	4803302	4803307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135032	NC_010524	CAT	2	6	4803352	4803357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135033	NC_010524	CCA	2	6	4803404	4803409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135034	NC_010524	CCG	2	6	4803459	4803464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135035	NC_010524	CGCT	2	8	4803469	4803476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135036	NC_010524	CGTG	2	8	4803522	4803529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135037	NC_010524	CGC	2	6	4803552	4803557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135038	NC_010524	AGC	2	6	4803572	4803577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135039	NC_010524	GTC	2	6	4803594	4803599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135040	NC_010524	TTC	2	6	4803748	4803753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060959
135041	NC_010524	TCA	2	6	4803759	4803764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060959
135042	NC_010524	TCGGG	2	10	4803771	4803780	0 %	20 %	60 %	20 %	171060959
135043	NC_010524	CAG	2	6	4803820	4803825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060959
135044	NC_010524	CGG	2	6	4803850	4803855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060959
135045	NC_010524	CTT	2	6	4804009	4804014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060959
135046	NC_010524	GGC	2	6	4804017	4804022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060959
135047	NC_010524	CG	3	6	4804121	4804126	0 %	0 %	50 %	50 %	171060959
135048	NC_010524	GGC	2	6	4804140	4804145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060959
135049	NC_010524	CTCG	2	8	4804188	4804195	0 %	25 %	25 %	50 %	171060959
135050	NC_010524	CTT	2	6	4804201	4804206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060959
135051	NC_010524	GGC	2	6	4804214	4804219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060959
135052	NC_010524	GCG	2	6	4804318	4804323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060960
135053	NC_010524	GTC	2	6	4804440	4804445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135054	NC_010524	ACG	2	6	4804450	4804455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135055	NC_010524	CGA	2	6	4804500	4804505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135056	NC_010524	CGG	2	6	4804506	4804511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060960
135057	NC_010524	CGCC	2	8	4804516	4804523	0 %	0 %	25 %	75 %	171060960
135058	NC_010524	GCA	2	6	4804562	4804567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135059	NC_010524	TGC	2	6	4804588	4804593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135060	NC_010524	GCA	2	6	4804600	4804605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135061	NC_010524	GCT	2	6	4804683	4804688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060960
135062	NC_010524	GTT	2	6	4804876	4804881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060961
135063	NC_010524	GCA	2	6	4804912	4804917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135064	NC_010524	GGC	2	6	4804989	4804994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060961
135065	NC_010524	TG	3	6	4805115	4805120	0 %	50 %	50 %	0 %	171060961
135066	NC_010524	CAG	2	6	4805243	4805248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135067	NC_010524	TCT	2	6	4805274	4805279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060961
135068	NC_010524	GCA	2	6	4805401	4805406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135069	NC_010524	TCTT	2	8	4805433	4805440	0 %	75 %	0 %	25 %	171060961
135070	NC_010524	CG	3	6	4805537	4805542	0 %	0 %	50 %	50 %	171060961
135071	NC_010524	TGC	3	9	4805549	4805557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135072	NC_010524	GCA	2	6	4805671	4805676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135073	NC_010524	TCG	2	6	4805682	4805687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135074	NC_010524	GTC	2	6	4805688	4805693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060961
135075	NC_010524	TCT	2	6	4805704	4805709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060961
135076	NC_010524	GAT	2	6	4805720	4805725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060961
135077	NC_010524	GGCC	2	8	4805801	4805808	0 %	0 %	50 %	50 %	171060961
135078	NC_010524	GCG	2	6	4805907	4805912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060961
135079	NC_010524	CGAT	2	8	4805948	4805955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135080	NC_010524	TGG	2	6	4805964	4805969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135081	NC_010524	ACG	2	6	4805971	4805976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135082	NC_010524	GCCCA	2	10	4806005	4806014	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135083	NC_010524	CATCGA	2	12	4806065	4806076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060962
135084	NC_010524	AAC	2	6	4806108	4806113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060962
135085	NC_010524	TCG	2	6	4806118	4806123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060962
135086	NC_010524	CAG	2	6	4806141	4806146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060962
135087	NC_010524	GC	4	8	4806149	4806156	0 %	0 %	50 %	50 %	171060962
135088	NC_010524	TCA	2	6	4806232	4806237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060962
135089	NC_010524	CGGTCA	2	12	4806256	4806267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060962
135090	NC_010524	GCA	2	6	4806281	4806286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060962
135091	NC_010524	G	6	6	4806344	4806349	0 %	0 %	100 %	0 %	171060962
135092	NC_010524	CGC	3	9	4806394	4806402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135093	NC_010524	GCA	2	6	4806422	4806427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135094	NC_010524	GC	3	6	4806493	4806498	0 %	0 %	50 %	50 %	171060963
135095	NC_010524	CAC	2	6	4806594	4806599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060963
135096	NC_010524	AGC	2	6	4806622	4806627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135097	NC_010524	CCG	2	6	4806663	4806668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060963
135098	NC_010524	CGC	2	6	4806715	4806720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060963
135099	NC_010524	GCGA	2	8	4806745	4806752	25 %	0 %	50 %	25 %	171060963
135100	NC_010524	GGC	2	6	4806753	4806758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060963
135101	NC_010524	CGA	3	9	4806794	4806802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135102	NC_010524	GTC	2	6	4806843	4806848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135103	NC_010524	GC	4	8	4806860	4806867	0 %	0 %	50 %	50 %	171060963
135104	NC_010524	GTCGC	2	10	4806889	4806898	0 %	20 %	40 %	40 %	171060963
135105	NC_010524	CCA	2	6	4806932	4806937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060963
135106	NC_010524	ATC	2	6	4806973	4806978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060963
135107	NC_010524	CTGCG	2	10	4806996	4807005	0 %	20 %	40 %	40 %	171060963
135108	NC_010524	A	6	6	4807006	4807011	100 %	0 %	0 %	0 %	171060963
135109	NC_010524	GCC	2	6	4807041	4807046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060963
135110	NC_010524	GC	3	6	4807047	4807052	0 %	0 %	50 %	50 %	171060963
135111	NC_010524	TTC	2	6	4807056	4807061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060963
135112	NC_010524	GC	3	6	4807090	4807095	0 %	0 %	50 %	50 %	171060963
135113	NC_010524	CGC	2	6	4807136	4807141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060963
135114	NC_010524	AGC	2	6	4807156	4807161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135115	NC_010524	TGC	2	6	4807247	4807252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060963
135116	NC_010524	ATTC	2	8	4807448	4807455	25 %	50 %	0 %	25 %	171060964
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135120	NC_010524	TGG	2	6	4807579	4807584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060964
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135124	NC_010524	CGG	2	6	4807643	4807648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060964
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135127	NC_010524	ATCT	2	8	4807788	4807795	25 %	50 %	0 %	25 %	171060964
135128	NC_010524	TGG	2	6	4807858	4807863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060964
135129	NC_010524	CGGG	2	8	4807897	4807904	0 %	0 %	75 %	25 %	171060964
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135142	NC_010524	GGT	2	6	4808556	4808561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060965
135143	NC_010524	GC	3	6	4808580	4808585	0 %	0 %	50 %	50 %	171060965
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135173	NC_010524	CCA	2	6	4809483	4809488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060966
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135211	NC_010524	TCA	2	6	4810832	4810837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060967
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135213	NC_010524	GC	3	6	4810875	4810880	0 %	0 %	50 %	50 %	171060967
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135215	NC_010524	GCC	2	6	4811008	4811013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060967
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135222	NC_010524	GCCT	2	8	4811371	4811378	0 %	25 %	25 %	50 %	171060967
135223	NC_010524	CCTGG	2	10	4811490	4811499	0 %	20 %	40 %	40 %	171060967
135224	NC_010524	TGC	2	6	4811513	4811518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060967
135225	NC_010524	GGCCG	2	10	4811521	4811530	0 %	0 %	60 %	40 %	171060967
135226	NC_010524	GCT	2	6	4811538	4811543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060967
135227	NC_010524	CGC	2	6	4811571	4811576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060967
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135229	NC_010524	TCA	2	6	4811615	4811620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060967
135230	NC_010524	GCC	2	6	4811639	4811644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060967
135231	NC_010524	CTGGCC	2	12	4811662	4811673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171060967
135232	NC_010524	CGGC	2	8	4811709	4811716	0 %	0 %	50 %	50 %	171060967
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135236	NC_010524	GCT	2	6	4811847	4811852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060967
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135243	NC_010524	GCCCG	2	10	4812061	4812070	0 %	0 %	40 %	60 %	171060967
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135252	NC_010524	GC	3	6	4812225	4812230	0 %	0 %	50 %	50 %	171060968
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135257	NC_010524	GCT	2	6	4812349	4812354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060968
135258	NC_010524	GCTG	2	8	4812361	4812368	0 %	25 %	50 %	25 %	171060968
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135331	NC_010524	CACC	2	8	4814821	4814828	25 %	0 %	0 %	75 %	171060970
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135344	NC_010524	TGC	2	6	4815168	4815173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060971
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135446	NC_010524	GCG	2	6	4818830	4818835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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135451	NC_010524	CG	4	8	4818945	4818952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135452	NC_010524	GCCG	2	8	4818963	4818970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135453	NC_010524	ACG	2	6	4819054	4819059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060974
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135457	NC_010524	GCT	2	6	4819220	4819225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135458	NC_010524	CG	3	6	4819314	4819319	0 %	0 %	50 %	50 %	171060974
135459	NC_010524	GCC	3	9	4819329	4819337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060974
135460	NC_010524	CG	3	6	4819360	4819365	0 %	0 %	50 %	50 %	171060974
135461	NC_010524	CG	4	8	4819375	4819382	0 %	0 %	50 %	50 %	171060974
135462	NC_010524	GCT	2	6	4819439	4819444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135463	NC_010524	CGC	2	6	4819474	4819479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060974
135464	NC_010524	TGC	2	6	4819498	4819503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135465	NC_010524	CTG	2	6	4819506	4819511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135466	NC_010524	CTG	2	6	4819542	4819547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060974
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135468	NC_010524	CG	5	10	4819574	4819583	0 %	0 %	50 %	50 %	171060974
135469	NC_010524	GAT	2	6	4819626	4819631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060974
135470	NC_010524	GCC	2	6	4819635	4819640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060974
135471	NC_010524	GCA	2	6	4819670	4819675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135472	NC_010524	AGC	2	6	4819717	4819722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060974
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135474	NC_010524	GCA	2	6	4819774	4819779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060974
135475	NC_010524	CCG	2	6	4819780	4819785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060974
135476	NC_010524	GC	3	6	4819843	4819848	0 %	0 %	50 %	50 %	171060974
135477	NC_010524	CGC	3	9	4819846	4819854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060974
135478	NC_010524	GGC	2	6	4819929	4819934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135479	NC_010524	CGT	2	6	4819939	4819944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135480	NC_010524	A	7	7	4819959	4819965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135481	NC_010524	CGA	2	6	4819996	4820001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135482	NC_010524	CTCG	2	8	4820004	4820011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135483	NC_010524	GAG	2	6	4820021	4820026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135484	NC_010524	CTT	2	6	4820052	4820057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060975
135485	NC_010524	CGG	3	9	4820066	4820074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135486	NC_010524	GCT	2	6	4820105	4820110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060975
135487	NC_010524	GCG	2	6	4820125	4820130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135488	NC_010524	GGC	2	6	4820133	4820138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135489	NC_010524	GCG	2	6	4820170	4820175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135490	NC_010524	GTG	2	6	4820176	4820181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060975
135491	NC_010524	CGG	2	6	4820201	4820206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135492	NC_010524	CGG	2	6	4820210	4820215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
135493	NC_010524	GCCG	2	8	4820223	4820230	0 %	0 %	50 %	50 %	171060975
135494	NC_010524	CGG	2	6	4820243	4820248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060975
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